„Nanohaloarchaeota“ – Versionsunterschied

aus Wikipedia, der freien Enzyklopädie
Zur Navigation springen Zur Suche springen
Versionsgeschichte interaktiv durchsuchen
[gesichtete Version][gesichtete Version]
← Zum vorherigen VersionsunterschiedZum nächsten Versionsunterschied →
Inhalt gelöscht Inhalt hinzugefügt
VisuellWikitext
K Chewbacca2205 verschob die Seite Benutzer:Versionen/Nanohaloarchaea nach Nanohaloarchaeota, ohne dabei eine Weiterleitung anzulegen
Rücksetzung auf letzte deutsche Version
Markierung: Manuelle Zurücksetzung
Zeile 1: Zeile 1:
<!-- Für Informationen zum Umgang mit dieser Vorlage siehe bitte [[Wikipedia:Taxoboxen]]. -->
{{Short description|Class of archaea}}
{{Taxobox
{{Taxobox
| Taxon_WissName = Nanohaloarchaeota
| domain = [[Archaea]]
| Taxon_Rang = Stamm
| regnum = [[Euryarchaeota]]
| Taxon_Autor = Rinke ''et&nbsp;al.'' 2013
| superphylum = [[DPANN]]

| phylum = "'''Nanohaloarchaeota'''"
| Taxon2_WissName = DPANN
| classis = "'''Nanohaloarchaea'''"
| Taxon2_Rang = Überstamm
| classis_authority = (sic) Narasingarao et al. 2012

| ordo = "Nanohalarchaeales"
| Taxon3_WissName = Archaea
| familia = "Nanohalarchaeaceae"
| Taxon3_Rang = Domäne
| subdivision_ranks = Genus

| subdivision =
| Taxon4_Name = Lebewesen
* "Candidatus Nanohalarchaeum" <small>corrig. Hamm et al. 2019</small>
| Taxon4_Rang = Klassifikation
| Bild =
| Bildbeschreibung =
}}
}}


Die '''Nanohaloarchaeota'''<ref name="OneZoom"/> sind ein [[Phylum]] ([[Stamm (Biologie)#Archaeen|Stamm]]) winziger extrem [[halophil]]er (sog. „nanohalophiler“) [[Archaeen]] mit einem ebenfalls vergleichsweise kleinen [[Genom]] und begrenzten [[Stoffwechsel]]fähigkeiten.
'''Nanohaloarchaea''' is a clade of diminutive [[archaea]] with small [[genomes]] and limited metabolic capabilities, belonging to the [[DPANN]] archaea. They are ubiquitous in [[hypersaline]] habitats, which they share with the extremely [[halophilic]] [[haloarchaea]].

== Forschungsgeschichte ==
Nanohalophile Archaeen, d.&nbsp;h. extrem kleine, salzliebende ([[halophil]]e) Archaeen sind in [[hypersalinar|hypersalinen]] (stark salzhaltigen) [[Habitat|Lebensräumen]] allgegenwärtig, die sie mit den größeren, ebenfalls extrem halophilen [[Halobacteria|Haloarchaeen]] teilen.

Bei der [[DNA-Sequenzierung|Sequenzierung]] von [[Genom]]en dieser halophilen Archaeen aus dem [[Lake Tyrrell]] – einem [[Salzsee]] in der Region „[[The Mallee]]“ im Nordwesten des [[Australien|australischen]] Bundesstaates [[Victoria (Australien)|Victoria]] – fanden sich [[Metagenomik|Metagenomdaten]], die sich stark von denen der Halobakterien unterschieden.<ref name="Andrade2015"/> Später wurden solche nanohalophilen Archaeen auch in weiteren hyper- und thalassosalinen<ref>[[wikt:en:thalassohaline|thalassohaline]], Wiktionary (en.)</ref><ref name="Bickel1995"/> Gewässern und [[Habitat|Umgebungen]] auch außerhalb Australien identifiziert, darunter:
* spanische [[Saline]]n,<ref name="Ghai2011"/>
* russische [[Natronsee]]n,<ref name="Vavourakis2016"/>
* kalifornische Salinen,<ref name="Zhaxybayeva2013"/> und
* chilenischer [[Halit]].<ref name="Crits-Christoph2016"/>
Für diese Gruppe nicht [[Kultivierung|kultivierbarer]] nanohalophiler Archaeen wurde daher zunächst die [[Klasse (Biologie)|Klasse]] [[Nanohaloarchaea]], und anschließend auch das [[Phylum]] Nanohaloarchaeota vorgeschlagen.
Innerhalb der Gruppe konnten zu dieser Zeit insgesamt sechs [[Klade]]n (Verwandtschaftsgruppen) ausgemacht werden.<ref name="Narasingarao2011"/><ref name="Ghai2011"/>

