„PVC-Gruppe“ – Versionsunterschied
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| Taxon_Name = PVC-Gruppe |
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Die '''PVC-Gruppe''' ({{enS}} {{lang|en|'''PVC group'''}}) ist eine [[Klade]] (Verwandtschaftsgruppe) von [[Bakterien]].<ref name="NCBI"/> Die Bezeichnung ist ein [[Akronym]], benannt nach den ursprünglichen drei Mitglieds-[[Phylum|Phyla]] [[Planctomycetes]], [[Verrucomicrobia]] und [[Chlamydiae]].<ref name="Wagner2006"/><ref name="Rivas2018"/> |
Die '''PVC-Gruppe''' ({{enS}} {{lang|en|'''PVC group'''}}) ist eine [[Klade]] (Verwandtschaftsgruppe) von [[Bakterien]].<ref name="NCBI" /> Die Bezeichnung ist ein [[Akronym]], benannt nach den ursprünglichen drei Mitglieds-[[Phylum|Phyla]] [[Planctomycetes]], [[Verrucomicrobia]] und [[Chlamydiae]].<ref name="Wagner2006" /><ref name="Rivas2018" /> |
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[[Thomas Cavalier-Smith]] postulierte 2002, dass die Bakterien dieser Gruppe ihre [[Peptidoglykan]]-[[Zellwand]] zweimal verloren oder reduziert haben.<ref name="Cavalier2002"/> |
[[Thomas Cavalier-Smith]] postulierte 2002, dass die Bakterien dieser Gruppe ihre [[Peptidoglykan]]-[[Zellwand]] zweimal verloren oder reduziert haben.<ref name="Cavalier2002" /> |
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In seiner Sys­tematik nannte er die Gruppe '''Planctobacteria''' (Planctobakterien) im [[Taxonomie|taxonomischen]] Rang eines [[Phylum]]s und die namensgebenden Mitglieder lediglich als [[Klasse (Biologie)|Klasse]].<ref name="Cavalier2002"/> |
In seiner Sys­tematik nannte er die Gruppe '''Planctobacteria''' (Planctobakterien) im [[Taxonomie|taxonomischen]] Rang eines [[Phylum]]s und die namensgebenden Mitglieder lediglich als [[Klasse (Biologie)|Klasse]].<ref name="Cavalier2002" /> |
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Dies wird jedoch von der größeren wissenschaftlichen Gemeinschaft nicht übernommen und die PVC-Gruppe dagegen eher als Superphylum eingestuft,<ref name="Garrity2010"/> und der Begriff Planctobacteria wird manchmal synonym zum Phylum Planctomycetes verwendet. |
Dies wird jedoch von der größeren wissenschaftlichen Gemeinschaft nicht übernommen und die PVC-Gruppe dagegen eher als Superphylum eingestuft,<ref name="Garrity2010" /> und der Begriff Planctobacteria wird manchmal synonym zum Phylum Planctomycetes verwendet. |
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In der bakteriellen Megaklassifikation nach Cavalier-Smith gehören die Plancto­bak­terien (alias PVC-Gruppe) zum bakteriellen Infrareich ({{enS}} {{lang|en|infrakingom}}, {{laS}} {{lang|la|infraregnum}}) [[Gracilicutes]] und umfassen neben den genannten Plancto­mycetes, Verrucomicrobia und Chlamydiae insbesondere auch die [[Lentisphaerae]].<ref name="Cavalier2002"/><ref name="Cavalier2006"/> |
In der bakteriellen Megaklassifikation nach Cavalier-Smith gehören die Plancto­bak­terien (alias PVC-Gruppe) zum bakteriellen Infrareich ({{enS}} {{lang|en|infrakingom}}, {{laS}} {{lang|la|infraregnum}}) [[Gracilicutes]] und umfassen neben den genannten Plancto­mycetes, Verrucomicrobia und Chlamydiae insbesondere auch die [[Lentisphaerae]].<ref name="Cavalier2002" /><ref name="Cavalier2006" /> |
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== Hypothese zur Eukaryogenese == |
== Hypothese zur Eukaryogenese == |
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[[Patrick Forterre]] (2011) und Baum ''et al.'' (2014) stellten die Hypothese auf, dass ein Mitglied der PVC-Klade in einem [[Endosymbiose|endosymbiotischen]] Ereignis in der Frühzeit des Leben [[Wirt (Biologie)|Wirtszelle]] gewesen sein könnte, aus der die erste [[Eukaryoten#Entwicklungsgeschichte|proto-eukaryotische]] Zelle hervorging.<ref name="Forterre2011"/><ref name="Baum2014"/> Diese Hypothese steht in Konkurrenz zur [[Eozyten-Hypothese]], nach der diese Wirtszellen stattdessen bestimmte [[Archaeen]] waren – nach der ursprünglichen Vermutung [[Crenarchaeota]] alias Eozyten. Diese Auffassung hat in jüngster Zeit Unterstützung bekommen: so vermutet man den Ursprung der Eukaryoten heute eher bei oder in den neu entdeckten (und mit den Crenarchaeota weitläufig verwandten) [[Asgard-Archaeen]]. |
[[Patrick Forterre]] (2011) und Baum ''et al.'' (2014) stellten die Hypothese auf, dass ein Mitglied der PVC-Klade in einem [[Endosymbiose|endosymbiotischen]] Ereignis in der Frühzeit des Leben [[Wirt (Biologie)|Wirtszelle]] gewesen sein könnte, aus der die erste [[Eukaryoten#Entwicklungsgeschichte|proto-eukaryotische]] Zelle hervorging.<ref name="Forterre2011" /><ref name="Baum2014" /> Diese Hypothese steht in Konkurrenz zur [[Eozyten-Hypothese]], nach der diese Wirtszellen stattdessen bestimmte [[Archaeen]] waren – nach der ursprünglichen Vermutung [[Crenarchaeota]] alias Eozyten. Diese Auffassung hat in jüngster Zeit Unterstützung bekommen: so vermutet man den Ursprung der Eukaryoten heute eher bei oder in den neu entdeckten (und mit den Crenarchaeota weitläufig verwandten) [[Asgard-Archaeen]]. |
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== Molekulargenetische Charakterisierung == |
== Molekulargenetische Charakterisierung == |
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[[Planctomycetes]], [[Verrucomicrobia]], und [[Chlamydiae]] werden in der konventionellen molekularen Phylogenie als [[Phylum|Phyla]] (d. h. [[Stamm (Biologie)#Bakterien|Stämme]] oder [[Abteilung (Biologie)|Abteilungen]], {{enS|divisions}}) betrachtet, und in der PVC-Gruppe als Superphylum zusammengefasst, zusammen mit weiteren Kandidaten-Phyla wie [[Omnitrophica]]<ref name="uniprot_Omnitrophica"/> (früher OP3) und [[Poribacteria]].<ref name="Wagner2006"/> |
[[Planctomycetes]], [[Verrucomicrobia]], und [[Chlamydiae]] werden in der konventionellen molekularen Phylogenie als [[Phylum|Phyla]] (d. h. [[Stamm (Biologie)#Bakterien|Stämme]] oder [[Abteilung (Biologie)|Abteilungen]], {{enS|divisions}}) betrachtet, und in der PVC-Gruppe als Superphylum zusammengefasst, zusammen mit weiteren Kandidaten-Phyla wie [[Omnitrophica]]<ref name="uniprot_Omnitrophica" /> (früher OP3) und [[Poribacteria]].<ref name="Wagner2006" /> |
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Dies wird begründet mit der [[Homologie (Genetik)|Homologie]] ihrer [[16S rRNA]]. Phylogenetische Bäume basierend auf dieser RNA zeigen die eine monophyletische Gruppierung dieser Phyla, d. h. eine Abstammung von einem gemeinsamen Vorfahren.<ref name="Wagner2006"/> |
Dies wird begründet mit der [[Homologie (Genetik)|Homologie]] ihrer [[16S rRNA]]. Phylogenetische Bäume basierend auf dieser RNA zeigen die eine monophyletische Gruppierung dieser Phyla, d. h. eine Abstammung von einem gemeinsamen Vorfahren.<ref name="Wagner2006" /> |
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Trotz ihres gemeinsamen Ursprungs unterscheiden sich die Mitglieder des PVC-Superstamms in Bezug auf Lebensweise, Physiologie und Ökologie erheblich. |
Trotz ihres gemeinsamen Ursprungs unterscheiden sich die Mitglieder des PVC-Superstamms in Bezug auf Lebensweise, Physiologie und Ökologie erheblich. |
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Es ist daher ein wichtiges Anliegen, zusätzlich [[Molekulare Marker]] zu identifizieren, [[Konservierung|hochkonservierte]] [[Gen]]e und die von ihnen [[Genetischer Code|kodierten]] [[Proteine]], die eine Zugehörigkeit zu dieser Gruppe anzeigen. 2014 fanden es Ilias Lagkouvardos ''et al.'' |
Es ist daher ein wichtiges Anliegen, zusätzlich [[Molekulare Marker]] zu identifizieren, [[Konservierung|hochkonservierte]] [[Gen]]e und die von ihnen [[Genetischer Code|kodierten]] [[Proteine]], die eine Zugehörigkeit zu dieser Gruppe anzeigen. 2014 fanden es Ilias Lagkouvardos ''et al.'' ein solches Protein, genannt PVC-Superphylum-Signaturprotein (en. {{lang|en|''PVC superphylum sinature protein''}}).<ref name="Lagkouvardos2014" /> |
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Dieses konservierte Signaturprotein wird von allen PVC-Mitgliedern, mit Ausnahme der Poribacteria, geteilt. Es könnte daher einen Marker darstellen, wie er gesucht wurde, d. h. eine [[synapomorph]]e Eigenschaft darstellen und ein Mittel zur Unterscheidung dieser Bakteriengruppe von anderen sein. Diesem Protein wurde eine wichtige Funktion bei der [[DNA-bindende Proteine|DNA/RNA-Bindung]] zugeschrieben.<ref name="Lagkouvardos2014"/> |
Dieses konservierte Signaturprotein wird von allen PVC-Mitgliedern, mit Ausnahme der Poribacteria, geteilt. Es könnte daher einen Marker darstellen, wie er gesucht wurde, d. h. eine [[synapomorph]]e Eigenschaft darstellen und ein Mittel zur Unterscheidung dieser Bakteriengruppe von anderen sein. Diesem Protein wurde eine wichtige Funktion bei der [[DNA-bindende Proteine|DNA/RNA-Bindung]] zugeschrieben.<ref name="Lagkouvardos2014" /> |
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Diese Beobachtung bietet nicht nur ein Mittel zur Abgrenzung der PVC-Supergruppe, sondern unterstützt auch deutlich eine evolutionäre Beziehung der Mitglieder dieser Gruppe im Unterschied zu anderen Bakterien.<ref name="Gupta2012"/><ref name="Gupta2016"/> |
Diese Beobachtung bietet nicht nur ein Mittel zur Abgrenzung der PVC-Supergruppe, sondern unterstützt auch deutlich eine evolutionäre Beziehung der Mitglieder dieser Gruppe im Unterschied zu anderen Bakterien.<ref name="Gupta2012" /><ref name="Gupta2016" /> |
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Es wurden auch [[Conserved Signature Indel]]s (CSIs: konservierte Signatur-[[Indel]]s) gefunden, die spezifisch für Planctomycetes, Verrucomicrobia und Chlamydiae sind und die die jeweiligen Stämme voneinander und von anderen Bakterien unterscheiden.<ref name=Gupta2012/><ref name="Gupta2015"/> Es wurde ein Drei-[[Aminosäure]]-[[Insertion (Genetik)|Insertion]] im [[RNA-Polymerasen|RNA-Polymerase-Protein]] [[RpoB]]<ref>[http://www.subtiwiki.uni-goettingen.de/v4/gene?id=EC32328548BFB59D9026ACE351C946DBBC0932BC ''rpoB''] (Gen). Auf {<span style="text-decoration: underline double; -webkit-text-decoration: underline double;">''Subti''Wiki</span>}, [[Universität Göttingen]].</ref> gefunden, das allen [[DNA-Sequenzierung|sequenzierten]] Verrucomicrobia-, Chlamydiae- und Lentisphaerae-Arten gemeinsam ist. Das CSI fehlt bei den benachbarten Planctomycetes und Poribacteria, was auf eine gemeinsame Abstammung und nähere Verwandtschaft der Phyla hindeutet, für die das CSI spezifisch ist.<ref name="Gupta2012"/> |
Es wurden auch [[Conserved Signature Indel]]s (CSIs: konservierte Signatur-[[Indel]]s) gefunden, die spezifisch für Planctomycetes, Verrucomicrobia und Chlamydiae sind und die die jeweiligen Stämme voneinander und von anderen Bakterien unterscheiden.<ref name="Gupta2012" /><ref name="Gupta2015" /> Es wurde ein Drei-[[Aminosäure]]-[[Insertion (Genetik)|Insertion]] im [[RNA-Polymerasen|RNA-Polymerase-Protein]] [[RpoB]]<ref>[http://www.subtiwiki.uni-goettingen.de/v4/gene?id=EC32328548BFB59D9026ACE351C946DBBC0932BC ''rpoB''] (Gen). Auf {<span style="text-decoration: underline double; -webkit-text-decoration: underline double;">''Subti''Wiki</span>}, [[Universität Göttingen]].</ref> gefunden, das allen [[DNA-Sequenzierung|sequenzierten]] Verrucomicrobia-, Chlamydiae- und Lentisphaerae-Arten gemeinsam ist. Das CSI fehlt bei den benachbarten Planctomycetes und Poribacteria, was auf eine gemeinsame Abstammung und nähere Verwandtschaft der Phyla hindeutet, für die das CSI spezifisch ist.<ref name="Gupta2012" /> |
