Autographiviridae

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Autographiviridae

Pseudomonas-Phage phiMKV,
Gattung Phikmvvirus

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Duplodnaviria[2]
Reich: Heunggongvirae[2]
Phylum: Uroviricota[2]
Klasse: Caudoviricetes[1]
Ordnung: incertae sedis
Familie: Autographiviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: ikosaedrisch, tailed
(Podoviren)
Wissenschaftlicher Name
Autographiviridae
Links
NCBI Taxonomy: 542835
ViralZone (Expasy, SIB): 709
ICTV Taxon History: 201908192

Die Autographiviridae (veraltet auch Autographivirinae, T7-Supergruppe, englisch T7 supergroup genannt) sind eine Familie von Viren in der Ordnung Caudovirales – sie wurden dort früher als Unterfamilie Autographivirinae in der früheren Familie Podoviridae geführt. Ihre natürlichen Wirte sind Bakterien. Es gibt derzeit 40 Arten (Spezies) in dieser Gruppe, die meisten davon sind einer von ca. sieben Gattungen zugewiesen.[3][4]

Forschungsgeschichte[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Seit den 1990er Jahren hat sich der Begriff T7-Supergruppe für die wachsende Gruppe der mit dem Coliphagen T7 verwandten Bakteriophagen vom Morphotyp der Podoviren etabliert. Salmonella virus SP6 (alias Enterobacteriaceae-Phage SP6) und Escherichia virus K1-5 (alias Enterobacteriaceae-Phage K1-5) wurden als erste als eine weitläufig verwandte Untergruppe (die heutige Gattung Zindervirus) dieser ‚T7-Supergruppe‘ betrachtet.[5] Das Pseudomonas-Virus phiKMV (alias Bakteriophage phiKMV) zeigte auf der Ebene der Genomorganisation ebenfalls Gemeinsamkeiten. Basierend auf den verfügbaren morphologischen und proteomischen Daten wurde diese Virusklade zunächst als eine Unterfamilie in der damaligen Familie Podoviridae etabliert. Nachdem Genom-Untersuchungen gezeigt hatten. dass diese Familie nicht monophyletisch ist, wurde sie seitens des ICTV im März/April 2022 aufgelöst; die frühere Unterfamilie Aurographivirinae war schon vorher zur Familie Autographiviridae hochgestuft worden.

Etymologie[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Der Name der Familie Autographiviridae kommt von griechisch αὐτο-γράφειν (aúto-gráphein, selbst-schreibend) und bezieht darauf, dass diese Phagen ihre eigene RNA-Polymerase kodieren, also selbst-transkribierend sind; dies ist ein gemeinsames Merkmal all ihrer Mitglieder.

Aufbau[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Beschriftete Schemazeichnung eines Virusteilchens von Escherichia-Virus T7 alias Enterobacteria-Phage T7 (Querschnitt und Seitenansicht)

Die Virusteilchen (Virionen) der Autographiviridae sind nicht umhüllt mit ikosaedrischem Kopf-Schwanz-Aufbau und eine Symmetrie (Triangulationszahl) T=7. Der Durchmesser beträgt ca. 60 nm. Das Genom ist linear und hat eine Länge von ca. 40–42 kb.[3]

Vermehrungszyklus[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Die Virusreplikation geschieht im Zytoplasma. Das Virus tritt durch Lyse (Auflösung) der Wirtszelle vermöge Holin-, Endolysin- bzw. Spanin-Proteinen aus dieser aus. Die Übertragung geschieht durch passive Diffusion.[3]

Systematik[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Die folgende Liste führt die Spezies in der Familie Autographiviridae auf gemäß der ICTV Master Species List (MSL) #37 v2:[1]

Familie Autographiviridae (veraltet: Autographivirinae, T7-Supergruppe). Morphotyp: Podoviren

