„Urvorfahr“ – Versionsunterschied

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Die Fähigkeit primitiver Lebewesen zum horizontalen Gentransfer könnte jedoch bedeuten, dass anstelle eines einzigen universellen Ahns eine Gemeinschaft (Genpool) primitiver Einzeller tritt.<ref>New Mexico Museum of Natural History and Science: [http://treeoflife.nmnaturalhistory.org/tree-of-life.html ''Tree of Life – Introduction''], dort insbesondere die interaktive Info zu ‘Who were they’</ref> Da diese sich untereinander im stetigen Genaustausch befanden ('Common ancestral community') könnten sie aus heutiger Sicht quasi als eine Einheit (Species) erscheinen.
Die Fähigkeit primitiver Lebewesen zum horizontalen Gentransfer könnte jedoch bedeuten, dass anstelle eines einzigen universellen Ahns eine Gemeinschaft (Genpool) primitiver Einzeller tritt.<ref>New Mexico Museum of Natural History and Science: [http://treeoflife.nmnaturalhistory.org/tree-of-life.html ''Tree of Life – Introduction''], dort insbesondere die interaktive Info zu ‘Who were they’</ref> Da diese sich untereinander im stetigen Genaustausch befanden ('Common ancestral community') könnten sie aus heutiger Sicht quasi als eine Einheit (Species) erscheinen.

== Zwei oder drei Domänen ==
Neue Untersuchungstechniken haben in den Jahren seit etwa 2015 das Bild stark verändert. Die bisherigen Stammbäume beruhten auf dem Vergleich homologer DNA-Sequenzen vor allem aus der kleineren Untereinheit der [[Ribosomale RNA|ribosomalen RNA]]. Die für die [[Amplifikation (Genetik)|Amplifikation]] verwendeten Methoden, vor allem die verwendeten [[Primer]], erwiesen sich nun für eine Reihe ungewöhnlicher Prokaryoten als ungeeignet. Diese Organismen waren der Aufmerksamkeit der Biologen bis dahin entgangen, weil sie sich mit den in Jahrzehnten entwickelten Standard-Techniken der Mikrobiologie nicht kultivieren ließen, und großenteils bis heute nicht lassen. Viele von ihnen besitzen ein sehr kleines Genom, ihnen fehlen für Lebensvorgänge wesentliche Synthese- und Stoffwechselwege<ref>Christopher T. Brown, Laura A. Hug, Brian C. Thomas, Itai Sharon, Cindy J. Castelle, Andrea Singh, Michael J. Wilkins, Kelly C. Wrighton, Kenneth H. Williams, Jillian F. Banfield (2015): Unusual biology across a group comprising more than 15% of domain Bacteria. Nature 523: 208–211. {{doi|10.1038/nature14486}}</ref>, weshalb man annimmt, sie können womöglich nur als [[Symbiose|Symbionten]] oder [[Parasitismus|Parasiten]], gemeinsam mit anderen Organismen, überleben. Da die formale Beschreibung von Prokaryotentaxa an Kultivierung gebunden ist, verharren die neu gefundenen Linien auf dem Status eines [[Candidatus (Biologie)|Candidatus]]. Tatsächlich wurden aber zahlreiche Taxa, die aufgrund ihrer Divergenz im Rang von [[Stamm (Biologie)|Stämmen]] eingeordnet werden müssen, gefunden, bei denen nicht ein kultivierbares Mitglied enthalten ist. Ihre Existenz verrät sich durch Analysemethoden, bei denen ohne Umweg über Kultivierung direkt Genome in der Umwelt analysiert und dann einzelnen Linien/Arten zugeordent werden (genannt [[Metagenomik]]) oder bei denen das Genom einer einzelnen, isolierten Zelle amplifiziert und sequenziert wird.<ref>Lindsey Solden, Karen Lloyd Kelly Wrighton (2016): The bright side of microbial dark matter: lessons learned from the uncultivated majority. Current Opinion in Microbiology 31: 217–226. {{doi|10.1016/j.mib.2016.04.020}}</ref>