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Weitere Beweise für die Existenz dieser Untergruppe sind das Vorhandensein von membranartigen Proteinen (en. {{lang|en|membrane coat-like proteins}}), [[Tubulin]], der [[Stoffwechselweg|Syntheseweg]] für [[Sterol]] und das Vorhandensein von [[DNA-Kondensation|kondensierter DNA]].<ref name="Wagner2006"/><ref name="Kamneva2012"/> |
Weitere Beweise für die Existenz dieser Untergruppe sind das Vorhandensein von membranartigen Proteinen (en. {{lang|en|membrane coat-like proteins}}), [[Tubulin]], der [[Stoffwechselweg|Syntheseweg]] für [[Sterol]] und das Vorhandensein von [[DNA-Kondensation|kondensierter DNA]].<ref name="Wagner2006" /><ref name="Kamneva2012" /> |
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== Phylogenie == |
== Phylogenie == |
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[[Datei:A Novel Representation Of The Tree Of Life.png |
[[Datei:A Novel Representation Of The Tree Of Life.png<!--425px|-->upright=2.5|mini|links|In diesem Stammbaum des Lebens von 2016 auf Basis [[ribosom]]aler [[Protein]]e ist das PVC-Superphylum auf der linken Seite zu finden.<ref name="Hug2016" /> Siehe auch Dudek ''et al.'' (1017), Fig. 1.<ref name="Dudek2017" />]] |
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{{Absatz}} |
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Links eine konservative Phylogenie nach [[Carl R. Woese|Woese]] (1987),<ref name="Woese1987"/> Rappé ''et al'' (2003),<ref name="Rappe2003"/> Wagner & Horn (2006)<ref name="Wagner2006"/> und Spring ''et al'' (2016);<ref name="Spring2016"/> rechts eine neuere nach der GTDB-Datenbank<ref name="gtdb"/> (mit Annotree: Mendler ''et al'', 2019<ref name="AnnoTree_Mendler2019"/>) |
Links eine konservative Phylogenie nach [[Carl R. Woese|Woese]] (1987),<ref name="Woese1987" /> Rappé ''et al'' (2003),<ref name="Rappe2003" /> Wagner & Horn (2006)<ref name="Wagner2006" /> und Spring ''et al'' (2016);<ref name="Spring2016" /> rechts eine neuere nach der GTDB-Datenbank<ref name="gtdb" /> (mit Annotree: Mendler ''et al'', 2019<ref name="AnnoTree_Mendler2019" />) |
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|Titel=PVC-Gruppe (2016)<ref name="Woese1987" /><ref name="Rappe2003" /><ref name="Wagner2006" /><ref name="Spring2016" /> |
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<!--}}-- Sumerlaeota ausgeblendet--> |
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== Systematik == |
== Systematik == |
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Die hier angegebene Konsensus-Taxonomie der PVC-Gruppe basiert mit Stand 15. März 2022 auf den folgenden Quellen: |
Die hier angegebene Konsensus-Taxonomie der PVC-Gruppe basiert mit Stand 15. März 2022 auf den folgenden Quellen: |
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* L – {{lang|en|[[List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature]]}} (LPSN), [[Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen]] (DSMZ)<ref name="LPSN"/> |
* L – {{lang|en|[[List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature]]}} (LPSN), [[Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen]] (DSMZ)<ref name="LPSN" /> |
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* N – {{lang|en|[[National Center for Biotechnology Information]]}} (NCBI, {{lang|en|Taxonomy Browser}})<ref name="NCBI"/> |
* N – {{lang|en|[[National Center for Biotechnology Information]]}} (NCBI, {{lang|en|Taxonomy Browser}})<ref name="NCBI" /> |
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* G – {{lang|en|Genome Taxonomy Database}} (GTDB), [[University of Queensland]] (UQ), Australien.<ref name="gtdb"/><ref name="AnnoTree_Mendler2019"/> – hier nur nachrangig eingeflossen (siehe [[#GTDB Verrucomicrobiota|Anmerkung unten]]). |
* G – {{lang|en|Genome Taxonomy Database}} (GTDB), [[University of Queensland]] (UQ), Australien.<ref name="gtdb" /><ref name="AnnoTree_Mendler2019" /> – hier nur nachrangig eingeflossen (siehe [[#GTDB Verrucomicrobiota|Anmerkung unten]]). |
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LPSN kennt die Supergruppe PVC selbst nicht, daher sind unten die jeweiligen Mitgliedsphyla einzeln referenziert. |
LPSN kennt die Supergruppe PVC selbst nicht, daher sind unten die jeweiligen Mitgliedsphyla einzeln referenziert. |
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{{Anker|GTDB Verrucomicrobiota}}Die GTDB versteht abweichend von der folgenden Systematik das Phylum Verrucomicrobiota im weiteren Sinne, d. h. es schließt die Kiritimatiellae (vorher Kiritimatiellaeota) und Lentrispheria (vorher Lentisphaerae) etc. mit ein, die in diesem Zug von Phyla zu Klassen „degradiert“ werden.<ref name="gtdb_Verrumicrobiota"/> |
{{Anker|GTDB Verrucomicrobiota}}Die GTDB versteht abweichend von der folgenden Systematik das Phylum Verrucomicrobiota im weiteren Sinne, d. h. es schließt die Kiritimatiellae (vorher Kiritimatiellaeota) und Lentrispheria (vorher Lentisphaerae) etc. mit ein, die in diesem Zug von Phyla zu Klassen „degradiert“ werden.<ref name="gtdb_Verrumicrobiota" /> |
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Üblicherweise sind von den PVC-Subtaxa nur die [[Klasse (Biologie)|Klassen]] ausgeführt. |
Üblicherweise sind von den PVC-Subtaxa nur die [[Klasse (Biologie)|Klassen]] ausgeführt. |
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* Klade: {{lang|en|Chlamydiae/Verrucomicrobia group}} (N), alias {{lang|en|Chlamydiales/Verrucomicrobia group}} (N) |
* Klade: {{lang|en|Chlamydiae/Verrucomicrobia group}} (N), alias {{lang|en|Chlamydiales/Verrucomicrobia group}} (N) |
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** [[Phylum]]: [[Chlamydiae]] <small>{{Person|Garrity & Holt}} 2012</small><ref name="LPSN_Chlamydiae"/><ref group=S name="Chlamydiae"/> |
** [[Phylum]]: [[Chlamydiae]] <small>{{Person|Garrity & Holt}} 2012</small><ref name="LPSN_Chlamydiae" /><ref group="S" name="Chlamydiae" /> |
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*** Klasse Chlamydiia <small>{{Person|Horn}} 2016</small> (G,L) bzw. <small>({{Person|Horn}} 2011) emend. {{Person|Gupta}} ''et al.'' 2016</small> (N) |
*** Klasse Chlamydiia <small>{{Person|Horn}} 2016</small> (G,L) bzw. <small>({{Person|Horn}} 2011) emend. {{Person|Gupta}} ''et al.'' 2016</small> (N) |
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** [[Phylum]]: [[Kiritimatiellaeota]] <small>{{Person|Spring}} ''et al.'' 2016</small> (L,N)<ref name="LPSN_Kiritimatiellaeota"/><ref group=S name="Kiritimatiellaeota"/> |
** [[Phylum]]: [[Kiritimatiellaeota]] <small>{{Person|Spring}} ''et al.'' 2016</small> (L,N)<ref name="LPSN_Kiritimatiellaeota" /><ref group="S" name="Kiritimatiellaeota" /> |
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*** [[Klasse (Biologie)|Klasse]]: [[Kiritimatiellae]] <small>{{Person|Spring}} ''et al.'' 2017</small> (L,N;G: zu Verrucomicrobiota) |
*** [[Klasse (Biologie)|Klasse]]: [[Kiritimatiellae]] <small>{{Person|Spring}} ''et al.'' 2017</small> (L,N;G: zu Verrucomicrobiota) |
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*** Klasse: Tichowtungiia <small>{{Person|Mu}} ''et al.'' 2020</small> (L,N;G: zu Kiritimatiellae), mit |
*** Klasse: Tichowtungiia <small>{{Person|Mu}} ''et al.'' 2020</small> (L,N;G: zu Kiritimatiellae), mit |
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::::[[Art (Biologie)|Spezies]]: ''Tichowtungia aerotolerans'' <small>{{Person|Mu}} ''et al.'' 2020</small> (N), inkl. Kiritimatiellaeota bacterium S-5007 (G,N) alias UBA5540 sp009905215 (G)<ref name="gtdb_GCF_009905215"/> |
:::: [[Art (Biologie)|Spezies]]: ''Tichowtungia aerotolerans'' <small>{{Person|Mu}} ''et al.'' 2020</small> (N), inkl. Kiritimatiellaeota bacterium S-5007 (G,N) alias UBA5540 sp009905215 (G)<ref name="gtdb_GCF_009905215" /> |
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:* Phylum: [[Lentisphaerae]] <small>{{Person|Cho}} ''et al.'' 2004</small> (N), Synonym: „Lentisphaeraeota“ (L,N)<ref name="LPSN_Lentisphaerae"/><ref group=S name="Lentisphaerae"/> |
:* Phylum: [[Lentisphaerae]] <small>{{Person|Cho}} ''et al.'' 2004</small> (N), Synonym: „Lentisphaeraeota“ (L,N)<ref name="LPSN_Lentisphaerae" /><ref group="S" name="Lentisphaerae" /> |
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:** Klasse: Lentisphaeria <small>{{Person|Cho}} ''et al.'' 2012</small> (L,N;G: zu Verrucomicrobiota) |
:** Klasse: Lentisphaeria <small>{{Person|Cho}} ''et al.'' 2012</small> (L,N;G: zu Verrucomicrobiota) |
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:** Klasse: Oligosphaeria <small>{{Person|Qiu}} ''et al.'' 2013</small> (L,N;G: zu Lentisphaeria) |
:** Klasse: Oligosphaeria <small>{{Person|Qiu}} ''et al.'' 2013</small> (L,N;G: zu Lentisphaeria) |
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:** Klade: Candidate division VadinBE97 (N), Synonym: Lentisphaerae subgroup L2 (N), mit |
:** Klade: Candidate division VadinBE97 (N), Synonym: Lentisphaerae subgroup L2 (N), mit |
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::::Spezies: {{lang|en|Uncultured candidate division VadinBE97 bacterium}} (N:09N211B)<ref name="Ley2006"/> |
:::: Spezies: {{lang|en|Uncultured candidate division VadinBE97 bacterium}} (N:09N211B)<ref name="Ley2006" /> |
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:* Phylum [[Verrucomicrobia]] <small>{{Person|Hedlund}}</small>, mit Synonym Verrucomicrobaeota <small>{{Person|Oren}} ''et al.'' 2015</small> (L,N), „Verrucomicrobiota“ <small>{{Person|Whitman}} ''et al.'' 2018</small> (G,L,N)<ref name="LPSN_Verrucomicrobia"/><ref name="OneZoom_Verrucomicrobia"/><ref group=S name="Verrucomicrobia"/> |
:* Phylum [[Verrucomicrobia]] <small>{{Person|Hedlund}}</small>, mit Synonym Verrucomicrobaeota <small>{{Person|Oren}} ''et al.'' 2015</small> (L,N), „Verrucomicrobiota“ <small>{{Person|Whitman}} ''et al.'' 2018</small> (G,L,N)<ref name="LPSN_Verrucomicrobia" /><ref name="OneZoom_Verrucomicrobia" /><ref group="S" name="Verrucomicrobia" /> |
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:** Klasse: „Methylacidiphilae“ (N), mit |
:** Klasse: „Methylacidiphilae“ (N), mit |
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::::Spezies: Methylacidiphilae bacterium JGI 000193CP-F02 (N) |
:::: Spezies: Methylacidiphilae bacterium JGI 000193CP-F02 (N) |
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::* Klasse: Opitutae <small>{{Person|Choo}} ''et al.'' 2007</small> (L,N)<ref group=S name="Opitutae"/> – bei GTDB Ordnung Opitutales innerhalb Klasse Verrucomicrobiae; mit |
::* Klasse: Opitutae <small>{{Person|Choo}} ''et al.'' 2007</small> (L,N)<ref group="S" name="Opitutae" /> – bei GTDB Ordnung Opitutales innerhalb Klasse Verrucomicrobiae; mit |
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::::Spezies: ''Ca.'' [[Epixenosoma|Epixenosoma ejectans]] <small>{{Person|Cho}} ''et al.'' 2010</small> (L,N) |
:::: Spezies: ''Ca.'' [[Epixenosoma|Epixenosoma ejectans]] <small>{{Person|Cho}} ''et al.'' 2010</small> (L,N) |
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::* Klasse „Spartobacteria“ <small>{{Person|Sangwan}} ''et al.'' 2004</small> (L, N), Synonym: Verrucomicrobia subdivision 2 (N), Xiphinematobacteriaceae (N) – bei GTDB zu Ordnung Chthoniobacterales innerhalb Klasse Verrucomicrobiae; mit |
::* Klasse „Spartobacteria“ <small>{{Person|Sangwan}} ''et al.'' 2004</small> (L, N), Synonym: Verrucomicrobia subdivision 2 (N), Xiphinematobacteriaceae (N) – bei GTDB zu Ordnung Chthoniobacterales innerhalb Klasse Verrucomicrobiae; mit |
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::::[[Gattung (Biologie)|Gattung]] ''Udaeobacter''<ref name="gtdb_Udaeobacter"/> (G) und |
