„Marseilleviridae“ – Versionsunterschied

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Version vom 15. Januar 2019, 23:13 Uhr

Marseilleviridae
Systematik
Klassifikation: Viren
Ordnung: ‚Megavirales‘
Familie: Marseilleviridae
Gattung: Marseillevirus
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA zirkulär
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: komplex, ikosaedrisch[1]
Hülle: vorhanden
Wissenschaftlicher Name
Marseillevirus

Die Marseilleviridae sind eine Virusfamilie, die 2012 erstmals beschrieben wurde.[2] Das Genom dieser Viren ist eine doppelsträngige DNA. Die Wirte sind oft Amöben, aber es gibt Hinweise darauf, dass sie auch beim Menschen gefunden werden.[3][4][5][6] Die Typusart wurde ursprünglich zum Mimivirus gruppiert (Familie Mimiviridae), spätere Studien zeigten jedoch, dass nur eine entfernte Verwandtschaft besteht. Mit Stand 2016 erkannte das Internationale Komitee für Taxonomie von Viren (ICTV) vier Spezies in dieser Familie an, die auf zwei Gattungen aufgeteilt sind.[7][8] Die Marseilleviridae gehören zu den Nucleocytoplasmic large DNA viruses (NCLDV), für die vorgeschlagen wurde, sie als Megavirales in den Rang einer Virusordnung zu erheben.

Spezies

Das erste bekannte Mitglied dieser Familie wurde als Acanthamoeba polyphaga marseillevirus bezeichnet und wurde vom International Committee of Taxonomy of Viruses (ICTV) offiziell als Spezies Marseillevirus marseillevirus der Gattung Marseillevirus) bestätigt. Ein zweites Mitglied ist Acanthamoeba castellanii lausannevirus (ICTV: Spezies Lausannevirus, Gattung nicht zugewiesen - Stand November 2018). In der Gattung Marseillevirus hat das ICTV als zweite Spezies das Senegalvirus marseillevirus aufgenommen. Ein anderes Mitglied dieser Familie wurde bei Blutspendern isoliert: ‚Giant Blood Marseillevirus‘ (‚GBM-Virus‘, wäre aufgrund phylogenetischer Analysen ebenfalls in die Gattung Marseillevirus zu stellen).[5] Auch über ein Isolat von Insekten – das Insectomime Virus – wurde berichtet.[9][10][11] Als weitere Mitglieder der Familie wurde Kurlavirus BKC-1[12][13] vorgeschlagen.

Die Systematik der vom ICTV mit Stand November 2018 anerkannten Taxa ist folgende:

  • Familie Marseilleviridae
  • Gattung Marseillevirus
  • Spezies Marseillevirus marseillevirus (alias Acanthamoeba polyphaga marseillevirus)
  • Spezies Senegalvirus marseillevirus
  • ohne zugewiesene Gattung
  • Spezies Lausannevirus (alias Acanthamoeba castellanii lausannevirus)
  • Spezies Tunisvirus

Einen Vorschlag für eine innere Systematik findet sich beim CNRS (2018):[14]

  • Familie Marseilleviridae
  • Marseillevirus[10] (Typus für A, mit den beiden offiziellen Spezies wie oben sowie dem ‚GBM-Virus‘[5])
  • ‚Melbournevirus‘[15]
  • ‚Cannes8-Virus‘ (englisch ‚Cannes8 virus‘)[10]
  • ‚Tokyovirus‘[16][17]
  • Klade B
  • Lausannevirus (Typus für B)
  • ‚Port-Miou-Virus‘ (englisch ‚Port-Miou virus‘)[18]
  • ‚Noumeavirus‘[11]
  • Klade C
  • ‚Insectomime Virus‘[19][10] (Typus für C)
  • Tunisvirus[10]
  • Klade D
  • Klade E

Genom

Eine Promotorsequenz – AAATATTT – wurde in Verbindung mit 55 % der in diesem Virus identifizierten Gene gefunden. Die meisten dieser Sequenzen kommen in mehreren Kopien vor.[22]

