„Amplifikation (Genetik)“ – Versionsunterschied
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| ⚫ | Unter '''Amplifikation''' bezeichnet die gezielte Vermehrung von [[Desoxyribonukleinsäure|DNA]]-Abschnitten. Eine Amplifikation beschreibt in der [[Genetik]] eine natürlich vorkommende Vermehrung von [[DNA-Sequenz]]en.<ref>M. Debatisse, B. Malfoy: ''Gene amplification mechanisms.'' In: ''Advances in experimental medicine and biology.'' Band 570, 2005, S. 343–361, {{ISSN|0065-2598}}. {{DOI|10.1007/1-4020-3764-3_12}}. PMID 18727507.</ref> Sie wird in der [[Molekularbiologie]] ''[[in vitro]]'' zur Vermehrung von DNA verwendet. Die Vermehrung des ganzen Genoms durch [[Polyploidisierung]] ist keine Amplifizierung im eigentlichen Sinne, da auch große DNA-Mengen ohne Relevanz vervielfältigt werden. |
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Die natürlich vorkommende Ampflifikation von DNA-Abschnitten ist eine Form der [[Mutation]] und dient vermutlich einer beschleunigten [[Evolution]] durch [[akkordeon]]artige Expansionen und Kontraktionen von DNA-Abschnitten im [[Genom]].<ref>K. T. Elliott, L. E. Cuff, E. L. Neidle: ''Copy number change: evolving views on gene amplification.'' In: ''Future microbiology.'' Band 8, Nummer 7, Juli 2013, S. 887–899, {{ISSN|1746-0921}}. {{DOI|10.2217/fmb.13.53}}. PMID 23841635.</ref> |
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Dies kann z. B. zu einer beschleunigten Ausbildung von [[Resistenz]]en führen, z. B. gegen [[Antibiotikum|Antibiotika]]<ref>L. Sandegren, D. I. Andersson: ''Bacterial gene amplification: implications for the evolution of antibiotic resistance.'' In: ''Nature reviews. Microbiology.'' Band 7, Nummer 8, August 2009, S. 578–588, {{ISSN|1740-1534}}. {{DOI|10.1038/nrmicro2174}}. PMID 19609259.</ref> oder [[Insektizid]]e.<ref>C. Bass, L. M. Field: ''Gene amplification and insecticide resistance.'' In: ''Pest management science.'' Band 67, Nummer 8, August 2011, S. 886–890, {{ISSN|1526-4998}}. {{DOI|10.1002/ps.2189}}. PMID 21538802.</ref> |
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== Formen natürlicher Amplifikation == |
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| ⚫ | Die gezielte Vermehrung von DNA ist auch ein natürlicher Prozess. Sie dient dazu, meist durch [[Genduplikation]] die [[Gendosis]] einzelner Gene bei Bedarf zu steigern. Man hat bei mehreren Lebewesen, z. B. beim [[Gelbrandkäfer]] (''Dytiscus marginalis'') oder beim [[Krallenfrosch]] (''Xenopus laevis'') herausgefunden, dass sie [[ribosomale DNA]] extrachromosomal amplifizieren können. Dies geschieht vor allem bei [[Eizelle]]n, da dort der Bedarf an [[Ribosom]]en stark erhöht ist. Die Amplifizierung erfolgt, indem die rDNA herausgeschnitten und zirkularisiert wird. Die rDNA-Ringe werden dann durch [[Replikation#Die allgemeine Replikation nach dem rolling-circle-Prinzip|rolling circle-Replikation]] vermehrt und gleichen somit den Mangel wieder aus. Ein weiteres Beispiel der natürlichen Amplifikation liefern die [[Gen]]e für die Eihülle ([[Chorion]]) in den [[Ovarialfollikel|Follikel]]zellen von ''[[Drosophila melanogaster]]''. Vor den Genen liegt ein unidirektionaler ''origin of replication'' (ori). Dieser bewirkt, dass nur die Gene selektiv repliziert werden, während andere Genombereiche in der alten Anzahl verbleiben. Die Replikation setzt an den Genen gleich mehrfach an, sodass es im [[Elektronenmikroskop]] wie eine Zwiebelschalenstruktur aussieht, weswegen man auch von ''onion skin replication'' spricht. Die Choriongene werden dabei versechzehnfacht, um für das rasante Ei-Wachstum genug Proteine zu liefern. |
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Die bedeutendste Technik der DNA-Vermehrung ist die [[Polymerase-Kettenreaktion]], siehe auch dort. |
