Virgaviridae

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Virgaviridae

TEM-Aufnahme von Virionen des Tabakmosaikvirus (TMV),
mit Schwermetall negativ gefärbt.

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Riboviria[2]
Reich: Orthornavirae[1]
Phylum: Kitrinoviricota[1]
Klasse: Alsuviricetes[1]
Ordnung: Martellivirales[1]
Familie: Virgaviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: (+)ssRNA
Baltimore: Gruppe 4
Symmetrie: stäbchenförmig helikal
Hülle: keine
Wissenschaftlicher Name
Virgaviridae
Links
ICTV Taxon History: 201905394
NCBI Taxonomy: 675071
ViralZone (Expasy, SIB): 734

Die Virgaviridae sind eine Familie von einzelsträngigen RNA-Viren mit positiver Polarität. Ihre natürlichen Wirte sind Pflanzen.[3][4][5][6] Derzeit (Stand Mai 2024) gibt es mindestens 59 Arten in dieser Familie, aufgeteilt in 7 Gattungen.[4][5][7] Der Name der Familie leitet sich von lateinisch virga ‚Stock, Stab‘,[8] auch ‚Stange‘, ab (da alle Viren in dieser Familie stab- oder stangenförmig sind).

Aufbau

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Schemazeichnung eines Virusteilchens aus der Familie Virgaviridae (exemplarisch Gattung Tobamovirus), aufgeschnitten

Die Virusteilchen (Virionen) der Virgaviridae sind nicht umhüllt, ihre Geometrie ist starr stabförmig und sie haben eine mit helikale Symmetrie. Der Durchmesser liegt bei 20–25 nm,[4][5] Die Virionen haben einen zentralen „Kanal“. RNARNARNA Das Genom besteht aus einer linearen, einzelsträngigen Positiv-Sense-RNA[4][5] mit einer 3'-tRNA-ähnlichen Struktur und keinem Poly-A-Schwanz. Das Genom kann je nach Gattung in einem, zwei oder drei Segmenten vorliegen (mono-, bi- oder tripartit). Die Hüllproteine haben eine Größe von 19 bis 24 Kilodalton.[4][5]

Vermehrungszyklus

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Die Replikation der Virusteilchen erfolgt cytoplasmatisch (d. h. sie findet im Zytoplasma statt) und folgt dem Replikationsmodell von Positivstrang-RNA-Viren. Ebenso ist die Transkriptions­methode die übliche für Positivstrang-RNA-Viren. Die Übersetzung benutzt durch Leaky-Scanning und Unterdrückung der Terminierung. [4][5]

Die natürlichen Wirte sind Pflanzen.[4][5]

Systematik

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Innere Systematik

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Die innere Systematik der Virgaviridae ist nach dem International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) mit Stand Mai 2024 wie folgt:[9][10]