Es bildeten sich in Konkurrenz zueinander zwei Theorien zur [[Taxonomie]] dieser nanohalophilen Archaeen heraus:<ref name="Petitjean2014"/><ref name="Cavalier-Smith2020"/><ref name="Aouad2018"/>
# Es könnte sich um einen eigenständiges Phylum ([[Stamm (Biologie)#Archaeen|Stamm]]) „Nanohaloarchaeota“ innerhalb des Superphylums [[DPANN]] ([[Diapherotrites|'''D'''iapherotrites]], [[Parvarchaeota|'''P'''arvarchaeota]], [[Aenigmarchaeota|'''A'''enigmarchaeota]], [[Nanoarchaeota|'''N'''anoarchaeota]], '''N'''anohaloarchaeota) handeln.<ref name="Rinke2013"/><ref name="NCBI"/> Zusammen mit halophilen Bakterien und anderen Haloarchaeen ist DPANN in Salzseen und [[Salzpfanne]]n auf der ganzen Welt zu finden.
# Es könnte sich aber auch nur um eine Klasse „Nanohaloarchaea“ und Schwestergruppe der [[Halobacteria|Haloarchaea]] innerhalb des {{nowrap|(Super-)}}<wbr/>Phylums [[Euryarchaeota]] handeln; diese beiden Euryarchaeota-Gruppen werden zusammen mit anderen gelegentlich zur größeren „[[Stenosarchaea]]-Gruppe“ zusammengefasst.<ref name="NCBI_Nanohaloarchaea"/>

Die phylogenetische Position der nanohalophilen Archaeen ist bis heute umstritten.
Die Diskussion könnte möglicherweise einen vorläufigen Abschluss gefunden haben,<ref name="Rinke2021"/> indem die Gruppe der nanohalophilen Archaeen als [[polyphyletisch]] aufgefasst und die Klasse „[[Nanohaloarchaea]]“ vom Rest des Phylums „Nanohaloarchaeota“ abgetrennt wird. Während die Klasse „Nanohaloarchaea“ bei den Euryarchaeota (und dort evtl. in der „Stenosarchaea-Gruppe“) verortet wird,<ref name="LPSN_Nanohaloarchaea"/><ref name="NCBI_Nanohaloarchaea"/> könnte der Rest des Phylums „Nanohaloarchaeota“ – das ist die Klasse „Nanohalobia“ und einige bisher nicht näher zugeordnete Vertreter – möglicherweise als namensgebender Teil bei den DPANN-Archaeen verbleiben,<ref name="NCBI"/> letzteres ist aber nicht sicher.<ref name="LPSN"/>

== Beschreibung und Vorkommen ==
Vertreter der Nanohaloarchaeota sind [[obligate Symbionten]] von [[Halobacteria|Haloarchaeen]], beispielsweise „''Ca.'' Nanohaloarchaeum antarcticus“ von ''[[Halorubrum lacusprofundi]]''.<ref name="Hamm2019"/>