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| ⚫ | Bei manchen [[Onkogen]]en kann es im Zuge der [[Onkogenese]] zu Amplifikationen kommen, z. B. [[HER2/neu]].<ref>M. Yan, B. A. Parker, R. Schwab, R. Kurzrock: ''HER2 aberrations in cancer: Implications for therapy.'' In: ''Cancer treatment reviews.'' [elektronische Veröffentlichung vor dem Druck] März 2014, {{ISSN|1532-1967}}. {{DOI|10.1016/j.ctrv.2014.02.008}}. PMID 24656976.</ref> Zu einer Amplifikation kann es „als Reaktion“ von manchen [[Onkogen]]en gegen [[Cytostatika]] kommen. Bei der Therapie von [[Krebs (Medizin)|Krebs]] werden als Cytostatikum oftmals Mittel benutzt, die die Produktion der [[Nukleotid|Nukleobasen]] oder deren Ausgangsstoffe verhindern. Die Krebszellen reagieren gelegentlich darauf mit der Amplifikation derjenigen Genbereiche, deren Genprodukte durch die Cytostatika gehemmt oder blockiert werden. Die Amplifikation geschieht intrachromosomal durch Ausbildung von sogenannten ''homogeneous staining regions'', also homogenen Chromosomenverlängerungen oder extrachromosomal durch sogenannte ''[[double minute]]s''. |
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Die gezielte Vermehrung von DNA ist auch ein natürlicher Prozess. Sie dient dazu die Aktivität einzelner Gene bei Bedarf zu steigern. |
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Man hat bei mehreren Lebewesen, z. B. beim [[Gelbrandkäfer]] (''Dytiscus marginalis'') oder beim [[Krallenfrosch]] (''Xenopus laevis'') herausgefunden, dass sie [[ribosomale DNA]] extrachromosomal amplifizieren können. Dies geschieht vor allem bei [[Eizelle]]n, da dort der Bedarf an [[Ribosom]]en stark erhöht ist. Die Amplifizierung erfolgt, indem die rDNA herausgeschnitten und zirkularisiert wird. Die rDNA-Ringe werden dann durch [[Replikation#Die allgemeine Replikation nach dem rolling-circle-Prinzip|rolling circle-Replikation]] vermehrt und gleichen somit den Mangel wieder aus. |
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{{Hauptartikel|Polymerasekettenreaktion}} |
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Die bedeutendste Technik der Amplifikation von DNA ist vermutlich die Polymerase-Kettenreaktion.<ref>C. Zhang, J. Xu, W. Ma, W. Zheng: ''PCR microfluidic devices for DNA amplification.'' In: ''Biotechnology advances.'' Band 24, Nummer 3, 2006 May-Jun, S. 243–284, {{ISSN|0734-9750}}. {{DOI|10.1016/j.biotechadv.2005.10.002}}. PMID 16326063.</ref> |
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== Einzelnachweise == |
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| ⚫ | Zu einer Amplifikation kann es „als Reaktion“ von manchen [[Onkogen]]en gegen [[Cytostatika]] kommen. Bei der Therapie von [[Krebs (Medizin)|Krebs]] werden als Cytostatikum oftmals Mittel benutzt, die die Produktion der [[Nukleotid|Nukleobasen]] oder deren Ausgangsstoffe verhindern. Die Krebszellen reagieren darauf mit der Amplifikation derjenigen Genbereiche, deren Genprodukte durch die Cytostatika gehemmt oder blockiert werden. Die Amplifikation geschieht intrachromosomal durch Ausbildung von sogenannten ''homogeneous staining regions'', also homogenen Chromosomenverlängerungen oder extrachromosomal durch sogenannte ''[[double minute]]s''. |
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Version vom 8. Mai 2014, 15:19 Uhr
Unter Amplifikation bezeichnet die gezielte Vermehrung von DNA-Abschnitten. Eine Amplifikation beschreibt in der Genetik eine natürlich vorkommende Vermehrung von DNA-Sequenzen.[1] Sie wird in der Molekularbiologie in vitro zur Vermehrung von DNA verwendet. Die Vermehrung des ganzen Genoms durch Polyploidisierung ist keine Amplifizierung im eigentlichen Sinne, da auch große DNA-Mengen ohne Relevanz vervielfältigt werden.
