Benutzer:Thomasgl/Baustelle2

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Andrea Thorn (* 1982 in Hamburg) ist eine deutsche Molekularbiologin. Seit 2020 arbeitet sie am Institut für Nanostruktur und Festkörperphysik der Universität Hamburg[1] und leitet die Coronavirus Structural Task Force[2].

Leben[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Thorn studierte Molecular Life Sciences an der Universität Erlangen von 2002 bis 2007, hatte 2004 einen 3-monatigen Aufenthalt an der Universität Chiba,[3] hielt 2008 einen Vortrag in Kyōto[4] und promovierte 2011 in George Sheldricks Gruppe an der Universität Göttingen über das Thema Angewandte Methoden zur Röntgenstrukturbestimmung von Makromolekülen.[5] Schwerpunktmäßig arbeitet sie an der Weiterentwicklung von Methoden in der Kristallographie. Sie arbeitete in Randy Reads Gruppe an der University of Cambridge und danach unabhängig als Marie-Curie-Stipendiatin am MRC Laboratory of Molecular Biology. Am Diamond Light Source und an der University of Oxford entwickelte sie die Software AUSPEX.[6][7]

Im Jahr 2019 wurde Thorn Juniorgruppenleiterin an der Universität Würzburg und begann, zusätzlich an den Möglichkeiten von AI-basierten Methoden[8] zu forschen. Seit Oktober 2020 arbeitet sie an der Universität Hamburg[9]und am Synchrotron PETRA.[10][11][12] Sie ist die Leiterin des international besetzten Teams der Coronavirus Structural Task Force, die sich das Ziel gesetzt hat, diverse Fehler in vorhandenen Proteinstrukturen zu finden[13] und die verbesserten Strukturmodelle der Forschungsgemeinschaft zur Verfügung zu stellen[14], um einen Beitrag im Kampf gegen COVID-19 leisten zu können.[15][16][17][18] Die Task Force stellt auch ein druckbares 3D-Modell des Coronavirus zur Verfügung[19][20][21]. Das Virus ist aber nur außerhalb der Zelle ein kugelförmiges Gebilde, innerhalb der infizierten Zelle zerfällt es in die Bestandteile, die verschiedenen Proteine. Letztendlich geht es der Task Force um das Verständnis der molekularen Maschinerie des Virus, d. h. wie die einzelnen Virusproteine eine befallene Zelle zum Bau von mehr Virus zwingen, um mit diesem Wissen effektive Medikamente entwickeln zu können[22][23].

Über ihre bisherige Biographie wurde auch im Straßenkreuzer berichtet.[24]

Forschungsschwerpunkte[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Zu Thorns Forschungsschwerpunkten gehören die Entwicklung neuer Qualitätsindikatoren für Einkristall-Diffraktionsdaten und die Verbesserung der Modellierung biologischer Makromoleküle in Kristallographie und Cryo-EM[8]. Außerdem arbeitet sie an der Evaluation und Verbesserung aller makromolekularer Molekülstrukturen aus SARS-CoV-2[25].