00 Unterfamilie Beijerinckvirinae
TEM-Aufnahem eines Virions des Acinetobacter-Phagen SH-Ab 15519[6]
  • Gattung Daemvirus (21 Spezies)
    • Spezies Acinetobacter-Virus Acibel007 (wiss. Daemvirus acibel007)
  • Gattung Friunavirus (veraltet Fri1virus)
    • Spezies Acinetobacter-Virus AB3 (wiss. Friunavirus AB3)
    • Spezies Acinetobacter-Virus Abp1 (wiss. Friunavirus Abp1)
    • Spezies Acinetobacter-Virus Fri1 (wiss. Friunavirus Fri1)
    • Spezies Acinetobacter-Virus IME200 (wiss. Friunavirus IME200)
    • Spezies Acinetobacter-Virus PD6A3 (wiss. Friunavirus PD6A3)
    • Spezies Acinetobacter-Virus PDAB9 (wiss. Friunavirus PDAB9)
    • Spezies Acinetobacter-Virus phiAB1 (wiss. Friunavirus AB1)
    • Spezies Acinetobacter-Virus SH-Ab 15519 (wiss. Friunavirus fv15519), mit Acinetobacter-Phage Ab124 und Acinetobacter-Phage SH-Ab 15519[6][7]
  • Gattung Pettyvirus
    • Spezies Acinetobacter-Virus Petty (wiss. Pettyvirus petty)
00 Unterfamilie Colwellvirinae
  • Gattung Gutovirus
    • Spezies Vibrio-Virus Vc1 (wiss. Gutovirus Vc1)
  • Gattung Kaohsiungvirus (3 Spezies)
    • Spezies Vibrio-Virus A318 (wiss. Kaohsiungvirus A318)
  • Gattung Murciavirus (2 Spezies)
    • Spezies Marinomonas-Virus CB5A (wiss. Murciavirus CB5A)
  • Gattung Trungvirus
    • Spezies Vibrio-Virus VEN (wiss. Trungvirus VEN)
  • Gattung Uliginvirus (5 Spezies)
    • Spezies Pseudomonas-Virus uligo (wiss. Uliginvirus uligo)
00 Unterfamilie Corkvirinae
  • Gattung Kantovirus
    • Spezies Pseudomonas-Virus C171 (wiss. Kantovirus C171)
  • Gattung Kotilavirus (3 Spezies)
    • Spezies Pectobacterium-Virus PP16 (wiss. Kotilavirus PP16)
  • Gattung Phimunavirus (12 Spezies)
    • Spezies Pectobacterium-Virus fM1 (wiss. Phimunavirus fM1)
  • Gattung Stompvirus
    • Spezies Dickeya-Virus BF25-12 (wiss. Stompvirus BF2512)
00 Unterfamilie Krylovirinae
  • Gattung Kirikabuvirus
    • Spezies Pseudomonas-Virus NV3 (wiss. Kirikabuvirus NV3)
  • Gattung Phikmvvirus (veraltet Phikmvlikevirus, PhiKMV-like viruses, PhiKMV-ähnliche Viren; 16 Spezies)[8]
    • Spezies Pseudomonas-Virus LKD16 (wiss. Phikmvvirus LKD16)
    • Spezies Pseudomonas-Virus phiKMV (wiss. Phikmvvirus phiKMV, mit Pseudomonas-Phage phiKMV)
  • Gattung Stubburvirus
    • Spezies Pseudomonas-Virus LKA1 (wiss. Stubburvirus LKA1, mit Pseudomonas-Phage LKA1)
  • Gattung Tunggulvirus (ICTV-Fehlschreibung Tunggulviirus korrigiert nach den ICTV-Regeln für Gattungsnamen)
    • Spezies Pseudomonas-Virus f2 (wiss. Tunggulviirus f2)
00 Unterfamilie Melnykvirinae
  • Gattung Aerosvirus
    • Spezies Aeromonas-Virus AS7 (wiss. Aerosvirus AS7, mit Aeromonas-Phage phiAS7)[9]
  • Gattung Aghbyvirus
    • Spezies Yersinia-Virus ISAO8 (wiss. Aghbyvirus ISAO8)
  • Gattung Ahphunavirus
    • Spezies Aeromonas-Virus Ahp1 (wiss. Ahphunavirus Ahp1)
  • Gattung Cronosvirus
    • Spezies Cronobacter-Virus GAP227 (wiss. Cronosvirus GAP227, mit Cronobacter-sakazakii-Phage vB_CsaP_GAP227)[9]
  • Gattung Panjvirus
    • Spezies Salmonella-Virus Spp16 (wiss. Panjvirus Spp16, mit Salmonella-Phage vB_SpuP_Spp16)
  • Gattung Pienvirus
    • Spezies Yersinia-Virus R8-01 (wiss. Pienvirus R801, mit Yersinia-Phage ϕR8-01)[9]
  • Gattung Pokrovskaiavirus
    • Spezies Yersinia-Virus Phi80-18 (wiss. Pokrovskaiavirus pv8018, mit Yersinia-Phage ϕ80-18)[9]
  • Gattung Wanjuvirus
    • Spezies Pectobacterium-Virus PP2 (wiss. Wanjuvirus PP2)
    • Spezies Pectobacterium-Virus Arno160 (wiss. Wanjuvirus arno160)
