„Nanohaloarchaea“ – Versionsunterschied

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{{Short description|Class of archaea}}
{{Taxobox
{{Taxobox
| Taxon_WissName = Nanohaloarchaea
| domain = [[Archaea]]
| Taxon_Rang = Klasse
| regnum = [[Euryarchaeota]]
| Taxon_Autor = Narasingarao ''et al.'' 2012
| superphylum = [[DPANN]]

| phylum = "'''Nanohaloarchaeota'''"
| Taxon2_WissName = Stenosarchaea group<ref name="NCBI_Nanohaloarchaea"/>
| classis = "'''Nanohaloarchaea'''"
| Taxon2_Rang = ohne Rang
| classis_authority = (sic) Narasingarao et al. 2012
| Taxon2_LinkName = nein
| ordo = "Nanohalarchaeales"

| familia = "Nanohalarchaeaceae"
| Taxon3_WissName = Euryarchaeota
| subdivision_ranks = Genus
| Taxon3_Rang = Stamm
| subdivision =

* "Candidatus Nanohalarchaeum" <small>corrig. Hamm et al. 2019</small>
| Taxon4_WissName = Archaea
| Taxon4_Rang = Domäne

| Taxon5_Name = Lebewesen
| Taxon5_Rang = Klassifikation
| Bild =
| Bildbeschreibung =
}}
}}


Die '''Nanohaloarchaea''' sind eine [[Klasse (Biologie)|Klasse]] winziger extern [[halophil]]er („nanohalophiler“) [[Archaeen]] mit einem ebenfalls vergleichsweise kleinen [[Genom]] und begrenzten [[Stoffwechsel]]fähigkeiten.
'''Nanohaloarchaea''' is a clade of diminutive [[archaea]] with small [[genomes]] and limited metabolic capabilities, belonging to the [[DPANN]] archaea. They are ubiquitous in [[hypersaline]] habitats, which they share with the extremely [[halophilic]] [[haloarchaea]].

== Forschungsgeschichte ==
{{Hauptartikel|Nanohaloarchaeota#Forschungsgeschichte|titel1=Nanohaloarchaeota §Forschungsgeschichte}}
Nanohaloarchaeen (d.&nbsp;h. nano[[halophil]]e – extrem kleine, salzliebende [[Archaeen]]) sind in [[hypersalinar|hypersalinen]] (stark salzhaltigen) [[Habitat|Lebensräumen]] allgegenwärtig, die sie mit den größeren, ebenfalls extrem [[halophil]]en [[Halobacteria|Haloarchaeen]] teilen.

Vertreter hat man per [[Metagenomik]] gefunden in verschiedenen hyper- und thalassosalinen<ref>[[wikt:en:thalassohaline|thalassohaline]], Wiktionary (en.)</ref><ref name="Bickel1995"/> Gewässern und [[Habitat|Umgebungen]] auf der ganzen Erde, darunter
* der australische [[Lake Tyrrell]] – ein [[Salzsee]] in der Region „[[The Mallee]]“ im Nordwesten des Bundesstaates [[Victoria (Australien)|Victoria]],
* spanische [[Saline]]n,<ref name="Ghai2011"/>
* russische [[Natronsee]]n,<ref name="Vavourakis2016"/>
* kalifornische Salinen,<ref name="Zhaxybayeva2013"/> und
* chilenischer [[Halit]].<ref name="Crits-Christoph2016"/>

Über die Phylogenie und Taxonomie dieser Archaeen wurde lange gerätselt.
Es bildeten sich in Konkurrenz zueinander zwei Theorien zur [[Taxonomie]] dieser nanohalophilen Archaeen heraus:<ref name="Petitjean2014"/><ref name="Cavalier-Smith2020"/><ref name="Aouad2018"/>
# Es könnte sich um einen eigenständiges Phylum ([[Stamm (Biologie)#Archaeen|Stamm]]) „Nanohaloarchaeota“ innerhalb des Superphylums [[DPANN]] ([[Diapherotrites|'''D'''iapherotrites]], [[Parvarchaeota|'''P'''arvarchaeota]], [[Aenigmarchaeota|'''A'''enigmarchaeota]], [[Nanoarchaeota|'''N'''anoarchaeota]], '''N'''anohaloarchaeota) handeln.<ref name="Rinke2013"/><ref name="NCBI"/> Zusammen mit halophilen Bakterien und anderen Haloarchaeen ist DPANN in Salzseen und [[Salzpfanne]]n auf der ganzen Welt zu finden.
# Es könnte sich aber auch nur um eine Klasse „Nanohaloarchaea“ und Schwestergruppe der [[Halobacteria|Haloarchaea]] innerhalb des {{nowrap|(Super-)}}<wbr/>Phylums [[Euryarchaeota]] handeln; diese beiden Euryarchaeota-Gruppen werden zusammen mit anderen gelegentlich zur größeren „[[Stenosarchaea]]-Gruppe“ zusammengefasst.<ref name="NCBI_Nanohaloarchaea"/>

Die gegenwärtig von der {{lang|en|[[List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature]]}} (LPSN) und der Taxonomie des {{lang|en|[[National Center for Biotechnology Information]]}} (NCBI) aufgezeigte Lösung könnte darin liegen, dass diese Gruppe [[polyphyletisch]] ist.<ref name="Rinke2021"/>
Die Klasse „Nanohaloarchaea“ wird daher in diesen Taxonomien vom Rest des Phylums „[[Nanohaloarchaeota]]“ abgetrennt.
Während die „Nanohaloarchaea“ bei den Euryarchaeota (und dort evtl. in der „Stenosarchaea-Gruppe“) verortet werden,<ref name="LPSN_Nanohaloarchaea"/><ref name="NCBI_Nanohaloarchaea"/> könnte der Rest des Phylums „Nanohaloarchaeota“ – die Klasse „Nanohalobia“ und einige bisher nicht weiter zugeordnete Vertreter – möglicherweise als namensgebender Teil bei den DPANN-Archaeen verbleiben,<ref name="NCBI"/> das ist aber nicht sicher.<ref name="LPSN"/>

