„Prasinovirus“ – Versionsunterschied

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'''''Prasinovirus''''' ist eine Gattung von großen doppelsträngigen [[DNA]]-Viren aus der Familie der ''[[Phycodnaviridae]]'', die [[Phytoplankton]] der [[Prasinophyceae]] infizieren.
'''''Prasinovirus''''' is a genus of large double-stranded DNA [[viruses]], in the family [[Phycodnaviridae]] that infect [[phytoplankton]] in the ''[[Prasinophyceae]]''. There are currently only two species in this genus including the type species [[Micromonas pusilla virus SP1]] <ref name=ViralZone>{{cite web|title=Viral Zone|url=http://viralzone.expasy.org/all_by_species/591.html|publisher=ExPASy|accessdate=15 June 2015}}</ref><ref name=ICTV>{{cite web|last1=ICTV|title=Virus Taxonomy: 2014 Release|url=http://ictvonline.org/virusTaxonomy.asp|accessdate=15 June 2015}}</ref>, that infects the cosmopolitan photosynthetic flagellate ''[[Micromonas]] pusilla''.<ref>{{Cite journal|last=Cottrell|first=Matthew T.|last2=Suttle|first2=Curtis A.|date=1991|title=Wide-spread occurrence and clonal variation in viruses which cause lysis of a cosmopolitan, eukaryotic marine phytoplankter, "Micromonas pusilla"|journal=Marine Ecology Progress Series |volume=78 |pages=1–9 |issn=1616-1599|url=http://www.int-res.com/articles/meps/78/m078p001.pdf |doi=10.3354/meps078001}}</ref> [[File:MpV-SP1.png|thumb|Negative stained image of MpV-SP1]] However, there is a large group of genetically diverse but related viruses that show considerable evidence of [[lateral gene transfer]].<ref>{{Cite journal|last=Bellec|first=Laure|last2=Grimsley |first2=Nigel|last3=Derelle |first3=Evelyn|last4=Moreau |first4=Herve|last5=Desdevises |first5=Yves|date=2010|title=Abundance, spatial distribution and genetic diversity of Ostreococcus tauri viruses in two different environments |journal=Environmental Microbiology Reports |volume=2 |issue=2|pages=313–321 |doi=10.1111/j.1758-2229.2010.00138.x |pmid=23766083}}</ref> <ref name="Finke 2017">{{Cite journal|last=Finke |first=Jan F |last2=Winget |first2=Danielle M |last3=Chan |first3=Amy M|last4=Suttle |first4=Curtis A |date=2017 |title=Variation in the genetic repertoire of viruses Infecting ''Micromonas pusilla'' reflects horizontal gene transfer and links to their environmental distribution |journal=Viruses |volume=9 |issue=5 |pages=116 |doi=10.3390/v9050116 |pmid=28534829 |url= http://www.mdpi.com/1999-4915/9/5/116/htm}}</ref> [[File:Shared coding sequences of Micromonas pusilla viruses and Micromonas pusilla.png|thumb|Venn diagram of shared coding sequences (CDS) of four MpVs and M. pusilla UTEX LB991, based on clusters by 0.5 amino acid identity. Dashed circles represent host genes shared with viruses <ref name="Finke 2017" /> .]]
Derzeit (Stand Juli 2019) gibt es in dieser Gattung nur zwei Arten:<ref name=ICTV>{{cite web|last1=ICTV|title=Virus Taxonomy|url=http://ictvonline.org/virusTaxonomy.asp|accessdate=7. Juli 2019}}, auf: [[International Committee on Taxonomy of Viruses]] Master Species List (MSL) #34 2018b</ref>
die Typusart
''[[Micromonas pusilla-Virus SP1]]'' (MpV-SP1),<ref name=ViralZone>{{cite web|title=Viral Zone|url=http://viralzone.expasy.org/all_by_species/591.html|publisher=ExPASy|accessdate=7. Juli 2019}}</ref> sowie ''[[Ostreococcus tauri-Virus OtV5]]'' (OtV5).
Mitglieder der Gattung ''Prasinovirus'' infizieren kleine einzellige [[Grünalgen]] der Ordnung [[Mamiellales]], die häufig in den Gewässeern an der Meeresküste vorkommen.<ref>{{cite journal |doi=10.1128/JVI.07221-11 |pmid=22318150 |pmc=3318615 |title=Prasinoviruses of the Marine Green Alga Ostreococcus tauri Are Mainly Species Specific |journal=Journal of Virology |volume=86 |issue=8 |pages=4611–4619 |year=2012 |last1=Clerissi |first1=Camille |last2=Desdevises |first2=Yves |last3=Grimsley |first3=Nigel }}</ref>
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==Taxonomy==
== Beschreibung ==
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Das ''Prasinovirus'' MpV-SP1 infiziert die [[Flagellaten|Flagellate]] ''Micromonas pusilla'' (UTEX 991, Plymouth 27), welches ein dominierender photosynthetischer mariner [[Picoeukaryot]] ist, also zum [[eukaryot]]ischen Piko[[plankton]] gehört.<ref>{{Cite journal|last=Cottrell|first=Matthew T.|last2=Suttle|first2=Curtis A.|date=1991|title=Wide-spread occurrence and clonal variation in viruses which cause lysis of a cosmopolitan, eukaryotic marine phytoplankter, "Micromonas pusilla"|journal=Marine Ecology Progress Series |volume=78 |pages=1–9 |issn=1616-1599|url=http://www.int-res.com/articles/meps/78/m078p001.pdf |doi=10.3354/meps078001}}</ref><ref name=":1">{{cite journal |doi=10.4319/lo.1995.40.4.0730 |title=Dynamics of lytic virus infecting the photosynthetic marine picoflagellate ''Micromonas'' pusilla |journal=Limnology and Oceanography |volume=40 |issue=4 |pages=730–739 |year=1995 |last1=Cottrell |first1=Matthew T. |last2=Suttle |first2=Curtis A. }}</ref>
==Structure==
Viruses in Prasinovirus are enveloped, with icosahedral and Round geometries, and T=169 symmetry. The diameter is around 104-118&nbsp;nm.<ref name=ViralZone />


