CHARMM
| CHARMM | |
|---|---|
| Basisdaten
| |
| Entwickler | Martin Karplus, Accelrys |
| Erscheinungsjahr | 1983 |
| Aktuelle Version | c39b1 (15. August 2014) |
| Aktuelle Vorabversion | c40a1 (15. August 2014) |
| Betriebssystem | Unix |
| Programmiersprache | Fortran |
| Kategorie | Simulationssoftware |
| Lizenz | kommerziell (600 US-$ für Akademiker) |
| deutschsprachig | nein |
| www.charmm.org | |
CHARMM (Chemistry at Harvard Macromolecular Mechanics) ist ein Programm für molekulardynamische Berechnungen (MD) von (biologischen) Makromolekülen wie Proteinen und DNA. Weiterhin wird mit CHARMM eine Reihe von Kraftfeldern in Verbindung gebracht. Die Software selbst wird von der chemischen Fakultät der Harvard University gepflegt und weltweit in verschiedenen Arbeitsgruppen weiterentwickelt und ist in Fortran geschrieben.
CHARMM Kraftfeld
Das CHARMM Kraftfeld ist neben den AMBER und GROMACS Kraftfeldern heute eines der am meisten verwendeten und wird von einer Reihe von weiterer Programmen wie beispielsweise NAMD unterstützt. Während das Simulationsprogramm an der Havard University gepflegt wird, wird die Kraftfeldentwicklung in der Gruppe von Alexander MacKerell an der University of Maryland durchgeführt. Die Kraftfelder werden dabei kostenlos zum Download bereitgestellt.
Siehe auch
Weblinks
- CHARMM-Website
- CHARMM-Tutorial
- CHARMM Website bei Harvard
- VMD - Visualisierung von CHARMM-Trajektorien
- Docking@Home
- CHARMM-GUI project
- CHARMM-Kraftfelder