„Far-Western-Blot“ – Versionsunterschied
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Ein '''Far-Western-Blot''' ist eine biochemische Methode zum Nachweis von [[Protein-Protein-Interaktion]]en.<ref>Catherine S. Chan, Tara M. L. Winstone, Raymond J. Turner: ''Investigating protein-protein interactions by far-Westerns.'' In: ''Advances in Biochemical Engineering/Biotechnology.'' Bd. 110, 2008, {{ISSN|0724-6145}}, S. 195–214, PMID 18219468, {{doi|10.1007/10_2007_090}}.</ref><ref>Randy A. Hall: ''Studying protein-protein interactions via blot overlay or Far Western blot.'' In: ''Methods in Molecular Biology.'' Bd. 261, 2004, {{ISSN|1064-3745}}, S. 167–174, PMID 15064457, {{doi|10.1385/1-59259-762-9:167}}.</ref> |
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* Erica A. Golemis, Peter D. Adams: ''Protein-protein interactions. A molecular cloning manual.'' 2nd edition. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor NY 2005, ISBN 0-87969-723-7. |
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* [[Friedrich Lottspeich]], [[Joachim Engels|Joachim W. Engels]] |
* [[Friedrich Lottspeich]], [[Joachim Engels|Joachim W. Engels]] (Hrsg.): ''Bioanalytik.'' 3., (aktualisierte und erweiterte) Auflage. Springer Spektrum, Berlin u. a. 2012, ISBN 978-3-8274-2942-1. |
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== Einzelnachweise == |
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Version vom 5. Mai 2013, 07:45 Uhr
Ein Far-Western-Blot ist eine biochemische Methode zum Nachweis von Protein-Protein-Interaktionen.[1][2]
Prinzip
Eine Probe wird durch eine SDS-PAGE oder eine 2D-Gelelektrophorese getrennt und per Western Blot auf eine Membran übertragen. Der Blot wird nach einer Blockierung mit einem gereinigten Protein inkubiert. Für dieses Protein wird zum Nachweis ein spezifischer Antikörper für eine Immunfärbung benötigt, oder das Protein wurde zuvor mit einem Radionuklid, per Biotinylierung oder mit einem Fluorophor markiert. Durch den Nachweis des Proteins, welches an seine Interaktionspartner auf dem Blot gebunden hat, erhält man durch Vergleich mit dem Größenmarker die Molekulargewichte der Bindungspartner und per Massenspektrometrie oder per Edman-Abbau auch eine identifizierbare Teilsequenz.
Da aufgrund der Denaturierung bei der SDS-PAGE und der anschließenden, oftmals unvollständigen Renaturierung manche Proteinfaltungen nicht wiederhergestellt werden, eignet sich diese Methode für Denaturierungs-unempfindliche Interaktionen wie z. B. an linearen oder phosphorylierten Sequenzen. Alternativ kann zur Trennung der Proteine unter Erhalt der nativen Proteinstruktur eine QPNC-PAGE oder eine Blue-Native-PAGE durchgeführt werden, eine Größenbestimmung über den Größenmarker ist damit jedoch nicht möglich.
Literatur
- Erica A. Golemis, Peter D. Adams: Protein-protein interactions. A molecular cloning manual. 2nd edition. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor NY 2005, ISBN 0-87969-723-7.
- Friedrich Lottspeich, Joachim W. Engels (Hrsg.): Bioanalytik. 3., (aktualisierte und erweiterte) Auflage. Springer Spektrum, Berlin u. a. 2012, ISBN 978-3-8274-2942-1.
Einzelnachweise
- ↑ Catherine S. Chan, Tara M. L. Winstone, Raymond J. Turner: Investigating protein-protein interactions by far-Westerns. In: Advances in Biochemical Engineering/Biotechnology. Bd. 110, 2008, ISSN 0724-6145, S. 195–214, PMID 18219468, doi:10.1007/10_2007_090.
- ↑ Randy A. Hall: Studying protein-protein interactions via blot overlay or Far Western blot. In: Methods in Molecular Biology. Bd. 261, 2004, ISSN 1064-3745, S. 167–174, PMID 15064457, doi:10.1385/1-59259-762-9:167.