Eines der am häufigsten untersuchten Prasinoviren, OtV5, dessen Genom vollständig sequenziert ist, infiziert ''Ostreococcus tauri'', die bis dato (2008) kleinsten frei lebenden Eukaryoten.<ref name=":322">{{cite journal |last=Derelle |first=Evelyne |last2=Ferraz |first2=Conchita |last3=Escande |first3=Marie-Line |last4=Eychenié |first4=Sophie |last5=Cooke |first5=Richard |last6=Piganeau |first6=Gwenaël |last7=Desdevises |first7=Yves |last8=Bellec |first8=Laure |last9=Moreau |first9=Hervé |date=2008-05-28 |title=Life-Cycle and Genome of OtV5, a Large DNA Virus of the Pelagic Marine Unicellular Green Alga ''Ostreococcus tauri'' |journal=PLoS ONE |volume=3 |issue=5 |pages=e2250 |bibcode=2008PLoSO...3.2250D |doi=10.1371/journal.pone.0002250 |pmc=2386258 |pmid=18509524 }}</ref>

=== Aufbau ===
Virionen der Gattung ''Prasinovirus'' haben ikosaedrische und runde Geometrie mit T=169-Symmetrie. Der Durchmesser liegt bei 104-118&nbsp;[[Meter#nm|nm]].<ref name=ViralZone />
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! Genus !! Structure || Symmetry !! Capsid !! Genomic arrangement !! Genomic segmentation
! Genus !! Strukture || Symmetrie !! Kapsid !! Genomic - Gestalt !! Genomic - Segmentierung
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siehe Virusbox -->


=== Vermehrungszyklus ===
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Viral replication is nucleo-cytoplasmic. Replication follows the DNA strand displacement model. Dna templated transcription is the method of transcription. The virus exits the host cell by lysis via lytic phospholipids.
Alga serve as the natural host. Transmission routes are passive diffusion.<ref name=ViralZone />