00 Unterfamilie Molineuxvirinae
  • Gattung Acadevirus (4 Spezies)
    • Spezies Proteus-Virus PM85 (wiss. Acadevirus PM85)
  • Gattung Axomammavirus
    • Spezies Pectobacterium-Virus PP1 (wiss. Axomammavirus PP1)
  • Gattung Eracentumvirus (2 Spezies)
    • Spezies Erwinia-Virus Era103 (wiss. Eracentumvirus era103, mit Erwinia-amylovora-Phage Era103)
  • Gattung Tuodvirus
    • Spezies Lelliottia-Virus phD2B (wiss. Tuodvirus phD2B)
  • Gattung Vectrevirus (11 Spezies)
    • Spezies Escherichia-Virus VEc3 (wiss. Vectrevirus VEc3)
    • Spezies Escherichia-Virus K1-5 (wiss. Vectrevirus K15, mit Enterobacteria-Phage K1-5)
    • Spezies Escherichia-Virus K1E (wiss. Vectrevirus K1E, mit Enterobacteria-Phage K1E)
  • Gattung Zindervirus (veraltet Sp6virus, Sp6likevirus, SP6-ähnliche Viren)[10]
    • Spezies Salmonella-Virus BP12B (wiss. Zindervirus BP12B)
    • Spezies Salmonella-Virus SP6 (wiss. Zindervirus SP6, mit Enterobacteria-Phage SP6)
    • Spezies Escherichia-Virus UAB78 (wiss. Zindervirus UAB78)
    • Spezies „Escherichia-Virus K5“ (wiss. „Escherichia virus K5“, vom ICTV ausgelistet wg. unzulänglichen Genom-Daten)
00 Unterfamilie Okabevirinae
  • Gattung Ampunavirus
    • Spezies Burkholderia-Virus BpAMP1 (wiss. Ampunavirus BpAMP1)
  • Gattung Higashivirus
    • Spezies Ralstonia-Virus RSB1 (wiss. Higashivirus RSB1)
  • Gattung Mguuvirus
    • Spezies Burkholderia-Virus JG068 (wiss. Mguuvirus JG068)
  • Gattung Risjevirus
    • Spezies Ralstonia-Virus RSJ2 (wiss. Risjevirus RSJ2)
  • Gattung Sukuvirus
    • Spezies Ralstonia-Virus RSPII1 (wiss. Sukuvirus RSPII1)
00 Unterfamilie Slopekvirinae
  • Gattung Bucovirus
    • Spezies Shigella-Virus Buco (wiss. Bucovirus buco)
  • Gattung Drulisvirus (veraltet Kp34virus)
    • Spezies Klebsiella-Virus F19 (wiss. Drulisvirus F19)
    • Spezies Klebsiella-Virus K244 (wiss. Drulisvirus K244)
    • Spezies Klebsiella-Virus Kp2 (wiss. Drulisvirus Kp2)
    • Spezies Klebsiella-Virus KP34 (wiss. Drulisvirus KP34)
    • Spezies Klebsiella-Virus KpV41 (wiss. Drulisvirus KpV41)
    • Spezies Klebsiella-Virus KpV71 (wiss. Drulisvirus KpV71)
    • Spezies Klebsiella-Virus KpV475 (wiss. Drulisvirus KpV475)
    • Spezies Klebsiella-Virus SU503 (wiss. Drulisvirus SU503)
    • Spezies Klebsiella-Virus SU552A (wiss. Drulisvirus SU552A)
  • Gattung Koutsourovirus
    • Spezies Enterobacter-Virus KDA1 (wiss. Koutsourovirus KDA1)
  • Gattung Novosibovirus
    • Spezies Proteus-Virus PM16 (wiss. Novosibovirus PM16)
00 Unterfamilie Studiervirinae
  • Gattung Aarhusvirus
    • Spezies Dickeya-Virus Dagda (wiss. Aarhusvirus dagda)
  • Gattung Apdecimavirus
    • Spezies Yersinia-Virus AP10 (wiss. Apdecimavirus AP10)
  • Gattung Berlinvirus
    • Spezies Kluyvera-Virus Kvp1 (wiss. Berlinvirus Kvp1, mit Kluyvera-Phage Kvp1)
    • Spezies Yersinia-Virus Berlin (wiss. Berlinvirus berlin)
  • Gattung Caroctavirus
    • Spezies Citrobacter-Virus CR8 (wiss. Caroctavirus CR8)
  • Gattung Chatterjeevirus
    • Spezies Vibrio-Virus N4 (wiss. Chatterjeevirus N4)
  • Gattung Eapunavirus
    • Spezies Enterobacter-Virus Eap1 (wiss. Eapunavirus Eap1)
  • Gattung Elunavirus
    • Spezies Erwinia-Virus L1 (wiss. Elunavirus L1, mit Erwinia-Phage vB_EamP-L1)[11]
    • Spezies „Pantoea-Phage vB_PagP-SK1“ en. „Pantoea agglomerans phage vB_PagP-SK1“ („vB_PagP-SK1“)[11]
  • Gattung Foetvirus
    • Spezies Escherichia-Virus SRT7 (wiss. Foetvirus SRT7)
