15 Mannschaften spielten um den Aufstieg in die höchste deutsche Spielklasse. Die ersten zwei Vereine der Abschlusstabelle stiegen direkt in die 1. Handball-Bundesliga auf. Die letzten beiden Vereine mussten den Gang in die 3. Liga antreten. Absteiger aus der letzten Saison der 1. Handball-Bundesliga waren der SVG Celle und der VfL Sindelfingen. Der VfL Sindelfingen zog jedoch seine Mannschaft zurück und trat somit nicht in der 2. Bundesliga an. Aufsteiger aus der 3. Liga waren die TSG Ober-Eschbach, die BVB Füchse Berlin, der 1. FSV Mainz 05 und die SG 09 Kirchhof.
Der Modus war jeder gegen jeden mit jeweils einem Heim- und Auswärtsspiel. Der Tabellenführer und die zweitplatzierte Mannschaft stiegen am Ende der Saison direkt in die 1. Bundesliga auf, die letzten beiden Mannschaften stiegen direkt in die 3. Liga ab. Bei Punktgleichheit entschied die bessere Tordifferenz. Bei gleicher Tordifferenz waren Entscheidungsspiele anzusetzen.
Die Torschützenliste zeigt die drei besten Torschützinnen in der 2. Handball-Bundesliga 2012/13. Zu sehen sind die Nation der Spielerin, der Name, die Position, der Verein, die gespielten Spiele, die Tore und die 7-m-Tore.
In der Tabelle stehen die drei besten 7-m-Werferinnen der 2. Handball-Bundesliga 2012/13. Zu sehen sind die Nation der Spielerin, der Name, die Position, der Verein, die gespielten Spiele, die 7-m-Tore, die 7-m-Versuche und die 7-m-Quote.
In der Tabelle stehen die drei am häufigsten verwarnten Spielerinnen der 2. Handball-Bundesliga 2012/13.
Zu sehen sind die Nation der Spielerin, der Name, die Position, der Verein, die gespielten Spiele, die Anzahl der Gelben Karten, die Anzahl der Strafminuten und die Anzahl der Roten Karten.