== Beschreibung – Vorkommen – Genom ==
Unter den aus der Metagenomik vermuteten möglichen Vertreten der ausgegliederten Klasse befinden sich nach Informationen aus der Gendatenbank des [[National Center for Biotechnology Information|NCBI]]<ref name="NCBI_uncl_Nanohaloarchaea"/> Isolate
* aus [[Saline#Meerwassersalinen (Salzgärten)|hypersalinen Salzgärten]] bei [[Alicante]], Spanien; Proben-Entnahme am 15. September 2009<!-- Stämme/Isolate H01, H12, N20, M06, M04, M21, E09-->
* aus ebensolchen Anlagen bei [[Santa Pola]], [[Provinz Alicante]], Spanien; entnommen am 18. Juni 2010<!-- pond crsytalizer CR30, Stamm/Isolat AB578-D14 -->
* von den [[Bonneville Salt Flats]] ([[:en:Bonneville Salt Flats|<nowiki>[en]</nowiki>]]), [[Tooele County]], [[Utah]], entnommen am 3. September 2016<!-- BinSanityLC-kmean-bin_57-bin_0-refined_3 -->
* aus hypersalinen Seen an der Mittelmeerküste Israels bei [[Atlit]] (zw. [[Haifa]] und [[Tel Aviv-Jaffa]]), entnommen im Oktober 2018<!--
MAG_AT22 -->
* aus dem [[Totes Meer|Toten Meer]], entnommen am 25. Juli 2018<!-- M3_22 -->
* vom Stadtrand von [[Hikurangi (Neuseeland)|Hikurangi]] (en. {{lang|en|[[:en:Hikurangi|Hikurangi]] Margin}}), [[Nordinsel (Neuseeland)|Nordinsel]], [[Neuseeland]], entnommen 2018/2019<!--GLR72-->
* bei [[Margherita di Savoia]] bei [[Bari]], [[Apulien]], Italien, entnommen im März 2016
* in der [[Atacama-Wüste]], [[Chile]], entnommen im Juni 2013
u.&nbsp;v.&nbsp;m.

Von den beiden [[Art (Biologie)|Spezies]] (Arten) mit den vorläufigen Bezeichnungen ''Ca.'' Nanosalina sp. J07AB43 und ''Ca.'' Nanosalinarum sp. J07AB56, beide aus dem [[Lake Tyrrell]] (Australien), wurden von Priya Narasingarao ''et&nbsp;al.'' 2011 die vollständigen [[Genom]]e sequenziert. Die Genomgröße beträgt jeweils etwa 1,2&nbsp;[[Basenpaar|Mbp]] (Megabasenpaare); die Zellgröße liegt bei etwa 0,6&nbsp;μm – beide sind damit tatsächlich sehr klein.<ref name="Narasingarao2011"/>

== Etymologie ==
Der Name des Klasse „Nanohaloarchaea“ leitet sich ab von {{grcS|νᾶνος|nanos|la=nanus|de=klein}}, „zwergig“; sowie {{lang|grc|ἅλς|háls|de=Salz}}, ‚Meer‘; der Suffix ‚-archaea‘ soll eine Archaeenklasse bezeichnen. „Nanohaloarchaea“ bezeichnet also eine Klasse salzliebender, keliner (d.&nbsp;h. nanohalophiler) Archaeen.

== Systematik ==
Die hier beschriebene [[Klasse (Biologie)]] „Nanohaloarchaea“ wurde wie dargelegt jüngst aus dem Phylum [[Nanohaloarchaeota]] ausgegliedert und stattdessen den [[Euryarchaeota]] angegliedert ([[LPSN]], [[National Center for Biotechnology Information|NCBI]]), und dort nach [[National Center for Biotechnology Information|NCBI]]-Taxonomie der Stenosarchaea-Gruppe.

In der graphischen Darstellung von [[LifeMap]] NCBI Version gehört abweichend zu NCBI selbst gehört die Klasse „Nanohaloarchaea“ zum Phylum „Candidatus Nanohaloarchaeota“, dieses aber zur Stenosarchaea-Gruppe innerhalb der [[Euryarchaeota]], ebenso ist es bei [[UniProt]].<ref name="UnProt_Nanohaloarchaea"/>

In der graphischen Darstellung bei [[OneZoom]] sind alle Vertreter umgekehrt der [[DPANN]]-Gruppe zugeordnet.<ref name="OneZoom"/>

Die Systematik der so „verschobenen“ Klasse „Nanohaloarchaea“ nach gegenwärtig akzeptierter Taxonomie (Stand Februar 2022) basiert im Wesentlichen auf folgenden Quellen:
* L – {{lang|en|[[LPSN|List of Prokaryotic Names with Standing in Nomenclature]]}} (LPSN)<ref name="LPSN_Nanohaloarchaea"/>
* N – {{lang|en|[[National Center for Biotechnology Information]]}} (NCBI, {{lang|en|Taxonomy Browser}})<ref name="NCBI_Nanohaloarchaea"/>
----
In der „Stenosarchaea-Gruppe“ (N) innerhalb der [[Euryarchaeota]] (L,N)<br/>
* Klasse: '''„Candidatus Nanohaloarchaea“''' oder '''„Nanohaloarchaea“ <small>{{Person|Narasingarao}} ''et&nbsp;al.'' 2012</small>''' (L,N)<!-- Schreibvariante '''„Nanohalarchaeia“''' de en WP nicht belegbar. Internet-Recherche negativ 14.02.2022-->
** Ordnung: „Nanosalinales“ <small>{{Person|Rinke}} ''et&nbsp;al.'' 2021</small><ref name="Rinke2021"/> (nicht LPSN oder NCBI)<!--in der en WP steht Rinke et al. 2020, möglicherweise bezieht sich das auf den PrePrint-->
*** Familie: „Nanosalinaceae“ <small>{{Person|Rinke}} ''et&nbsp;al.'' 2021</small><ref name="Rinke2021"/> (nicht LPSN oder NCBI)<!--dito-->
**** Gattung: „''Candidatus'' Haloredivivus“ <small>{{Person|Ghai}} ''et&nbsp;al.'' 2011</small> (L,N mit „[[Klade]]“ statt „Gattung“)
***** Spezies: ''Candidatus'' Haloredivivus sp. G17 (N)
**** Gattung: „''Candidatus'' Nanosalina“ <small>{{Person|Narasingarao}} ''et&nbsp;al.'' 2012</small> (L,N)
***** Spezies: ''Candidatus'' Nanosalina sp. J07AB43 (N)
**** Gattung: Gattung: „''Candidatus'' Nanosalinicola“ <small>corrig. {{Person|Narasingarao}} ''et&nbsp;al.'' 2012</small> mit Schreibvariante „''Candidatus'' Nanosalinarum“ <small>{{Person|Narasingarao}} ''et&nbsp;al.'' 2012</small> (N)
***** Spezies: ''Candidatus'' Nanosalinarum sp. J07AB56 (N), früher ''Candidatus'' Nanosalina sp. J07AB56 (N)
**
** weitere Sämme der Nanohaloarchaea als mögliche Spezies ohne Ordnung-, Familien- oder Gattungszuweisung mit vorläufiger Bezeichnung.<ref name="NCBI_uncl_Nanohaloarchaea"/> (N)

