Affinitätselektrophorese
Die Affinitätselektrophorese umfasst in der Biochemie alle elektrophoretischen Verfahren, bei denen ein verändertes Laufverhalten von Molekülen (z. B. von Proteinkomplexen oder DNA-Protein-Komplexen) durch die Affinität zweier oder mehrerer Moleküle zueinander erzeugt wird.[1] Aufgrund der veränderten Laufgeschwindigkeiten werden affinitätselektrophoretische Verfahren auch als electrophoretic shift assays bezeichnet.
Verfahren
Je nach beobachtetem Parameter einer Elektrophorese werden die Anwendungen als mobility shift electrophoresis (bei verfolgter Laufweite), charge shift electrophoresis (bei verfolgtem isoelektrischem Punkt) oder affinity capillary electrophoresis (bei einer Kapillarelektrophorese) bezeichnet.
Affinitätselektrophoretische Verfahren zum Nachweis von Protein-Protein-Interaktionen sind z. B. die QPNC-PAGE, die Clear-Native-PAGE, die Blue-Native-PAGE oder die SDS-PAGE nach einer Quervernetzung.
Die Interaktion von DNA mit Proteinen kann durch einen Electrophoretic Mobility Shift Assay oder eine Kapillarelektrophorese nachgewiesen werden.
Eine Bindung von Kohlenhydraten an Proteine (z. B. von Polysacchariden an Lektine) kann durch eine Lektin-Affinitätselektrophorese untersucht werden.[2]
Literatur
- Erica A. Golemis, Peter D. Adams: Protein-protein interactions. A molecular cloning manual. 2nd edition. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 2005, ISBN 0-87969-723-7.
- Friedrich Lottspeich, Joachim W. Engels (Hrsg.): Bioanalytik. 3., aktualisierte und erweiterte Auflage. Springer Spektrum, Berlin u. a. 2012, ISBN 978-3-8274-2942-1.
Einzelnachweise
- ↑ N. H. Heegaard, R. T. Kennedy: Identification, quantitation, and characterization of biomolecules by capillary electrophoretic analysis of binding interactions. In: Electrophoresis. Band 20, Nr. 15-16, Oktober 1999, S. 3122–3133, doi:10.1002/(SICI)1522-2683(19991001)20:15/16<3122::AID-ELPS3122>3.0.CO;2-M, PMID 10596820.
- ↑ Kazuaki Kakehi, Mitsuhiro Kinoshita: Capillary lectin-affinity electrophoresis for glycan analysis. In: Methods in molecular biology. Band 534, 2009, S. 93–105, doi:10.1007/978-1-59745-022-5_7, PMID 19277533.