Diskussion:Z-DNA

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Letzter Kommentar: vor 17 Jahren von Skho
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Die Daten der folgenden Tabelle werden angezweifelt und ließen sich nicht durch Quellen stützen. Es wird um Überprüfung unter Quellenangabe gebeten: ↗ nerdi disk.Hürdenlauf? 14:04, 13. Feb. 2007 (CET)Beantworten

Strukturinformationen der drei DNA-Formen, die biologisch relevant sein könnten (B-DNA ist die in der belebten Natur häufigste Form)
Strukturmerkmal A-DNA B-DNA Z-DNA
Drehsinn der Helix rechts rechts links
Repititive Elemente 1 bp 1 bp 2 bp
Helikale Drehung je Basenpaar (twist) 33.6° 35.9° 60°/2bp
Basenpaare pro helikale Windung 10.7 10.0 12
Neigungswinkel der Basenpaare zur Achse +19° -1.2° -9°
Längenwachstum pro Basenpaar entlang der Achse 23 Å 33.2 Å 38 Å
Abstand der Windungen voneinander 24.6 Å 33.2 Å 45.6 Å
Mean propeller twist +18° +16°
Glykosidische Bindung anti anti C: anti,
G: syn
Zuckerkonformation C3'-endo C2'-endo C: C2'-endo,
G: C2'-exo
Durchmesser 25.5 Å 23.7 Å 18.4 Å


Im Voet et al: "Fundamentals of Biochemstry" 2nd Edition (2006) ist folgende Tabelle, dies scheint mir verlässlicher zu sein. Ich habe ausserdem die Begriffe mit dem deutschen Voet (2002) abgestimmt, das sollte nun korrekt sein. Ich weiss nicht ob alle information; besonders die zur grossen und kleinen Furche wirklich hier sein sollte, aber ich hab die Tabelle einfach mal Originalgetreu genommen und nichts ausgelassen. Die Daten sollten also auf dem neusten Stand sein und stimmen! : --hroest 14:42, 13. Feb. 2007 (CET)Beantworten

Strukturinformationen der drei DNA-Formen, die biologisch relevant sein könnten (B-DNA ist die in der belebten Natur häufigste Form)
Strukturmerkmal A-DNA B-DNA Z-DNA
helikaler Drehsinn rechts rechts links
Durchmesser ~26 Å ~20 Å ~18 Å
Basenpaare pro helikale Windung 11.6 10.0 12 (6 Dimere)
Helikale Windung je Basenpaar (twist) 31° 36° 60° (pro Dimer)
Ganghöhe (Anstig pro Windung) 34 Å 34 Å 44 Å
Anstieg pro Base 2.9 Å 3.4 Å 7.4 Å (pro Dimer)
Neigungswinkel der Basenpaare zur Achse 20°
Grosse Furche eng und tief breit und tief flach
Kleine Furche breit und flach eng und tief eng und tief
Zuckerkonformation C3'-endo C2'-endo Pyrimidine: C2'-endo
Purine: C3'-endo
Glykosidische Bindung anti anti Pyrimidine: anti
Purine: syn


m.M.n. sollten es auch irgendwie sowas wie eine Legende geben oder die Einheiten werden ausgeschrieben. Als nicht Biologe/Gentechniker hat man nicht unbedingt eine Ahnung was Å, bp, Dimer bedeuten. --skho Nachricht 15:17, 13. Feb. 2007 (CET)Beantworten
Stimmt, wird ergänzt (nach Möglichkeit). Allerdings gibt es einige Sachen hier, die man als Nicht-Biologe nicht versteht und gerade bei der Tabelle halte ich es für sinnvoll, wenn auch fortgeschrittene Information geboten wird, oder? Ich meine, es ist ja nicht der ganze Artikel Tabelle. --hroest 16:16, 13. Feb. 2007 (CET)Beantworten
ja klar sollen auch fortgeschrittene Informationen rein, manchmal klappt es auch nicht, dass selbst Oma es versteht. Gut mit den Wikilinks in der Tabelle ist es m.E. ok. --skho Nachricht 16:31, 13. Feb. 2007 (CET)Beantworten

Allgeimein: Pyrimidine und Purine[Quelltext bearbeiten]

Meiner Meinung nach sollte der Paragraph

Der Name Z-DNA leitet sich vom zickzackartigen Verlauf des Zucker-Phosphat-Rückgrates ab. Diese außergewöhnliche Struktur wird durch die alternierende glykosidische Bindung bei Guanosin (syn) und Cytidin (anti) hervorgerufen. Entsprechend tritt die Z-Form der DNA besonders in Bereichen auf, in denen genannte Basen häufig und alternierend vorkommen (GCGC...).

überarbeitet werden, da es sicher nicht korrekt ist, dass dies nur bei G und C geschieht, sondern (laut Voet) allgemein immer bei abwechselnden Pyrimidinen und Purine, also auch bei poly AC / poly GT. --hroest 14:45, 13. Feb. 2007 (CET)Beantworten