:::: [[Gattung (Biologie)|Gattung]] ''Udaeobacter''<ref name="gtdb_Udaeobacter" /> (G) und |
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::::Gattung UBA10450 (G) mit Spezies UBA10450 sp003445855 (G)<ref name="gtdb_UBA10450"/> mit Isolat UBA10450 (N) |
:::: Gattung UBA10450 (G) mit Spezies UBA10450 sp003445855 (G)<ref name="gtdb_UBA10450" /> mit Isolat UBA10450 (N) |
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::* Klasse: Terrimicrobia <small>{{Person|García-López}} ''et al.'' 2020</small> (L,N) – bei GTDB Familie Terrimicrobiaceae zu Ordnung Chthoniobacterales |
::* Klasse: Terrimicrobia <small>{{Person|García-López}} ''et al.'' 2020</small> (L,N) – bei GTDB Familie Terrimicrobiaceae zu Ordnung Chthoniobacterales |
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::* Klasse: Verrucomicrobiae <small>{{Person|Hedlund}} ''et al.'' 1998 emend. {{Person|Yoon}} ''et al.'' 2008</small> (N)<ref group=S name="Verrucomicrobiae"/> |
::* Klasse: Verrucomicrobiae <small>{{Person|Hedlund}} ''et al.'' 1998 emend. {{Person|Yoon}} ''et al.'' 2008</small> (N)<ref group="S" name="Verrucomicrobiae" /> |
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* Phyla ohne Zuordnung zu einer Subklade der PVC-Gruppe: |
* Phyla ohne Zuordnung zu einer Subklade der PVC-Gruppe: |
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** Phylum: „[[Planctomycetes]]“ (L,N), mit Synonym Planctomycetota (G,L,N)<ref name="LPSN_Planctomycetes"/><ref group=S name="Planctomycetota"/> |
** Phylum: „[[Planctomycetes]]“ (L,N), mit Synonym Planctomycetota (G,L,N)<ref name="LPSN_Planctomycetes" /><ref group="S" name="Planctomycetota" /> |
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*** Klasse: Phycisphaerae <small>{{Person|Fukunaga}} ''et al.'' 2010</small> (G,L,N) |
*** Klasse: Phycisphaerae <small>{{Person|Fukunaga}} ''et al.'' 2010</small> (G,L,N) |
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*** Klasse „Planctomycetia“ <small>{{Person|Ward}}</small> (L,N), mit Synonym Planctomycetes <small>{{Person|Oren}} ''et al.''</small><ref group=S name="Planctomycetia"/> |
*** Klasse „Planctomycetia“ <small>{{Person|Ward}}</small> (L,N), mit Synonym Planctomycetes <small>{{Person|Oren}} ''et al.''</small><ref group="S" name="Planctomycetia" /> |
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*** Klasse: „''Candidatus'' Brocadiia“ <small>{{Person|Lodha}} ''et al.'' 2021</small> (N), Synonym: „''Ca.'' Brocadiae“ <small>{{Person|Jenkins & Staley}} 2013</small> (G,L,N) |
*** Klasse: „''Candidatus'' Brocadiia“ <small>{{Person|Lodha}} ''et al.'' 2021</small> (N), Synonym: „''Ca.'' Brocadiae“ <small>{{Person|Jenkins & Staley}} 2013</small> (G,L,N) |
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*** Klasse: „''Candidatus'' Uabimicrobiia“ <small>{{Person|Lodha}} ''et al.'' 2021</small> (L,N) alias J132 (G), mit |
*** Klasse: „''Candidatus'' Uabimicrobiia“ <small>{{Person|Lodha}} ''et al.'' 2021</small> (L,N) alias J132 (G), mit |
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:::::Spezies: ''Ca.'' Uabimicrobium amorphum <small>corrig. {{Person|Shiratori}} ''et al.'' 2019</small> (N)<ref name="gtdb_GCF_009002475"/><ref group=S name="SRT547"/> |
::::: Spezies: ''Ca.'' Uabimicrobium amorphum <small>corrig. {{Person|Shiratori}} ''et al.'' 2019</small> (N)<ref name="gtdb_GCF_009002475" /><ref group="S" name="SRT547" /> |
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:* Phylum „''Candidatus'' [[Abyssubacteria]]“ (G,L,N)<ref name="LPSN_Abyssubacteria"/><ref group=S name="Abyssubacteria"/> |
:* Phylum „''Candidatus'' [[Abyssubacteria]]“ (G,L,N)<ref name="LPSN_Abyssubacteria" /><ref group="S" name="Abyssubacteria" /> |
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:** Klasse SURF-5 (G)<ref name="gtdb_SURF-5"/> mit |
:** Klasse SURF-5 (G)<ref name="gtdb_SURF-5" /> mit |
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:::::Spezies ''Ca.'' Abyssubacteria bacterium SURF_5 (N) alias SURF-5 sp003598085 (G) und |
::::: Spezies ''Ca.'' Abyssubacteria bacterium SURF_5 (N) alias SURF-5 sp003598085 (G) und |
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:::::Spezies ''Ca.'' Abyssubacteria bacterium SURF_17 (N) alias SURF-17 sp003598055 (G) |
::::: Spezies ''Ca.'' Abyssubacteria bacterium SURF_17 (N) alias SURF-17 sp003598055 (G) |
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:* Phylum ''Candidatus'' [[Aureabacteria]] <small>{{Person|Momper}} ''et al.'' 2017</small> (G,N), Synonym Candidate phylum {{nowrap|SURF-CP-2}} (N)<ref name="gtdb_Aureabacteria"/> |
:* Phylum ''Candidatus'' [[Aureabacteria]] <small>{{Person|Momper}} ''et al.'' 2017</small> (G,N), Synonym Candidate phylum {{nowrap|SURF-CP-2}} (N)<ref name="gtdb_Aureabacteria" /> |
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:* Phylum ''Candidatus'' [[Omnitrophica]] <small>{{Person|Rinke}} ''et al.'' 2013</small> (L,N), Synonym ''Ca.'' Omnitrophicaeota (N), ''Ca.'' Omnitrophota (G,N)<ref name="LPSN_Omnitrophica"/><ref name="gtdb_Omnitrophota"/><ref name="OneZoom_OP3"/><ref group=S name="Omnitrophica"/> |
:* Phylum ''Candidatus'' [[Omnitrophica]] <small>{{Person|Rinke}} ''et al.'' 2013</small> (L,N), Synonym ''Ca.'' Omnitrophicaeota (N), ''Ca.'' Omnitrophota (G,N)<ref name="LPSN_Omnitrophica" /><ref name="gtdb_Omnitrophota" /><ref name="OneZoom_OP3" /><ref group="S" name="Omnitrophica" /> |
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::::Gattung „''Candidatus'' Omnitrophus“ <small>{{Person|Rinke}} ''et al.'' 2013</small> (L,N) |
:::: Gattung „''Candidatus'' Omnitrophus“ <small>{{Person|Rinke}} ''et al.'' 2013</small> (L,N) |
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:::::Spezies „''Candidatus'' Omnitrophus fodinae“ <small>{{Person|Rinke}} ''et al.'' 2013</small> (L,N) |
::::: Spezies „''Candidatus'' Omnitrophus fodinae“ <small>{{Person|Rinke}} ''et al.'' 2013</small> (L,N) |
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:::::Spezies „''Candidatus'' Omnitrophus magneticus“ <small>{{Person|Kolinko}} ''et al.'' 2016</small> (L,N) – in der GTDB in eigener Gattung ''Omnitrophus_A'' (G) |
::::: Spezies „''Candidatus'' Omnitrophus magneticus“ <small>{{Person|Kolinko}} ''et al.'' 2016</small> (L,N) – in der GTDB in eigener Gattung ''Omnitrophus_A'' (G) |
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::::Gattung „''Candidatus'' [[Velamenicoccus]]“ <small>{{Person|Kizina}} ''et al.'' 2022</small> (N), mit Synonym „''Ca.'' Vampirococcus“ <small>{{Person|Kizina}} 2017 non {{Person|Guerrero}} ''et al.'' 1986</small> – ungültig wegen Doppelvergabe (N) bzw. ''Vampirococcus_B'' (G) |
:::: Gattung „''Candidatus'' [[Velamenicoccus]]“ <small>{{Person|Kizina}} ''et al.'' 2022</small> (N), mit Synonym „''Ca.'' Vampirococcus“ <small>{{Person|Kizina}} 2017 non {{Person|Guerrero}} ''et al.'' 1986</small> – ungültig wegen Doppelvergabe (N) bzw. ''Vampirococcus_B'' (G) |
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:::::Spezies „''Candidatus'' [[Velamenicoccus archaeovorus]]“ (N), mit Synonym ''Vampirococcus_B archaeovorus'' (G), früher OP3 LiM,<ref name="Kizina2022"/> Referenzstamm LiM (G,N)<ref name="Kizina2022"/> |
::::: Spezies „''Candidatus'' [[Velamenicoccus archaeovorus]]“ (N), mit Synonym ''Vampirococcus_B archaeovorus'' (G), früher OP3 LiM,<ref name="Kizina2022" /> Referenzstamm LiM (G,N)<ref name="Kizina2022" /> |
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* Phyla „''[[incertae sedis]]''“: |
* Phyla „''[[incertae sedis]]''“: |
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** Phylum: [[Elusimicrobia|Elusimicrobiota]] <small>{{Person|Geissinger}} ''et al.'' 2021</small>, mit Synonym Elusimicrobia [phylum] <small>{{Person|Geissinger}} ''et al.'' 2010</small><ref name="Taib2020"/><ref name="NCBI_TG1"/><ref group=S name="Elusimicrobia"/> |
** Phylum: [[Elusimicrobia|Elusimicrobiota]] <small>{{Person|Geissinger}} ''et al.'' 2021</small>, mit Synonym Elusimicrobia [phylum] <small>{{Person|Geissinger}} ''et al.'' 2010</small><ref name="Taib2020" /><ref name="NCBI_TG1" /><ref group="S" name="Elusimicrobia" /> |
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<!--- incertae sedes ---- |
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Die Mitgliedschaft folgender in der spanischen WP [[:es:Grupo PVC]] gelisteten Phyla konnte nicht verifiziert werden (17.03.2022, Ernsts): |
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== Synonymien == |
== Synonymien == |
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<references group=S> |
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<ref group="S" name="Chlamydiae"> |
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[[Chlamydiae]] <small>{{Person|Garrity}} & Holt 2012</small> (N) bzw. „Chlamydiae“ <small>{{Person|Garrity & Holt}} 2001</small> (L), Synonyme: |
[[Chlamydiae]] <small>{{Person|Garrity}} & Holt 2012</small> (N) bzw. „Chlamydiae“ <small>{{Person|Garrity & Holt}} 2001</small> (L), Synonyme: |
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* „Chlamydaeota“ <small>{{Person|Oren}} ''et al.'' 2015</small> (L,N) |
* „Chlamydaeota“ <small>{{Person|Oren}} ''et al.'' 2015</small> (L,N) |
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* Chlamydiota <small>{{Person|Garrity & Holt}} 2021</small> (G,L,N) |
* Chlamydiota <small>{{Person|Garrity & Holt}} 2021</small> (G,L,N) |
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* „Chlamydiota“ <small>{{Person|Whitman}} ''et al.'' 2018</small> (L)</ref> |
* „Chlamydiota“ <small>{{Person|Whitman}} ''et al.'' 2018</small> (L) |
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<ref group="S" name="Kiritimatiellaeota"> |
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[[Kiritimatiellaeota]] <small>{{Person|Spring}} ''et al.'' 2016</small> (L,N), Synonyme: |
[[Kiritimatiellaeota]] <small>{{Person|Spring}} ''et al.'' 2016</small> (L,N), Synonyme: |
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* Kiritimatiellota <small>{{Person|Spring}} ''et al.'' 2021</small> (L) |
* Kiritimatiellota <small>{{Person|Spring}} ''et al.'' 2021</small> (L) |
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* Verrucomicrobia {{lang|en|subdivision 5}} (N)</ref> |
* Verrucomicrobia {{lang|en|subdivision 5}} (N) |
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<ref group="S" name="Lentisphaerae"> |
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[[Lentisphaerae]] <small>{{Person|Cho}} ''et al.'' 2004</small> (N), Synonyme: |
[[Lentisphaerae]] <small>{{Person|Cho}} ''et al.'' 2004</small> (N), Synonyme: |
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* „Lentisphaeraeota“ <small>{{Person|Oren}} ''et al.'' 2015</small> (L,N) |
* „Lentisphaeraeota“ <small>{{Person|Oren}} ''et al.'' 2015</small> (L,N) |
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* „Lentisphaerota“ <small>{{Person|Whitman}} ''et al.'' 2018</small> (L,N)</ref> |
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<ref group="S" name="Planctomycetota"> |
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„[[Planctomycetes]]“ <small>{{Person|Garrity & Holt}} 2001 emend. {{Person|Ward}} 2011</small> (N), Synonyme: |
„[[Planctomycetes]]“ <small>{{Person|Garrity & Holt}} 2001 emend. {{Person|Ward}} 2011</small> (N), Synonyme: |
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* „Planctomycetes“ <small>{{Person|Garrity & Holt}} 2001</small> (L) |
* „Planctomycetes“ <small>{{Person|Garrity & Holt}} 2001</small> (L) |