Eine solche Gruppe, die zu den Archaebakterien gehörenden [[Lokiarchaeota]]<ref>Anja Spang, Jimmy H. Saw, Steffen L. Jørgensen, Katarzyna Zaremba-Niedzwiedzka, Joran Martijn, Anders E. Lind, Roel van Eijk, Christa Schleper, Lionel Guy, Thijs J. G. Ettema (2015): Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes. Nature 521: 173–179. {{doi|10.1038/nature14447}}</ref><ref>[http://hawaiireedlab.com/wpress/?p=2178 Loki's Castle and the New Tree of Life: Two Domains and the CPR Hidden Folk]. University of Hawai'i Reed Lab, Floyd A. Reed, 24.Juni 2016.</ref> erwies sich unerwarteterweise nach genetischen Analysen als nahe verwandt mit den [[Eukaryoten]]. Ein mit Hilfe der neuen Techniken 2016 aufgestellter neuer Stammbaum des Lebens, der auf mehr als 3000 vollständig analysierten Genomen beruht<ref>Laura A. Hug, Brett J. Baker, Karthik Anantharaman, Christopher T. Brown, Alexander J. Probst, Cindy J. Castelle, Cristina N. Butterfield, Alex W. Hernsdorf, Yuki Amano, Kotaro Ise, Yohey Suzuki, Natasha Dudek, David A. Relman, Kari M. Finstad, Ronald Amundson, Brian C. Thomas Jillian F. Banfield (2016): A new view of the tree of life. Nature Microbiology 1, Article number: 16048. {{doi|10.1038/nmicrobiol.2016.48}}</ref> fand nicht nur eine neue Großgruppe der Bacteria, die (mit einer Ausnahme) ausschließlich solche unkultivierbaren (Eu-)Bakterienstämme enthält, sondern ergab außerdem eine Wurzel der Eukaryoten innerhalb der Archaebacteria, nicht, wie bisher als gut abgesichert angenommen<ref>Carl R. Woese, Otto Kandler, Mark L. Wheelis (1990): Towards a natural system of organisms: Proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya. Proceedings of the National Academy of Sciences USA 87: 4576-4579.</ref>, eine unabhängige Wurzel von diesen. Danach würden nur zwei, statt bisher drei [[Domäne (Biologie)|Domänen]] des Lebens existieren, die Eukaryoten wären zu einer Linie innerhalb der [[Archaeen]] reduziert<ref>vgl. dazu auch Kasie Raymann, Céline Brochier-Armanet, Simonetta Gribaldo (2015): The two-domain tree of life is linked to a new root for the Archaea. Proceedings of the National Academy of Sciences USA 112 (21): 6670–6675. {{doi|10.1073/pnas.1420858112}}</ref>; dies war als Eozyten-Hypothese schon früher vorgeschlagen worden<ref>J.A. Lake, E.Henderson, M. Oakes, M.W. Clark (1984): Eocytes: A new ribosome structure indicates a kingdom with a close relationship to eukaryotes. Proceedings of the National Academy of Sciences USA 81: 3786–3790. [http://www.pnas.org/content/81/12/3786.short online]</ref>, galt aber bisher als im Widerspruch zu den Befunden. In Zusammenhang mit diesen Entdeckungen wurden auch andere bisherige Ansichten zum systematischen Wert grundlegender Unterschiede in Frage gestellt, etwa zum Aufbau der Lipide der Zellmembran<ref>Laura Villanueva, Stefan Schouten, Jaap S. Sinninghe Damsté (2016): Phylogenomic analysis of lipid biosynthetic genes of Archaea shed light on the ‘lipid divide’. Environmental Microbiology 19: 54–69. {{doi|10.1111/1462-2920.13361}}</ref> oder zum Ursprung der [[Gram-Färbung|grampositiven]] Bakterien<ref>Sergio A. Muñoz-Gómez & Andrew J. Roger (2016): Phylogenomics: Leaving negative ancestors behind. eLife 2016; 5:e20061. {{doi|10.7554/eLife.14589}}</ref>

Die bisher erzielten Ergebnisse sind aufgrund ihrer Neuartigkeit noch vorläufig, sie stehen teilweise im Widerspruch zu den anhand der traditionellen Methoden erzielten Erkenntnisse und müssen daher noch umfassend geprüft werden. Sie deuten aber auf die Möglichkeit hin, dass eventuell einige Prokaryoten mit sehr kleinem Genom möglicherweise nicht auf die Reduktion komplexer organisierter Vorfahren zurückgehen, sondern dass es sich um reliktäre Linien handeln könnte, die in der modernen Welt nur als Symbionten überleben konnten.


== Siehe auch ==
== Siehe auch ==

Version vom 30. Mai 2017, 17:40 Uhr

Der Urvorfahr oder englisch last universal ancestor (LUA, etwa „letzter allgemeiner Vorfahr“), auch last universal common ancestor (LUCA, etwa „letzter allgemeiner gemeinsamer Vorfahr“) ist der – hypothetische – letzte gemeinsame Vorfahre aller heute lebenden Lebewesen (Biota im kladistischen Sinn). Dieser wird von den monophyletischen Abstammungstheorien postuliert.

