Datei:Cluster partitioning of the phylogenetic tree of nidoviruses 2018 by DEmARC.png
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Beschreibung
| Beschreibung |
English: Cluster partitioning of the phylogenetic tree of nidoviruses by DEmARC. Shown is the ML tree of 87 nidoviruses (one for each nidovirus species delineated by DEmARC) inferred by IQ-Tree 1.5.5 using concatenated MSAs of 3CLpro, NiRAN, RdRp, ZBD, HEL1 domains. Shimodaira-Hasegawa-like approximate likelihood ratio test (SH-aLRT) branch support values are depicted by shaded circles. For the virus abbreviations, see the table below. The 2018 family structures of the order Nidovirales are detailed at the right of the virus names.
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| Datum | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Quelle |
Own edit of a figure from: J. Ziebuhr, R.S. Baric, S. Baker, R.J. de Groot, C. Drosten, A. Gulyaeva, B.L. Haagmans, B.W. Neuman, S. Perlman, L.L.M. Poon, I. Sola, A.E. Gorbalenya: Reorganization of the family Coronaviridae into two families, Coronaviridae (including the current subfamily Coronavirinae and the new subfamily Letovirinae) and the new family Tobaniviridae (accommodating the current subfamily Torovirinae and three other subfamilies), revision of the genus rank structure and introduction of a new subgenus rank. Proposal. In: Virus Taxonomy. History. Revision 2018a, July. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), 18th February 2017, Proposal-Code 2017.013S, Figure 3 (English, ictvonline.org [ZIP; 5.1 MB; last access: 7th May 2020]). |
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| Urheber | Present: Markus Prokott. Original: Gulyaeva et al. & Gorbalenya. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Lizenz
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| aktuell | 04:58, 14. Jun. 2020 | | 1.170 × 1.740 (322 KB) | Markus Prokott | {{Information |description ={{en|1=Cluster partitioning of the phylogenetic tree of nidoviruses by DEmARC. Shown is the ML tree of 87 nidoviruses (one for each nidovirus species delineated by DEmARC) inferred by IQ-Tree 1.5.5 using concatenated MSAs of 3CLpro, NiRAN, RdRp, ZBD, HEL1 domains. Shimodaira-Hasegawa-like approximate likelihood ratio test (SH-aLRT) branch support values are depicted by shaded circles. For the virus abbreviations, see the table below. The 2018 family structures of... |
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