TEM-Aufnahme von Virionen der Spezies Pseudomonas-Virus gh1
  • Gattung Ghunavirus
    • Spezies Pseudomonas-Virus gh1 (wiss. Ghunavirus gh1, mit Pseudomonas-Phage gh-1)
  • Gattung Helsettvirus
    • Spezies Yersinia-Virus fPS9 (wiss. Helsettvirus fPS9)
  • Gattung Jarilovirus
    • Spezies Pectobacterium-Virus Jarilo (wiss. Jarilovirus jarilo)
  • Gattung Kayfunavirus
    • Spezies Escherichia-Virus K1F (wiss. Kayfunavirus K1F)
  • Gattung Minipunavirus
    • Spezies Morganella-Virus MmP1 (wiss. Minipunavirus MmP1)
  • Gattung Ningirsuvirus
    • Spezies Dickeya-Virus Ninurta (wiss. Ningirsuvirus ninurta)
  • Gattung Pektosvirus
    • Spezies Pectobacterium-Virus PP81 (wiss. Pektosvirus PP81)
  • Gattung Phutvirus
    • Spezies Pseudomonas-Virus PPpW4 (wiss. Phutvirus PPpW4)
  • Gattung Pifdecavirus
    • Spezies Pseudomonas-Virus Pf10 (wiss. Pifdecavirus Pf10)
  • Gattung Pijolavirus
    • Spezies Pseudomonas-Virus PspYZU08 (wiss. Pijolavirus PspYZU08)
  • Gattung Przondovirus (veraltet Kp32virus)
    • Spezies Escherichia-Virus K30 (wiss. Przondovirus K30)
    • Spezies Klebsiella-Virus K5 (wiss. Przondovirus K5)
    • Spezies Klebsiella-Virus K11 (wiss. Przondovirus K11)
    • Spezies Klebsiella-Virus Kp1 (wiss. Przondovirus Kp1)
    • Spezies Klebsiella-Virus KP32 (wiss. Przondovirus KP32)
    • Spezies Klebsiella-Virus KpV289 (wiss. Przondovirus KpV289)
  • Gattung Teetrevirus
    • Spezies Escherichia-Virus T3 (wiss. Teetrevirus T3)
TEM-Aufnahme eines Virions der Gattung Teseptimavirus
  • Gattung Teseptimavirus (veraltet T7virus, T7likevirus, T7-ähnliche Viren) – Kandidaten (Vorschläge nach NCBI, wo nicht anders vermerkt)[12][13]
    • Spezies Escherichia-Virus T7 (wiss. Teseptimavirus T7, mit Enterobacteria-Phage T7)
    • Spezies Escherichia-Virus 13a (wiss. Teseptimavirus 13a)
    • Spezies Escherichia-Virus 64795ec1 (wiss. Teseptimavirus tv64795ec1)
    • Spezies Escherichia-Virus C5 (wiss. Teseptimavirus C5)
    • Spezies Escherichia-Virus CICC80001 (wiss. Teseptimavirus CICC80001)
    • Spezies Escherichia-Virus Ebrios (wiss. Teseptimavirus ebrios)
    • Spezies Escherichia-Virus EG1 (wiss. Teseptimavirus EG1)
    • Spezies Escherichia-Virus HZ2R8 (wiss. Teseptimavirus HZ2R8)
    • Spezies Escherichia-Virus HZP2 (wiss. Teseptimavirus HZP2)
    • Spezies Enterobacteria-Virus IME390 (wiss. Teseptimavirus IME390, mit Escherichia-Phage vB_EcoP_PHB20)
    • Spezies Escherichia-Virus N30 (wiss. Teseptimavirus N30)
    • Spezies Escherichia-Virus NCA (wiss. Teseptimavirus NCA)
    • Spezies Escherichia-Virus T7 (wiss. Teseptimavirus T7)
    • Spezies Salmonella-Virus 3A8767 (wiss. Teseptimavirus tv3A8767)
    • Spezies Salmonella-Virus Vi06 (wiss. Teseptimavirus Vi06)
    • Spezies Stenotrophomonas-Virus IME15 (wiss. Teseptimavirus IME15, mit Aeromonas-Phage PZL-Ah1)
    • Spezies Yersinia-Virus YpPY (wiss. Teseptimavirus YpPY)
    • Spezies Yersinia-Virus YpsPG (wiss. Teseptimavirus YpsPG)
    • Spezies „Teseptimavirus S2B“
    • Spezies Escherichia-Phage 13a (wiss. Teseptimavirus 13a)
    • Spezies „Enterobacteria-Phage W31“ (en. „Phage W31“)
    • Spezies „Enterococcus-Phage EFA-2“ (en. „Enterococcus phage EFA-2“)
    • Spezies „Escherichia-Phage JB01“ (en. „Escherichia phage JB01“)
    • Spezies „Escherichia-Phage N13“ (en. „Escherichia phage N13“)
    • Spezies „Bacteriophage PhiI“ (alias „Phage PhiI“)[14]
    • Spezies „Prochlorococcus-Virus 4f“ (en. „Prochlorococcus virus 4f“)