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* „Planctomycetaeota“ <small>{{Person|Oren}} ''et al.'' 2015</small> (L,N) |
* „Planctomycetaeota“ <small>{{Person|Oren}} ''et al.'' 2015</small> (L,N) |
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* Planctomycetota <small>{{Person|Garrity & Holt}} 2021</small> (G,L,N) und „Planctomycetota“ <small>{{Person|Whitman}} ''et al.'' 2018</small> (L) |
* Planctomycetota <small>{{Person|Garrity & Holt}} 2021</small> (G,L,N) und „Planctomycetota“ <small>{{Person|Whitman}} ''et al.'' 2018</small> (L) |
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* „Planctobacteria“ <small>{{Person|(Cavalier-Smith 1987) Cavalier-Smith}} 2002</small> (L)</ref> |
* „Planctobacteria“ <small>{{Person|(Cavalier-Smith 1987) Cavalier-Smith}} 2002</small> (L) |
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</ref> |
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<ref group="S" name="Planctomycetia"> |
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„Planctomycetia“ <small>{{Person|Ward}} 2011</small> (N) und <small>{{Person|Cavalier-Smith}} 2020</small> (L), bzw. Planctomycetia <small>{{Person|Ward}} 2020</small> (L), Synonyme: |
„Planctomycetia“ <small>{{Person|Ward}} 2011</small> (N) und <small>{{Person|Cavalier-Smith}} 2020</small> (L), bzw. Planctomycetia <small>{{Person|Ward}} 2020</small> (L), Synonyme: |
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* „Planctomycetacia“ <small>{{Person|Garrity & Holt}} 2001</small> (L,N) |
* „Planctomycetacia“ <small>{{Person|Garrity & Holt}} 2001</small> (L,N) |
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* Planctomycea <small>{{Person|Cavalier-Smith}} 2002</small> (L,N) |
* Planctomycea <small>{{Person|Cavalier-Smith}} 2002</small> (L,N) |
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* „Planctomycetes“ <small>{{Person|Oren}} ''et al.'' 2015</small> (L) bzw. Planctomycetes <small>{{Person|Oren}} ''et al.'' 2015 emend. {{Person|Lodha}} ''et al.'' 2021</small> (G,N)</ref> |
* „Planctomycetes“ <small>{{Person|Oren}} ''et al.'' 2015</small> (L) bzw. Planctomycetes <small>{{Person|Oren}} ''et al.'' 2015 emend. {{Person|Lodha}} ''et al.'' 2021</small> (G,N) |
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<ref group="S" name="SRT547"> |
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''Ca.'' Uabimicrobium amorphum <small>corrig. {{Person|Shiratori}} ''et al.'' 2019</small> (N), Synonyme: |
''Ca.'' Uabimicrobium amorphum <small>corrig. {{Person|Shiratori}} ''et al.'' 2019</small> (N), Synonyme: |
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* „''Ca.'' Uab amorphum“ <small>{{Person|Shiratori}} ''et al.'' 2019</small> (N) |
* „''Ca.'' Uab amorphum“ <small>{{Person|Shiratori}} ''et al.'' 2019</small> (N) |
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* Planctomycetes bacterium SRT547 (G,N) |
* Planctomycetes bacterium SRT547 (G,N) |
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* SRT547 sp009002475 (G)</ref> |
* SRT547 sp009002475 (G) |
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[[Verrucomicrobia]] <small>{{Person|Hedlund}} 2012</small> (N) oder <small>2021</small> (L) bzw. (<small>{{Person|Hedlund}} ''et al.'' 1997) {{Person|Yoon}} ''et al.'' 2010</small> (N), Synonyme: |
[[Verrucomicrobia]] <small>{{Person|Hedlund}} 2012</small> (N) oder <small>2021</small> (L) bzw. (<small>{{Person|Hedlund}} ''et al.'' 1997) {{Person|Yoon}} ''et al.'' 2010</small> (N), Synonyme: |
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* „Verrucomicrobia“ <small>{{Person|Hedlund}} ''et al.'' 1997</small> (L) oder <small>{{Person|Hedlund}} 2010</small> (L), <small>{{Person|Yoon}} ''et al.'' 2010</small> (L) |
* „Verrucomicrobia“ <small>{{Person|Hedlund}} ''et al.'' 1997</small> (L) oder <small>{{Person|Hedlund}} 2010</small> (L), <small>{{Person|Yoon}} ''et al.'' 2010</small> (L) |
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* Verrucomicrobaeota <small>{{Person|Oren}} ''et al.'' 2015</small> (L,N) bzw. „Verrucomicrobiota“ <small>{{Person|Whitman}} ''et al.'' 2018</small> (G,L,N)</ref> |
* Verrucomicrobaeota <small>{{Person|Oren}} ''et al.'' 2015</small> (L,N) bzw. „Verrucomicrobiota“ <small>{{Person|Whitman}} ''et al.'' 2018</small> (G,L,N) |
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</ref> |
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<ref group="S" name="Opitutae"> |
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<ref group=S name="Opitutae"> |
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Opitutae <small>{{Person|Choo}} ''et al.'' 2007</small> (L,N), Synonyme: |
Opitutae <small>{{Person|Choo}} ''et al.'' 2007</small> (L,N), Synonyme: |
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* „Opitutia“ <small>{{Person|Cavalier-Smith}} 2020</small> (L) |
* „Opitutia“ <small>{{Person|Cavalier-Smith}} 2020</small> (L) |
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* Verrucomicrobia {{lang|en|subdivision 4}} (N)</ref> |
* Verrucomicrobia {{lang|en|subdivision 4}} (N) |
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</ref> |
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<ref group="S" name="Verrucomicrobiae"> |
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<ref group=S name="Verrucomicrobiae"> |
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Verrucomicrobiae <small>{{Person|Hedlund}} ''et al.'' 1998 emend. {{Person|Yoon}} ''et al.'' 2008</small> (N) bzw. <small>{{Person|Hedlund}} ''et al.'' 1998</small> (G,L), Synonym: |
Verrucomicrobiae <small>{{Person|Hedlund}} ''et al.'' 1998 emend. {{Person|Yoon}} ''et al.'' 2008</small> (N) bzw. <small>{{Person|Hedlund}} ''et al.'' 1998</small> (G,L), Synonym: |
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* „Verrucomicrobiia“ <small>{{Person|Cavalier-Smith}} 2020</small> (L)</ref> |
* „Verrucomicrobiia“ <small>{{Person|Cavalier-Smith}} 2020</small> (L) |
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</ref> |
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<ref group="S" name="Abyssubacteria"> |
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<ref group=S name="Abyssubacteria"> |
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„''Candidatus'' [[Abyssubacteria]]“ (G,L,N), mit Schreibvariante |
„''Candidatus'' [[Abyssubacteria]]“ (G,L,N), mit Schreibvariante |
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* „''Ca.'' Abyssobacteria“ <small>corrig. {{Person|Momper}} ''et al.'' 2018</small> (L), Synonyme: |
* „''Ca.'' Abyssobacteria“ <small>corrig. {{Person|Momper}} ''et al.'' 2018</small> (L), Synonyme: |
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* „''Ca.'' Abyssubacteria“ <small>{{Person|Momper}} ''et al.'' 2018</small> (L) |
* „''Ca.'' Abyssubacteria“ <small>{{Person|Momper}} ''et al.'' 2018</small> (L) |
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* {{lang|en|Candidate division {{nowrap|SURF-CP-1}}}} (N)</ref> |
* {{lang|en|Candidate division {{nowrap|SURF-CP-1}}}} (N) |
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</ref> |
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<ref group="S" name="Omnitrophica"> |
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<ref group=S name="Omnitrophica"> |
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''Candidatus'' [[Omnitrophica]] <small>{{Person|Rinke}} ''et al.'' 2013</small> (L,N), Synonyme: |
''Candidatus'' [[Omnitrophica]] <small>{{Person|Rinke}} ''et al.'' 2013</small> (L,N), Synonyme: |
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* ''Ca.'' Omnitrophicaeota (N), |
* ''Ca.'' Omnitrophicaeota (N), |
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* ''Ca.'' Omnitrophota (G,N) |
* ''Ca.'' Omnitrophota (G,N) |
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* {{lang|en|Candidate division {{nowrap|WOR-2}} (N), Candidate division White Oak River group 2}} (N) |
* {{lang|en|Candidate division {{nowrap|WOR-2}} (N), Candidate division White Oak River group 2}} (N) |
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* {{lang|en|Candidate division OP3 (N), Candidate division Obsidian Pool 3}} (N)</ref> |
* {{lang|en|Candidate division OP3 (N), Candidate division Obsidian Pool 3}} (N) |
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</ref> |
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<ref group="S" name="Elusimicrobia"> |
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<ref group=S name="Elusimicrobia"> |
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[[Elusimicrobia|Elusimicrobiota]] <small>{{Person|Geissinger}} ''et al.'' 2021</small> bzw. „Elusimicrobiota“ <small>{{Person|Whitman}} ''et al.'' 2018</small>, mit Synonymen: |
[[Elusimicrobia|Elusimicrobiota]] <small>{{Person|Geissinger}} ''et al.'' 2021</small> bzw. „Elusimicrobiota“ <small>{{Person|Whitman}} ''et al.'' 2018</small>, mit Synonymen: |
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* „Elusimicrobaeota“ <small>{{Person|Oren}} ''et al.'' 2015</small> |
* „Elusimicrobaeota“ <small>{{Person|Oren}} ''et al.'' 2015</small> |
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* Elusimicrobia [phylum] <small>{{Person|Geissinger}} ''et al.'' 2010</small> |
* Elusimicrobia [phylum] <small>{{Person|Geissinger}} ''et al.'' 2010</small> |
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* {{lang|en|Candidate phylum/division TG1, Candidate phylum/division Termite Group 1}}</ref> |
* {{lang|en|Candidate phylum/division TG1, Candidate phylum/division Termite Group 1}} |
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</references> |
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== Einzelnachweise == |
== Einzelnachweise == |
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{{Internetquelle |
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<ref name="gtdb">{{cite web |title=GTDB release 05-RS95 |url=https://gtdb.ecogenomic.org/about#4%7C |website=[[Genome Taxonomy Database]]}}</ref> |
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<ref name="LPSN">J. P. Euzéby: [https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem/10.1099/00207713-47-2-590 List of Bacterial Names with Standing in Nomenclature: a Folder Available on the Internet]. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Band 47, Nr. 2, S. 590–592; [[doi:10.1099/00207713-47-2-590]], PMID 9103655.</ref> |
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[[National Center for Biotechnology Information|NCBI]]: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=1783257&lvl=3&srchmode=3 PVC group], Details: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=1783257&srchmode=3 PVC group] (clade, includes Chlamydiae/Verrucomicrobia group alias Chlamydiales/Verrucomicrobia); graphisch: [http://lifemap-ncbi.univ-lyon1.fr/?tid=1783257 PVC group], [[Lifemap]] NCBI Version. |
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[[National Center for Biotechnology Information|NCBI]]: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=74152&lvl=6&srchmode=1 Elusimicrobia], Detail:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=74152&srchmode=1 Elusimicrobia Geissinger et al. 2010] (phylum), synonym: Elusimicrobaeota Oren ''et al.'' 2015, Elusimicrobiota, candidate division TG1, |
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<ref name="OneZoom_Verrucomicrobia">[[OneZoom]]: [https://www.onezoom.org/life.html/@Verrucomicrobia Verrucomicrobia].</ref> |
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candidate division Termite Group 1, candidate phylum Termite Group 1. |
