„Faustovirus“ – Versionsunterschied

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Gattung/Species Andreani 2018+NCBI vs. Oliveira 2019
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„'''''Faustovirus'''''“ („'''FauV'''“) bzw. „'''''Faustovirus mariensis'''''“ ist die vorgeschlagene Bezeichnung für eine [[Gattung (Bilogie)|Gattung]] bzw. [[Art (Biologie)|Spezies]] von [[DNA-Virus|DNA-Viren]].<ref name="Oliveira2019" /><ref name="NCBI_FauV">NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?id=1477405 Faustovirus] (species) - wegen Oliveira 2019 hier als Gettung geführt ([[Nomenklatur (Biologie)#Binäre Nomenklatur nach Linné|BinäreNomenklatur]])</ref><ref name=Bajral2016 /><ref name="Klose" /><!-- die Bezeichnungsweisen sind leider etwas unterschiedlich bzgl. Gattung und Spezies, am besten man hält es so wie in der Taxonomie von zellulären organismen. Siehe auch Diskussion bei ICTV online-->


== Eigenschaften ==
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== Systematik ==
== Systematik ==
In der Spezies „''Faustovirus''“ gibt es nach Andreani ''at&nbsp;al.'' (2018) gibt es die folgenden Vertreter:<ref name="Andreani2018">Julien Andreani, Jacques Y. B. Khalil, Emeline Baptiste, Issam Hasni, Caroline Michelle, Didier Raoult, Anthony Levasseur, Bernard La Scola: [https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2017.02643/full Orpheovirus IHUMI-LCC2: A New Virus among the Giant Viruses], in: Front. Microbiol., 22. Januar 2018, [[doi:10.3389/fmicb.2017.02643]]</ref>
In der Gattung „''Faustovirus''“ mit der Spezies „''Faustovirus mariensis''“ gibt es nach Andreani ''at&nbsp;al.'' (2018) die folgenden Vertreter:<ref name="Andreani2018">Julien Andreani, Jacques Y. B. Khalil, Emeline Baptiste, Issam Hasni, Caroline Michelle, Didier Raoult, Anthony Levasseur, Bernard La Scola: [https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2017.02643/full Orpheovirus IHUMI-LCC2: A New Virus among the Giant Viruses], in: Front. Microbiol., 22. Januar 2018, [[doi:10.3389/fmicb.2017.02643]]</ref>
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Die meisten Autoren schlagen vor, die Gattung „''Faustovirus''“ als [[Typus (Nomenklatur)|typusspezies]] einer neuen Familie ''Faustoviridae''<ref name=Bajral2016 /> innerhalb der ''Nucleocytoplasmic large DNA viruses'' (NCLDV) aufzufassen.
Die meisten Autoren schlagen vor, die Gattung „''Faustovirus''“ als [[Typus (Nomenklatur)|typusspezies]] einer neuen Familie ''Faustoviridae''<ref name=Bajral2016 /> innerhalb der ''Nucleocytoplasmic large DNA viruses'' (NCLDV) aufzufassen.
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:* [https://www.igs.cnrs-mrs.fr/wp-content/uploads/2019/03/TableVirus_Mars_2019.pdf List of the main “giant” viruses known as of today (March 2019)], Université Aix Marseille, März 2019
:* [https://www.igs.cnrs-mrs.fr/wp-content/uploads/2019/03/TableVirus_Mars_2019.pdf List of the main “giant” viruses known as of today (March 2019)], Université Aix Marseille, März 2019
* [https://talk.ictvonline.org/ictv-reports/ictv_online_report/dsdna-viruses/w/asfarviridae dsDNA Viruses &gt; Asfarviridae] [[International Committee on Taxonomy of Viruses|ICTV]] Report vom März 2018, Fig.&nbsp;4
* [https://talk.ictvonline.org/ictv-reports/ictv_online_report/dsdna-viruses/w/asfarviridae dsDNA Viruses &gt; Asfarviridae] [[International Committee on Taxonomy of Viruses|ICTV]] Report vom März 2018, Fig.&nbsp;4
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* Graziele Oliveira, Bernard La Scola, Jônatas Abrahão: [https://www.researchgate.net/publication/337018425_Giant_virus_vs_amoeba_fight_for_supremacy Giant virus vs amoeba: fight for supremacy], in: Virol J 16, 126, 4. November 2019, [[doi:10.1186/s12985-019-1244-3]], [https://www.researchgate.net/publication/337018425_Giant_virus_vs_amoeba_fight_for_supremacy PDF]