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Bei der nukleo-zytoplasmatische Replikation der Prasinoviren, heften sich die [[Virion|Virusteilchen (Virionen)]] an der Oberfläche der Wirtszelle an und injizieren anschließend ihre [[DNA]] in das [[Zytoplasma]] der Wirtszelle injizieren.<ref name=":322"/>
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Man fand nämlich heraus, dass "leere" OtV5-Virionen bzw. Virusüberreste, bei denen nur das [[Kapsid]] an die Wirtsmembran gebunden ist, in keinem Stadium der Infektion zu sehen sind. Die Autoren stellten auch fest, dass ein hoher Anteil der Viren nach der Einimpfung ({{enS|inoculation}}) der DNA nicht an Zellen anhaftete, was nahlegt, dass die Anhaftung von Viren ein begrenzender Schritt bei der Infektion sein könnte.
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Inzwischen wurde in ''O. tauri''-Zellen auch eine Virusproduktion ohne Zelllyse beobachtet. Thomas ''et&nbsp;al.'' fanden 2011 heraus, dass in resistenten Wirtszellen das Virusgenom repliziert und Viren über einen [[Knospung]]smechanismus ({{enS|budding mechanism}}) freigesetzt wurden.<ref>{{cite journal |doi=10.1111/j.1462-2920.2011.02441.x |pmid=21392198 |title=Acquisition and maintenance of resistance to viruses in eukaryotic phytoplankton populations |journal=Environmental Microbiology |volume=13 |issue=6 |pages=1412–1420 |year=2011 |last1=Thomas |first1=Rozenn |last2=Grimsley |first2=Nigel |last3=Escande |first3=Marie-Line |last4=Subirana |first4=Lucie |last5=Derelle |first5=Evelyne |last6=Moreau |first6=Hervé }}</ref>
==References==
Diese geringe Freisetzungsrate von Viren durch Knospungn ermöglicht eine längere Überlebensdauer des Wirts und der Virusnachkommen, was zu einer stabilen Koexistenz führt.<ref>{{cite journal |last1=Sime-Ngando |first1=Télesphore |doi=10.3389/fmicb.2014.00355 |pmid=25104950 |pmc=4109441 |title=Environmental bacteriophages: Viruses of microbes in aquatic ecosystems |journal=Frontiers in Microbiology |volume=5 |pages=355 |year=2014 }}</ref>
{{Reflist}}


==External links==
=== Genom ===
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Es gibt jedoch eine große Gruppe genetisch unterschiedlicher, aber verwandter Viren, die starke Hinweise auf [[Horizontaler Gentransfer|lateralen Gentransfer]] zeigen.<ref>{{Cite journal|last=Bellec|first=Laure|last2=Grimsley |first2=Nigel|last3=Derelle |first3=Evelyn|last4=Moreau |first4=Herve|last5=Desdevises |first5=Yves|date=2010|title=Abundance, spatial distribution and genetic diversity of Ostreococcus tauri viruses in two different environments |journal=Environmental Microbiology Reports |volume=2 |issue=2|pages=313–321 |doi=10.1111/j.1758-2229.2010.00138.x |pmid=23766083}}</ref><ref name="Finke 2017">{{Cite journal|last=Finke |first=Jan F |last2=Winget |first2=Danielle M |last3=Chan |first3=Amy M|last4=Suttle |first4=Curtis A |date=2017 |title=Variation in the genetic repertoire of viruses Infecting ''Micromonas pusilla'' reflects horizontal gene transfer and links to their environmental distribution |journal=Viruses |volume=9 |issue=5 |pages=116 |doi=10.3390/v9050116 |pmid=28534829 |url= http://www.mdpi.com/1999-4915/9/5/116/htm}}</ref>

== Systematik ==
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Systematik nach ICTV:<ref name="ICTV" />
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<big>'''Baltimore-Gruppe: dsDNA'''</big>
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* Familie: ''[[Phycodnaviridae]]''
:* Genus: ''Prasinovirus''
::* Spezies: ''[[Micromonas pusilla-Virus SP1]]''''' (en: ''Micromonas pusilla virus SP1'', Typusspezies)
::* Spezies: ''[[Ostreococcus tauri-Virus OtV5]]</small> (en: ''Ostreococcus tauri virus OtV5'')

== Einzelnachweise ==
<references />

== Weblinks ==
* [http://viralzone.expasy.org/all_by_species/591.html '''Viralzone''': Prasinovirus]
* [http://viralzone.expasy.org/all_by_species/591.html '''Viralzone''': Prasinovirus]
* [http://ictvonline.org/virusTaxonomy.asp '''ICTV''']
* [http://ictvonline.org/virusTaxonomy.asp '''ICTV''']
{{Baltimore classification}}


[[Kategorie:Pflanzenvirus]]
⚫
{{Taxonbar|from=Q18822149}}
[[Kategorie:Virusgattung]]

⚫
<!--{{Taxonbar|from=Q18822149}}-->


<!--Quellen der Erstübersetzung-->
⚫
[[Category:Phycodnaviridae]]
[[en:Prasinovirus]]
<!--[:en:Phycodnaviridae#Prasinovirus]]-->

Version vom 7. Juli 2019, 19:20 Uhr

Prasinovirus

Negativ-Bild von MpV-SP1]

Systematik
Klassifikation: Viren
Ordnung: ‚Megavirales‘
Familie: Phycodnaviridae
Gattung: Prasinovirus
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA ?linear
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: ikosaedrisch
Hülle: vorhanden
Wissenschaftlicher Name
Prasinovirus

