Erste internationale Erfahrungen sammelte Joan Cherono bei den Commonwealth Games 2018 im australischen Gold Coast, bei denen sie im 200-Meter-Lauf mit 25,10 s in der ersten Runde ausschied. Im August schied sie bei den Afrikameisterschaften in Asaba mit 12,20 s im Vorlauf über 100 Meter aus und gewann mit der kenianischen 4-mal-100-Meter-Staffel in 45,58 s die Bronzemedaille hinter Nigeria und der Elfenbeinküste. Bei den IAAF World Relays 2019 in Yokohama ging sie mit der 4-mal-200-Meter-Staffel an den Start, konnte den Lauf aber nicht beenden. Ende August gewann sie bei den Afrikaspielen in Rabat mit der 4-mal-100-Meter-Staffel in 45,44 s die Bronzemedaille hinter Nigeria und Südafrika und belegte mit der 4-mal-400-Meter-Staffel in 3:32,93 min Rang vier. Bei den World Athletics Relays 2021 im polnischen Chorzów belegte sie mit der 4-mal-200-Meter-Staffel mit neuem Landesrekord von 1:38,26 min den fünften Platz und in der gemischten 4-mal-400-Meter-Staffel wurde sie im Vorlauf disqualifiziert. Im Jahr darauf gewann sie bei den Afrikameisterschaften in Port Louis in 3:35,55 min gemeinsam mit Veronica Mutua, Jacinter Shikanda und Hellen Syombua die Silbermedaille in der 4-mal-400-Meter-Staffel hinter dem Team aus Südafrika.
2018 wurde Cherono kenianische Meisterin im 100-Meter-Lauf.
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