Eigenschaften
Die natürlich vorkommende Ampflifikation von DNA-Abschnitten ist eine Form der Mutation und dient vermutlich einer beschleunigten Evolution durch akkordeonartige Expansionen und Kontraktionen von DNA-Abschnitten im Genom.[2] Dies kann z. B. zu einer beschleunigten Ausbildung von Resistenzen führen, z. B. gegen Antibiotika[3] oder Insektizide.[4]
Formen natürlicher Amplifikation
Die gezielte Vermehrung von DNA ist auch ein natürlicher Prozess. Sie dient dazu, meist durch Genduplikation die Gendosis einzelner Gene bei Bedarf zu steigern. Man hat bei mehreren Lebewesen, z. B. beim Gelbrandkäfer (Dytiscus marginalis) oder beim Krallenfrosch (Xenopus laevis) herausgefunden, dass sie ribosomale DNA extrachromosomal amplifizieren können. Dies geschieht vor allem bei Eizellen, da dort der Bedarf an Ribosomen stark erhöht ist. Die Amplifizierung erfolgt, indem die rDNA herausgeschnitten und zirkularisiert wird. Die rDNA-Ringe werden dann durch rolling circle-Replikation vermehrt und gleichen somit den Mangel wieder aus. Ein weiteres Beispiel der natürlichen Amplifikation liefern die Gene für die Eihülle (Chorion) in den Follikelzellen von Drosophila melanogaster. Vor den Genen liegt ein unidirektionaler origin of replication (ori). Dieser bewirkt, dass nur die Gene selektiv repliziert werden, während andere Genombereiche in der alten Anzahl verbleiben. Die Replikation setzt an den Genen gleich mehrfach an, sodass es im Elektronenmikroskop wie eine Zwiebelschalenstruktur aussieht, weswegen man auch von onion skin replication spricht. Die Choriongene werden dabei versechzehnfacht, um für das rasante Ei-Wachstum genug Proteine zu liefern.
Gesundheitliche Auswirkungen
Bei manchen Onkogenen kann es im Zuge der Onkogenese zu Amplifikationen kommen, z. B. HER2/neu.[5] Zu einer Amplifikation kann es „als Reaktion“ von manchen Onkogenen gegen Cytostatika kommen. Bei der Therapie von Krebs werden als Cytostatikum oftmals Mittel benutzt, die die Produktion der Nukleobasen oder deren Ausgangsstoffe verhindern. Die Krebszellen reagieren gelegentlich darauf mit der Amplifikation derjenigen Genbereiche, deren Genprodukte durch die Cytostatika gehemmt oder blockiert werden. Die Amplifikation geschieht intrachromosomal durch Ausbildung von sogenannten homogeneous staining regions, also homogenen Chromosomenverlängerungen oder extrachromosomal durch sogenannte double minutes.
Amplifikation als Technik
Die bedeutendste Technik der Amplifikation von DNA ist vermutlich die Polymerase-Kettenreaktion.[6]
Einzelnachweise
- ↑ M. Debatisse, B. Malfoy: Gene amplification mechanisms. In: Advances in experimental medicine and biology. Band 570, 2005, S. 343–361, ISSN 0065-2598. doi:10.1007/1-4020-3764-3_12. PMID 18727507.
- ↑ K. T. Elliott, L. E. Cuff, E. L. Neidle: Copy number change: evolving views on gene amplification. In: Future microbiology. Band 8, Nummer 7, Juli 2013, S. 887–899, ISSN 1746-0921. doi:10.2217/fmb.13.53. PMID 23841635.
- ↑ L. Sandegren, D. I. Andersson: Bacterial gene amplification: implications for the evolution of antibiotic resistance. In: Nature reviews. Microbiology. Band 7, Nummer 8, August 2009, S. 578–588, ISSN 1740-1534. doi:10.1038/nrmicro2174. PMID 19609259.
- ↑ C. Bass, L. M. Field: Gene amplification and insecticide resistance. In: Pest management science. Band 67, Nummer 8, August 2011, S. 886–890, ISSN 1526-4998. doi:10.1002/ps.2189. PMID 21538802.
- ↑ M. Yan, B. A. Parker, R. Schwab, R. Kurzrock: HER2 aberrations in cancer: Implications for therapy. In: Cancer treatment reviews. [elektronische Veröffentlichung vor dem Druck] März 2014, ISSN 1532-1967. doi:10.1016/j.ctrv.2014.02.008. PMID 24656976.
- ↑ C. Zhang, J. Xu, W. Ma, W. Zheng: PCR microfluidic devices for DNA amplification. In: Biotechnology advances. Band 24, Nummer 3, 2006 May-Jun, S. 243–284, ISSN 0734-9750. doi:10.1016/j.biotechadv.2005.10.002. PMID 16326063.