„Kozak-Sequenz“ – Versionsunterschied

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[[Datei:KozakConsensus.jpg|thumb|Die Häufigkeitsverteilung der Nukleinbasen in der Nähe des Startcodons AUG (+1 bis +3), dargestellt durch die Größe des [[Nukleinsäure-Nomenklatur|Basen-Codes]] führt zur Kozak-Sequenz]]
[[Datei:KozakConsensus.jpg|thumb|Die Häufigkeitsverteilung der Nukleinbasen in der Nähe des Startcodons AUG (+1 bis +3), dargestellt durch die Größe des [[Nukleinsäure-Nomenklatur|Basen-Codes]] führt zur Kozak-Sequenz]]
Die '''Kozak-Sequenz''',auch engl. '''Kozak consensus sequence''' genannt, ist eine [[Nukleinbase]]n-Sequenz in der [[Messenger-RNA]] (mRNA) [[eukaryot]]ischer Lebewesen. Sie stellt einen Konsens aus den am häufigsten vorkommenden Nukleinbasen in unmittelbarer Nähe des [[Startcodon]]s AUG auf der mRNA dar. Als Kozak-Sequenz wird oft die Basenfolge (gcc)gccRccATGG genannt, wobei es deutliche Unterschiede zwischen verschiedenen Gruppen von Eukaryoten gibt. Die Kozak-Sequenz oder eine ähnliche Nukleinbasenfolge wird von den [[Ribosom]]en erkannt und ist für den Start der [[Translation (Biologie)|Translation]] im Rahmen der [[Proteinbiosynthese]] von Bedeutung.
Die '''Kozak-Sequenz''',auch engl. '''Kozak consensus sequence''' genannt, ist eine [[Nukleinbase]]n-Sequenz in der [[Messenger-RNA]] (mRNA) [[eukaryot]]ischer Lebewesen. Sie stellt einen Konsens aus den am häufigsten vorkommenden Nukleinbasen in unmittelbarer Nähe des [[Startcodon]]s AUG auf der mRNA dar. Als Kozak-Sequenz wird oft die Basenfolge (gcc)gccRccATGG genannt, wobei es deutliche Unterschiede zwischen verschiedenen Gruppen von Eukaryoten gibt. Die Kozak-Sequenz oder eine ähnliche Nukleinbasenfolge wird von den [[Ribosom]]en erkannt und ist für den Start der [[Translation (Biologie)|Translation]] im Rahmen der [[Proteinbiosynthese]] von Bedeutung.

== Variationen ==

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|}

== Einzelnachweise ==
<references/>


[[Kategorie:RNA]]
[[Kategorie:RNA]]

Version vom 11. Februar 2010, 22:10 Uhr

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Die Häufigkeitsverteilung der Nukleinbasen in der Nähe des Startcodons AUG (+1 bis +3), dargestellt durch die Größe des Basen-Codes führt zur Kozak-Sequenz

Die Kozak-Sequenz,auch engl. Kozak consensus sequence genannt, ist eine Nukleinbasen-Sequenz in der Messenger-RNA (mRNA) eukaryotischer Lebewesen. Sie stellt einen Konsens aus den am häufigsten vorkommenden Nukleinbasen in unmittelbarer Nähe des Startcodons AUG auf der mRNA dar. Als Kozak-Sequenz wird oft die Basenfolge (gcc)gccRccATGG genannt, wobei es deutliche Unterschiede zwischen verschiedenen Gruppen von Eukaryoten gibt. Die Kozak-Sequenz oder eine ähnliche Nukleinbasenfolge wird von den Ribosomen erkannt und ist für den Start der Translation im Rahmen der Proteinbiosynthese von Bedeutung.

Variationen

Biota Phylum Consensus sequences
Wirbeltiere
gccRccATGG[1]
Fruchtfliege (Drosophila spp.) Arthropoda   cAAaATG[2]
Backhefe (Saccharomyces cerevisiae) Ascomycota aAaAaAATGTCt[3]
Dictyostelium discoideum Amoebozoa aaaAAAATGRna[4]
Wimpertierchen Ciliophora nTaAAAATGRct[4]
Plasmodium ssp. Apicomplexa taaAAAATGAan[4]
Toxoplasma (Toxoplasma gondii) Apicomplexa gncAaaATGg[5]
Trypanosomatidae Euglenozoa nnnAnnATGnC[4]
Landpflanzen
  AACAATGGC[6]

Einzelnachweise

  1. ↑ Referenzfehler: Ungültiges <ref>-Tag; kein Text angegeben für Einzelnachweis mit dem Namen Kozak1987.
  2. ↑ Cavener DR: Comparison of the consensus sequence flanking translational start sites in Drosophila and vertebrates. In: Nucleic Acids Res. 15. Jahrgang, Nr. 4, Februar 1987, S. 1353–61, doi:10.1093/nar/15.4.1353, PMID 3822832, PMC 340553 (freier Volltext) – (oxfordjournals.org).
  3. ↑ Hamilton R, Watanabe CK, de Boer HA: Compilation and comparison of the sequence context around the AUG startcodons in Saccharomyces cerevisiae mRNAs. In: Nucleic Acids Res. 15. Jahrgang, Nr. 8, April 1987, S. 3581–93, doi:10.1093/nar/15.8.3581, PMID 3554144, PMC 340751 (freier Volltext) – (oxfordjournals.org).
  4. ↑ a b c d Yamauchi K: The sequence flanking translational initiation site in protozoa. In: Nucleic Acids Res. 19. Jahrgang, Nr. 10, Mai 1991, S. 2715–20, doi:10.1093/nar/19.10.2715, PMID 2041747, PMC 328191 (freier Volltext) – (oxfordjournals.org).
  5. ↑ Seeber, F.: Consensus sequence of translational initiation sites from Toxoplasma gondii genes. In: Parasitology Research. 83. Jahrgang, Nr. 3, 1997, S. 309–311, doi:10.1007/s004360050254, PMID 9089733.
  6. ↑ Lütcke HA, Chow KC, Mickel FS, Moss KA, Kern HF, Scheele GA: Selection of AUG initiation codons differs in plants and animals. In: Embo J. 6. Jahrgang, Nr. 1, Januar 1987, S. 43–8, PMID 3556162, PMC 553354 (freier Volltext).
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