== Literatur ==
* {{cite journal |author=Rohit Ghai, Lejla Pašić, Ana Beatriz Fernández, Ana-Belen Martin-Cuadrado, Carolina Megumi Mizuno, Katherine D. McMahon, R. Thane Papke, Ramunas Stepanauskas, Beltran Rodriguez-Brito, Forest Rohwer, Cristina Sánchez-Porro, [[Antonio Ventosa]], Francisco Rodríguez-Valera |date=2011-10-31 |title=New Abundant Microbial Groups in Aquatic Hypersaline Environments |url=https://www.nature.com/articles/srep00135 |journal=[[Nature]] Scientific Reports |volume=1 |issue=135 |pages=135| doi= 10.1038/srep00135 |pmid=22355652 |pmc=3216616|bibcode =2011NatSR...1E.135G }}
* {{cite journal |author=Priya Narasingarao, Sheila Podell, Juan A. Ugalde, Céline Brochier-Armanet, Joanne B. Emerson, Jochen J. Brocks, Karla B. Heidelberg, [[Jillian F. Banfield]], Eric E. Allen |date=2012 |title=De novo metagenomic assembly reveals abundant novel major lineage of Archaea in hypersaline microbial communities |url=https://www.nature.com/articles/ismej201178 |journal=[[Nature]] ISME J. |volume=6 |issue=1 |date=2011-06-30 |pages=81–93 |pmid=21716304 |pmc=3246234 |doi=10.1038/ismej.2011.78 }}

== Einzelnachweise ==
<references>

<ref name="OneZoom">[[OneZoom]]: [https://www.onezoom.org/life.html/@Nanohaloarchaeota Nanohaloarchaeota]</ref>

<ref name="LPSN">{{cite web |author=J.&nbsp;P. Euzéby |title=Phylum "''Candidatus'' Nanohaloarchaeota" Rinke ''et&nbsp;al.'' 2013| publisher=[[List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature]] (LPSN) |url=https://lpsn.dsmz.de/phylum/nanohaloarchaeota }}</ref>

<ref name="NCBI">{{cite web |author=Sayers ''et&nbsp;al.'' |url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=1462430&lvl=3 |title=Candidatus Nanohaloarchaeota |publisher=[[National Center for Biotechnology Information]] (NCBI) taxonomy database}} Details: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=1462430&srchmode=1 "Candidatus Nanohaloarchaeota" Rinke et&nbsp;al. 2013] (phylum; graphisch: [http://lifemap-ncbi.univ-lyon1.fr/?tid=1462430 =Candidatus Nanohaloarchaeota], auf: Lifemap NCBI Version.</ref>

<!-Nanohaloarchaea---------------------->

<ref name="UnProt_Nanohaloarchaea">[[UniProt]]: [https://www.uniprot.org/taxonomy/1051663 Taxonomy - Nanohaloarchaea <small>(CLASS)</small>], [https://www.uniprot.org/taxonomy/?query=ancestor%3a1051663 Nanohaloarchaea: All lower taxonomy nodes]</ref><!-- Nanohaloarchaea in Candidatus Nanohaloarchaeota-->

<ref name="LPSN_Nanohaloarchaea">{{cite web |author=J.&nbsp;P. Euzéby |title=Class "''Candidatus'' Nanohaloarchaea" Narasingarao ''et&nbsp;al.'' 2012| publisher=[[List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature]] (LPSN) |url=https://lpsn.dsmz.de/class/nanohaloarchaea }}</ref>

<ref name="NCBI_Nanohaloarchaea">{{cite web |author=Sayers ''et&nbsp;al.'' |url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=1051663&lvl=3 |title=Nanohaloarchaea |publisher=[[National Center for Biotechnology Information]] (NCBI) taxonomy database}} Details: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=1051663&srchmode=1 "Nanohaloarchaea" Narasingarao et&nbsp;al. 2012] (class); graphisch: [http://lifemap-ncbi.univ-lyon1.fr/?tid=1051663 Nanohaloarchaea], auf: Lifemap NCBI Version.</ref>

<ref name="NCBI_uncl_Nanohaloarchaea">{{cite web |author=Sayers ''et&nbsp;al.'' |url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=1072680&lvl=3&srchmode=2 |title=unclassified Nanohaloarchaea |publisher=[[National Center for Biotechnology Information]] (NCBI) taxonomy database}} Details: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/?term=txid1072680%5BOrganism:exp%5D Nucleotide: txid1072680<nowiki>[Organism:exp]</nowiki>], Nanohaloarchaea archaeon strains/isolates.
</ref>

<!----------------------->

<ref name="Aouad2018">
{{cite journal |author=Monique Aouad, Najwa Taïb, Anne Oudart, Michel Lecocq, Manolo Gouy, [[Céline Brochier-Armanet]] |title=Extreme halophilic archaea derive from two distinct methanogen Class II lineages |url=https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1055790317306978 |journal=Molecular Phylogenetics and Evolution |date=2018-04-21 |volume=2018 |issue=27 |pages=46–54 |doi=10.1016/j.ympev.2018.04.011 |pmid=29684598 |publisher=Elsevier}} [https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01799910/file/aouad2018.pdf PDF].
</ref>

<ref name="Bickel1995">
Susanne M. Bickel, Martina Ufer, Kerstin Steinert, Michaela Dane: [https://www.researchgate.net/publication/225187724_Leben_im_Salz_-_Halophile_Archaea Leben im Salz]. In: [[Biologie in unserer Zeit]], Band 25, Nr.&nbsp;6, Dezember 1995, Projekt: Bioenergetics of Halophilic Archaea, S.&nbsp;380-393; [[doi:10.1002/biuz.19950250624]]. [https://www.researchgate.net/profile/Susanne-Bickel/publication/225187724_Leben_im_Salz_-_Halophile_Archaea/links/5c35c9ad92851c22a3665e7b/Leben-im-Salz-Halophile-Archaea.pdf PDF]
</ref>

<ref name="Cavalier-Smith2020">
{{Cite journal |author=[[Thomas Cavalier-Smith]], Ema E-Yung Chao |url=https://link.springer.com/article/10.1007/s00709-019-01442-7 |doi=10.1007/s00709-019-01442-7 |title=Multidomain ribosomal protein trees and the planctobacterial origin of neomura (Eukaryotes, archaebacteria) |date=2020-01-03 |journal=Protoplasma |volume=257 |issue=3 |pages=621–753 |pmid = 31900730 |pmc = 7203096 }}
</ref>