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<ref name="OneZoom_OP3">[[OneZoom]]: [https://www.onezoom.org/life.html/@Candidate_division_OP3=5246068?img=best_any&anim=flight#x590,y378,w0.4645 Candidate division OP3].</ref> |
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J. P. Euzéby: [https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem/10.1099/00207713-47-2-590 List of Bacterial Names with Standing in Nomenclature: a Folder Available on the Internet]. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Band 47, Nr. 2, S. 590–592; [[doi:10.1099/00207713-47-2-590]]. PMID 9103655. |
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<ref name="AnnoTree_Mendler2019">{{cite journal |last1=Mendler|first1=K. |last2=Chen|first2=H. |last3=Parks|first3=D. H. |last4=Hug|first4=L. A. |last5=Doxey|first5=A. C. |date=2019 |title=AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life |journal=Nucleic Acids Research |volume=47 |issue=9 | pages=4442​–4448 |url=http://annotree.uwaterloo.ca/app/ |doi=10.1093/nar/gkz246 |pmid=31081040 |pmc=6511854 }}</ref> |
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[[LPSN]]: [https://lpsn.dsmz.de/phylum/lentisphaerae "''Lentisphaerae''" Cho ''et al.'' 2004]. |
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[[LPSN]]: [https://lpsn.dsmz.de/phylum/verrucomicrobiota ''Verrucomicrobiota'' Hedlund 2021]. |
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[[LPSN]]: [https://lpsn.dsmz.de/class/abyssubacteria "''Candidatus'' Abyssubacteria" Momper ''et al.'' 2018]. |
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[[LPSN]]: [https://lpsn.dsmz.de/phylum/omnitrophica "''Candidatus'' Omnitrophica" Rinke ''et al.'' 2013]. |
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[[OneZoom]]: [https://www.onezoom.org/life.html/@Candidate_division_OP3=5246068?img=best_any&anim=flight#x590,y378,w0.4645 Candidate division OP3]. |
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<ref name="AnnoTree_Mendler2019"> |
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{{Literatur |
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|Autor=K. Mendler, H. Chen, D. H. Parks, L. A. Hug, A. C. Doxey |
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|Titel=AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life |
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|Sammelwerk=Nucleic Acids Research |
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|Band=47 |
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|Datum=2019 |
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|Seiten=4442​–4448 |
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<ref name="Baum2014">{{cite journal|author=David A. Baum, Buzz Baum |title=An inside-out origin for the eukaryotic cell |journal=BMC Biology |date=2014-10-28 |volume=12 |issue=1 |pages=76 |doi=10.1186/s12915-014-0076-2 |pmid=25350791 |pmc=4210606 |url=https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-014-0076-2 }}</ref> |
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{{Literatur |
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|Autor=David A. Baum, Buzz Baum |
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<ref name="Cavalier1987">[[Thomas Cavalier-Smith]]: [https://nyaspubs.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1749-6632.1987.tb40596.x The Origin of Eukaryote and Archaebacterial Cells]. In: Annals of the New York Academy of Sciences, Band 503, Nr. 1, Juli 1987, S. 17–54; [[doi:10.1111/j.1749-6632.1987.tb40596.x]], PMID 3113314.</ref> |
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|Titel=An inside-out origin for the eukaryotic cell |
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|Sammelwerk=BMC Biology |
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<ref name="Cavalier2002">{{Cite journal |author=[[Thomas Cavalier-Smith]] |title=The neomuran origin of archaebacteria, the negibacterial root of the universal tree and bacterial megaclassification |journal=International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology |volume=52 |issue=1 |pages=7–76 |date=2002-01-01 |pmid=11837318 |doi=10.1099/00207713-52-1-7 |url=https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem/10.1099/00207713-52-1-7 }}</ref> |
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|Band=12 |
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|Nummer=1 |
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<ref name="Cavalier2006">{{cite journal |author=[[Thomas Cavalier-Smith]] |title=Rooting the tree of life by transition analyses |journal=Biol. Direct |volume=1 |issue= 1|pages=19 |date=2006-07-11 |pmid=16834776 |pmc=1586193 |doi=10.1186/1745-6150-1-19 |url=https://biologydirect.biomedcentral.com/articles/10.1186/1745-6150-1-19 }}</ref> |
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|Datum=2014-10-28 |
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|Seiten=76 |
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<ref name="Dudek2017">Natasha K. Dudek, Christine L. Sun, David Burstein, Rose S. Kantor, Daniela S. Aliaga Goltsman, Elisabeth M. Bik, Brian C. Thomas, [[Jillian F. Banfield]], David A. Relman: [https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(17)31343-X Novel Microbial Diversity and Functional Potential in the Marine Mammal Oral Microbiome]. In: Current Biology, Band 27, Nr. 24, S. 3752​-3762.e6, 18. Dezember 2017; [[doi:10.1016/j.cub.2017.10.040]], PMID 29153320, Epub 16. November 2017. Siehe insbes. [https://els-jbs-prod-cdn.jbs.elsevierhealth.com/cms/attachment/05116743-dedd-433f-9013-e2d06771dbf6/gr1.jpg Fig. 1].</ref> |
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|Online=https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-014-0076-2 |
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|DOI=10.1186/s12915-014-0076-2 |
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<ref name="Forterre2011">{{cite journal |author=[[Patrick Forterre]] |title=A new fusion hypothesis for the origin of Eukarya: better than previous ones, but probably also wrong|journal=Research in Microbiology |date=2011-01 |volume=162 |issue=1 |pages=77–91 |doi=10.1016/j.resmic.2010.10.005 |pmid=21034817 |url=https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0923250810002160 }}</ref> |
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|PMID=25350791}} |
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<ref name="Garrity2010">{{cite book |series=Bergey's Manual of Systematic Bacteriology|volume=4|title=The Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Planctomycetes |
|||
</ref> |
|||
|author=N. R. Krieg, W. Ludwig, W. B. Whitman, B. P. Hedlund, B. J. Paster, J. T. Staley, N. Ward, D. Brown, A. Parte| editor=George M. Garrity |
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<ref name="Cavalier1987"> |
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|publisher=Springer|location= New York |edition=2 |isbn=978-0-387-95042-6 |pages=908 |url=https://www.springer.com/life+sciences/book/978-0-387-95042-6 |date=2010-11-24 |id=British Library no. GBA561951}} Erstauflage Williams & Wilkins, 1984.</ref> |
|||
[[Thomas Cavalier-Smith]]: [https://nyaspubs.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1749-6632.1987.tb40596.x The Origin of Eukaryote and Archaebacterial Cells]. In: Annals of the New York Academy of Sciences, Band 503, Nr. 1, Juli 1987, S. 17–54; [[doi:10.1111/j.1749-6632.1987.tb40596.x]]. PMID 3113314. |
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</ref> |
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<ref name="Gupta2012">{{cite journal |author=Radhey S. Gupta, Vaibhav Bhandari, Hafiz Sohail Naushad |title=Molecular Signatures for the PVC Clade (Planctomycetes, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Lentisphaerae) of Bacteria Provide Insights into Their Evolutionary Relationships |
|||
<ref name="Cavalier2002"> |
|||
|journal=Front Microbiol |volume=3 |pages=327 |date=2012-09-17 |pmid=23060863 |pmc=3444138 |doi=10.3389/fmicb.2012.00327 |url=https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2012.00327/full}}</ref> |
|||
{{Literatur |
|||
|Autor=[[Thomas Cavalier-Smith]] |
|||
<ref name="Gupta2015">{{cite journal |author=Radhey S. Gupta, Sohail Naushad, Chirayu Chokshi, Emma Griffiths, Mobolaji Adeolu |title=A phylogenomic and molecular markers based analysis of the phylum Chlamydiae: proposal to divide the class Chlamydiia into two orders, Chlamydiales and Parachlamydiales ord. nov., and emended description of the class Chlamydiia |journal=Antonie van Leeuwenhoek |volume=108 |issue=3 |pages=765–781 |date=2015-07-16 |pmid=26179278 |doi=10.1007/s10482-015-0532-1 |url=https://link.springer.com/article/10.1007/s10482-015-0532-1 }}</ref> |
|||
|Titel=The neomuran origin of archaebacteria, the negibacterial root of the universal tree and bacterial megaclassification |
|||
|Sammelwerk=International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology |
|||
<ref name="Gupta2016">{{cite journal |author=Radhey S. Gupta |title=Impact of genomics on the understanding of microbial evolution and classification: the importance of Darwin's views on classification |journal= FEMS Microbiol Rev |volume=40 |issue=4 |pages=520–553 |date=2016-06-08 |pmid=27279642 |doi=10.1093/femsre/fuw011 |url=https://academic.oup.com/femsre/article/40/4/520/2198043 }}</ref> |
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|Band=52 |
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|Nummer=1 |
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<ref name="Hug2016">{{cite journal |
|||
|Datum=2002-01-01 |
|||
|author=Laura A. Hug, Brett J. Baker, Karthik Anantharaman, Christopher T. Brown, Alexander J. Probst, Cindy J. Castelle, Cristina N. Butterfield, Alex W. Hernsdorf, Yuki Amano, Kotaro Ise, Yohey Suzuki, Natasha Dudek, David A. Relman, Kari M. Finstad, Ronald Amundson, Brian C. Thomas, [[Jillian F. Banfield]] |
|||
|Seiten=7–76 |
|||
|title=A new view of the tree of life|journal=[[Nature]] Microbiology |
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|Online=https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem/10.1099/00207713-52-1-7 |
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|volume=1|issue=5|date=2016-04-11|pages=16048 |
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|DOI=10.1099/00207713-52-1-7 |
|||
|doi=10.1038/nmicrobiol.2016.48|pmid=27572647 |
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|PMID=11837318}} |
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|url=https://www.nature.com/articles/nmicrobiol201648}}</ref> |
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</ref> |
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<ref name="Cavalier2006"> |
|||
<ref name="Kizina2022">Jana Kizina, Sebastian F. A. Jordan, Gerrit Alexander Martens, Almud Lonsing, Christina Probian, Androniki Kolovou, Rachel Santarella-Mellwig, Erhard Rhiel, Sten Littmann, Stephanie Markert, Kurt Stüber, Michael Richter, Thomas Schweder, Jens Harder: [https://journals.asm.org/doi/10.1128/aem.02407-21 ''Methanosaeta'' and “''Candidatus'' Velamenicoccus archaeovorus”]. In: ASM Journals: Applied and Environmental Microbiology, Band 88, Nr. 7, 21. März 2022; [[doi:10.1128/aem.02407-21]]. Dazu: |
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{{Literatur |
|||
|Autor=[[Thomas Cavalier-Smith]] |
|||
|Titel=Rooting the tree of life by transition analyses |
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|Sammelwerk=Biol. Direct |
|||
|Band=1 |
|||
|Nummer=1 |