In diesem Zusammenhang bezeichnet LCA (auch MRCA, Last Common Ancestor bzw. Most Recent Common Ancestor) den „letzten gemeinsamen Vorfahr/Ahn“ („LGV“/„LGA“) einer Gruppe von Lebewesen oder Viren.[1] Beinhaltet die Gruppe alle Nachfahren des LCA, so handelt es sich um eine Klade. Der LCA aller Lebewesen (der Erde) wird dann LUCA (Last Universal Common Ancestor) bzw. „LUGA“ („letzter allgemeiner/universeller gemeinsamer Vorfahr/Ahn“) genannt.[2][3] Es wird in diesen Hypothesen davon ausgegangen, dass diese Urform allen heutigen Lebens vor mindestens 3,5 Milliarden Jahren, also im späten Hadaikum oder frühen Archaikum, gelebt hat.

Hintergrund

Für den Urvorfahren wird angenommen, dass dieser diejenigen Merkmale der heute lebenden Organismen hatte, die diesen gemeinsam sind: eine Zellstruktur, DNA, der genetische Code wie auch mRNA, tRNA und eine ribosomal vermittelte Translation. Der ursprüngliche genetische Code konnte wahrscheinlich gemacht werden.[4]

Darüber hinaus ist es möglich, dass der Urvorfahr thermophil war.[5] Das wird allerdings zunehmend angezweifelt, weil diese Hypothese auf vergleichende Sequenzanalysen der rRNA (ribosomalen RNA) basierte, die bei thermophilen Organismen fragwürdige Ergebnisse liefern.[6] Es scheint, dass seine Zellwandbestandteile Murein enthielten, eine häufige Zellwandkomponente moderner Bakterien.[7][8]

Anmerkungen zu möglichen Fehlschlüssen:

  1. Der Last Universal Ancestor stellt nicht zwangsläufig auch den ersten existierenden Organismus dar.
  2. Folglich wäre er auch nicht zwingend die einfachststrukturierte Lebensform.
  3. Es handelt sich bei diesem Urvorfahren nicht um ein bestimmtes Individuum.

Der Aufbau von Dendrogrammen (Baumdiagrammen), auf der Grundlage genetischer Distanz zwischen allen existenten Zelltypen, zeigt eine relativ frühe Aufspaltung zwischen Archaebakterien, die hoch resistent gegenüber extremen Lebensbedingungen (extremophil) sind, und den übrigen Lebensformen (dies hat zu einigen Vermutungen darüber geführt, dass sich der Urvorfahr in solch extremen Ökosystemen entwickelt haben könnte, etwa im Tiefseerücken).

All seine Zeitgenossen sind seither ausgestorben; lediglich das genetische Erbe hätte bis zum heutigen Tag überlebt. Im Gegensatz dazu propagierte Carl Woese, dass unser genetisches Prä-LUCA Erbe von einer Vielzahl an Organismen entstammte, als nur von einer Spezies (Biofilmtheorie, Horizontaler [lateraler] Gentransfer).

Eine statistische Untersuchung aus dem Jahr 2010 hat ergeben, dass das Leben sehr wahrscheinlich von einem einzigen gemeinsamen Vorfahren abstammt.[9] Ein einziger gemeinsamer Vorfahr ist danach 102860-mal wahrscheinlicher als mehrere.[10]

Die Fähigkeit primitiver Lebewesen zum horizontalen Gentransfer könnte jedoch bedeuten, dass anstelle eines einzigen universellen Ahns eine Gemeinschaft (Genpool) primitiver Einzeller tritt.[11] Da diese sich untereinander im stetigen Genaustausch befanden ('Common ancestral community') könnten sie aus heutiger Sicht quasi als eine Einheit (Species) erscheinen.