<ref name="Crits-Christoph2016">
Nanohaloarchaea were first identified from metagenomic data as a class of uncultivated halophilic archaea composed of 6 clades<ref>{{cite journal | last = Narasingarao | display-authors = etal | date = 2011 | title = De novo metagenomic assembly reveals abundant novel major lineage of Archaea in hypersaline microbial communities | journal = ISME J. | volume = 6 | issue = 1 |pages = 81–93 | pmid = 21716304 | doi = 10.1038/ismej.2011.78 | pmc=3246234}}</ref><ref name=salternRef>{{cite journal|last=Ghai|first=Rohit|display-authors=4|author2=Lejla Pašić|author3=Ana Beatriz Fernandez|author4=Ana-Belen Martin-Cuadrado|author5=Carolina Megumi Mizuno|author6=Katherine D. McMahon|author7=R. Thane Papke|author8=Ramunas Stepanauskas|author9=Beltran Rodriguez-Brito|author10=Forest Rohwer|author11=Cristina Sanchez-Porro|author12=Antonio Ventosa|author13=Francisco Rodriguez-Valera|title=New Abundant Microbial Groups in Aquatic Hypersaline Environments|journal=Scientific Reports|date=10 October 2011|volume=1|doi=10.1038/srep00135|pmid=22355652|pages=135|pmc=3216616|bibcode=2011NatSR...1E.135G}}</ref> and were subsequently placed in the phylum Nanohaloarchaeota within the Diapherotrites, Parvarchaeota, Aenigmarchaeota, [[Nanoarchaeota]], Nanohaloarchaeota ([[DPANN]]) [[superphylum]].<ref>{{cite journal |author1=Rinke C, Schwientek P, Sczyrba A, Ivanova NN, Anderson IJ, Cheng JF, Darling A, Malfatti S, Swan BK, Gies EA, Dodsworth JA, Hedlund BP, Tsiamis G, Sievert SM, Liu WT, Eisen JA, Hallam SJ, Kyrpides NC, Stepanauskas R, Rubin EM, Hugenholtz P, Woyke T |title=Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter |journal=Nature |date=July 25, 2013 |volume=499, 431–437 (2013) |issue=7459 |pages=431–437 |doi=10.1038/nature12352 |pmid=23851394 |bibcode=2013Natur.499..431R |doi-access=free }}</ref> However the phylogenetic position of nanohaloarchaea is still highly debated, being alternatively proposed as the sister-lineage of haloarchaea or a member of the DPANN super-phylum.<ref name="petitjean">{{cite journal |author=Petitjean, C. |author2=Deschamps, P. |author3=López-García, P. |author4=Moreira, D. |title=Rooting the domain Archaea by phylogenomic analysis supports the foundation of the new kingdom Proteoarchaeota |journal=Genome Biol. Evol. |volume=7 |issue=1 |pages=191–204 |year=2014 |pmid=25527841 |pmc=4316627 |doi=10.1093/gbe/evu274}}</ref><ref name="cavalier-smith">{{Cite journal|url= |doi = 10.1007/s00709-019-01442-7|title = Multidomain ribosomal protein trees and the planctobacterial origin of neomura (Eukaryotes, archaebacteria)|year = 2020|last1 = Cavalier-Smith|first1 = Thomas|last2 = Chao|first2 = Ema E-Yung|journal = Protoplasma|volume = 257|issue = 3|pages = 621–753|pmid = 31900730|pmc = 7203096}}</ref><ref>{{cite journal |author1=Monique Aouad, Najwa Taïb, Anne Oudart, Michel Lecocq, Manolo Gouy,Céline Brochier-Armanet |title=Extreme halophilic archaea derive from two distinct methanogen Class II lineages |journal=Molecular Phylogenetics and Evolution |date=21 Apr 2018 |volume=2018 |issue=27 |pages=46–54 |doi=10.1016/j.ympev.2018.04.011 |pmid=29684598 |url=https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01799910/file/aouad2018.pdf |publisher=Elsevier}}</ref>
{{cite journal |author=Alexander Crits-Christoph, Diego R. Gelsinger, Bing Ma, Jacek Wierzchos, Jacques Ravel, Alfonso Davila, M. Cristina Casero, Jocelyne DiRuggiero |title=Functional interactions of archaea, bacteria and viruses in a hypersaline endolithic community |url=https://sfamjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1462-2920.13259 |journal=Environmental Microbiology |date=2016-03-21 |volume=18 |issue=6 |pages=2064&#x200B;–2077 |doi=10.1111/1462-2920.13259 |pmid=26914534 }}
</ref>