Auszeichnungen[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

  • Rising Star Award, Asian Crystallographic Association 2013

Veröffentlichungen[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

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  • Croll, T., Diederichs, K., Fischer, F., Fyfe, C., Gao, Y., Horrell, S., Joseph, A., Kandler, L., Kippes, O., Kirsten, F., Müller, K., Nolte, K., Payne, A., Reeves, M.G., Richardson, J., Santoni, G., Stäb, S., Tronrud, D., Williams, C, Thorn, A*. (2021) Making the invisible enemy visible, Nature Structural & Molecular Biology 28, 404–408
  • Mostosi, P., Schindelin, H., Kollmannsberger, P. & Thorn, A.* (2019) Haruspex: A Neural Network for the Automatic Identification of Oligonucleotides and Protein Secondary Structure in Cryo‐EM Maps (2020) Angewandte Chem. (Int. Edition) 59, 14788-14795
  • Thorn, A.*, Parkhurst, J.M., Emsley, P., Nicholls, R., Evans, G., Vollmar, M. & Murshudov, G.N. (2017) AUSPEX: a graphical tool for X-ray diffraction data analysis, Acta Cryst D73, 729-737
  • Parkhurst, J.M., Thorn, A., Vollmar, M., Winter, G., Waterman, D.G., Fuentes-Montero, L., Gildea, R.J., Murshudov G.N. & Evans, G. (2017) Background modelling of diffraction data in the presence of ice-rings, IUCrJ 4, 626-638.
  • Thorn, A.* (2016) Experimental Phasing: Substructure Solution and Density Modification as Implemented in SHELX in Protein Crystallography, Methods in Molecular Biology (series), 357-376 Koeditoren A. Wlodawer, Z. Dauter, and M. Jaskolski, Springer 2017[26].
  • Knott, G.J, Panjikar, S., Thorn, A., Fox, A.H., Conte, M.R., Lee, M. & Bond, C.S. (2016) A crystallographic study of human NONO (p54nrb): Overcoming pathological problems with purification, data collection and non-crystallographic symmetry, Acta Cryst. D72, 761-769
  • Deigan Warner, K.D., Chen, M.C., Song, W., Strack R.L., Thorn, A., Jaffrey S.R. & Ferré-D’Amaré, A.R. (2014) Structural basis for activity of highly efficient RNA mimics of green fluorescent protein, NSMB 21, 658-663
  • Thorn, A.* & Sheldrick G.M. (2013) Extending Molecular Replacement Solutions with SHELXE, Acta Cryst. D69, 2251-2256.
  • Cooper, R.I., Thorn, A. & Watkin D.J. (2012) CRYSTALS enhancements: asymmetric restraints, J. Appl. Cryst. 45, 1057-1060
  • Thorn, A., Steinfeld, R., Ziegenbein, M., Grapp, M., Hsiao, H.H., Urlaub, H., Sheldrick, G.M., Gärtner, J. & Krätzner, R. (2012) Structure and activity of the only human RNase T2, Nucleic Acids Res. 40, 8733-8742
  • Thorn, A., Dittrich, B. & Sheldrick, G.M. (2012) Enhanced rigid-bond restraints Acta Cryst. A68, 448- 451
  • Thorn, A. & Sheldrick, G.M. (2011) ANODE: ANOmalous and heavy-atom DEnsity calculation, J. Appl. Cryst. 44, 1285-1287
  • Vouffo, B., Dongo, E., Facey, P., Thorn, A., Sheldrick, G. M., Maier, A., Fiebig, H.H. & Laatsch, H. (2010) Antiarol cinnamate and Africanoside, a cinnamoyl triterpene and a hydroperoxy-cardenolide from the stem bark of Antiaris Africana, Planta Med. 76, 1717-1723
  • Tavcar, G., Sen, S.S., Azhakar, R., Thorn, A. & Roesky, H.W. (2010) Facile syntheses of silylene nickel carbonyl complexes from Lewis base stabilized chlorosilylenes, Inorg. Chem. 49, 10199-10202 (IF: 4.9, Zitationen: 90)
  • Fischer, A., Stern, D., Thorn, A., Abraham, S., Stalke, D. & Klingebiel, U. (2010) From the Lithium-2- anilide-2-fluoro-1,3-diaza-2-sila-cyclopentene-GaCl3 Adduct to 1,4,6-Triaza-5-gallium-7-sila-cyclo-3- heptene - Experimental and Quantum-chemical Results, Z. Anorg. Allg. Chem. 636, 1527-1532
  • Vollmar, D., Thorn, A., Schuberth, I. & Grond, S. (2009) A comprehensive view on 4-methyl-2- quinazolinamine, a new microbial alkaloid from Streptomyces of TCM plant origin, J. Antibiot. 62, 439- 444 (IF: 2.4, Zitationen: 13)
  • Thorn, A., Egerer-Sieber, C., Jäger, C.M., Herl, V., Müller-Uri, F., Kreis, W. & Muller Y.A. (2008) The crystal structure of 5β-Progesterone Reductase from Digitalis Lanata defines of a novel subfamily of short-chain dehydrogenases/reductases, J. Biol. Chem. 283, 17260-17269
  • Tampier, S., Müller, R., Thorn, A., Hübner, E. & Burzlaff, N. (2008) Synthesis, Structure and Reactivity of Ruthenium Carboxylato and 2-Oxocarboxylato Complexes bearing the Bis(3,5-dimethylpyrazol-1- yl)acetato Ligand, Inorg. Chem. 47, 9624-9641

Weblinks[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Einzelnachweise[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

