MassTag-PCR
MassTag PCR ist eine biochemische Methode, es handelt sich um die Kombination einer Polymerasekettenreaktion mit der Massenspektrometrie.[1]
Prinzip
Die MassTag-PCR verwendet markierte Primer in der Polymerasekettenreaktion zur Vervielfältigung der DNA, meistens per Multiplex-PCR. Die Markierung der Primer erfolgt über eine UV-Licht-instabile Bindung. Im Anschluss an die PCR werden die vervielfältigten DNA durch eine DNA-Extraktion von ungebundenen Primern getrennt, wodurch nur Markierungen aus eingebauten Primern nachgewiesen werden. Unter UV-Licht im Massenspektrometer werden die Markierungen mit unterschiedlichen charakteristischen M/z-Verhältnissen (engl. MassCodes) freigesetzt. Im Vergleich zur Multiplex-qPCR besitzt die MassTag-PCR eine höhere Nachweisgrenze.[2]
Anwendungen
Die MassTag-PCR wird unter anderem zum Nachweis von Pathogenen verwendet.[1][3][4]
Einzelnachweise
- ↑ a b T. Briese, G. Palacios, M. Kokoris, O. Jabado, Z. Liu, N. Renwick, V. Kapoor, I. Casas, F. Pozo, R. Limberger, P. Perez-Brena, J. Ju, W. I. Lipkin: Diagnostic system for rapid and sensitive differential detection of pathogens. In: Emerging infectious diseases. Band 11, Nummer 2, Februar 2005, S. 310–313, ISSN 1080-6040. doi:10.3201/eid1102.040492. PMID 15752453. PMC 3320438 (freier Volltext).
- ↑ J. Doellinger, K. Schroeder, N. Witt, C. Heunemann, A. Nitsche: Comparison of real-time PCR and MassTag PCR for the multiplex detection of highly pathogenic agents. In: Molecular and cellular probes. Band 26, Nummer 5, Oktober 2012, S. 177–181, ISSN 1096-1194. doi:10.1016/j.mcp.2012.07.002. PMID 22819946.
- ↑ M. R. Wilson, K. L. Tyler: Issues and updates in emerging neurologic viral infections. In: Seminars in neurology. Band 31, Nummer 3, Juli 2011, S. 245–253, ISSN 1098-9021. doi:10.1055/s-0031-1287650. PMID 21964843.
- ↑ S. R. Dominguez, T. Briese, G. Palacios, J. Hui, J. Villari, V. Kapoor, R. Tokarz, M. P. Glodé, M. S. Anderson, C. C. Robinson, K. V. Holmes, W. I. Lipkin: Multiplex MassTag-PCR for respiratory pathogens in pediatric nasopharyngeal washes negative by conventional diagnostic testing shows a high prevalence of viruses belonging to a newly recognized rhinovirus clade. In: Journal of clinical virology: the official publication of the Pan American Society for Clinical Virology. Band 43, Nummer 2, Oktober 2008, S. 219–222, ISSN 1386-6532. doi:10.1016/j.jcv.2008.06.007. PMID 18674964. PMC 2603178 (freier Volltext).