<ref name="Ghai2011">
The lineage has since been identified in data from a range of hypersaline environments including: Australian thalassohaline lake,<ref>{{cite journal |author1=Karen Andrade, Jörn Logemann, Karla B Heidelberg, Joanne B Emerson, Luis R Comolli, Laura A Hug, Alexander J Probst, Angus Keillar, Brian C Thomas, Christopher S Miller, Eric E Allen, John W Moreau, Jochen J Brocks & Jillian F Banfield |title=Metagenomic and lipid analyses reveal a diel cycle in a hypersaline microbial ecosystem |journal=ISME J |date=28 April 2015 |volume=ISME J 9, 2697–2711 (2015) |issue=12 |pages=2697–2711 |doi=10.1038/ismej.2015.66 |pmid=25918833 |pmc=4817636 |doi-access=free }}</ref> Spanish saltern,<ref>{{cite journal |author1=Rohit Ghai, Lejla Pašić, Ana Beatriz Fernández, Ana-Belen Martin-Cuadrado, Carolina Megumi Mizuno, Katherine D. McMahon, R. Thane Papke, Ramunas Stepanauskas, Beltran Rodriguez-Brito, Forest Rohwer, Cristina Sánchez-Porro, Antonio Ventosa & Francisco Rodríguez-Valera |title=New Abundant Microbial Groups in Aquatic Hypersaline Environments |journal=Scientific Reports |date=31 October 2011 |volume=1 |issue=Sci Rep 1, 135 (2011) |page=135 |doi=10.1038/srep00135 |pmid=22355652 |pmc=3216616 |bibcode=2011NatSR...1E.135G |doi-access=free }}</ref> Russian soda brine,<ref>{{cite journal |author1=Vavourakis Charlotte D., Ghai Rohit, Rodriguez-Valera Francisco, Sorokin Dimitry Y., Tringe Susannah G., Hugenholtz Philip, Muyzer Gerard |title=Metagenomic Insights into the Uncultured Diversity and Physiology of Microbes in Four Hypersaline Soda Lake Brines |journal=Frontiers in Microbiology |date=25 February 2016 |volume=7 |pages=211 |doi=10.3389/fmicb.2016.00211 |pmid=26941731 |pmc=4766312 |doi-access=free }}</ref> Californian saltern,<ref>{{cite journal |author1=Olga Zhaxybayeva 1 , Ramunas Stepanauskas, Nikhil Ram Mohan, R Thane Papke |title=Cell sorting analysis of geographically separated hypersaline environments |journal=Extremophiles |date=29 January 2013 |volume=17,2 (2013) |issue=2 |pages=265–275 |doi=10.1007/s00792-013-0514-z |pmid=23358730 |s2cid=5933801 |url=https://www.researchgate.net/publication/235380187 |access-date=2 March 2021}}</ref> and Chilean halite<ref>{{cite journal |author1=Alexander Crits‐Christoph Diego R. Gelsinger Bing Ma Jacek Wierzchos Jacques Ravel Alfonso Davila M. Cristina Casero Jocelyne DiRuggiero |title=Functional interactions of archaea, bacteria and viruses in a hypersaline endolithic community |journal=Environmental Microbiology |date=21 March 2016 |volume=18 |issue=2016 v.18 no.6 |pages=2064–2077 |doi=10.1111/1462-2920.13259 |pmid=26914534 |url=https://doi.org/10.1111/1462-2920.13259 |access-date=2 March 2021}}</ref>
{{cite journal|author=Rohit Ghai, Lejla Pašić, Ana Beatriz Fernández, Ana-Belen Martin-Cuadrado, Carolina Megumi Mizuno, Katherine D. McMahon, R. Thane Papke, Ramunas Stepanauskas, Beltran Rodriguez-Brito, Forest Rohwer, Cristina Sánchez-Porro, [[Antonio Ventosa]], Francisco Rodríguez-Valera |title=New Abundant Microbial Groups in Aquatic Hypersaline Environments |url=https://www.nature.com/articles/srep00135 |journal=[[Nature]] Scientific Reports |date=2011-10-31 |volume=1 |pages=135 |doi=10.1038/srep00135 |pmid=22355652 |pmc=3216616 |bibcode=2011NatSR...1E.135G}}
</ref>


<ref name="Narasingarao2011">
==Taxonomy==
{{cite journal |author=Priya Narasingarao, Sheila Podell, Juan A. Ugalde, [[Céline Brochier-Armanet]], Joanne B. Emerson, Jochen J. Brocks, Karla B. Heidelberg, [[Jillian F. Banfield]], Eric E. Allen |date=2012-01 |title=De novo metagenomic assembly reveals abundant novel major lineage of Archaea in hypersaline microbial communities |url=https://www.nature.com/articles/ismej201178 |journal=[[Nature]] ISME J. |volume=6 |issue=1 |pages=81–93 |pmid=21716304 |doi=10.1038/ismej.2011.78 |pmc=3246234}} Epub 30. Juni 2011.
The currently accepted taxonomy is based on the [[List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature]] (LPSN)<ref>{{cite web | author=J.P. Euzéby | title=Phylum "Candidatus Nanohaloarchaeota" | access-date=2011-11-17 | publisher=[[List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature]] (LPSN) | url-status=live | url=https://lpsn.dsmz.de/phylum/nanohaloarchaeota }}</ref> and [[National Center for Biotechnology Information]] (NCBI).<ref>{{cite web |author = Sayers |display-authors = etal| url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=1051663&lvl=3&lin |title=Nanohaloarchaea |access-date=2011-06-05 |publisher=[[National Center for Biotechnology Information]] (NCBI) taxonomy database}}</ref>
</ref>


<ref name="Petitjean2014">
Phylum "Nanohalarchaeota" <small>corrig. Rinke et al. 2013</small>
{{cite journal |author=Céline Petitjean, Philippe Deschamps, Purificación López-García, David Moreira |title=Rooting the domain Archaea by phylogenomic analysis supports the foundation of the new kingdom Proteoarchaeota |url=https://academic.oup.com/gbe/article/7/1/191/601621 |journal=Genome Biol. Evol. |volume=7 |issue=1 |pages=191–204 |date=2014-12-19 |pmid=25527841 |pmc=4316627 |doi=10.1093/gbe/evu274 }}
* Class "Nanohalarchaeia" <small>corrig. Narasingarao et al. 2012</small>
</ref>
** Order "Nanohalarchaeales"
*** Family "Nanohalarchaeaceae"
**** Genus "''Candidatus'' [[Nanohalarchaeum]]" <small>corrig. Hamm et al. 2019</small>
***** "''Ca.'' N. antarcticum" <small>corrig. Hamm et al. 2019</small>
** Order "Nanohalobiales" <small>La Cono et al. 2020</small><ref>{{cite journal | last=La Cono | display-authors=et al. | date=2020 | title=Symbiosis between nanohaloarchaeon and haloarchaeon is based on utilization of different polysaccharides | journal=Proc Natl Acad Sci USA | volume=117 | issue=33 |pages=20223–20234 | pmid= 32759215| pmc= 7443923| doi=10.1073/pnas.2007232117 | doi-access=free }}</ref>
*** Family "Nanohalobiaceae" <small>La Cono et al. 2020</small>
**** Genus "''Candidatus'' [[Nanohalobium]]" <small>La Cono et al. 2020</small>
***** "''Ca.'' N. constans" <small>La Cono et al. 2020</small>
** Order "Nanosalinales" <small>Rinke et al. 2020</small>
*** Family "Nanosalinaceae" <small>Rinke et al. 2020</small>
**** Genus "''Candidatus'' [[Nanopetraeus]]" <small>corrig. Crits‐Christoph et al. 2016</small> ["Nanopetramus" (sic)]
**** Genus "''Candidatus'' [[Haloredivivus]]" <small>Ghai et al. 2011</small>
**** Genus "''Candidatus'' [[Nanosalina]]" <small>Narasingarao et al. 2012</small>
**** Genus "''Candidatus'' [[Nanosalinicola]]" <small>corrig. Narasingarao et al. 2012</small> ["Nanosalinarum" (sic)]