Zwei oder drei Domänen

Neue Untersuchungstechniken haben in den Jahren seit etwa 2015 das Bild stark verändert. Die bisherigen Stammbäume beruhten auf dem Vergleich homologer DNA-Sequenzen vor allem aus der kleineren Untereinheit der ribosomalen RNA. Die für die Amplifikation verwendeten Methoden, vor allem die verwendeten Primer, erwiesen sich nun für eine Reihe ungewöhnlicher Prokaryoten als ungeeignet. Diese Organismen waren der Aufmerksamkeit der Biologen bis dahin entgangen, weil sie sich mit den in Jahrzehnten entwickelten Standard-Techniken der Mikrobiologie nicht kultivieren ließen, und großenteils bis heute nicht lassen. Viele von ihnen besitzen ein sehr kleines Genom, ihnen fehlen für Lebensvorgänge wesentliche Synthese- und Stoffwechselwege[12], weshalb man annimmt, sie können womöglich nur als Symbionten oder Parasiten, gemeinsam mit anderen Organismen, überleben. Da die formale Beschreibung von Prokaryotentaxa an Kultivierung gebunden ist, verharren die neu gefundenen Linien auf dem Status eines Candidatus. Tatsächlich wurden aber zahlreiche Taxa, die aufgrund ihrer Divergenz im Rang von Stämmen eingeordnet werden müssen, gefunden, bei denen nicht ein kultivierbares Mitglied enthalten ist. Ihre Existenz verrät sich durch Analysemethoden, bei denen ohne Umweg über Kultivierung direkt Genome in der Umwelt analysiert und dann einzelnen Linien/Arten zugeordent werden (genannt Metagenomik) oder bei denen das Genom einer einzelnen, isolierten Zelle amplifiziert und sequenziert wird.[13]

Eine solche Gruppe, die zu den Archaebakterien gehörenden Lokiarchaeota[14][15] erwies sich unerwarteterweise nach genetischen Analysen als nahe verwandt mit den Eukaryoten. Ein mit Hilfe der neuen Techniken 2016 aufgestellter neuer Stammbaum des Lebens, der auf mehr als 3000 vollständig analysierten Genomen beruht[16] fand nicht nur eine neue Großgruppe der Bacteria, die (mit einer Ausnahme) ausschließlich solche unkultivierbaren (Eu-)Bakterienstämme enthält, sondern ergab außerdem eine Wurzel der Eukaryoten innerhalb der Archaebacteria, nicht, wie bisher als gut abgesichert angenommen[17], eine unabhängige Wurzel von diesen. Danach würden nur zwei, statt bisher drei Domänen des Lebens existieren, die Eukaryoten wären zu einer Linie innerhalb der Archaeen reduziert[18]; dies war als Eozyten-Hypothese schon früher vorgeschlagen worden[19], galt aber bisher als im Widerspruch zu den Befunden. In Zusammenhang mit diesen Entdeckungen wurden auch andere bisherige Ansichten zum systematischen Wert grundlegender Unterschiede in Frage gestellt, etwa zum Aufbau der Lipide der Zellmembran[20] oder zum Ursprung der grampositiven Bakterien[21]

Die bisher erzielten Ergebnisse sind aufgrund ihrer Neuartigkeit noch vorläufig, sie stehen teilweise im Widerspruch zu den anhand der traditionellen Methoden erzielten Erkenntnisse und müssen daher noch umfassend geprüft werden. Sie deuten aber auf die Möglichkeit hin, dass eventuell einige Prokaryoten mit sehr kleinem Genom möglicherweise nicht auf die Reduktion komplexer organisierter Vorfahren zurückgehen, sondern dass es sich um reliktäre Linien handeln könnte, die in der modernen Welt nur als Symbionten überleben konnten.

Siehe auch

Literatur

  • Nicolas Glansdorff, Ying Xu, Bernard Labedan: The Last Universal Common Ancestor : emergence, constitution and genetic legacy of an elusive forerunner. Biology Direct 2008, 3:29.