== Einzelnachweise ==
== Einzelnachweise ==

Version vom 26. Mai 2020, 21:50 Uhr

„Faustovirus“

Cryo-EM-Bild eines Virions von „Faustovirus“

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Varidnaviria[2]
Reich: Bamfordvirae[2]
Phylum: Nucleocytoviricota[2]
Klasse: Pokkesviricetes[2]
Ordnung: Asfuvirales[2]
Familie: „Faustoviridae“
Gattung: „Faustovirus“
Art: „Faustovirus mariensis“[1]
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA
Baltimore: Gruppe 1
Wissenschaftlicher Name
„Faustovirus“
Kurzbezeichnung
„FauV“
Links
NCBI Taxonomy: 1477405

„Faustovirus“ („FauV“) bzw. „Faustovirus mariensis“ ist die vorgeschlagene Bezeichnung für eine Gattung bzw. Spezies von DNA-Viren.[1][3][4][5]

Eigenschaften

Faustoviren sind Riesenviren aus dem Phylum Negarnaviricota (veraltetNucleocytoplasmic large DNA viruses, NCLDV; früher gelegentlich auch als Ordnung Megavirales eingestuft). Sie infizieren Amöben.[6] Sie wurden erstmals 2015 in Vermamoeba verformis (Arcellinida) beschrieben, die vor allem in der Umgebung von Menschen vorkommt.[7]

Struktur

Die größte Ähnlichkeit zu anderen Viren besteht mit denen der Familie Asfarviridae, wobei die Virusteilchen (Virionen) von „Faustovirus“ (wie auch das nicht näher verwandte Coltivirus der Familie Reoviridae) eine doppelte Proteinhülle zur Verpackung des Genoms aufweist.[5] Faustoviren besitzen einen Durchmesser von 2.400 Ångström.[5] Das Kapsid ist ungefähr ikosaedrisch.[5] Symmetrie T=277.[8]

Genom

Das Genom der Faustoviren besteht aus dsDNA und hat eine Länge von 466 kbp (Faustovirus ST1: 470.659 bp, Faustovirus D6: 462011 bp) und kodiert vorhergesagt 478 (respektive 495) virale Proteine, von denen etwa zwei Drittel keine bekannten Homologe aufweisen.[5] Der GC-Gehalt liegt bei 37 % (respektive 38 %).[9] Ungewöhnlich für Viren enthält das Genom der Faustoviren mehrere Introns.[5] Das Gen des Haupt-Kapsidproteins MCP (englisch major Capsid protein) kodiert für 652 Aminosäuren, hat aber eine ungewöhnliche Länge von 17 kB.[5]

Replikationszyklus

Der Replikationszyklus der Faustoviren dauert etwa 24 Stunden und endet mit der Zelllyse zur Freisetzung der neugebildeten Virionen.[5]

Systematik

In der Gattung „Faustovirus“ mit der Spezies „Faustovirus mariensis“ gibt es nach Andreani at al. (2018) die folgenden Vertreter:[10]

  • Gattung: „Faustovirus“.[3]
  • Spezies „Faustovirus mariensis“.[1]
  • Faustovirus D3
  • Faustovirus E9
  • Faustovirus Liban
  • Faustovirus E12 (Prototyp)[11]
  • Faustovirus E24

Die meisten Autoren schlagen vor, die Gattung „Faustovirus“ als typusspezies einer neuen Familie Faustoviridae[4] innerhalb der Nucleocytoplasmic large DNA viruses (NCLDV) aufzufassen. Diese Gruppe umfasst neben den Pockenviren alle bekannten Riesenviren und wurde im März 2020 vom ICTV offiziell als Phylum Nucleocytoviricota bestätigt. Die Faustoviren stehen innerhalb der NCLDV der Familie Asfarviridae mit Gattung Asfivirus (ASFV) am nächsten, auch wenn sie von diesen Viren verschieden sind.[7][6][5] Das ICTV hat im März für die nähere Verwandtschaft der Asfarviridae die neue Ordnung Asfuvirales eingerichtet, womit ein Taxon für die gemeinsame Klade der Asfaviridae und „Faustoviridae“ zur Verfügung steht. Schulz et al (2018) schlagen für diese Klade eine Systematik wie folgt vor:[12]

 Asfuvirales[2]  

 „Kaumoebavirus“[4]


   

 Asfarviridae (Asfivirus)


 ?„Faustoviridae“ 

 „Pacmanvirus“[13]


   

 „Faustovirus“





Vorlage:Klade/Wartung/Style

Im Vergleich dazu sehen Guglielmini et al. (2019), Fig. 2, die Positionen von Asfarviridae und „Kaumoebavirus“ vertauscht.[14] Als mögliches weiteres Mitglied dieser erweiterten Asfarviridae-Gruppe wurde das Dinodnavirus vorgeschlagen.[15]

  • Centre national de la recherche scientifique (CNRS):

