PSI Protein Classifier

PSI Protein Classifier ist ein Computerprogram welches die Ergebnisse der sowohl sukzessiven, als auch der unabhängigen Iterationen des PSI-BLAST-Computerprogramms zusammen fässt. Eine iterative Suche zeigt mögliche evolutionäre Verhältnisse innerhalb Proteinfamilien an und teilt sie in Unterfamilien auf. Mit PSI Protein Classifier lassen sich evolutionäre Abstände zwischen homologen Proteinen über die Anzahl der Iterationen bestimmen.

Weblinks

• PSI Protein Classifier
• D.G. Naumoff and M. Carreras. PSI Protein Classifier: a new program automating PSI-BLAST search results. Molecular Biology (Engl Transl), 2009, 43(4):652-664. PMID 19807035, PDF