Prasinovirus ist eine Gattung von großen doppelsträngigen DNA-Viren aus der Familie der Phycodnaviridae, die Phytoplankton der Prasinophyceae infizieren. Derzeit (Stand Juli 2019) gibt es in dieser Gattung nur zwei Arten:[1] die Typusart Micromonas pusilla-Virus SP1 (MpV-SP1),[2] sowie Ostreococcus tauri-Virus OtV5 (OtV5). Mitglieder der Gattung Prasinovirus infizieren kleine einzellige Grünalgen der Ordnung Mamiellales, die häufig in den Gewässeern an der Meeresküste vorkommen.[3] Gemeinsame Wirte von Prasinoviren umfassen Mitglieder der Flagellaten-Gattungen Ostreococcus und Micromonas. Drei Arten von Ostreococcus wurden als Kandidaten identifiziert, die sich aufgrund ihres Lichtbedarfs unterscheiden.[4]

Beschreibung

Die Typusart der Gattung Prasinovirus ist das Micromonas pusilla-Virus SP1 (MpV-SP1),[1] das aus einer aus San Diego entnommenen Wasserprobe isoliert wurde.[5]

Das Prasinovirus MpV-SP1 infiziert die Flagellate Micromonas pusilla (UTEX 991, Plymouth 27), welches ein dominierender photosynthetischer mariner Picoeukaryot ist, also zum eukaryotischen Pikoplankton gehört.[6][7]

Eines der am häufigsten untersuchten Prasinoviren, OtV5, dessen Genom vollständig sequenziert ist, infiziert Ostreococcus tauri, die bis dato (2008) kleinsten frei lebenden Eukaryoten.[8]

Aufbau

Virionen der Gattung Prasinovirus haben ikosaedrische und runde Geometrie mit T=169-Symmetrie. Der Durchmesser liegt bei 104-118 nm.[2]

Vermehrungszyklus

Die virale Replikation ist nukleo-zytoplasmatisch. Die Replikation folgt dem DNA-Strang-Verdrängungsmodell (englisch DNA strand displacement model). die Die Methode der Transkription ist DNA-gestützte Transkription. Das Virus verlässt die Wirtszelle durch Lyse über lytische Phospholipide. Als natürlicher Wirt dienen Algen, die Übertragung erfolgt durch passive Diffusion.

/> Bei der nukleo-zytoplasmatische Replikation der Prasinoviren, heften sich die Virusteilchen (Virionen) an der Oberfläche der Wirtszelle an und injizieren anschließend ihre DNA in das Zytoplasma der Wirtszelle injizieren.[8] Offenbar lösen sich die Reste der Virionen nach Injektion ihrer DNA von der Wirtsmembran. Man fand nämlich heraus, dass "leere" OtV5-Virionen bzw. Virusüberreste, bei denen nur das Kapsid an die Wirtsmembran gebunden ist, in keinem Stadium der Infektion zu sehen sind. Die Autoren stellten auch fest, dass ein hoher Anteil der Viren nach der Einimpfung (englisch inoculation) der DNA nicht an Zellen anhaftete, was nahlegt, dass die Anhaftung von Viren ein begrenzender Schritt bei der Infektion sein könnte. Die virale DNA wird dann durch die Maschinerie der Wirtszelle im Zellkern repliziert. Die Viruspartikel sammeln sich im im Zytoplasma an und nehmen normalerweise einen Raum nahe der Innenseite des Zellkernerns ein. Aufgrund der extrem geringen Größe der Algenzellen wurde eine durchschnittliche Burstgröße von nur 25 Viruspartikeln pro Zelle festgestellt.[8]

Inzwischen wurde in O. tauri-Zellen auch eine Virusproduktion ohne Zelllyse beobachtet. Thomas et al. fanden 2011 heraus, dass in resistenten Wirtszellen das Virusgenom repliziert und Viren über einen Knospungsmechanismus (englisch budding mechanism) freigesetzt wurden.[9] Diese geringe Freisetzungsrate von Viren durch Knospungn ermöglicht eine längere Überlebensdauer des Wirts und der Virusnachkommen, was zu einer stabilen Koexistenz führt.[10]

Genom

Venn-Diagramm der gemeinsamen Codierungssequenzen (CDS) von vier MpVs und M. pusilla UTEX LB991. Gestrichelte Kreise stellen Wirtsgene dar, die mit Viren geteilt werden.[11]