<ref name="Rinke2013">
==References==
{{cite journal |author=Christian Rinke, Patrick Schwientek, Alexander Sczyrba, Natalia N. Ivanova, Iain J.
{{Reflist|30em}}
Anderson, Jan-Fang Cheng, Aaron Darling, Stephanie Malfatti, Brandon K. Swan, Esther A. Gies, Jeremy A. Dodsworth, Brian P. Hedlund, George Tsiamis, Stefan M. Sievert, Wen-Tso Liu, Jonathan A. Eisen, Steven J. Hallam, Nikos C. Kyrpjdes, Ramunas Stepanauskas, Edward M. Rubin, Philip Hugenholtz, Tanja Woyke |title=Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter |url=https://www.nature.com/articles/nature12352 |journal=[[Nature]] |date=2013-07-25 |volume=499| issue=7459 |pages=431–437 |doi=10.1038/nature12352 |pmid=23851394 |bibcode=2013Natur.499..431R }}
</ref>


<ref name="Rinke2021">
==Further reading==
Christian Rinke, Maria Chuvochina, Aaron Mussig, Pierre-Alain Chaumeil, Adrián Davín, David W. Waite, William B. Whitman, Donovan H. Parks, Philip Hugenholtz: [https://www.researchgate.net/publication/352608636_A_standardized_archaeal_taxonomy_for_the_Genome_Taxonomy_Database A standardized archaeal taxonomy for the Genome Taxonomy Database]. In: [[Nature]] Microbiology, Band 6, Nr.&nbsp;7, 21. Juni 2021, S.&nbsp; pages 946–959; [[doi:10.1038/s41564-021-00918-8]], Epub Juli 2021. Projects: A rank-normalized prokaryotic taxonomy – A rank normalized prokaryotic taxonomy. Hier insbes. Tbl.&nbsp;S13 in [https://static-content.springer.com/esm/art%3A10.1038%2Fs41564-021-00918-8/MediaObjects/41564_2021_918_MOESM1_ESM.pdf Supplementary Information].
* {{cite journal | last = Ghai | display-authors = etal | date = 2011 | title = New Abundant Microbial Groups in Aquatic Hypersaline Environments | journal = Scientific Reports | volume = 1 | issue = 135 |pages = 135| doi = 10.1038/srep00135 | pmid=22355652 | pmc=3216616| bibcode =2011NatSR...1E.135G}}
</ref>
* {{cite journal | last = Narasingarao | display-authors = etal | date = 2012 | title = De novo metagenomic assembly reveals abundant novel major lineage of Archaea in hypersaline microbial communities | journal = ISME J. | volume = 6 | issue = 1 |pages = 81–93 | pmid = 21716304 | pmc = 3246234 | doi = 10.1038/ismej.2011.78}}


<ref name="Vavourakis2016">
{{Archaea classification}}
{{cite journal |author=Charlotte D. Vavourakis, Rohit Ghai, Francisco Rodriguez-Valera, Dimitry Y. Sorokin, Susannah G. Tringe, Philip Hugenholtz, Gerard Muyzer |title=Metagenomic Insights into the Uncultured Diversity and Physiology of Microbes in Four Hypersaline Soda Lake Brines |url=https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2016.00211/full |journal=Frontiers in Microbiology |date=2016-02-25 |volume=7 |pages=211 |doi=10.3389/fmicb.2016.00211 |pmid=26941731 |pmc=4766312 }}
{{Taxonbar|from=Q6964054}}
</ref>


<ref name="Zhaxybayeva2013">
[[Category:Archaea classes]]
{{cite journal |author=Olga Zhaxybayeva, Ramunas Stepanauskas, Nikhil Ram Mohan, R. Thane Papke |title=Cell sorting analysis of geographically separated hypersaline environments |url=https://link.springer.com/article/10.1007/s00792-013-0514-z |journal=Extremophiles |date=2013-01-29 |volume=17 |issue=2 |pages=265–275 |doi=10.1007/s00792-013-0514-z |pmid=23358730 }} [https://www.researchgate.net/publication/235380187 ResearchGate].
[[Category:Euryarchaeota]]
</ref>


</references>


{{Euryarchaeota-stub}}
[[Kategorie:Euryarchaeota]]

Version vom 15. Februar 2022, 22:12 Uhr

Nanohaloarchaea
Systematik
Klassifikation: Lebewesen
Domäne: Archaea
Stamm: Euryarchaeota
ohne Rang: Stenosarchaea group[1]
Klasse: Nanohaloarchaea
Wissenschaftlicher Name
Nanohaloarchaea
Narasingarao et al. 2012

Die Nanohaloarchaea sind eine Klasse winziger extern halophiler („nanohalophiler“) Archaeen mit einem ebenfalls vergleichsweise kleinen Genom und begrenzten Stoffwechselfähigkeiten.

Forschungsgeschichte

Nanohaloarchaeen (d. h. nanohalophile – extrem kleine, salzliebende Archaeen) sind in hypersalinen (stark salzhaltigen) Lebensräumen allgegenwärtig, die sie mit den größeren, ebenfalls extrem halophilen Haloarchaeen teilen.

Vertreter hat man per Metagenomik gefunden in verschiedenen hyper- und thalassosalinen[2][3] Gewässern und Umgebungen auf der ganzen Erde, darunter

Über die Phylogenie und Taxonomie dieser Archaeen wurde lange gerätselt. Es bildeten sich in Konkurrenz zueinander zwei Theorien zur Taxonomie dieser nanohalophilen Archaeen heraus:[8][9][10]

  1. Es könnte sich um einen eigenständiges Phylum (Stamm) „Nanohaloarchaeota“ innerhalb des Superphylums DPANN (Diapherotrites, Parvarchaeota, Aenigmarchaeota, Nanoarchaeota, Nanohaloarchaeota) handeln.[11][12] Zusammen mit halophilen Bakterien und anderen Haloarchaeen ist DPANN in Salzseen und Salzpfannen auf der ganzen Welt zu finden.
  2. Es könnte sich aber auch nur um eine Klasse „Nanohaloarchaea“ und Schwestergruppe der Haloarchaea innerhalb des (Super-)Phylums Euryarchaeota handeln; diese beiden Euryarchaeota-Gruppen werden zusammen mit anderen gelegentlich zur größeren „Stenosarchaea-Gruppe“ zusammengefasst.[1]

Die gegenwärtig von der List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) und der Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI) aufgezeigte Lösung könnte darin liegen, dass diese Gruppe polyphyletisch ist.[13] Die Klasse „Nanohaloarchaea“ wird daher in diesen Taxonomien vom Rest des Phylums „Nanohaloarchaeota“ abgetrennt. Während die „Nanohaloarchaea“ bei den Euryarchaeota (und dort evtl. in der „Stenosarchaea-Gruppe“) verortet werden,[14][1] könnte der Rest des Phylums „Nanohaloarchaeota“ – die Klasse „Nanohalobia“ und einige bisher nicht weiter zugeordnete Vertreter – möglicherweise als namensgebender Teil bei den DPANN-Archaeen verbleiben,[12] das ist aber nicht sicher.[15]

Beschreibung – Vorkommen – Genom

Unter den aus der Metagenomik vermuteten möglichen Vertreten der ausgegliederten Klasse befinden sich nach Informationen aus der Gendatenbank des NCBI[16] Isolate

u. v. m.