Einzelnachweise

  1. ↑ Eugene V. Koonin, Natalya Yutin: Evolution of the Large Nucleocytoplasmatic DNA Viruses of Eukaryotes and Convergent Origins of ViralGigantism, in: Advances in Virus reseach, Band 103, AP 21. Januar 2019, doi:10.1016/bs.aivir.2018.09.002, S. 167-202.
  2. ↑ Philippe Colson, Isabelle Pagnier, Niyaz Yoosuf, Ghislain Fournous, Bernard La Scola, Didier Raoult: 'Marseilleviridae', a new family of giant viruses infecting amoebae. In: Archives of Virology. 158. Jahrgang, Nr. 4, 2012, S. 915–20, doi:10.1007/s00705-012-1537-y, PMID 23188494.
  3. ↑ Bernard La Scola: Looking at protists as a source of pathogenic viruses. In: Microbial Pathogenesis. 77. Jahrgang, 2014, S. 131–5, doi:10.1016/j.micpath.2014.09.005, PMID 25218687.
  4. ↑ Philippe Colson, Laura Fancello, Gregory Gimenez, Fabrice Armougom, Christelle Desnues, Ghislain Fournous, Niyaz Yoosuf, Matthieu Million, Bernard La Scola, Didier Raoult: Evidence of the megavirome in humans. In: Journal of Clinical Virology. 57. Jahrgang, Nr. 3, 2013, S. 191–200, doi:10.1016/j.jcv.2013.03.018, PMID 23664726.
  5. ↑ a b c Nikolay Popgeorgiev, Mickaël Boyer, Laura Fancello, Sonia Monteil, Catherine Robert, Romain Rivet, Claude Nappez, Said Azza, Jacques Chiaroni, Didier Raoult, Christelle Desnues: Marseillevirus-Like Virus Recovered from Blood Donated by Asymptomatic Humans. In: The Journal of Infectious Diseases. 208. Jahrgang, Nr. 7, 2013, S. 1042–50, doi:10.1093/infdis/jit292, PMID 23821720.
  6. ↑ Sarah Aherfi, Philippe Colson, Gilles Audoly, Claude Nappez, Luc Xerri, Audrey Valensi, Matthieu Million, Hubert Lepidi, Regis Costello, Didier Raoult: Marseillevirus in lymphoma: A giant in the lymph node. In: The Lancet Infectious Diseases. 16. Jahrgang, Nr. 10, 2016, S. e225–e234, doi:10.1016/S1473-3099(16)30051-2, PMID 27502174.
  7. ↑ Viral Zone. ExPASy, abgerufen am 25. November 2018.
  8. ↑ Virus Taxonomy: 2016 Release. ICTV, abgerufen am 25. November 2018.
  9. ↑ Mondher Boughalmi, Isabelle Pagnier, Sarah Aherfi, Philippe Colson, Didier Raoult, Bernard La Scola: First Isolation of a Marseillevirus in the Diptera Syrphidae Eristalis tenax. In: Intervirology. 56. Jahrgang, Nr. 6, 2013, S. 386–94, doi:10.1159/000354560, PMID 24157885.
  10. ↑ a b c d e Albert J. Erives: Phylogenetic analysis of the core histone doublet and DNA topo II genes of Marseilleviridae: evidence of proto-eukaryotic provenance, in: Epigenetics & Chromatin (2017) 10:55 doi:10.1186/s13072-017-0162-0
  11. ↑ a b Elisabeth Fabre, Sandra Jeudy, Sébastien Santini, Matthieu Legendre, Mathieu Trauchessec, Yohann Couté, Jean-Michel Claverie, Chantal Abergel: Noumeavirus replication relies on a transient remote control of the host nucleus, in: Nature Communications. 8, Article number: 15087 (April 2017), doi:10.1038/ncomms15087. Insectomimevirus teilweise alsInsectominevirus (mit n) verschrieben.