  1. ↑ Dr. Andrea Thorn — Universität Hamburg, Institut for Nanostruktur und Festkörperphysik. Abgerufen am 17. Dezember 2021.
  2. ↑ Dr. Andrea Thorn : Nanostruktur- und Festkörperphysik : Gruppenleiterin. Abgerufen am 17. Dezember 2021.
  3. ↑ Andrea Thorn, Research Group Leader at University of Hamburg. In: LinkedIn. Abgerufen am 18. Dezember 2021.
  4. ↑ Kyoto Crystallographic Computing School 2008 - Participants. IUCr, 14. Dezember 2009, abgerufen am 28. Dezember 2021.
  5. ↑ Andrea Thorn: Practical approaches to macromolecular X-ray structure determination. In: eDiss Göttingen (Hrsg.): Dissertation. 21. November 2011 (uni-goettingen.de [abgerufen am 14. Dezember 2021]).
  6. ↑ Neue Modelle und bessere Daten für die makromolekulare Strukturbestimmung. Abgerufen am 17. Dezember 2021.
  7. ↑ A. Thorn, J. Parkhurst, P. Emsley, R. A. Nicholls, M. Vollmar: AUSPEX: a graphical tool for X-ray diffraction data analysis. In: Acta Crystallographica Section D: Structural Biology. Band 73, Nr. 9, 1. September 2017, ISSN 2059-7983, S. 729–737, doi:10.1107/S205979831700969X.
  8. ↑ a b P. Mostosi, H. Schindelin, P. Kollmannsberger, Andrea Thorn: Haruspex: A Neural Network for the Automatic Identification of Oligonucleotides and Protein Secondary Structure in Cryo-Electron Microscopy Maps. In: Angewandte Chemie. Band 132, Nr. 35, 2020, ISSN 1521-3757, S. 14898–14905, doi:10.1002/ange.202000421.
  9. ↑ Marc Hasse: Diese Hamburgerin erforscht die Struktur des Coronavirus. In: Hamburger Abendblatt Online. 14. Juni 2021, abgerufen am 14. Dezember 2021.
  10. ↑ SARS-CoV-2: Ein Virus hält die Wissenschaft in Atem. In: ZDF-heute -Planet-e. 17. Januar 2021, abgerufen am 14. Dezember 2021.
  11. ↑ Volle Kanne. In: ZDF. 15. Januar 2021, abgerufen am 15. Dezember 2021.
  12. ↑ A. Thorn am PETRA III. In: nano (3SAT). 2. Februar 2021, abgerufen am 17. Dezember 2021.
  13. ↑ Structural biologists clean up SARS-CoV-2 protein structures. In: C&EN Online. 31. März 2021, abgerufen am 17. Dezember 2021 (englisch).
  14. ↑ Molekülstrukturmodelle des Coronavirus verbessern. In: Labo. Dr. Barbara Schick, 11. Mai 2021, abgerufen am 19. Dezember 2021.
  15. ↑ Tim Pritlove: FG085 Coronavirus Structural Task Force (PODCAST). In: Forschergeist.de. 6. April 2021, abgerufen am 17. Dezember 2021.
  16. ↑ Andrea Thorn: Die Coronavirus Structural Task Force. In: BIOspektrum. Band 26, Nr. 4, 1. Juni 2020, ISSN 1868-6249, S. 442–443, doi:10.1007/s12268-020-1408-0, PMID 32834542, PMC 7318718 (freier Volltext).
  17. ↑ The Team, insidecorona.net, abgerufen am 14. Dezember 2021
  18. ↑ „Wollen den Aufbau von Corona verstehen“. In: Berliner Zeitung Online. 25. Februar 2021, abgerufen am 14. Dezember 2021.
  19. ↑ Das Coronavirus zum Ausdrucken - Erstes biologisch korrektes Modell von SARS-CoV-2 für den 3D-Drucker - scinexx.de. 3. August 2020, abgerufen am 19. Dezember 2021 (deutsch).
  20. ↑ Christian Lüttmann: Coronaviren in der Detailansicht. In: Laborpraxis (Online). 18. Mai 2021, abgerufen am 18. Dezember 2021.
  21. ↑ Coronaviren zum Anfassen aus dem 3D-Drucker. In: Medica Magazine (online). 3. August 2020, abgerufen am 18. Dezember 2021.
  22. ↑ Film von Birgit Hermes und Thomas Bleich: Corona – Ende in Sicht? In: Phoenix TV. Abgerufen am 19. Dezember 2021.
  23. ↑ Deutsche Welle (www.dw.com): Inside the coronavirus factory | DW | 20.05.2020. Abgerufen am 19. Dezember 2021 (britisches Englisch).
  24. ↑ Die Strukturen erkennen. In: Strassenkreuzer.info. 1. Juli 2020, abgerufen am 17. Dezember 2021.
  25. ↑ Tristan I. Croll, Kay Diederichs, Florens Fischer, … & AndreaThorn: Making the invisible enemy visible. In: Nature Structural & Molecular Biology. Band 28, Nr. 5, Mai 2021, ISSN 1545-9985, S. 404–408, doi:10.1038/s41594-021-00593-7.
  26. ↑ Andrea Thorn: Experimental Phasing: Substructure Solution and Density Modification as Implemented in SHELX. In: Protein Crystallography: Methods and Protocols (= Methods in Molecular Biology). Springer, New York, NY 2017, ISBN 978-1-4939-7000-1, S. 357–376, doi:10.1007/978-1-4939-7000-1_15.
Personendaten
NAME Thorn, Andrea
KURZBESCHREIBUNG Molekularbiologin
GEBURTSDATUM 1982
GEBURTSORT Hamburg

Beispiel für die Verwendung von <chem> (Besser als math) siehe VErsionsgeschichte.

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