Familie Virgaviridae

  • Gattung: Furovirus
    • Spezies Furovirus avenae mit Oat golden stripe virus (OGSV)[11]
    • Spezies Furovirus cerealis mit European wheat mosaic virus alias Soil-borne rye mosaic virus oder Soil-borne cereal mosaic virus (SBCMV)
    • Spezies Furovirus chinense mit Chinese wheat mosaic virus (CWMV)
    • Spezies Furovirus japonicum mit Japanese soil-borne wheat mosaic virus (JSBWMV) und French barley mosaic virus (FBMV)
    • Spezies Furovirus sorghi mit Sorghum chlorotic spot virus (SrCSV)
    • Spezies Furovirus tritici (ehem. Typusspezies) mit Soil-borne wheat mosaic virus (SBWMV)
  • Gattung: Goravirus
    • Spezies Goravirus drakeae mit Drakaea virus A (DrVA, DVA)
    • Spezies Goravirus gentianae (ehem. Typusspezies) mit Gentian ovary ringspot virus (GORV)
  • Gattung: Hordeivirus
    • Spezies Hordeivirus anthoxanthi mit Anthoxanthum latent blanching virus (ALBV)
    • Spezies Hordeivirus hordei (ehem. Typusspezies) mit Barley stripe mosaic virus (BSMV)
    • Spezies Hordeivirus lychnis mit Lychnis ringspot virus (LRSV)
    • Spezies Hordeivirus poae mit Poa semilatent virus (PSLV)
  • Gattung: Pecluvirus
    • Spezies Pecluvirus arachidis (ehem. Typusspezies) mit Peanut clump virus (PCV)
    • Spezies Pecluvirus indicum mit Indian peanut clump virus (IPCV)
  • Gattung: Pomovirus
    • Spezies Pomovirus betae mit Beet virus Q (BVQ)
    • Spezies Pomovirus colombiense mit Colombian potato soil-borne virus (CPSBV)
    • Spezies Pomovirus solani (ehem. Typusspezies) mit Potato mop-top virus (PMTV)
    • Spezies Pomovirus solibetae mit Beet soil-borne virus (BSBV)
    • Spezies Pomovirus viciae mit broad Bean necrosis virus (BBNV)
  • Gattung: Tobamovirus
    • Spezies Tobamovirus anthocercis mit Yellow tailflower mild mottle virus (YTMMV)
    • Spezies Tobamovirus brugmansiae mit Brugmansia mild mottle virus (BrMMV)
    • Spezies Tobamovirus cacti mit Cactus mild mottle virus (CMMoV)[12]
    • Spezies Tobamovirus capsici mit Pepper mild mottle virus (PMMoV)
    • Spezies Tobamovirus clitoriae mit Clitoria yellow mottle virus (CliYMV)
    • Spezies Tobamovirus crotalariae mit sunn-hemp mosaic virus (SHMV)
    • Spezies Tobamovirus cucumeris mit Cucumber mottle virus (CMoV, CMV)
    • Spezies Tobamovirus cucurbitae mit Zucchini green mottle mosaic virus (ZGMMV, Grünscheckungsmosaikvirus der Zucchini)[13]
    • Spezies Tobamovirus fortpiercense mit Hibiscus latent Fort Pierce virus (HLFPV)
    • Spezies Tobamovirus frangipani mit Frangipani mosaic virus (FrMV)
    • Spezies Tobamovirus fructirugosum mit Tomato brown rugose fruit virus (TBRFV)
    • Spezies Tobamovirus kyuri mit Kyuri green mottle mosaic virus (KGMMV), (Grünscheckungsmosaikvirus der Kyuri)[13]
    • Spezies Tobamovirus latentabaci mit Tobacco latent virus (TLV) und Nigerian tobacco latent virus (TLV1)
    • Spezies Tobamovirus maculacapsici mit Bell pepper mottle virus (BPMV, BPeMV)
    • Spezies Tobamovirus maculafructi mit Cucumber fruit mottle mosaic virus (CFMMV, CFMMV0)
    • Spezies Tobamovirus maculatessellati mit Tomato mottle mosaic virus (ToMMV)
    • Spezies Tobamovirus maracujae mit maracuja mosaic virus (MarMV)
    • Spezies Tobamovirus mititessellati mit Tobacco mild green mosaic virus (TMGMV)
    • Spezies Tobamovirus muricaudae mit Rattail cactus necrosis-associated virus (RCNaV)
    • Spezies Tobamovirus obudae mit Obuda pepper virus (ObPV)
    • Spezies Tobamovirus odontoglossi mit Odontoglossum ringspot virus (ORSV)
    • Spezies Tobamovirus opuntiae mit Sammons's Opuntia virus (SOV)
    • Spezies Tobamovirus paprikae mit Paprika mild mottle virus (PaMMV)
    • Spezies Tobamovirus passiflorae mit Passion fruit mosaic virus (PFMV)
    • Spezies Tobamovirus plantagonis mit ribgrass mosaic virus (RMV)
    • Spezies Tobamovirus plumeriae mit Plumeria mosaic virus (PluMV)
    • Spezies Tobamovirus rapae mit Turnip vein-clearing virus (TVCV)
    • Spezies Tobamovirus rehmanniae mit Rehmannia mosaic virus (RheMV)
    • Spezies Tobamovirus singaporense mit Hibiscus latent Singapore virus (HLSV)
    • Spezies Tobamovirus streptocarpi mit Streptocarpus flower break virus (SFBV)
    • Spezies Tobamovirus tabaci mit Tobacco mosaic virus (TMV, T2MV, Tabakmosaikvirus)
    • Spezies Tobamovirus tomatotessellati mit Tomato mosaic virus (ToMV, Tomatenmosaikvirus)
    • Spezies Tobamovirus tropici mit Tropical soda apple mosaic virus (TSAMV)
    • Spezies Tobamovirus ulluci mit Ullucus mild mottle virus (UMMV)
    • Spezies Tobamovirus viridimaculae mit Cucumber green mottle mosaic virus (CGMMV, Grünscheckungsmosaikvirus der Gurke)[13]
    • Spezies Tobamovirus wasabi mit Wasabi mottle virus (WMoV)
    • Spezies Tobamovirus youcai mit Youcai mosaic virus (YoMV) alias Oil-seed rape mosaic virus (ORMV)
  • Gattung: Tobravirus
    • Spezies Tobravirus capsici mit Pepper ringspot virus (PepRSV)
    • Spezies Tobravirus pisi mit Pea early-browning virus (PEBV)
    • Spezies Tobravirus tabaci mit Tobacco rattle virus (TRV, Tabak-Rattle-Virus)

Äußere Systematik

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Koonin et al haben 2015 die Virgaviridae taxonomisch (aufgrund ihrer Verwandtschaft) der von ihnen postulierten Supergruppe ‚Alphavirus-like superfamily‘ zugeordnet.[14] Schwestergruppe ist danach die Familie Closteroviridae. Der Stammbaum dieser Supergruppe ist nach den Autoren wie folgt:[15]


 „Alphavirus-like superfamily“  


 „Tetraviridae“ (vom ICTV 2011 aufgeteilt) 

Alphatetraviridae,[16] (mit Helicoverpa armigera stunt virus)


   

Carmotetraviridae[17] (mit Providence virus)


   

Permutotetraviridae[18] (mit Thosea asigna virus)


Vorlage:Klade/Wartung/3

   

?Birnaviridae (dsRNA)