    • Spezies „Prochlorococcus-Virus 5e“ (en. „Prochlorococcus virus 5e“)
    • Spezies „Prochlorococcus-Virus 5f“ (en. „Prochlorococcus virus 5f“)
    • Spezies „Prochlorococcus-Virus 6b“ (en. „Prochlorococcus virus 6b“)
    • Spezies „Prochlorococcus-Virus 6ed6p“ (en. „Prochlorococcus virus 6ed6p“)
    • Spezies „Prochlorococcus-Virus 7g“ (en. „Prochlorococcus virus 7g“)
    • Spezies „Prochlorococcus-Virus d67f2“ (en. „Prochlorococcus virus d67f2“)
    • Spezies „Pseudomonas-Phage phiPLS27“ (en. „Pseudomonas phage phiPLS27“)
    • Spezies „Pseudomonas-Virus Pf1 ERZ-2017“ (en. „Pseudomonas virus Pf1 ERZ-2017“)
    • Spezies „Salmonella-Phage C2“ (en. „Salmonella phage C2“)
    • Spezies „Serratia-Phage Pila“ (en. „Serratia phage Pila“)[15]
    • Spezies „Synechococcus-Virus 11bc6“ (en. „Synechococcus virus 11bc6“)
    • Spezies „Synechococcus-Virus 11ec6“ (en. „Synechococcus virus 11ec6“)
    • Spezies „Synechococcus-Virus 2fc6“ (en. „Synechococcus virus 2fc6“)
    • Spezies „Synechococcus-Virus 4dc“ (en. „Synechococcus virus 4dc“)
    • Spezies „Synechococcus-Virus 5gcp“ (en. „Synechococcus virus 5gcp“)
    • Spezies „Synechococcus-Virus 6bc6“ (en. „Synechococcus virus 6bc6“)
    • Spezies „Synechococcus-Virus 7dc6“ (en. „Synechococcus virus 7dc6“)
    • Spezies „Synechococcus-Virus 9ec6“ (en. „Synechococcus virus 9ec6“)
    • Spezies „Synechococcus-Virus 9ecp“ (en. „Synechococcus virus 9ecp“)
    • Spezies „Synechococcus-Virus c7e4“ (en. „Synechococcus virus c7e4“)
    • Spezies „T7-like bacteriophage Eptesicus fuscus/P1/IT/USA/2009“
    • Spezies „Yersinia-Phage phiA1122“ (en. „Yersinia phage phiA1122“! „Yersinia pestis bacteriophage phiA1122“)
    • Spezies „Yersinia-Phage phiR3“ (en. „Yersinia phage phiR3“, „Yersinia enterocolitica bacteriophage phiR3“)
    • Spezies „Yersinia-Phage R“ (en. „Yersinia phage R“, „Yersinia pestis phage R“)
    • Spezies „Yersinia-Phage Y“ (en. „Yersinia phage Y“, „Yersinia pestis bacteriophage Y“)
    • Spezies „Yersinia-Phage YpP-R“ (en. „Yersinia phage YpP-R“)
  • Gattung Troedvirus
    • Spezies Pseudomonas-Virus Phi15 (wiss. Troedvirus Phi15)
  • Gattung Unyawovirus
    • Spezies Pectobacterium-Virus DUPPII (wiss. Unyawovirus DUPPII)
00 Unterfamilie nicht bestimmt:
  • Gattung Aegirvirus
    • Spezies Synechococcus-Virus SCBP42 (wiss. Aegirvirus SCBP42)
  • Gattung Aqualcavirus
    • Spezies Aquamicrobium-Virus P14 (wiss. Aqualcavirus P14)
  • Gattung Ashivirus
    • Spezies Ashivirus S45C4, mit Phage MedDCM-OCT-S45-C4
    • Spezies „Synechococcus-Phage S-SBP1“ (alias „Cyanopodovirus S-SBP1“, Wirt Synechococcus-Stamm WH7803)[16][17]
  • Gattung Atuphduovirus
    • Spezies Agrobacterium-Virus Atuph02 (wiss. Atuphduovirus atuph02)
    • Spezies Agrobacterium-Virus Atuph03 (wiss. Atuphduovirus atuph03)
  • Gattung Ayakvirus
    • Spezies Ralstonia-Virus Ap1 (wiss. Ayakvirus Ap1)
  • Gattung Ayaqvirus
    • Spezies Ayaqvirus S45C18, mit Phage MedDCM-OCT-S45-C18
  • Gattung Banchanvirus
    • Spezies Prochlorococcus-Virus SS120-1 (wiss. Banchanvirus SS1201)
  • Gattung Bifseptvirus
    • Spezies Pseudomonas-Virus Bf7 (wiss. Bifseptvirus Bf7)
  • Gattung Bonnellvirus
    • Spezies Escherichia-Virus J8-65 (wiss. Bonnellvirus J865)
    • Spezies Escherichia-Virus Lidtsur (wiss. Bonnellvirus lidtsur)
  • Gattung Cheungvirus
    • Spezies Prochlorococcus-Virus NATL1A7 (wiss. Cheungvirus NATL1A7)
  • Gattung Chosvirus
    • Spezies Chosvirus KM23C739, mit Phage Deep1-GF2-KM23-C739