Weblinks

Einzelnachweise

  1. ↑ Richard Dawkins verwendet für den LGV auch die alternative Bezeichnung concestor, zu deutsch Mitfahr, die auf Nicky Warren zurückgehen soll, siehe Richard Dawkins: Geschichten vom Ursprung des Lebens, S. 69 und 83 sowie Fußnote S. 22, Ullstein 2008, ISBN 978-3-550-08748-6. Dawkins benutzt den Begriff „universell“ allerdings nicht für „alle Lebewesen (der Erde)“, sondern eingeschränkt für „alle Lebewesen einer zuvor ausgewählten Gruppe“, S. 73.
  2. ↑ Patrick Forterre: Looking for LUCA.
  3. ↑ Buchvorstellung von Susanne Liedtke: Matt Ridley, Die Geschichte von Luga – „Alphabet des Lebens“. In: bild der wissenschaft.
  4. ↑ Xiaoxia Liu, Jingxian Zhang, Feng Ni, Xu Dong, Bucong Han, Daxiong Han, Zhiliang Ji, Yufen Zhao: Genome wide exploration of the origin and evolution of amino acids. In: BMC Evolutionary Biology. Band 10, 15. März 2010, ISSN 1471-2148, S. 77, doi:10.1186/1471-2148-10-77 (englisch).
  5. ↑ Dawn J. Brooks, Eric A. Gaucher: Inferred thermophily of the last universal ancestor based on estimated amino acid composition. (PDF) Abgerufen am 1. April 2013.
  6. ↑ Nicolas Galtier, Nicolas Tourasse, Manolo Gouy: A Nonhyperthermophilic Common Ancestor to Extant Life Forms. In: Science. Band 283, Nr. 5399, 8. Januar 1999, S. 220–221, doi:10.1126/science.283.5399.220 (englisch).
  7. ↑ Arthur L. Koch: The Exocytoskeleton. In: Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology. Band 11, Nr. 3–5, S. 115–125, doi:10.1159/000094048 (englisch).
  8. ↑ Arthur L. Koch: The Exoskeleton of Bacterial Cells (the Sacculus): Still a Highly Attractive Target for Antibacterial Agents That Will Last For a Long Time. In: Critical Reviews in Microbiology. Band 26, Nr. 1, Januar 2000, ISSN 1040-841X, S. 1–35, doi:10.1080/10408410091154165 (englisch).
  9. ↑ A formal test of the theory of universal common ancestry. nature.com, abgerufen am 15. Januar 2011.
  10. ↑ All Present-day Life Arose From A Single Ancestor. sciencenews.org, abgerufen am 15. Januar 2011.
  11. ↑ New Mexico Museum of Natural History and Science: Tree of Life – Introduction, dort insbesondere die interaktive Info zu ‘Who were they’
  12. ↑ Christopher T. Brown, Laura A. Hug, Brian C. Thomas, Itai Sharon, Cindy J. Castelle, Andrea Singh, Michael J. Wilkins, Kelly C. Wrighton, Kenneth H. Williams, Jillian F. Banfield (2015): Unusual biology across a group comprising more than 15% of domain Bacteria. Nature 523: 208–211. doi:10.1038/nature14486
  13. ↑ Lindsey Solden, Karen Lloyd Kelly Wrighton (2016): The bright side of microbial dark matter: lessons learned from the uncultivated majority. Current Opinion in Microbiology 31: 217–226. doi:10.1016/j.mib.2016.04.020
  14. ↑ Anja Spang, Jimmy H. Saw, Steffen L. Jørgensen, Katarzyna Zaremba-Niedzwiedzka, Joran Martijn, Anders E. Lind, Roel van Eijk, Christa Schleper, Lionel Guy, Thijs J. G. Ettema (2015): Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes. Nature 521: 173–179. doi:10.1038/nature14447
  15. ↑ Loki's Castle and the New Tree of Life: Two Domains and the CPR Hidden Folk. University of Hawai'i Reed Lab, Floyd A. Reed, 24.Juni 2016.
  16. ↑ Laura A. Hug, Brett J. Baker, Karthik Anantharaman, Christopher T. Brown, Alexander J. Probst, Cindy J. Castelle, Cristina N. Butterfield, Alex W. Hernsdorf, Yuki Amano, Kotaro Ise, Yohey Suzuki, Natasha Dudek, David A. Relman, Kari M. Finstad, Ronald Amundson, Brian C. Thomas Jillian F. Banfield (2016): A new view of the tree of life. Nature Microbiology 1, Article number: 16048. doi:10.1038/nmicrobiol.2016.48
  17. ↑ Carl R. Woese, Otto Kandler, Mark L. Wheelis (1990): Towards a natural system of organisms: Proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya. Proceedings of the National Academy of Sciences USA 87: 4576-4579.
  18. ↑ vgl. dazu auch Kasie Raymann, Céline Brochier-Armanet, Simonetta Gribaldo (2015): The two-domain tree of life is linked to a new root for the Archaea. Proceedings of the National Academy of Sciences USA 112 (21): 6670–6675. doi:10.1073/pnas.1420858112
  19. ↑ J.A. Lake, E.Henderson, M. Oakes, M.W. Clark (1984): Eocytes: A new ribosome structure indicates a kingdom with a close relationship to eukaryotes. Proceedings of the National Academy of Sciences USA 81: 3786–3790. online
  20. ↑ Laura Villanueva, Stefan Schouten, Jaap S. Sinninghe Damsté (2016): Phylogenomic analysis of lipid biosynthetic genes of Archaea shed light on the ‘lipid divide’. Environmental Microbiology 19: 54–69. doi:10.1111/1462-2920.13361
  21. ↑ Sergio A. Muñoz-Gómez & Andrew J. Roger (2016): Phylogenomics: Leaving negative ancestors behind. eLife 2016; 5:e20061. doi:10.7554/eLife.14589
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