   





Virgaviridae


   

Closteroviridae



   

Bromoviridae



   

Tymovirales (Ordnung)



   

Endornaviridae[19] (dsRNA, mit Oryza sativa alphaendornavirus)



   

Hepeviridae


   

Togaviridae (mit Alphavirus)


   

?Matonaviridae (mit Rötelnvirus — vom ICTV 2019 aus den Togaviridae ausgegliedert)


Vorlage:Klade/Wartung/3



   

?Nodaviridae[20] (mit Boolarravirus)



Vorlage:Klade/Wartung/Style

Die Mitglieder dieser vorgeschlagenen Supergruppe gehören verschiedenen Gruppen der Baltimore-Klassifikation an, in der Regel handelt es sich um einzelsträngige RNA-Viren positiver Polarität ((+)ssRNA, Baltimore-Gruppe 4), es sind aber auch doppelsträngige Vertreter (mit dsRNA gekennzeichnet, Baltimore-Gruppe 3) zu finden.

Obwohl ihre Mitglieder stäbchenförmig sind und Pflanzen infizieren gehört die Gattung Benyvirus nicht zu dieser Familie, sondern zu den Benyviridae; die Proteine der beiden Gruppen sind offenbar nur weitläufig verwandt.[21] Eine weitere verwandte Gattung ist vorschlagsgemäß Charavirus mit den Spezies Charavirus canadensis (CV-Can) und Charavirus australis (CV-Aus), diese Viren befallen Charophyten.[22]

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Einzelnachweise

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  1. ↑ a b c d ICTV Master Species List 2019.v1. ICTV, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. ↑ ICTV Master Species List 2018b.v2. MSL #34, März 2019
  3. ↑ Michael J. Adams, Scott Adkins, Claude Bragard, David Gilmer, Dawei Li, Stuart A. MacFarlane, Sek-Man Wong, Ulrich Melcher, Claudio Ratti, Ki Hyun Ryu: ICTV Virus Taxonomy Profile: Virgaviridae. In: Journal of General Virology. 98. Jahrgang, Nr. 8, 1. August 2017, S. 1999–2000, doi:10.1099/jgv.0.000884, PMID 28786782, PMC 5656781 (freier Volltext) – (englisch).
  4. ↑ a b c d e f g ICTV Report Virgaviridae. (englisch).
  5. ↑ a b c d e f g Viral Zone. ExPASy, abgerufen am 2. September 2019 (englisch).
  6. ↑ M. J. Adams, J. F. Antoniw, J. Kreuze: Virgaviridae: a new family of rod-shaped plant viruses. In: Arch Virol, Band 154, Nr. 12, 2009, S. 1967–1972; doi:10.1007/s00705-009-0506-6 (englisch).
  7. ↑ Virus Taxonomy: 2015 Release. ICTV, abgerufen am 4. Juni 2016 (englisch).
  8. ↑ virga|Latein → Deutsch. Pons.de
  9. ↑ ICTV: Taxonomy Browser.
  10. ↑ ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).
  11. ↑ M. J. Adams, P. Jones, A. G. Swaby: Purification and some properties of oat golden stripe virus. In: Annals of Applied Biology, April 1988; doi:10.1111/j.1744-7348.1988.tb02064.x (englisch).
  12. ↑ BE Min, BN Chung, MJ Kim, JH Ha, BY Lee, KH Ryu: Cactus mild mottle virus is a new cactus-infecting tobamovirus. In: Archives of Virology. 151. Jahrgang, Nr. 1, Januar 2006, S. 13–21, doi:10.1007/s00705-005-0617-7, PMID 16132178 (englisch).
  13. ↑ a b c Tobamovirien. Auf: Seminis
  14. ↑ Da diese Gruppe (von den Autoren als englisch superfamily bezeichnet) mit den Tymovirales eine Ordnung enthält, muss ihr Rang höher sein als dieser und ist nicht etwa als Überfamilie zu verstehen. Ränge höher als Ordnung waren zum Zeitpunkt der Arbeit vom ICTV aber noch gar nicht vorgegeben.
  15. ↑ Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity. In: Virology, Band 479–480, Mai 2015, S. 2–25; doi:10.1016/j.virol.2015.02.039 , PMC 5898234 (freier Volltext), PMID 25771806, Epub 12. März 2015 (englisch).
  16. ↑ SIB: Alphatetraviridae, auf: ViralZone
  17. ↑ SIB: Carmotetraviridae, auf: ViralZone
  18. ↑ SIB: Permutotetraviridae, auf: ViralZone
  19. ↑ SIB: Endornaviridae, auf: ViralZone
  20. ↑ SIB: Nodaviridae, auf: ViralZone
  21. ↑ ICTV Report Benyviridae. (englisch).
  22. ↑ Marli Vlok, Adrian J. Gibbs. Curtis A. Suttle: Metagenomes of a Freshwater Charavirus from British Columbia Provide a Window into Ancient Lineages of Viruses. In: Viruses, Band 11, Nr. 3, S. 299, 25. März 2019; doi:10.3390/v11030299, PMC 6466400 (freier Volltext), PMID 30934644 (englisch).
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