  • Gattung Cuernavacavirus
    • Spezies Rhizobium-Virus RHEph02 (wiss. Cuernavacavirus RHEph02)
    • Spezies Rhizobium-Virus RHEph08 (wiss. Cuernavacavirus RHEph08)
    • Spezies Rhizobium-Virus RHEph09 (wiss. Cuernavacavirus RHEph09)
  • Gattung Cyclitvirus
  • Spezies Vibrio-Virus Cyclit (wiss. Cyclitvirus cyclit)
  • Gattung Ermolevavirus
    • Spezies Escherichia-Virus PhiKT (wiss. Ermolevavirus PhiKT)
  • Gattung Foturvirus
    • Spezies Alteromonas-Virus vB_AspP-H4/4 (wiss. Alteromonas virus vB_AspP-H4/4)
  • Gattung Foussvirus
    • Spezies Foussvirus S46C10, mit Phage MedDCM-OCT-S46-C10
  • Gattung Fussvirus
    • Spezies Fussvirus S30C28, mit Phage MedDCM-OCT-S30-C28
  • Gattung Gajwadongvirus
    • Spezies Escherichia-Virus ECBP5 (wiss. Gajwadongvirus ECBP5)
    • Spezies Pectobacterium-Virus PP99 (wiss. Gajwadongvirus PP99)
  • Gattung Gyeongsanvirus
    • Spezies Ralstonia-Virus DURPI (wiss. Gyeongsanvirus DURPI)
    • Spezies Ralstonia-Virus RsoP1EGY (wiss. Gyeongsanvirus RsoP1EGY)
  • Gattung Igirivirus
    • Spezies Synechococcus-Virus STIP37 (wiss. Igirivirus STIP37, mit Synechococcus T7-like phage S-TIP37)
  • Gattung Jalkavirus
    • Spezies Jalkavirus S08C159, mit Phage MedDCM-OCT-S08-C159
  • Gattung Jiaoyazivirus
    • Spezies Ralstonia-Virus RSB3 (wiss. Jiaoyazivirus RSB3)
  • Gattung Kafavirus
    • Spezies Kafavirus SWcelC56 (früher Kawavirus SWcelC56), mit Phage MedPE-SWcel-C56
  • Gattung Kajamvirus
    • Spezies Synechococcus-Virus SRIP1 (wiss. Kajamvirus SRIP1)
  • Gattung Kakivirus
    • Spezies Providencia-Virus PS3 (wiss. Kakivirus PS3)
  • Gattung Kalppathivirus
    • Spezies Curvibacter-Virus P26059B (wiss. Kalppathivirus P26059B)
  • Gattung Kelmasvirus
    • Spezies Ralstonia-Virus RSB2 (wiss. Kelmasvirus RSB2)
  • Gattung Kembevirus
    • Spezies Synechococcus-Virus SCBP2 (wiss. Kembevirus SCBP2)
  • Gattung Krakvirus
    • Spezies Krakvirus S39C11, mit Phage MedDCM-OCT-S39-C11
  • Gattung Lauvirus
    • Spezies Lauvirus lau218 (früher Podovirus Lau218)
  • Gattung Limelightvirus
    • Spezies Pantoea-Virus Limelight (wiss. Limelightvirus limelight, mit Pantoea-Phage LIMElight)
  • Gattung Lingvirus
    • Spezies Prochlorococcus-Virus PGSP1 (wiss. Lingvirus PGSP1)
  • Gattung Lirvirus
    • Spezies Synechococcus-Virus SCBP3 (wiss. Lirvirus SCBP3)
  • Gattung Lullwatervirus
    • Spezies Caulobacter-Virus Lullwater (wiss. Lullwatervirus lullwater)
  • Gattung Maculvirus
    • Spezies Vibrio-Virus OWB (wiss. Maculvirus OWB)
  • Gattung Napahaivirus
    • Spezies Pseudomonas-Virus VSW3 (wiss. Napahaivirus VSW3)
  • Gattung Nohivirus
    • Spezies Nohivirus S31C1, mit Phage MedDCM-OCT-S31-C1
  • Gattung Oinezvirus
    • Spezies Oinezvirus S37C6, mit Phage MedDCM-OCT-S37-C6
  • Gattung Paadamvirus
    • Spezies Rhizobium-Virus RHEph01 (wiss. Paadamvirus RHEph01)
  • Gattung Pagavirus
    • Spezies Pagavirus S05C849, mit Phage MedDCM-OCT-S05-C849
  • Gattung Pairvirus
    • Spezies Mesorhizobium-Virus Lo5R7ANS (wiss. Pairvirus Lo5R7ANS)
  • Gattung Pedosvirus
    • Spezies Pedosvirus S28C3, mit Phage MedDCM-OCT-S28-C3
  • Gattung Pekhitvirus
    • Spezies Pekhitvirus S04C24, mit Phage MedDCM-OCT-S04-C24
  • Gattung Pelagivirus
    • Spezies Pelagibacter-Virus HTVC019P (wiss. Pelagivirus HTVC019P)
    • Spezies Pelagivirus S35C6, mit Phage MedDCM-OCT-S35-C6
  • Gattung Percyvirus
    • Spezies Caulobacter-Virus Percy (wiss. Percyvirus percy)
