Bicaudaviridae

aus Wikipedia, der freien Enzyklopädie
Zur Navigation springen Zur Suche springen
Bicaudaviridae

Bicaudavirus

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: nicht klassifiziert[1]
Reich: nicht klassifiziert[1]
Phylum: nicht klassifiziert[1]
Klasse: nicht klassifiziert[1]
Ordnung: nicht klassifiziert[1]
Familie: Bicaudaviridae[1]
Gattung: Bicaudavirus
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA zirkulär
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: zitronenförmig
Hülle: ?
Wissenschaftlicher Name
Bicaudaviridae
Links
NCBI Taxonomy: 2732902 (Familie),
352476 (Gattung)
ViralZone (Expasy, SIB): 713 (Familie),
742 (Gattung)
ICTV Taxon History: 201902737

Bicaudaviridae ist die offizielle Bezeichnung einer Familie von Viren mit Doppelstrang-DNA-Genom. Ihre natürlichen Wirte sind hyperthermophile Archaeen der Familie Sulfolobaceae im Phylum Thermoproteota (mit Gattungen Acidianus, Sulfolobus, Saccharolobus)[A. 1] Derzeit (Stand Mitte März 2021) gibt es in der Familie Bicaudaviridae vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigt nur die eine Gattung Bicaudavirus mit der Typusart Acidianus two-tailed virus (ATV).[2][3][1]

Der Name leitet sich ab von den lateinischen Wörtern bi und cauda ab, was so viel wie Zweischwanz oder Doppelschwanz bedeutet.

Aufbau[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Die Virionen (Virusteilchen) der Bicaudaviridae sind möglicherweise umhüllt und haben eine zitronenförmige Geometrie. Das Genom ist unsegmentiert (monopartit) und besteht aus einem zirkulär geschlossenen dsDNA-Molekül mit einer Länge von etwa 62 kbp (Kilobasenpaaren). Es hat 72 offene Leserahmen (en. open reading frames, ORFs).[3]

Reproduktionszyklus[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

EM-Aufnahmen, den Reproduktionszyklus von ATV im Wirt Acidianus convivator (Crenarchaeota) dokumentierend.

Die Reproduktion der Viren erfolgt im Zytoplasma der Wirtszellen. Der Eintritt in die Wirtszelle (Infektion) erfolgt durch Anlagerung der Virus-Proteine an Wirtsrezeptoren, wodurch eine Endozytose vermittelt wird. Die Virus-DNA dient als Vorlage für die Transkription (en. DNA-templated transcription). Der Austritt aus der Wirtszelle erfolgt durch Knospung (en. budding). Die Übertragung der Virusteilchen geschieht durch passive Diffusion.[3]

Forschungsgeschichte[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Die Familie Bicaudaviridae wurde erstmals von dem Team um D. Prangishvili im Jahr 2005 beschrieben.[4][5]

Systematik[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Die Systematik ist nach ICTV (Master Species List #35: Offiziell anerkannte Taxa)[1] und National Center for Biotechnology Information (NCBI – Vorschläge, in doppelten Anführungszeichen)[6][7] mit Stand Mitte März 2021 wie folgt:

Gruppe: dsDNA (Baltimore: 1)[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Familie: Bicaudaviridae

  • Gattung: Bicaudavirus
    • Spezies: Acidianus two-tailed virus (ATV, ehem. Typus)[8]
    • Spezies: „Acidianus two-tailed virus 2“ (ATV-2)[9]
    • Spezies: „Acidianus two-tailed virus variant 1“[10]
  • Gattung „Betabicaudavirus“[11]
    • Spezies: „Sulfolobus-Virus STSV1“ (englisch „Sulfolobus virus STSV1“ alias „Sulfolobus tengchongensis spindle-shaped virus 1“, STSV-1)[12]
    • Spezies: „Sulfolobus virus STSV2“ (en. „Sulfolobus virus STSV2“ alias „Sulfolobus tengchongensis spindle-shaped virus 2“, STSV-2)[13]
  • ohne Gattungszuordnung:
    • Spezies: „Acidianus tailed spindle virus“ (ATSV-1)
    • Spezies: „Sulfolobus monocaudavirus SMV1“ (SMV-1)[8]
    • Spezies: „Sulfolobus monocaudavirus SMV2“ (SMV-2)
    • Spezies: „Sulfolobus monocaudavirus SMV3“ (SMV-3)
    • Spezies: „Sulfolobus monocaudavirus SMV4“ (SMV-4)

Die beiden vorgeschlagenen Species STSV1 und STSV2 sind wohl zu unterscheiden von den beiden ICTV-bestätigten Spezies

  • Spezies Sulfolobus spindle-shaped virus 1 (SSV-1)[14][1]
  • Spezies Sulfolobus spindle-shaped virus 2 (SSV-2)[15][1]

der Gattung Alphafusellovirus in der Familie Fuselloviridae.