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|Datum=2006-07-11 |
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|Seiten=19 |
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|Online=https://biologydirect.biomedcentral.com/articles/10.1186/1745-6150-1-19 |
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|DOI=10.1186/1745-6150-1-19 |
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|PMC=1586193 |
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|PMID=16834776}} |
|||
</ref> |
|||
<ref name="Dudek2017"> |
|||
Natasha K. Dudek, Christine L. Sun, David Burstein, Rose S. Kantor, Daniela S. Aliaga Goltsman, Elisabeth M. Bik, Brian C. Thomas, [[Jillian F. Banfield]], David A. Relman: [https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(17)31343-X Novel Microbial Diversity and Functional Potential in the Marine Mammal Oral Microbiome]. In: Current Biology, Band 27, Nr. 24, S. 3752​-3762.e6, 18. Dezember 2017; [[doi:10.1016/j.cub.2017.10.040]]. PMID 29153320, Epub 16. November 2017. Siehe insbes. [https://els-jbs-prod-cdn.jbs.elsevierhealth.com/cms/attachment/05116743-dedd-433f-9013-e2d06771dbf6/gr1.jpg Fig. 1]. |
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</ref> |
|||
<ref name="Forterre2011"> |
|||
{{Literatur |
|||
|Autor=[[Patrick Forterre]] |
|||
|Titel=A new fusion hypothesis for the origin of Eukarya: better than previous ones, but probably also wrong |
|||
|Sammelwerk=Research in Microbiology |
|||
|Band=162 |
|||
|Nummer=1 |
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|Datum=2011-01 |
|||
|Seiten=77–91 |
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<ref name="Garrity2010"> |
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{{Literatur |
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|Autor=N. R. Krieg, W. Ludwig, W. B. Whitman, B. P. Hedlund, B. J. Paster, J. T. Staley, N. Ward, D. Brown, A. Parte |
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|Hrsg=George M. Garrity |
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|Titel=The Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Planctomycetes |
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|Reihe=Bergey's Manual of Systematic Bacteriology |
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|BandReihe=4 |
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|Auflage=2 |
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|Verlag=Springer |
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|Ort=New York |
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|Datum=2010 |
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|ISBN=978-0-387-95042-6 |
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|Seiten=908 |
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|Kommentar=British Library no. GBA561951}} Erstauflage Williams & Wilkins, 1984. |
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{{Literatur |
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|Autor=Radhey S. Gupta, Vaibhav Bhandari, Hafiz Sohail Naushad |
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|Titel=Molecular Signatures for the PVC Clade (Planctomycetes, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Lentisphaerae) of Bacteria Provide Insights into Their Evolutionary Relationships |
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|Sammelwerk=Front Microbiol |
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|Band=3 |
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|Datum=2012-09-17 |
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|Seiten=327 |
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{{Literatur |
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|Autor=Radhey S. Gupta, Sohail Naushad, Chirayu Chokshi, Emma Griffiths, Mobolaji Adeolu |
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|Titel=A phylogenomic and molecular markers based analysis of the phylum Chlamydiae: proposal to divide the class Chlamydiia into two orders, Chlamydiales and Parachlamydiales ord. nov., and emended description of the class Chlamydiia |
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|Sammelwerk=Antonie van Leeuwenhoek |
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|Band=108 |
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|Nummer=3 |
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|Seiten=765–781 |
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|Autor=Radhey S. Gupta |
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|Titel=Impact of genomics on the understanding of microbial evolution and classification: the importance of Darwin's views on classification |
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|Sammelwerk=FEMS Microbiol Rev |
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|Band=40 |
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|Datum=2016-06-08 |
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|Seiten=520–553 |
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|PMID=27279642}} |
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<ref name="Hug2016"> |
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{{Literatur |
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|Autor=Laura A. Hug, Brett J. Baker, Karthik Anantharaman, Christopher T. Brown, Alexander J. Probst, Cindy J. Castelle, Cristina N. Butterfield, Alex W. Hernsdorf, Yuki Amano, Kotaro Ise, Yohey Suzuki, Natasha Dudek, David A. Relman, Kari M. Finstad, Ronald Amundson, Brian C. Thomas, [[Jillian F. Banfield]] |
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|Titel=A new view of the tree of life |
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|Sammelwerk=[[Nature]] Microbiology |
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|Band=1 |
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|Datum=2016-04-11 |
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Jana Kizina, Sebastian F. A. Jordan, Gerrit Alexander Martens, Almud Lonsing, Christina Probian, Androniki Kolovou, Rachel Santarella-Mellwig, Erhard Rhiel, Sten Littmann, Stephanie Markert, Kurt Stüber, Michael Richter, Thomas Schweder, Jens Harder: [https://journals.asm.org/doi/10.1128/aem.02407-21 ''Methanosaeta'' and “''Candidatus'' Velamenicoccus archaeovorus”]. In: A. S. M. Journals: ''Applied and Environmental Microbiology.'' Band 88, Nr. 7, 21. März 2022; [[doi:10.1128/aem.02407-21]]. Dazu: |
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* [https://www.biologie-seite.de/News/R%C3%A4uberische_Bakterien.html Räuberische Bakterien]. Mikrobiologie: Bio-News vom 23. März 2022. |
* [https://www.biologie-seite.de/News/R%C3%A4uberische_Bakterien.html Räuberische Bakterien]. Mikrobiologie: Bio-News vom 23. März 2022. |
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* [https://www.eurekalert.org/news-releases/947362?language=german Räuberische Bakterien] (deutsch); [https://www.eurekalert.org/news-releases/947362 Predatory bacteria] (englisch); [https://www.eurekalert.org/multimedia/822759?language=german EM-Aufnahme]. Auf: EurekAlert! vom 23. März 2022.</ref> |
* [https://www.eurekalert.org/news-releases/947362?language=german Räuberische Bakterien] (deutsch); [https://www.eurekalert.org/news-releases/947362 Predatory bacteria] (englisch); [https://www.eurekalert.org/multimedia/822759?language=german EM-Aufnahme]. Auf: EurekAlert! vom 23. März 2022. |
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<ref name="Kamneva2012"> |
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{{Literatur |
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<ref name="Kamneva2012">{{cite journal |author=Olga K. Kamneva, David A. Liberles, Naomi L. Ward |title=Genome-wide influence of indel Substitutions on evolution of bacteria of the PVC superphylum, revealed using a novel computational method |journal=Genome Biol Evol |volume=2 |pages=870–886 |year=2010 |pmid=21048002 |pmc=3000692 |doi=10.1093/gbe/evq071 |url=https://academic.oup.com/gbe/article/doi/10.1093/gbe/evq071/581885 }}</ref> |
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|Autor=Olga K. Kamneva, David A. Liberles, Naomi L. Ward |
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|Titel=Genome-wide influence of indel Substitutions on evolution of bacteria of the PVC superphylum, revealed using a novel computational method |
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<ref name="Lagkouvardos2014">{{cite journal |author=Ilias Lagkouvardos, Marc-André Jehl, Thomas Rattei, Matthias Horn |title= Signature protein of the PVC superphylum |journal=Appl Environ Microbiol |volume=80 |issue=2 |pages=440–445 |date=2014-01-02 |pmid=24185849 |doi=10.1128/AEM.02655-13 |pmc=3911108 |url=https://journals.asm.org/doi/10.1128/AEM.02655-13 }} Siehe insbes. Tbl. 1 und [https://www.researchgate.net/figure/Evolutionary-relationships-of-all-of-the-known-PVC-superphylum-SPs-and-their-metagenomic_fig1_258253558 Fig. 1].</ref> |
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Ruth E. Ley, J. Kirk Harris, Joshua Wilcox, John R. Spear, Scott R. Miller, Brad M. Bebout, Julia A. Maresca, Donald A. Bryant, Mitchell L. Sogin, Norman R. Pace: [https://journals.asm.org/doi/10.1128/AEM.72.5.3685-3695.2006 Unexpected Diversity and Complexity of the Guerrero Negro Hypersaline Microbial Mat]. In: A. S. M. Journals: ''Applied and Environmental Microbiology.'' Band 72, Nr. 5, 3. Mai 2006; [[doi:10.1128/AEM.72.5.3685-3695.2006]]. PMID 16672518, {{PMC|1472358}}. |
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Version vom 15. November 2022, 12:44 Uhr
| PVC-Gruppe | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||||
| Systematik | ||||||||
| ||||||||
| Wissenschaftlicher Name | ||||||||
| Planctobacteria[1] | ||||||||
| Cavalier-Smith, 1987 |
Die PVC-Gruppe (englisch PVC group) ist eine Klade (Verwandtschaftsgruppe) von Bakterien.[2] Die Bezeichnung ist ein Akronym, benannt nach den ursprünglichen drei Mitglieds-Phyla Planctomycetes, Verrucomicrobia und Chlamydiae.[3][4]
Thomas Cavalier-Smith postulierte 2002, dass die Bakterien dieser Gruppe ihre Peptidoglykan-Zellwand zweimal verloren oder reduziert haben.[5] In seiner Systematik nannte er die Gruppe Planctobacteria (Planctobakterien) im taxonomischen Rang eines Phylums und die namensgebenden Mitglieder lediglich als Klasse.[5] Dies wird jedoch von der größeren wissenschaftlichen Gemeinschaft nicht übernommen und die PVC-Gruppe dagegen eher als Superphylum eingestuft,[6] und der Begriff Planctobacteria wird manchmal synonym zum Phylum Planctomycetes verwendet.
In der bakteriellen Megaklassifikation nach Cavalier-Smith gehören die Planctobakterien (alias PVC-Gruppe) zum bakteriellen Infrareich (englisch infrakingom, lateinisch infraregnum) Gracilicutes und umfassen neben den genannten Planctomycetes, Verrucomicrobia und Chlamydiae insbesondere auch die Lentisphaerae.[5][7]
Hypothese zur Eukaryogenese
Patrick Forterre (2011) und Baum et al. (2014) stellten die Hypothese auf, dass ein Mitglied der PVC-Klade in einem endosymbiotischen Ereignis in der Frühzeit des Leben Wirtszelle gewesen sein könnte, aus der die erste proto-eukaryotische Zelle hervorging.[8][9] Diese Hypothese steht in Konkurrenz zur Eozyten-Hypothese, nach der diese Wirtszellen stattdessen bestimmte Archaeen waren – nach der ursprünglichen Vermutung Crenarchaeota alias Eozyten. Diese Auffassung hat in jüngster Zeit Unterstützung bekommen: so vermutet man den Ursprung der Eukaryoten heute eher bei oder in den neu entdeckten (und mit den Crenarchaeota weitläufig verwandten) Asgard-Archaeen.
