Heptadenmuster

Als Heptadenmuster oder Heptad-Wiederholung (englisch: heptad repeat) bezeichnet man ein Sequenzmotiv, bei dem hydrophobe Aminosäurereste an 1. und 4. Position eines sieben Aminosäuren umfassenden Abschnitts stehen. Das Motiv kann folgendermaßen beschrieben werden:

 a b c d e f g             H: hydrophober Aminosäurerest
 H P P H C P C             P: polarer Aminosäurerest
                           C: elektrisch geladener Aminosäurerest (engl. charged residue)

Die einzelnen Aminosäurereste werden mit den Minuskeln von a bis g notiert. Bei Fortführung der Sequenz notiert man von a’ bis g’, a’’ bis g’’ usw.

Dieses Motiv ist eine markante Struktur von Coiled-Coils, insbesondere der bZIP-Domäne. Durch die hydrophobe Wechselwirkung dieser Aminosäuren wird die Coiled-Coil-Struktur stabilisiert.

Literatur

• Jeremy M. Berg, Lubert Stryer, John L. Tymoczko: Stryer Biochemie. Springer-Verlag, Berlin, Heidelberg 2014, ISBN 978-3-8274-2989-6.