Es gibt jedoch eine große Gruppe genetisch unterschiedlicher, aber verwandter Viren, die starke Hinweise auf lateralen Gentransfer zeigen.[12][11]

Systematik

Systematik nach ICTV:[1] Baltimore-Gruppe: dsDNA Ordnung: ‚Megavirales‘(putativ)

  • Genus: Prasinovirus

Einzelnachweise

  1. ↑ a b c ICTV: Virus Taxonomy. Abgerufen am 7. Juli 2019., auf: International Committee on Taxonomy of Viruses Master Species List (MSL) #34 2018b
  2. ↑ a b Viral Zone. ExPASy, abgerufen am 7. Juli 2019.
  3. ↑ Camille Clerissi, Yves Desdevises, Nigel Grimsley: Prasinoviruses of the Marine Green Alga Ostreococcus tauri Are Mainly Species Specific. In: Journal of Virology. 86. Jahrgang, Nr. 8, 2012, S. 4611–4619, doi:10.1128/JVI.07221-11, PMID 22318150, PMC 3318615 (freier Volltext).
  4. ↑ HomeOstreococcus lucimarinus. In: genome.jgi.doe.gov. Abgerufen am 28. Februar 2017.
  5. ↑ MT Cottrell, CA Suttle: Wide-spread occurrence and clonal variation in viruses which cause lysis of a cosmopolitan, eukaryotic marine phytoplankter Micromonas pusilla. In: Marine Ecology Progress Series. 78. Jahrgang, 1991, S. 1–9, doi:10.3354/meps078001, bibcode:1991MEPS...78....1C.
  6. ↑ Matthew T. Cottrell, Curtis A. Suttle: Wide-spread occurrence and clonal variation in viruses which cause lysis of a cosmopolitan, eukaryotic marine phytoplankter, "Micromonas pusilla". In: Marine Ecology Progress Series. 78. Jahrgang, 1991, ISSN 1616-1599, S. 1–9, doi:10.3354/meps078001 (int-res.com [PDF]).
  7. ↑ Matthew T. Cottrell, Curtis A. Suttle: Dynamics of lytic virus infecting the photosynthetic marine picoflagellate Micromonas pusilla. In: Limnology and Oceanography. 40. Jahrgang, Nr. 4, 1995, S. 730–739, doi:10.4319/lo.1995.40.4.0730.
  8. ↑ a b c Evelyne Derelle, Conchita Ferraz, Marie-Line Escande, Sophie Eychenié, Richard Cooke, Gwenaël Piganeau, Yves Desdevises, Laure Bellec, Hervé Moreau: Life-Cycle and Genome of OtV5, a Large DNA Virus of the Pelagic Marine Unicellular Green Alga Ostreococcus tauri. In: PLoS ONE. 3. Jahrgang, Nr. 5, 28. Mai 2008, S. e2250, doi:10.1371/journal.pone.0002250, PMID 18509524, PMC 2386258 (freier Volltext), bibcode:2008PLoSO...3.2250D.
  9. ↑ Rozenn Thomas, Nigel Grimsley, Marie-Line Escande, Lucie Subirana, Evelyne Derelle, Hervé Moreau: Acquisition and maintenance of resistance to viruses in eukaryotic phytoplankton populations. In: Environmental Microbiology. 13. Jahrgang, Nr. 6, 2011, S. 1412–1420, doi:10.1111/j.1462-2920.2011.02441.x, PMID 21392198.
  10. ↑ Télesphore Sime-Ngando: Environmental bacteriophages: Viruses of microbes in aquatic ecosystems. In: Frontiers in Microbiology. 5. Jahrgang, 2014, S. 355, doi:10.3389/fmicb.2014.00355, PMID 25104950, PMC 4109441 (freier Volltext).
  11. ↑ a b Jan F Finke, Danielle M Winget, Amy M Chan, Curtis A Suttle: Variation in the genetic repertoire of viruses Infecting Micromonas pusilla reflects horizontal gene transfer and links to their environmental distribution. In: Viruses. 9. Jahrgang, Nr. 5, 2017, S. 116, doi:10.3390/v9050116, PMID 28534829 (mdpi.com).
  12. ↑ Laure Bellec, Nigel Grimsley, Evelyn Derelle, Herve Moreau, Yves Desdevises: Abundance, spatial distribution and genetic diversity of Ostreococcus tauri viruses in two different environments. In: Environmental Microbiology Reports. 2. Jahrgang, Nr. 2, 2010, S. 313–321, doi:10.1111/j.1758-2229.2010.00138.x, PMID 23766083.
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