Einzelnachweise

  1. ↑ a b c Graziele Oliveira, Bernard La Scola, Jônatas Abrahão: Giant virus vs amoeba: fight for supremacy, in: Virol J 16, 126, 4. November 2019, doi:10.1186/s12985-019-1244-3, PDF
  2. ↑ a b c d e f ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  3. ↑ a b NCBI: Faustovirus (species) - wegen Oliveira 2019 hier als Gettung geführt (BinäreNomenklatur)
  4. ↑ a b c Leena H. Bajrai, Samia Benamar, Esam I. Azhar, Catherine Robert, Anthony Levasseur, Didier Raoult, Bernard La Scola; Eric O. Freed (Hrsg.): Kaumoebavirus, a New Virus That Clusters with Faustoviruses and Asfarviridae. In: VirusesVolume 8, Nr. 11, 28. Oktober 2016, S. 278, doi: 10.3390/v8110278, PMC 5127008 (freier Volltext), PMID 27801826
  5. ↑ a b c d e f g h i T. Klose, D. G. Reteno, S. Benamar, A. Hollerbach, P. Colson, B. La Scola, M. G. Rossmann: Structure of faustovirus, a large dsDNA virus. In: Proceedings of the National Academy of Sciences. Band 113, Nummer 22, Mai 2016, S. 6206–6211, doi:10.1073/pnas.1523999113, PMID 27185929, PMC 4896704 (freier Volltext).
  6. ↑ a b S. Benamar, D. G. Reteno, V. Bandaly, N. Labas, D. Raoult, B. La Scola: Faustoviruses: Comparative Genomics of New Megavirales Family Members. In: Frontiers in microbiology. Band 7, 2016, S. 3, doi:10.3389/fmicb.2016.00003, PMID 26903952, PMC 4742530 (freier Volltext).
  7. ↑ a b D. G. Reteno, S. Benamar, J. B. Khalil, J. Andreani, N. Armstrong, T. Klose, M. Rossmann, P. Colson, D. Raoult, B. La Scola: Faustovirus, an asfarvirus-related new lineage of giant viruses infecting amoebae. In: Journal of virology. Band 89, Nummer 13, Juli 2015, S. 6585–6594, doi:10.1128/JVI.00115-15, PMID 25878099, PMC 4468488 (freier Volltext).
  8. ↑ Genki Yoshikawa, Romain Blanc-Mathieu, Chihong Song, Yoko Kayama, Tomohiro Mochizuki, Kazuyoshi Murata, Hiroyuki Ogata, Masaharu Takemura: Medusavirus, a novel large DNA virus discovered from hot spring water. In: Journal of Virology, ISSN 0022-538X. 93. Jahrgang, Nr. 8, 2019, doi:10.1128/JVI.02130-18, PMID 30728258 (asm.org [abgerufen am 2. Juli 2019]). PDF
  9. ↑ David M. Needham, Alexandra Z. Worden et al.: A distinct lineage of giant viruses brings a rhodopsin photosystem to unicellular marine predators, in: PNAS, 23. September 2019, doi:10.1073/pnas.1907517116, ISSN 0027-8424, hier: Supplement 1 (xlsx)
  10. ↑ Julien Andreani, Jacques Y. B. Khalil, Emeline Baptiste, Issam Hasni, Caroline Michelle, Didier Raoult, Anthony Levasseur, Bernard La Scola: Orpheovirus IHUMI-LCC2: A New Virus among the Giant Viruses, in: Front. Microbiol., 22. Januar 2018, doi:10.3389/fmicb.2017.02643
  11. ↑ Amina Cherif Louazani, Emeline Baptiste, Anthony Levasseur, Philippe Colson, Bernard La Scola: Faustovirus E12 Transcriptome Analysis Reveals Complex Splicing in Capsid Gene, in: Front. Microbiol., 23. Oktober 2018, doi:10.3389/fmicb.2018.02534
  12. ↑ Frederik Schulz, Lauren Alteio, Danielle Goudeau, Elizabeth M. Ryan, Feiqiao B. Yu, Rex R. Malmstrom, Jeffrey Blanchard, Tanja Woyke: Hidden diversity of soil giant viruses, in: Nature Communicationsvolume 9, Article number: 4881 (2018) vom 19. November 2018, doi:10.1038/s41467-018-07335-2
  13. ↑ Pierre-Philippe Dechant: Recent developments in mathematical virology. (PDF) ICERM, York St. John University, 15. November 2018
  14. ↑ Julien Guglielmini, Anthony C. Woo, Mart Krupovic, Patrick Forterre, Morgan Gaia: Diversification of giant and large eukaryotic dsDNnA viruses predated the origin of modern eukaryotes, in: PNAS 116(39), 10./24. September 2019, S. 19585–19592, doi:10.1073/pnas.1912006116, PMID 31506349, Fig. 2
  15. ↑ H. Ogata, K. Toyoda, Y. Tomaru, N. Nakayama, Y. Shirai, J. M. Claverie, K. Nagasaki: Remarkable sequence similarity between the dinoflagellate-infecting marine girus and the terrestrial pathogen African swine fever virus. In: Virol J. 6, 2009, S. 178.
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