Anmerkungen[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

  1. ↑ Einige Gattungen von Sulfolobus (offenbar aber nicht S. tengchongensis) wurden in neuerer Zeit nach Saccharolobus verschoben:
    • LPSN: Saccharolobus, Sulfolobus, S. shibatae, S. solfataricus
    • Hiroyuki D. Sakai, Norio Kurosawa: Saccharolobus caldissimus gen. nov., sp. nov., a facultatively anaerobic iron-reducing hyperthermophilic archaeon isolated from an acidic terrestrial hot spring, and reclassification of Sulfolobus solfataricus as Saccharolobus solfataricus comb. nov. and Sulfolobus shibatae as Saccharolobus shibatae comb. nov, in: Int J Syst Evol Microbiol 68(4), April 2018, S. 1271–1278, Epub 27. Februar 2018, doi:10.1099/ijsem.0.002665, PMID 29485400
    • Anh Le-Cook, James Musser: Sulfolobus/Saccharolobus, Extreme Viruses Lab (Stedman Lab)

Weblinks[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Weiterführende Literatur[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Einzelnachweise[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

  1. ↑ a b c d e f g h i j ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. ↑ David Prangishvili, Mart Krupovic et al.: ICTV Virus Taxonomy Profile: Bicaudaviridae. In: The Journal of General Virology. 99. Jahrgang, Nr. 7, 7. Juni 2018, S. 864–865, doi:10.1099/jgv.0.001106, PMID 29877786 (englisch).
  3. ↑ a b c Viral Zone. Expasy, abgerufen am 18. März 2021 (englisch).
  4. ↑ Häring M, Vestergaard G, Rachel R, Chen L, Garrett RA and Prangishvili D (2005) Independent virus development outside a host. Nature 436, 1101–1102
  5. ↑ Prangishvili, D., Vestergaard G, Häring M, Aramayo R, Basta T, Rachel R and Garrett RA (2006) Structural and genomic properties of the hyperthermophilic archaeal virus ATV with an extracellular stage of the reproductive cycle. J. Mol. Biol. 359, S. 1203–1216
  6. ↑ NCBI: Bicaudaviridae (family)
  7. ↑ Andrew M. Kropinski, Stuart G. Siddell: ICTV: ICTV Report Bicaudaviridae, Mai 2018
  8. ↑ a b Fengbin Wang, Virginija Cvirkaite-Krupovic, Matthijn Vos, Leticia C. Beltran, Mark A. B. Kreutzberger, Jean-Marie Winter, Zhangli Su, Jun Liu, Stefan Schouten, Mart Krupovic, Edward H. Egelman: Spindle-shaped archaeal viruses evolved from rod-shaped ancestors to package a larger genome. In:
  9. ↑ NCBI: Acidianus two-tailed virus 2 (species)
  10. ↑ NCBI: Acidianus two-tailed virus variant 1 (species)
  11. ↑ Mart Krupovic, Emmanuelle R. J. Quemin, Dennis H. Bamford, Patrick Forterre, David Prangishvili: Unification of the globally distributed spindle-shaped viruses of the Archaea. In: Journal of Virology. 88. Jahrgang, Nr. 4, 2014, ResearchGate:259320195, S. 2354​–2358, doi:10.1128/JVI.02941-13, PMID 24335300, PMC 3911535 (freier Volltext) – (englisch).
  12. ↑ NCBI: Sulfolobus virus STSV1 (unclassified species)
  13. ↑ NCBI: Sulfolobus virus STSV2 (unclassified species)
  14. ↑ NCBI: Sulfolobus spindle-shaped virus 1 (ICTV accepte species)
  15. ↑ NCBI: Sulfolobus spindle-shaped virus 2 (ICTV accepte species)
Abgerufen von „https://de.wikipedia.org/w/index.php?title=Bicaudaviridae&oldid=242972808“