Von den beiden Spezies (Arten) mit den vorläufigen Bezeichnungen Ca. Nanosalina sp. J07AB43 und Ca. Nanosalinarum sp. J07AB56, beide aus dem Lake Tyrrell (Australien), wurden von Priya Narasingarao et al. 2011 die vollständigen Genome sequenziert. Die Genomgröße beträgt jeweils etwa 1,2 Mbp (Megabasenpaare); die Zellgröße liegt bei etwa 0,6 μm – beide sind damit tatsächlich sehr klein.[17]

Etymologie

Der Name des Klasse „Nanohaloarchaea“ leitet sich ab von altgriechisch νᾶνος nanos, deutsch ‚klein‘, lateinisch nanus, „zwergig“; sowie ἅλς háls, deutsch ‚Salz‘, ‚Meer‘; der Suffix ‚-archaea‘ soll eine Archaeenklasse bezeichnen. „Nanohaloarchaea“ bezeichnet also eine Klasse salzliebender, keliner (d. h. nanohalophiler) Archaeen.

Systematik

Die hier beschriebene Klasse (Biologie) „Nanohaloarchaea“ wurde wie dargelegt jüngst aus dem Phylum Nanohaloarchaeota ausgegliedert und stattdessen den Euryarchaeota angegliedert (LPSN, NCBI), und dort nach NCBI-Taxonomie der Stenosarchaea-Gruppe.

In der graphischen Darstellung von LifeMap NCBI Version gehört abweichend zu NCBI selbst gehört die Klasse „Nanohaloarchaea“ zum Phylum „Candidatus Nanohaloarchaeota“, dieses aber zur Stenosarchaea-Gruppe innerhalb der Euryarchaeota, ebenso ist es bei UniProt.[18]

In der graphischen Darstellung bei OneZoom sind alle Vertreter umgekehrt der DPANN-Gruppe zugeordnet.[19]

Die Systematik der so „verschobenen“ Klasse „Nanohaloarchaea“ nach gegenwärtig akzeptierter Taxonomie (Stand Februar 2022) basiert im Wesentlichen auf folgenden Quellen:

In der „Stenosarchaea-Gruppe“ (N) innerhalb der Euryarchaeota (L,N)

  • Klasse: „Candidatus Nanohaloarchaea“ oder „Nanohaloarchaea“ Narasingarao et al. 2012 (L,N)
    • Ordnung: „Nanosalinales“ Rinke et al. 2021[13] (nicht LPSN oder NCBI)
      • Familie: „Nanosalinaceae“ Rinke et al. 2021[13] (nicht LPSN oder NCBI)
        • Gattung: „Candidatus Haloredivivus“ Ghai et al. 2011 (L,N mit „Klade“ statt „Gattung“)
          • Spezies: Candidatus Haloredivivus sp. G17 (N)
        • Gattung: „Candidatus Nanosalina“ Narasingarao et al. 2012 (L,N)
          • Spezies: Candidatus Nanosalina sp. J07AB43 (N)
        • Gattung: Gattung: „Candidatus Nanosalinicola“ corrig. Narasingarao et al. 2012 mit Schreibvariante „Candidatus Nanosalinarum“ Narasingarao et al. 2012 (N)
          • Spezies: Candidatus Nanosalinarum sp. J07AB56 (N), früher Candidatus Nanosalina sp. J07AB56 (N)
    • weitere Sämme der Nanohaloarchaea als mögliche Spezies ohne Ordnung-, Familien- oder Gattungszuweisung mit vorläufiger Bezeichnung.[16] (N)

Literatur

  • Rohit Ghai, Lejla Pašić, Ana Beatriz Fernández, Ana-Belen Martin-Cuadrado, Carolina Megumi Mizuno, Katherine D. McMahon, R. Thane Papke, Ramunas Stepanauskas, Beltran Rodriguez-Brito, Forest Rohwer, Cristina Sánchez-Porro, Antonio Ventosa, Francisco Rodríguez-Valera: New Abundant Microbial Groups in Aquatic Hypersaline Environments. In: Nature Scientific Reports. 1. Jahrgang, Nr. 135, 31. Oktober 2011, S. 135, doi:10.1038/srep00135, PMID 22355652, PMC 3216616 (freier Volltext), bibcode:2011NatSR...1E.135G (nature.com).
  • Priya Narasingarao, Sheila Podell, Juan A. Ugalde, Céline Brochier-Armanet, Joanne B. Emerson, Jochen J. Brocks, Karla B. Heidelberg, Jillian F. Banfield, Eric E. Allen: De novo metagenomic assembly reveals abundant novel major lineage of Archaea in hypersaline microbial communities. In: Nature ISME J. 6. Jahrgang, Nr. 1, 30. Juni 2011, S. 81–93, doi:10.1038/ismej.2011.78, PMID 21716304, PMC 3246234 (freier Volltext) – (nature.com).