  • Gattung Piedvirus
    • Spezies Delftia-Virus IMEDE1 (wiss. Piedvirus IMEDE1)
  • Gattung Podivirus
    • Spezies Podivirus S05C243, mit Phage MedDCM-OCT-S05-C243
  • Gattung Pollyceevirus
    • Spezies Pseudomonas-Virus PollyC (wiss. Pollyceevirus pollyC)
  • Gattung Poseidonvirus
    • Spezies Synechococcus-Virus SCBP4 (wiss. Poseidonvirus SCBP4, mit Synechococcus-Phage S-CBP4)
  • Gattung Powvirus
    • Spezies Powvirus S08C41, mit Phage MedDCM-OCT-S08-C41
  • Gattung Pradovirus
    • Spezies Xanthomonas-Virus f20 (wiss. Pradovirus f20)
    • Spezies Xanthomonas-Virus f30 (wiss. Pradovirus f30)
    • Spezies Xanthomonas-Virus XAJ24 (wiss. Pradovirus XAJ24)
    • Spezies Xanthomonas-Virus Xc10 (wiss. Pradovirus Xc10)
    • Spezies Xylella-Virus Prado (wiss. Pradovirus prado)
  • Gattung Qadamvirus
    • Spezies Synechococcus-Virus SB28 (wiss. Qadamvirus SB28)
  • Gattung Scottvirus
    • Spezies Sphingomonas-Virus Scott (wiss. Scottvirus scott)
  • Gattung Sednavirus
    • Spezies Synechococcus-Virus SRIP2 (wiss. Sednavirus SRIP2, veraltet Cyanopodovirus S-RIP2, mit Synechococcus-Phage S-RIP2 alias Cyanophage S-RIP2, und Cyanophage KBS-P-1A)[16][18]
  • Gattung Serkorvirus
    • Spezies Ralstonia-Virus ITL1 (wiss. Serkorvirus ITL1)
  • Gattung Sieqvirus
    • Spezies Sieqvirus S42C7, mit Phage MedDCM-OCT-S42-C7
  • Gattung Stompelvirus
    • Spezies Ralstonia-Virus RPSC1 (wiss. Stompelvirus RPSC1)
  • Gattung Stopalavirus
    • Spezies Stopalavirus S38C3, mit Phage MedDCM-OCT-S38-C3
  • Gattung Stopavirus
    • Spezies Pelagibacter-Virus HTVC011P (wiss. Stopavirus HTVC011P)
  • Gattung Stupnyavirus
    • Spezies Stupnyavirus KM16C193, mit Phage Deep-GF0-KM16-C193
  • Gattung Tangaroavirus
    • Spezies Prochlorococcus-Virus NATL2A133 (wiss. Tangaroavirus NATL2A133)
    • Spezies Prochlorococcus-Virus PSSP10 (wiss. Tangaroavirus PSSP10)
    • Spezies Prochlorococcus-Virus 951510a (wiss. Tangaroavirus tv951510a, mit Prochlorococcus phage P-SSP6 und Cyanophage 9515-10a)
  • Gattung Tawavirus
    • Spezies Vibrio-Virus JSF7 (wiss. Tawavirus JSF7)
Adsorption von P-SSP7-Phagen an Prochlorococcus marinus MED4, visualisiert durch Kryo-ET.
  • Gattung Tiamatvirus
    • Spezies Prochlorococcus-Virus PSSP7 (wiss. Tiamatvirus PSSP7, früher Cyanopodovirus PSSP7 oder Cyanopodovirus P-SSP7, mit Prochlorococcus-Phage P-SSP7, Wirt Prochlorococcus-Stamm MED4)[16][19][20][21] – früher zur informellen Gattung Cyanopodovirus
  • Gattung Tiilvirus
    • Spezies Synechococcus-Virus P60 (wiss. Tiilvirus P60, mit Synechococcus-Phage P60)[22][23][24]
  • Gattung Tritonvirus
    • Spezies Synechococcus-Virus PSSP2 (wiss. Tritonvirus PSSP2, mit Synechococcus-Phage P-SSP2 alias Cyanophage P-SSP2)
    • Spezies Prochlorococcus-Virus PSSP3 (wiss. Tritonvirus PSSP3, mit Prochlorococcus-Phage P-SSP3 alias Cyanophage P-SSP3)
  • Gattung Voetvirus
    • Spezies Synechococcus-Virus Syn5 (wiss. Voetvirus syn5, mit Synechococcus-Phage syn5 alias Cyanophage Syn5)[25][26][21][27]
  • Gattung Votkovvirus
    • Spezies Votkovvirus S28C10, mit Phage MedDCM-OCT-S28-C10
  • Gattung Waewaevirus
    • Spezies Pantoea-Virus Limezero (wiss. Waewaevirus limezero, mit Pantoea-Phage LIMEzero)
  • Gattung Wuhanvirus (wohl zu unterscheiden von SARS-CoV-2, dem Erreger von COVID-19)
    • Spezies Pasteurella-Virus PHB01 (wiss. Wuhanvirus PHB01)
    • Spezies Pasteurella-Virus PHB02 (wiss. Wuhanvirus PHB02)

