Andrei Lupas

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Andrei N. Lupas (* 6. September 1963 in Bukarest) ist ein deutsch-rumänischer Biochemiker, Molekularbiologe und Bioinformatiker.

Leben

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Lupas studierte von 1982 bis 1985 Biologie an der Technischen Universität München und promovierte 1991 an der Princeton University in Molekularbiologie. Danach kehrte er als PostDoc nach München zurück, erst an das Gene Center Munich und daraufhin an das Max-Planck-Institut für Biochemie. Von 1997 bis 2001 war er als Senior Computational Biologist und Assistant Director of Bioinformatics bei SmithKline Beecham Pharmaceuticals tätig. Seit 2001 ist er Direktor am Max-Planck-Institut für Biologie Tübingen und leitet die Arbeitsgruppe „Protein Evolution“.[1][2]

Forschung

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Lupas Forschung ist größtenteils bioinformatisch in Kombination mit experimenteller Strukturbiologie. Seine früheren Forschungen beschäftigten sich insbesondere mit der Voraussage von Coiled-Coil-Strukturelementen[3] und der von Proteinen, aber auch mit Berechnungen von Strukturhomologien.[4] Weitere Schwerpunkte seiner Forschung sind die Entstehung frühster Peptide und ihrer Evolution zu heutigen Domänen und schlussendlich zu Proteinen.[5][6][7][8] Darüber hinaus war seine Arbeitsgruppe mitbeteiligt an der Entwicklung des MPI Bioinformatics Toolkit.[9][10] Seine Forschungen wurden unter anderem von der Deutschen Forschungsgemeinschaft, der Volkswagenstiftung, dem Wellcome Trust und dem Howard Hughes Medical Institute gefördert.[11]

Lupas war einer der Richter beim CASP14, in dem AlphaFold gewann.[12][13]

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Einzelnachweise

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  1. ↑ Website von Andrei N. Lupas. 16. März 2022, abgerufen am 16. März 2022.
  2. ↑ Profil von Andrei N. Lupas auf in der Max-Planck Gesellschaft. 16. März 2022, abgerufen am 16. März 2022.
  3. ↑ Andrei Lupas, Marc Van Dyke, Jeff Stock: Predicting Coiled Coils from Protein Sequences. In: Science. 252. Jahrgang, Nr. 5009, 24. Mai 1991, ISSN 0036-8075, S. 1162–1164, doi:10.1126/science.252.5009.1162.
  4. ↑ J. Soding, A. Biegert, A. N. Lupas: The HHpred interactive server for protein homology detection and structure prediction. In: Nucleic Acids Research. Band 33, Web Server, 1. Juli 2005, S. W244–W248, doi:10.1093/nar/gki408, PMID 15980461, PMC 1160169 (freier Volltext).
  5. ↑ Johannes Söding, Andrei N. Lupas: More than the sum of their parts: On the evolution of proteins from peptides. In: BioEssays. 25. Jahrgang, Nr. 9, 18. August 2003, ISSN 0265-9247, S. 837–846, doi:10.1002/bies.10321, PMID 12938173.
  6. ↑ Vikram Alva, Kristin K Koretke, Murray Coles, Andrei N Lupas: Cradle-loop barrels and the concept of metafolds in protein classification by natural descent. In: Current Opinion in Structural Biology. 18. Jahrgang, Nr. 3, Juni 2008, ISSN 0959-440X, S. 358–365, doi:10.1016/j.sbi.2008.02.006, PMID 18457946.
  7. ↑ Vikram Alva, Johannes Söding, Andrei N Lupas: A vocabulary of ancient peptides at the origin of folded proteins. In: eLife. 4. Jahrgang, 14. Dezember 2015, doi:10.7554/eLife.09410, PMID 26653858, PMC 4739770 (freier Volltext).
  8. ↑ Andrei N. Lupas, Vikram Alva: Ribosomal proteins as documents of the transition from unstructured (poly)peptides to folded proteins. In: Journal of Structural Biology. 198. Jahrgang, Nr. 2, Mai 2017, ISSN 1047-8477, S. 74–81, doi:10.1016/j.jsb.2017.04.007, PMID 28454764.
  9. ↑ Felix Gabler, Seung‐Zin Nam, Sebastian Till, Milot Mirdita, Martin Steinegger: Protein Sequence Analysis Using the MPI Bioinformatics Toolkit. In: Current Protocols in Bioinformatics. Band 72, Nr. 1, Dezember 2020, doi:10.1002/cpbi.108.
  10. ↑ MPI Bioinformatics Toolkit. 16. März 2022, abgerufen am 16. März 2022.
  11. ↑ Public access mandates. 16. März 2022, abgerufen am 16. März 2022.
  12. ↑ CASP14 Website. 16. März 2022, abgerufen am 16. März 2022.
  13. ↑ ‘It will change everything’: DeepMind’s AI makes gigantic leap in solving protein structures. 16. März 2022, abgerufen am 16. März 2022.
Personendaten
NAME Lupas, Andrei
ALTERNATIVNAMEN Lupas, Andrei N.
KURZBESCHREIBUNG deutsch-rumänischer Biochemiker, Molekularbiologe und Bioinformatiker
GEBURTSDATUM 6. September 1963
GEBURTSORT Bukarest
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