Molekulargenetische Charakterisierung
Planctomycetes, Verrucomicrobia, und Chlamydiae werden in der konventionellen molekularen Phylogenie als Phyla (d. h. Stämme oder Abteilungen, englisch divisions) betrachtet, und in der PVC-Gruppe als Superphylum zusammengefasst, zusammen mit weiteren Kandidaten-Phyla wie Omnitrophica[10] (früher OP3) und Poribacteria.[3] Dies wird begründet mit der Homologie ihrer 16S rRNA. Phylogenetische Bäume basierend auf dieser RNA zeigen die eine monophyletische Gruppierung dieser Phyla, d. h. eine Abstammung von einem gemeinsamen Vorfahren.[3] Trotz ihres gemeinsamen Ursprungs unterscheiden sich die Mitglieder des PVC-Superstamms in Bezug auf Lebensweise, Physiologie und Ökologie erheblich. Es ist daher ein wichtiges Anliegen, zusätzlich Molekulare Marker zu identifizieren, hochkonservierte Gene und die von ihnen kodierten Proteine, die eine Zugehörigkeit zu dieser Gruppe anzeigen. 2014 fanden es Ilias Lagkouvardos et al. ein solches Protein, genannt PVC-Superphylum-Signaturprotein (en. PVC superphylum sinature protein).[11] Dieses konservierte Signaturprotein wird von allen PVC-Mitgliedern, mit Ausnahme der Poribacteria, geteilt. Es könnte daher einen Marker darstellen, wie er gesucht wurde, d. h. eine synapomorphe Eigenschaft darstellen und ein Mittel zur Unterscheidung dieser Bakteriengruppe von anderen sein. Diesem Protein wurde eine wichtige Funktion bei der DNA/RNA-Bindung zugeschrieben.[11] Diese Beobachtung bietet nicht nur ein Mittel zur Abgrenzung der PVC-Supergruppe, sondern unterstützt auch deutlich eine evolutionäre Beziehung der Mitglieder dieser Gruppe im Unterschied zu anderen Bakterien.[12][13]
Es wurden auch Conserved Signature Indels (CSIs: konservierte Signatur-Indels) gefunden, die spezifisch für Planctomycetes, Verrucomicrobia und Chlamydiae sind und die die jeweiligen Stämme voneinander und von anderen Bakterien unterscheiden.[12][14] Es wurde ein Drei-Aminosäure-Insertion im RNA-Polymerase-Protein RpoB[15] gefunden, das allen sequenzierten Verrucomicrobia-, Chlamydiae- und Lentisphaerae-Arten gemeinsam ist. Das CSI fehlt bei den benachbarten Planctomycetes und Poribacteria, was auf eine gemeinsame Abstammung und nähere Verwandtschaft der Phyla hindeutet, für die das CSI spezifisch ist.[12] Weitere Beweise für die Existenz dieser Untergruppe sind das Vorhandensein von membranartigen Proteinen (en. membrane coat-like proteins), Tubulin, der Syntheseweg für Sterol und das Vorhandensein von kondensierter DNA.[3][16]
Phylogenie
Links eine konservative Phylogenie nach Woese (1987),[19] Rappé et al (2003),[20] Wagner & Horn (2006)[3] und Spring et al (2016);[21] rechts eine neuere nach der GTDB-Datenbank[22] (mit Annotree: Mendler et al, 2019[23])
| PVC-Gruppe (2016)[19][20][3][21] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PVC-Gruppe (2019+)[22] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Eine ähnliche Situation ist bei der FCB-Gruppe zu beobachten.
Systematik
Die hier angegebene Konsensus-Taxonomie der PVC-Gruppe basiert mit Stand 15. März 2022 auf den folgenden Quellen:
- L – List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ)[24]
- N – National Center for Biotechnology Information (NCBI, Taxonomy Browser)[2]
- G – Genome Taxonomy Database (GTDB), University of Queensland (UQ), Australien.[22][23] – hier nur nachrangig eingeflossen (siehe Anmerkung unten).
LPSN kennt die Supergruppe PVC selbst nicht, daher sind unten die jeweiligen Mitgliedsphyla einzeln referenziert.
Die GTDB versteht abweichend von der folgenden Systematik das Phylum Verrucomicrobiota im weiteren Sinne, d. h. es schließt die Kiritimatiellae (vorher Kiritimatiellaeota) und Lentrispheria (vorher Lentisphaerae) etc. mit ein, die in diesem Zug von Phyla zu Klassen „degradiert“ werden.[25]
Üblicherweise sind von den PVC-Subtaxa nur die Klassen ausgeführt. Mit Anführungszeichen veröffentlichte Namen sind nicht gültig veröffentlicht; weniger gebräuchliche Synonyme sind als Anmerkungen wiedergegeben:
Klade/Superphylum: PVC-Gruppe, englisch PVC group (N), alias Planctobacteria Cavalier-Smith 1987 (N)
- Klade: Chlamydiae/Verrucomicrobia group (N), alias Chlamydiales/Verrucomicrobia group (N)
- Phylum: Chlamydiae Garrity & Holt 2012[26][S 1]
- Klasse Chlamydiia Horn 2016 (G,L) bzw. (Horn 2011) emend. Gupta et al. 2016 (N)
- Phylum: Kiritimatiellaeota Spring et al. 2016 (L,N)[27][S 2]
- Klasse: Kiritimatiellae Spring et al. 2017 (L,N;G: zu Verrucomicrobiota)
- Klasse: Tichowtungiia Mu et al. 2020 (L,N;G: zu Kiritimatiellae), mit
- Phylum: Chlamydiae Garrity & Holt 2012[26][S 1]
- Phylum: Lentisphaerae Cho et al. 2004 (N), Synonym: „Lentisphaeraeota“ (L,N)[29][S 3]
- Klasse: Lentisphaeria Cho et al. 2012 (L,N;G: zu Verrucomicrobiota)
- Klasse: Oligosphaeria Qiu et al. 2013 (L,N;G: zu Lentisphaeria)
- Klade: Candidate division VadinBE97 (N), Synonym: Lentisphaerae subgroup L2 (N), mit
- Spezies: Uncultured candidate division VadinBE97 bacterium (N:09N211B)[30]
- Phylum Verrucomicrobia Hedlund, mit Synonym Verrucomicrobaeota Oren et al. 2015 (L,N), „Verrucomicrobiota“ Whitman et al. 2018 (G,L,N)[31][32][S 4]
- Klasse: „Methylacidiphilae“ (N), mit
- Spezies: Methylacidiphilae bacterium JGI 000193CP-F02 (N)
- Klasse: Opitutae Choo et al. 2007 (L,N)[S 5] – bei GTDB Ordnung Opitutales innerhalb Klasse Verrucomicrobiae; mit
- Spezies: Ca. Epixenosoma ejectans Cho et al. 2010 (L,N)
- Klasse „Spartobacteria“ Sangwan et al. 2004 (L, N), Synonym: Verrucomicrobia subdivision 2 (N), Xiphinematobacteriaceae (N) – bei GTDB zu Ordnung Chthoniobacterales innerhalb Klasse Verrucomicrobiae; mit
- Klasse: Terrimicrobia García-López et al. 2020 (L,N) – bei GTDB Familie Terrimicrobiaceae zu Ordnung Chthoniobacterales
- Klasse: Verrucomicrobiae Hedlund et al. 1998 emend. Yoon et al. 2008 (N)[S 6]
- Phyla ohne Zuordnung zu einer Subklade der PVC-Gruppe:
- Phylum: „Planctomycetes“ (L,N), mit Synonym Planctomycetota (G,L,N)[35][S 7]
- Klasse: Phycisphaerae Fukunaga et al. 2010 (G,L,N)
- Klasse „Planctomycetia“ Ward (L,N), mit Synonym Planctomycetes Oren et al.[S 8]
- Klasse: „Candidatus Brocadiia“ Lodha et al. 2021 (N), Synonym: „Ca. Brocadiae“ Jenkins & Staley 2013 (G,L,N)
- Klasse: „Candidatus Uabimicrobiia“ Lodha et al. 2021 (L,N) alias J132 (G), mit
- Phylum: „Planctomycetes“ (L,N), mit Synonym Planctomycetota (G,L,N)[35][S 7]
-
- Phylum „Candidatus Abyssubacteria“ (G,L,N)[37][S 10]
- Klasse SURF-5 (G)[38] mit
- Spezies Ca. Abyssubacteria bacterium SURF_5 (N) alias SURF-5 sp003598085 (G) und
- Spezies Ca. Abyssubacteria bacterium SURF_17 (N) alias SURF-17 sp003598055 (G)
- Phylum Candidatus Aureabacteria Momper et al. 2017 (G,N), Synonym Candidate phylum SURF-CP-2 (N)[39]
- Phylum Candidatus Omnitrophica Rinke et al. 2013 (L,N), Synonym Ca. Omnitrophicaeota (N), Ca. Omnitrophota (G,N)[40][41][42][S 11]
- Gattung „Candidatus Omnitrophus“ Rinke et al. 2013 (L,N)
- Spezies „Candidatus Omnitrophus fodinae“ Rinke et al. 2013 (L,N)
- Spezies „Candidatus Omnitrophus magneticus“ Kolinko et al. 2016 (L,N) – in der GTDB in eigener Gattung Omnitrophus_A (G)
- Gattung „Candidatus Velamenicoccus“ Kizina et al. 2022 (N), mit Synonym „Ca. Vampirococcus“ Kizina 2017 non Guerrero et al. 1986 – ungültig wegen Doppelvergabe (N) bzw. Vampirococcus_B (G)
- Spezies „Candidatus Velamenicoccus archaeovorus“ (N), mit Synonym Vampirococcus_B archaeovorus (G), früher OP3 LiM,[43] Referenzstamm LiM (G,N)[43]
- Gattung „Candidatus Omnitrophus“ Rinke et al. 2013 (L,N)
- Phylum „Candidatus Abyssubacteria“ (G,L,N)[37][S 10]
- Phyla „incertae sedis“:
- Phylum: Elusimicrobiota Geissinger et al. 2021, mit Synonym Elusimicrobia [phylum] Geissinger et al. 2010[44][45][S 12]
Synonymien
- ↑
Chlamydiae Garrity & Holt 2012 (N) bzw. „Chlamydiae“ Garrity & Holt 2001 (L), Synonyme:
- „Chlamydaeota“ Oren et al. 2015 (L,N)
- Chlamydiota Garrity & Holt 2021 (G,L,N)
- „Chlamydiota“ Whitman et al. 2018 (L)
- ↑
Kiritimatiellaeota Spring et al. 2016 (L,N), Synonyme:
- Kiritimatiellota Spring et al. 2021 (L)
- Verrucomicrobia subdivision 5 (N)
- ↑
Lentisphaerae Cho et al. 2004 (N), Synonyme:
- „Lentisphaeraeota“ Oren et al. 2015 (L,N)
- „Lentisphaerota“ Whitman et al. 2018 (L,N)
- ↑
Verrucomicrobia Hedlund 2012 (N) oder 2021 (L) bzw. (Hedlund et al. 1997) Yoon et al. 2010 (N), Synonyme:
- „Verrucomicrobia“ Hedlund et al. 1997 (L) oder Hedlund 2010 (L), Yoon et al. 2010 (L)
- Verrucomicrobaeota Oren et al. 2015 (L,N) bzw. „Verrucomicrobiota“ Whitman et al. 2018 (G,L,N)
- ↑
Opitutae Choo et al. 2007 (L,N), Synonyme:
- „Opitutia“ Cavalier-Smith 2020 (L)
- Verrucomicrobia subdivision 4 (N)
- ↑
Verrucomicrobiae Hedlund et al. 1998 emend. Yoon et al. 2008 (N) bzw. Hedlund et al. 1998 (G,L), Synonym:
- „Verrucomicrobiia“ Cavalier-Smith 2020 (L)
- ↑
„Planctomycetes“ Garrity & Holt 2001 emend. Ward 2011 (N), Synonyme:
- „Planctomycetes“ Garrity & Holt 2001 (L)
- „Planctomycetaeota“ Oren et al. 2015 (L,N)
- Planctomycetota Garrity & Holt 2021 (G,L,N) und „Planctomycetota“ Whitman et al. 2018 (L)
- „Planctobacteria“ (Cavalier-Smith 1987) Cavalier-Smith 2002 (L)
- ↑
„Planctomycetia“ Ward 2011 (N) und Cavalier-Smith 2020 (L), bzw. Planctomycetia Ward 2020 (L), Synonyme:
- „Planctomycetacia“ Garrity & Holt 2001 (L,N)
- Planctomycea Cavalier-Smith 2002 (L,N)
- „Planctomycetes“ Oren et al. 2015 (L) bzw. Planctomycetes Oren et al. 2015 emend. Lodha et al. 2021 (G,N)
- ↑
Ca. Uabimicrobium amorphum corrig. Shiratori et al. 2019 (N), Synonyme:
- „Ca. Uab amorphum“ Shiratori et al. 2019 (N)
- Planctomycetes bacterium SRT547 (G,N)
- SRT547 sp009002475 (G)
- ↑
„Candidatus Abyssubacteria“ (G,L,N), mit Schreibvariante
- „Ca. Abyssobacteria“ corrig. Momper et al. 2018 (L), Synonyme:
- „Ca. Abyssubacteria“ Momper et al. 2018 (L)
- Candidate division SURF-CP-1 (N)
- ↑
Candidatus Omnitrophica Rinke et al. 2013 (L,N), Synonyme:
- Ca. Omnitrophicaeota (N),
- Ca. Omnitrophota (G,N)
- Candidate division WOR-2 (N), Candidate division White Oak River group 2 (N)
- Candidate division OP3 (N), Candidate division Obsidian Pool 3 (N)
- ↑
Elusimicrobiota Geissinger et al. 2021 bzw. „Elusimicrobiota“ Whitman et al. 2018, mit Synonymen:
- „Elusimicrobaeota“ Oren et al. 2015
- Elusimicrobia [phylum] Geissinger et al. 2010
- Candidate phylum/division TG1, Candidate phylum/division Termite Group 1
Einzelnachweise
- ↑ Thomas Cavalier-Smith: The Origin of Eukaryote and Archaebacterial Cells. In: Annals of the New York Academy of Sciences, Band 503, Nr. 1, Juli 1987, S. 17–54; doi:10.1111/j.1749-6632.1987.tb40596.x. PMID 3113314.