Anmerkung: Die Cyanophagen vom Morphotyp der Myoviren werden in überkommener Weise in einer informellen Gattung Cyanopodovirus zusammengefasst. Viele deavon werden wegen genomischer Ähnlichkeit zu Escherichia-Virus T7 inzwischen zu den Autographiviridae, insbesondere der Unterfamilie Studiervirinae um T7 gestellt.[28][29]

Weblinks[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Einzelnachweise[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

  1. ↑ a b ICTV: ICTV Master Species List 2021.v2, New MSL including some corrections.
  2. ↑ a b c ICTV: ICTV Taxonomy history: Enterobacteria phage T4, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  3. ↑ a b c Viral Zone. ExPASy, abgerufen am 29. Dezember 2018.
  4. ↑ ICTV: Virus Taxonomy. Abgerufen am 29. Dezember 2018.
  5. ↑ D. Scholl, J. Kieleczawa, P. Kemp, J. Rush, C. C. Richardson, C. Merril, S. Adhya, I. J. Molineux: Genomic analysis of bacteriophages SP6 and K1-5, an estranged subgroup of the T7 supergroup. In: Journal of Molecular Biology. Band 335, Nr. 5, 2004, S. 1151–1171, doi:10.1016/j.jmb.2003.11.035, PMID 14729334.
  6. ↑ a b Yunfen Hua, Tingting Luo, Yiqi Yang, Dong Dong, Rui Wang, Yanjun Wang, Mengsha Xu, Xiaokui Guo, Fupin Hu, Ping He: Phage Therapy as a Promising New Treatment for Lung Infection Caused by Carbapenem-Resistant Acinetobacter baumannii in Mice, in: Front. Microbiol., 9. Januar 2018; doi:10.3389/fmicb.2017.02659
  7. ↑ Natalia Bagińska, Anna Pichlak, Andrzej Górski1, Ewa Jończyk-Matysiak: Specific and Selective Bacteriophages in the Fight against Multidrug-resistant Acinetobacter baumannii (PDF) in: Virologica Sinica, Band 34, S. 347–357; doi:10.1007/s12250-019-00125-0, Tbl. 1
  8. ↑ SIB: Phikmvvirus. Auf: ViralZone.
  9. ↑ a b c d R. Abbasifar, A. M. Kropinski, P. M. Sabour, H. W. Ackermann, A. Alanis Villa, A. Abbasifar, M. W. Griffiths: The Genome of Cronobacter sakazakii Bacteriophage vB_CsaP_GAP227 Suggests a New Genus within the Autographivirinae. In: Genome Announc. Band 1, Nr. 1, 2013, doi:10.1128/genomeA.00122-12, PMID 23409275, PMC 3569369 (freier Volltext).
  10. ↑ SIB: Zindervirus. Auf: ViralZone.
  11. ↑ a b Mary Ann Liebert: New bacteriophage fully characterized and sequenced, auf: EurekAlert vom 27. Januar 2020, Quelle: Inc./Genetic Engineering News
  12. ↑ NCBI: unclassified Teseptimavirus
  13. ↑ SIB: Teseptimavirus. Auf: ViralZone.
  14. ↑ NCBI: Phage PhiI (species)
  15. ↑ NCBI: Serratia phage Pila (species)
  16. ↑ a b c Sijun Huang et al.: Temporal transcriptomes of a marine cyanopodovirus and its Synechococcus host during infection, in: MicrobiologyOpen, 30. Dezember 2020, doi:10.1002/mbo3.1150
  17. ↑ NCBI: Synechococcus phage S-SBP1 (species)
  18. ↑ NCBI: Sednavirus SRIP2 (species)
  19. ↑ John H. Paul, Matthew B. Sullivan: Marine phage genomics: what have we learned? In: Curr. Op. in Biotechnology, Band 16, Nr. 3, Juni 2005, S. 299–307, doi:10.1016/j.copbio.2005.03.007, PMID 15961031, PMC 15961031 (freier Volltext), siehe Fig. 3 (Genomkarte)
  20. ↑ NCBI: Prochlorococcus virus PSSP7 (species)
  21. ↑ a b Preeti Gipson, Matthew L. Baker, Desislava Raytcheva, Cameron Haase-Pettingell, Jacqueline Piret, Jonathan A. King, Wah Chiu: Protruding knob-like proteins violate local symmetries in an icosahedral marine virus. In: Nature Communications. 5. Jahrgang, Nr. 4278, 2. Juli 2014, doi:10.1038/ncomms5278 (englisch, nature.com)., Corrigendum, in: Nature Communications, Band 6, Nr. 6040, 12. Januar 2015, doi:10.1038/ncomms7040.
  22. ↑ NCBI: Synechococcus virus P60 (species)
  23. ↑ John H. Paul, Matthew B. Sullivan: Marine phage genomics: what have we learned?, Curr. Op. in Biotechnology Band 16, Nr. 3, Juni 2005, S. 299–307, doi:10.1016/j.copbio.2005.03.007, PMID 15961031, PMC 15961031 (freier Volltext), siehe Fig. 1 (Genomkarte)
  24. ↑ Jacqueline Z.-M. Chan, Andrew D. Millard, Nicholas H. Mann, Hendrik Schäfer: Comparative genomics defines the core genome of the growing N4-like phage genus and identifies N4-like Roseophage specific genes (PDF; 3,9 MB) In: Frontiers in Microbiology, Band 5, Nr. 506, 10. Oktober 2014, doi:10.3389/fmicb.2014.00506
  25. ↑ NCBI: Synechococcus virus Syn5 (species)
  26. ↑ Desislava A. Raytcheva, Cameron Haase-Pettingell, Jacqueline Piret, Jonathan A. King: Two Novel Proteins of Cyanophage Syn5 Compose Its Unusual Horn Structure. In: ASM Journal of Virology. 88. Jahrgang, Nr. 4, 15. Februar 2014, ISSN 0022-538X, S. 2047–2055, doi:10.1128/JVI.02479-13, PMID 24307583, PMC 3911526 (freier Volltext) – (englisch, jvi.asm.org (Memento des Originals vom 11. Mai 2021 im Internet Archive) [abgerufen am 11. Mai 2021]).  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/jvi.asm.org Epub 31. Januar 2014, insbes. Fig. 1 (Memento des Originals vom 11. Mai 2021 im Internet Archive)  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/jvi.asm.org (mit B: Schemazeichnung)
  27. ↑ Desislava A. Raytcheva, Cameron Haase-Pettingell, Jacqueline Piret, Jonathan A. King: Two Novel Proteins of Cyanophage Syn5 Compose Its Unusual Horn Structure, in: ASM Journals / Journal of Virology, Band 88, Nr. 4, 31. Januar 2014, doi:10.1128/JVI.02479-13
  28. ↑ S. J. Labrie, K. Frois-Moniz, M. S. Osburne, L. Kelly, S. E. Roggensack, M. B. Sullivan, G. Gearin, Q. Zeng, M. Fitzgerald, M. R. Henn, S. W. Chisholm: Genomes of marine cyanopodoviruses reveal multiple origins of diversity. In: Environ. Microbiol. Band 15, Nr. 5, 2013, S. 1356–1376, doi:10.1111/1462-2920.12053, PMID 23320838 (mit.edu [PDF]).
  29. ↑ Stephen T. Abedon, Richard Calendar (Hrsg.): The Bacteriophages. 2. Auflage. Oxford University Press, 2005, ISBN 0-19-803385-0, S. 518f. (books.google.de)
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