Einzelnachweise

  1. ↑ a b c d Sayers et al.: Nanohaloarchaea. National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database; Details: "Nanohaloarchaea" Narasingarao et al. 2012 (class); graphisch: Nanohaloarchaea, auf: Lifemap NCBI Version.
  2. ↑ thalassohaline, Wiktionary (en.)
  3. ↑ Susanne M. Bickel, Martina Ufer, Kerstin Steinert, Michaela Dane: Leben im Salz. In: Biologie in unserer Zeit, Band 25, Nr. 6, Dezember 1995, Projekt: Bioenergetics of Halophilic Archaea, S. 380-393; doi:10.1002/biuz.19950250624. PDF
  4. ↑ Rohit Ghai, Lejla Pašić, Ana Beatriz Fernández, Ana-Belen Martin-Cuadrado, Carolina Megumi Mizuno, Katherine D. McMahon, R. Thane Papke, Ramunas Stepanauskas, Beltran Rodriguez-Brito, Forest Rohwer, Cristina Sánchez-Porro, Antonio Ventosa, Francisco Rodríguez-Valera: New Abundant Microbial Groups in Aquatic Hypersaline Environments. In: Nature Scientific Reports. 1. Jahrgang, 31. Oktober 2011, S. 135, doi:10.1038/srep00135, PMID 22355652, PMC 3216616 (freier Volltext), bibcode:2011NatSR...1E.135G (nature.com).
  5. ↑ Charlotte D. Vavourakis, Rohit Ghai, Francisco Rodriguez-Valera, Dimitry Y. Sorokin, Susannah G. Tringe, Philip Hugenholtz, Gerard Muyzer: Metagenomic Insights into the Uncultured Diversity and Physiology of Microbes in Four Hypersaline Soda Lake Brines. In: Frontiers in Microbiology. 7. Jahrgang, 25. Februar 2016, S. 211, doi:10.3389/fmicb.2016.00211, PMID 26941731, PMC 4766312 (freier Volltext) – (frontiersin.org).
  6. ↑ Olga Zhaxybayeva, Ramunas Stepanauskas, Nikhil Ram Mohan, R. Thane Papke: Cell sorting analysis of geographically separated hypersaline environments. In: Extremophiles. 17. Jahrgang, Nr. 2, 29. Januar 2013, S. 265–275, doi:10.1007/s00792-013-0514-z, PMID 23358730 (springer.com). ResearchGate.
  7. ↑ Alexander Crits-Christoph, Diego R. Gelsinger, Bing Ma, Jacek Wierzchos, Jacques Ravel, Alfonso Davila, M. Cristina Casero, Jocelyne DiRuggiero: Functional interactions of archaea, bacteria and viruses in a hypersaline endolithic community. In: Environmental Microbiology. 18. Jahrgang, Nr. 6, 21. März 2016, S. 2064​–2077, doi:10.1111/1462-2920.13259, PMID 26914534 (wiley.com).
  8. ↑ Céline Petitjean, Philippe Deschamps, Purificación López-García, David Moreira: Rooting the domain Archaea by phylogenomic analysis supports the foundation of the new kingdom Proteoarchaeota. In: Genome Biol. Evol. 7. Jahrgang, Nr. 1, 19. Dezember 2014, S. 191–204, doi:10.1093/gbe/evu274, PMID 25527841, PMC 4316627 (freier Volltext) – (oup.com).
  9. ↑ Thomas Cavalier-Smith, Ema E-Yung Chao: Multidomain ribosomal protein trees and the planctobacterial origin of neomura (Eukaryotes, archaebacteria). In: Protoplasma. 257. Jahrgang, Nr. 3, 3. Januar 2020, S. 621–753, doi:10.1007/s00709-019-01442-7, PMID 31900730, PMC 7203096 (freier Volltext) – (springer.com).
  10. ↑ Monique Aouad, Najwa Taïb, Anne Oudart, Michel Lecocq, Manolo Gouy, Céline Brochier-Armanet: Extreme halophilic archaea derive from two distinct methanogen Class II lineages. In: Molecular Phylogenetics and Evolution. 2018. Jahrgang, Nr. 27. Elsevier, 21. April 2018, S. 46–54, doi:10.1016/j.ympev.2018.04.011, PMID 29684598 (sciencedirect.com). PDF.
  11. ↑ Christian Rinke, Patrick Schwientek, Alexander Sczyrba, Natalia N. Ivanova, Iain J. Anderson, Jan-Fang Cheng, Aaron Darling, Stephanie Malfatti, Brandon K. Swan, Esther A. Gies, Jeremy A. Dodsworth, Brian P. Hedlund, George Tsiamis, Stefan M. Sievert, Wen-Tso Liu, Jonathan A. Eisen, Steven J. Hallam, Nikos C. Kyrpjdes, Ramunas Stepanauskas, Edward M. Rubin, Philip Hugenholtz, Tanja Woyke: Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter. In: Nature. 499. Jahrgang, Nr. 7459, 25. Juli 2013, S. 431–437, doi:10.1038/nature12352, PMID 23851394, bibcode:2013Natur.499..431R (nature.com).
  12. ↑ a b Sayers et al.: Candidatus Nanohaloarchaeota. National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database; Details: "Candidatus Nanohaloarchaeota" Rinke et al. 2013 (phylum; graphisch: =Candidatus Nanohaloarchaeota, auf: Lifemap NCBI Version.
  13. ↑ a b c Christian Rinke, Maria Chuvochina, Aaron Mussig, Pierre-Alain Chaumeil, Adrián Davín, David W. Waite, William B. Whitman, Donovan H. Parks, Philip Hugenholtz: A standardized archaeal taxonomy for the Genome Taxonomy Database. In: Nature Microbiology, Band 6, Nr. 7, 21. Juni 2021, S.  pages 946–959; doi:10.1038/s41564-021-00918-8, Epub Juli 2021. Projects: A rank-normalized prokaryotic taxonomy – A rank normalized prokaryotic taxonomy. Hier insbes. Tbl. S13 in Supplementary Information.
  14. ↑ a b J. P. Euzéby: Class "Candidatus Nanohaloarchaea" Narasingarao et al. 2012. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN);
  15. ↑ J. P. Euzéby: Phylum "Candidatus Nanohaloarchaeota" Rinke et al. 2013. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN);
  16. ↑ a b Sayers et al.: unclassified Nanohaloarchaea. National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database; Details: Nucleotide: txid1072680[Organism:exp], Nanohaloarchaea archaeon strains/isolates.
  17. ↑ Priya Narasingarao, Sheila Podell, Juan A. Ugalde, Céline Brochier-Armanet, Joanne B. Emerson, Jochen J. Brocks, Karla B. Heidelberg, Jillian F. Banfield, Eric E. Allen: De novo metagenomic assembly reveals abundant novel major lineage of Archaea in hypersaline microbial communities. In: Nature ISME J. 6. Jahrgang, Nr. 1, Januar 2012, S. 81–93, doi:10.1038/ismej.2011.78, PMID 21716304, PMC 3246234 (freier Volltext) – (nature.com). Epub 30. Juni 2011.
  18. ↑ UniProt: Taxonomy - Nanohaloarchaea (CLASS), Nanohaloarchaea: All lower taxonomy nodes
  19. ↑ OneZoom: Nanohaloarchaeota
Abgerufen von „https://de.wikipedia.org/w/index.php?title=Nanohaloarchaea&oldid=220237372“