„Inverted Repeat“ – Versionsunterschied

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Ein '''inverted Repeat''' (‚umgekehrte Wiederholung‘) ist eine Nukleotidsequenz am 5'-Ende einer doppelsträngigen Nukleinsäure, die sich am Ende des anderen Strangs in umgekehrter Reihenfolge wiederholt.
 
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== Eigenschaften ==
== Eigenschaften ==
Inverted Repeats werden von manchen [[Viren]] wie [[Retroviren]] zur [[Insertion (Genetik)|Insertion]] des viralen [[Genom]]s in das Genom des [[Wirt (Biologie)|Wirts]] verwendet. Daneben kommen sie bei [[Insertionssequenz]]en vor.<ref>I. Fattash, R. Rooke, A. Wong, C. Hui, T. Luu, P. Bhardwaj, G. Yang: ''Miniature inverted-repeat transposable elements: discovery, distribution, and activity.'' In: ''Genome.'' Band 56, Nummer 9, September 2013, S.&nbsp;475–486, {{DOI|10.1139/gen-2012-0174}}, PMID 24168668.</ref> Weiterhin kommen inverted repeats – allerdings ohne Nukleotide dazwischen – in den [[Palindromische Sequenz|palindromischen Erkennungssequenzen]] von [[Restriktionsendonuklease]]n des Typs II vor. Teilweise kommen inverted Repeats als [[Tandemrepeat]]s in mehrfachen Wiederholungen in einer Nukleotidsequenz vor.
Inverted Repeats werden von manchen [[Viren]] wie [[Retroviren]] zur [[Insertion (Genetik)|Insertion]] des viralen [[Genom]]s in das Genom des [[Wirt (Biologie)|Wirts]] verwendet. Daneben kommen sie bei [[Insertionssequenz]]en, [[Transposon]]s<ref>I. Ammar, Z. Izsvák, Z. Ivics: ''The Sleeping Beauty transposon toolbox.'' In: ''Methods in molecular biology.'' Band 859, 2012, S.&nbsp;229–240, {{DOI|10.1007/978-1-61779-603-6_13}}, PMID 22367875.</ref> und [[Miniature Inverted-repeat Transposable Element]]s<ref>I. Fattash, R. Rooke, A. Wong, C. Hui, T. Luu, P. Bhardwaj, G. Yang: ''Miniature inverted-repeat transposable elements: discovery, distribution, and activity.'' In: ''Genome.'' Band 56, Nummer 9, September 2013, S.&nbsp;475–486, {{DOI|10.1139/gen-2012-0174}}, PMID 24168668.</ref> vor. Weiterhin kommen inverted repeats – allerdings ohne Nukleotide dazwischen – in den [[Palindromische Sequenz|palindromischen Erkennungssequenzen]] von [[Restriktionsendonuklease]]n des Typs II vor. Teilweise kommen inverted Repeats als [[Tandemrepeat]]s in mehrfachen Wiederholungen in einer Nukleotidsequenz vor.


== Einzelnachweise ==
== Einzelnachweise ==

Version vom 20. Juni 2018, 22:22 Uhr

Ein inverted Repeat (‚umgekehrte Wiederholung‘) ist eine Nukleotidsequenz am 5'-Ende einer doppelsträngigen Nukleinsäure, die sich am Ende des anderen Strangs in umgekehrter Reihenfolge wiederholt. Aufgrund der Basenpaarung kommt ein inverted Repeat am Ende desselben Strangs revers komplementär vor.

Eigenschaften

Inverted Repeats werden von manchen Viren wie Retroviren zur Insertion des viralen Genoms in das Genom des Wirts verwendet. Daneben kommen sie bei Insertionssequenzen, Transposons[1] und Miniature Inverted-repeat Transposable Elements[2] vor. Weiterhin kommen inverted repeats – allerdings ohne Nukleotide dazwischen – in den palindromischen Erkennungssequenzen von Restriktionsendonukleasen des Typs II vor. Teilweise kommen inverted Repeats als Tandemrepeats in mehrfachen Wiederholungen in einer Nukleotidsequenz vor.

Einzelnachweise

  1. I. Ammar, Z. Izsvák, Z. Ivics: The Sleeping Beauty transposon toolbox. In: Methods in molecular biology. Band 859, 2012, S. 229–240, doi:10.1007/978-1-61779-603-6_13, PMID 22367875.
  2. I. Fattash, R. Rooke, A. Wong, C. Hui, T. Luu, P. Bhardwaj, G. Yang: Miniature inverted-repeat transposable elements: discovery, distribution, and activity. In: Genome. Band 56, Nummer 9, September 2013, S. 475–486, doi:10.1139/gen-2012-0174, PMID 24168668.