  12. ↑ Anirvan Chatterjee, Kiran Kondabagil: Complete genome sequence of Kurlavirus, a novel member of the family Marseilleviridae isolated in Mumbai, India. In: Archives of Virology. 162. Jahrgang, Nr. 10, 2017, S. 3243, doi:10.1007/s00705-017-3469-z, PMID 28685284.
  13. ↑ Uniprot: Kurlavirus BKC-1: Histone H2A domain-containing protein, Stand: 28. März 2018, NCBI Taxon Id 1958810
  14. ↑ Centre national de la recherche scientifique: List of the main “giant” viruses known as of today, Université Aix Marseille, 18. April 2018
  15. ↑ G Doutre, N Philippe, C Abergel, J.-M Claverie: Genome Analysis of the First Marseilleviridae Representative from Australia Indicates that Most of Its Genes Contribute to Virus Fitness. In: Journal of Virology. 88. Jahrgang, Nr. 24, 2014, S. 14340–9, doi:10.1128/JVI.02414-14, PMID 25275139, PMC 4249118 (freier Volltext).
  16. ↑ Masaharu Takemura: Draft Genome Sequence of Tokyovirus, a Member of the Family Marseilleviridae Isolated from the Arakawa River of Tokyo, Japan. In: Genome Announcements. 4. Jahrgang, Nr. 3, 2016, S. e00429–16, doi:10.1128/genomeA.00429-16, PMID 27284144, PMC 4901213 (freier Volltext).
  17. ↑ Masaharu TakeMura: Morphological and Taxonomic Properties of Tokyovirus, the First Marseilleviridae Member Isolated from Japan, in: Microbes Environ. Vol. 31, No. 4, S. 442-448, 2016, doi:10.1264/jsme2.ME16107
  18. ↑ Sarah Aherfi, Bernard La Scola, Isabelle Pagnier, Didier Raoult, Philippe Colson: The expanding family Marseilleviridae. Genome Announc. 2015 Nov-Dec; 3(6): e01148-15. Online veröffentlicht am 25. November 2015, doi:10.1128/genomeA.01148-15
  19. ↑ Referenzfehler: Ungültiges <ref>-Tag; kein Text angegeben für Einzelnachweis mit dem Namen pmid24157885.
  20. ↑ Fábio Dornas, Felipe Assis, Sarah Aherfi, Thalita Arantes, Jônatas Abrahão, Philippe Colson, Bernard La Scola: A Brazilian Marseillevirus is the Founding Member of a Lineage in Family Marseilleviridae. In: Viruses. 8. Jahrgang, Nr. 3, 2016, S. 76, doi:10.3390/v8030076, PMID 26978387, PMC 4810266 (freier Volltext).
  21. ↑ Raíssa Nunes dos Santos, Fabrício Souza Campos, Nathalia Rammé Medeiros de Albuquerque, Fernando Finoketti, Rayra Almeida Côrrea, Lucia Cano-Ortiz, Felipe Lopes Assis, Thalita Souza Arantes, Paulo Michel Roehe, Ana Cláudia Franco: A new marseillevirus isolated in Southern Brazil from Limnoperna fortunei, in: Nature Scientific Reports volume 6, Article number: 35237 vom 14. Oktober 2016, doi:10.1038/srep35237
  22. ↑ Graziele Pereira Oliveira, Maurício Teixeira Lima, Thalita Souza Arantes, Felipe Lopes Assis, Rodrigo Araújo Lima Rodrigues, Flávio Guimarães Da Fonseca, Cláudio Antônio Bonjardim, Erna Geessien Kroon, Philippe Colson, Bernard La Scola, Jônatas Santos Abrahão: The Investigation of Promoter Sequences of Marseilleviruses Highlights a Remarkable Abundance of the AAATATTT Motif in Intergenic Regions. In: Journal of Virology. 91. Jahrgang, Nr. 21, 2017, S. e01088–17, doi:10.1128/JVI.01088-17, PMID 28794030, PMC 5640848 (freier Volltext).
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