- ↑ a b NCBI: PVC group, Details: PVC group (clade, includes Chlamydiae/Verrucomicrobia group alias Chlamydiales/Verrucomicrobia); graphisch: PVC group, Lifemap NCBI Version.
- ↑ a b c d e f Michael Wagner, Matthias Horn: The Planctomycetes, Verrucomicrobia, Chlamydiae and sister phyla comprise a superphylum with biotechnological and medical relevance. In: Current Opinion in Biotechnology. Band 17, Nr. 3, Juni 2006, S. 241–249, doi:10.1016/j.copbio.2006.05.005, PMID 16704931 (sciencedirect.com).
- ↑ Elena Rivas-Marín, Damien P. Devos: The Paradigms They Are a-Changin’: past, present and future of PVC bacteria research. In: Antonie van Leeuwenhoek. Band 111, 1. Juni 2018, S. 785–799, doi:10.1007/s10482-017-0962-z (englisch).
- ↑ a b c Thomas Cavalier-Smith: The neomuran origin of archaebacteria, the negibacterial root of the universal tree and bacterial megaclassification. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Band 52, Nr. 1, 1. Januar 2002, S. 7–76, doi:10.1099/00207713-52-1-7, PMID 11837318 (microbiologyresearch.org).
- ↑ N. R. Krieg, W. Ludwig, W. B. Whitman, B. P. Hedlund, B. J. Paster, J. T. Staley, N. Ward, D. Brown, A. Parte: The Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Planctomycetes. Hrsg.: George M. Garrity (= Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Band 4). 2. Auflage. Springer, New York 2010, ISBN 978-0-387-95042-6, S. 908 (springer.com – British Library no. GBA561951). Erstauflage Williams & Wilkins, 1984.
- ↑ Thomas Cavalier-Smith: Rooting the tree of life by transition analyses. In: Biol. Direct. Band 1, Nr. 1, 11. Juli 2006, S. 19, doi:10.1186/1745-6150-1-19, PMID 16834776, PMC 1586193 (freier Volltext) – (biomedcentral.com).
- ↑ Patrick Forterre: A new fusion hypothesis for the origin of Eukarya: better than previous ones, but probably also wrong. In: Research in Microbiology. Band 162, Nr. 1, Januar 2011, S. 77–91, doi:10.1016/j.resmic.2010.10.005, PMID 21034817 (sciencedirect.com).
- ↑ David A. Baum, Buzz Baum: An inside-out origin for the eukaryotic cell. In: BMC Biology. Band 12, Nr. 1, 28. Oktober 2014, S. 76, doi:10.1186/s12915-014-0076-2, PMID 25350791, PMC 4210606 (freier Volltext) – (biomedcentral.com).
- ↑ Taxonomy – Candidatus Omnitrophica (PHYLUM). UniProt, abgerufen am 15. November 2022.
- ↑ a b Ilias Lagkouvardos, Marc-André Jehl, Thomas Rattei, Matthias Horn: Signature protein of the PVC superphylum. In: Appl Environ Microbiol. Band 80, Nr. 2, 2. Januar 2014, S. 440–445, doi:10.1128/AEM.02655-13, PMID 24185849, PMC 3911108 (freier Volltext) – (asm.org). Siehe insbes. Tbl. 1 und Fig. 1.
- ↑ a b c Radhey S. Gupta, Vaibhav Bhandari, Hafiz Sohail Naushad: Molecular Signatures for the PVC Clade (Planctomycetes, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Lentisphaerae) of Bacteria Provide Insights into Their Evolutionary Relationships. In: Front Microbiol. Band 3, 17. September 2012, S. 327, doi:10.3389/fmicb.2012.00327, PMID 23060863, PMC 3444138 (freier Volltext) – (frontiersin.org).
- ↑ Radhey S. Gupta: Impact of genomics on the understanding of microbial evolution and classification: the importance of Darwin's views on classification. In: FEMS Microbiol Rev. Band 40, Nr. 4, 8. Juni 2016, S. 520–553, doi:10.1093/femsre/fuw011, PMID 27279642 (oup.com).
- ↑ Radhey S. Gupta, Sohail Naushad, Chirayu Chokshi, Emma Griffiths, Mobolaji Adeolu: A phylogenomic and molecular markers based analysis of the phylum Chlamydiae: proposal to divide the class Chlamydiia into two orders, Chlamydiales and Parachlamydiales ord. nov., and emended description of the class Chlamydiia. In: Antonie van Leeuwenhoek. Band 108, Nr. 3, 16. Juli 2015, S. 765–781, doi:10.1007/s10482-015-0532-1, PMID 26179278 (springer.com).
- ↑ rpoB (Gen). Auf {SubtiWiki}, Universität Göttingen.
- ↑ Olga K. Kamneva, David A. Liberles, Naomi L. Ward: Genome-wide influence of indel Substitutions on evolution of bacteria of the PVC superphylum, revealed using a novel computational method. In: Genome Biol Evol. Band 2, 2010, S. 870–886, doi:10.1093/gbe/evq071, PMID 21048002, PMC 3000692 (freier Volltext) – (oup.com).
- ↑ Laura A. Hug, Brett J. Baker, Karthik Anantharaman, Christopher T. Brown, Alexander J. Probst, Cindy J. Castelle, Cristina N. Butterfield, Alex W. Hernsdorf, Yuki Amano, Kotaro Ise, Yohey Suzuki, Natasha Dudek, David A. Relman, Kari M. Finstad, Ronald Amundson, Brian C. Thomas, Jillian F. Banfield: A new view of the tree of life. In: Nature Microbiology. Band 1, Nr. 5, 11. April 2016, S. 16048, doi:10.1038/nmicrobiol.2016.48, PMID 27572647 (nature.com).
- ↑ Natasha K. Dudek, Christine L. Sun, David Burstein, Rose S. Kantor, Daniela S. Aliaga Goltsman, Elisabeth M. Bik, Brian C. Thomas, Jillian F. Banfield, David A. Relman: Novel Microbial Diversity and Functional Potential in the Marine Mammal Oral Microbiome. In: Current Biology, Band 27, Nr. 24, S. 3752-3762.e6, 18. Dezember 2017; doi:10.1016/j.cub.2017.10.040. PMID 29153320, Epub 16. November 2017. Siehe insbes. Fig. 1.
- ↑ a b Carl R. Woese: Bacterial evolution. In: Microbiological Reviews. Band 51, Nr. 2, 1. Juni 1987, S. 221–271, doi:10.1128/MMBR.51.2.221-271.1987, PMID 2439888, PMC 373105 (freier Volltext).
- ↑ a b Michael S. Rappé, Stephen J. Giovannoni: The Uncultured Microbial Majority. In: Annual Review of Microbiology. Band 57, Oktober 2003, S. 369–394, doi:10.1146/annurev.micro.57.030502.090759, PMID 14527284.
- ↑ a b Stefan Spring, Boyke Bunk, Cathrin Spröer, Peter Schumann, Manfred Rohde, Brian J. Tindall, Hans-Peter Klenk: Characterization of the first cultured representative of Verrucomicrobia subdivision 5 indicates the proposal of a novel phylum. In: Nature: The ISME Journal, Band 10, 14. Juni 2016, S. 2801–2816; doi:10.1038/ismej.2016.84. PMID 27300277, PMC 5148204 (freier Volltext).
- ↑ a b c GTDB release 05-RS95. In: Genome Taxonomy Database. Abgerufen am 15. November 2022.
- ↑ a b K. Mendler, H. Chen, D. H. Parks, L. A. Hug, A. C. Doxey: AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life. In: Nucleic Acids Research. Band 47, Nr. 9, 2019, S. 4442–4448, doi:10.1093/nar/gkz246, PMID 31081040, PMC 6511854 (freier Volltext) – (uwaterloo.ca).
- ↑ J. P. Euzéby: List of Bacterial Names with Standing in Nomenclature: a Folder Available on the Internet. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Band 47, Nr. 2, S. 590–592; doi:10.1099/00207713-47-2-590. PMID 9103655.
- ↑ GTDB: Verrumicrobiota
- ↑ LPSN: "Chlamydiae" Garrity and Holt 2001.
- ↑ LPSN: "Kiritimatiellaeota" Spring et al. 2016.
- ↑ GTDB: GCF_009905215.1: UBA5540 sp009905215; sowie Search: SRT547
- ↑ LPSN: "Lentisphaerae" Cho et al. 2004.
- ↑ Ruth E. Ley, J. Kirk Harris, Joshua Wilcox, John R. Spear, Scott R. Miller, Brad M. Bebout, Julia A. Maresca, Donald A. Bryant, Mitchell L. Sogin, Norman R. Pace: Unexpected Diversity and Complexity of the Guerrero Negro Hypersaline Microbial Mat. In: A. S. M. Journals: Applied and Environmental Microbiology. Band 72, Nr. 5, 3. Mai 2006; doi:10.1128/AEM.72.5.3685-3695.2006. PMID 16672518, PMC 1472358 (freier Volltext).
- ↑ LPSN: Verrucomicrobiota Hedlund 2021.
- ↑ OneZoom: Verrucomicrobia.
- ↑ GTDB: Udaeobacter
- ↑ GTDB: GCA_00353355.1: UBA10450 sp003445855.
- ↑ LPSN: "Planctomycetes" Garrity and Holt 2001.
- ↑ GTDB: GCF_009002475.1: SRT547 sp009002475; sowie Search: SRT547
- ↑ LPSN: "Candidatus Abyssubacteria" Momper et al. 2018.
- ↑ GTDB: SURF-5 (Klasse).
- ↑ GTDB: Aureabacteria
- ↑ LPSN: "Candidatus Omnitrophica" Rinke et al. 2013.
- ↑ GTDB: Omnitrophota
- ↑ OneZoom: Candidate division OP3.
- ↑ a b
Jana Kizina, Sebastian F. A. Jordan, Gerrit Alexander Martens, Almud Lonsing, Christina Probian, Androniki Kolovou, Rachel Santarella-Mellwig, Erhard Rhiel, Sten Littmann, Stephanie Markert, Kurt Stüber, Michael Richter, Thomas Schweder, Jens Harder: Methanosaeta and “Candidatus Velamenicoccus archaeovorus”. In: A. S. M. Journals: Applied and Environmental Microbiology. Band 88, Nr. 7, 21. März 2022; doi:10.1128/aem.02407-21. Dazu:
- Räuberische Bakterien. Mikrobiologie: Bio-News vom 23. März 2022.
- Räuberische Bakterien (deutsch); Predatory bacteria (englisch); EM-Aufnahme. Auf: EurekAlert! vom 23. März 2022.
- ↑ Najwa Taib, Daniela Megrian, Jerzy Witwinowski, Panagiotis Adam, Daniel Poppleton, Guillaume Borrel, Christophe Beloin, Simonetta Gribaldo: Genome-wide analysis of the Firmicutes illuminates the diderm/monoderm transition. In: Nature Ecology & Evolution, Band 4, S. 1661–1672, 19. Oktober 2020; doi:10.1038/s41559-020-01299-7. Siehe insbes. Fig. 5.
- ↑ NCBI: Elusimicrobia, Detail:Elusimicrobia Geissinger et al. 2010 (phylum), synonym: Elusimicrobaeota Oren et al. 2015, Elusimicrobiota, candidate division TG1, candidate division Termite Group 1, candidate phylum Termite Group 1.