Unter den aus der Metagenomik vermuteten möglichen Vertreten des nach der Ausgliederung verbliebenen Phylums befinden sich nach Informationen aus der Gendatenbank des [[National Center for Biotechnology Information|NCBI]]<ref name="NCBI_uncl"/> Isolate
* aus dem Meeressediment im [[Guaymas-Becken]] ([[Golf von Kalifornien]]), Proben-Entnahme am 4. Dezember 2009,<!-- AB_69_Bin_152, AB_3033_Bin_53, AB_1215_Bin_137, AB_03_Bin_175, AB_03_Bin_104 "27.388 N 111.24560 W"-->
* aus dem Sediment bei den [[Raucher (Hydrothermie)|Hydrothermal-Schloten]] im Guaymas-Becken, entnommen am 2. Dezember 2009,<!-- B72_G9 "29.52416667 N 113.57000000 W" -->
* aus [[Raucher (Hydrothermie)|Hydrothermal-Sulfid-Schloten der Tiefsee]] des [[Ostpazifischer Rücken|Ostpazifischen Rückens]] im [[Pazifisher Ozean|Pazifik]], entnommen am 1. Januar 2014<!-- L_MetaBat.18 "9.7712 N 104.2789 W"-->
* aus inländischen Salinen der {{lang|es|[[Desierto de los Monegros]]}} ({{enS|[[:en:Monegros Desert|Monegros Desert]]}}), [[Aragonien]], Spanien,<!-- OTU_6047, OTU_4304, OTU_3863, OTU_3617, OTU_3573, OTU_3408, OTU_3192, OTU_2682, … -->
* aus einer solaren Salinen (en. ''{{lang|en|solar salterns}}'') bei [[Tuzlagözü (Kozluk)|Tuzlagözü]] im Landkreis [[Kozluk]], Türkei, entnommen im August 2014,<!-- N_ST84, N_ST51, N_ST64, N_ST36, …--> und bei [[Ayvalık]], ebenfalls in der Türkei, entnommen im September 2015<!-- N_A93 -->, und
* vom [[Tuz Gölü]] (Tuz-Salzsee, {{laS|Lcus Tatta}}), Türkei, entnommen im Juni 2016.<!-- N_TG86 -->

== Etymologie ==
Der Name des Phyalums „Nanohaloarchaeota“ leitet sich ab von {{grcS|νᾶνος|nanos|la=nanus|de=klein}}, „zwergig“; sowie{{lang|grc|ἅλς|háls|de=Salz, Meer}}, der Suffix ‚-archaeota‘ ist reserviert für Phyla (Stämme/Abteilungen) der Archaeen. „Nanohaloarchaeota“ bezeichnet also ein Phylum salzliebender, keliner (d.&nbsp;h. nanohalophiler) Archaeen.

== Systematik ==
Die [[Klasse (Biologie)]] „[[Nanohaloarchaea]]“ wurde jüngst aus dem hier bschriebenen Phylum Nanohaloarchaeota ausgegliedert ([[#Forschungsgeschichte|s.&nbsp;o.]]) und stattdessen den [[Euryarchaeota]] angegliedert ([[LPSN]], [[National Center for Biotechnology Information|NCBI]]); nach der [[National Center for Biotechnology Information|NCBI]]-Taxonomie gehören sie dort der „Stenosarchaea-Gruppe“ an (Stand 14. Februar 2022).

In der graphischen Darstellung von [[LifeMap]] (NCBI Version, älterer Stand)<ref name="NCBI_Nanohaloarchaea"/> wird die Klasse „Nanohaloarchaea“ (anders als in der NCBI-Taxonomie) selbst noch im Phylum „Candidatus Nanohaloarchaeota“ dargestellt, dieses aber insgesamt zur „Stenosarchaea-Gruppe“ innerhalb der [[Euryarchaeota]]; ebenso ist es bei [[UniProt]].<ref name="UnProt_Nanohaloarchaea"/>
In der graphischen Darstellung bei [[OneZoom]] sind alle Vertreter derzeit umgekehrt der [[DPANN]]-Gruppe zugeordnet.<ref name="OneZoom"/>

Die folgende Systematik der nach der Ausgliederung verbleibenden Nanohaloarchaeota (Stand 14. Februar 2022) basiert im Wesentlichen auf folgenden Quellen:
* L – {{lang|en|[[LPSN|List of Prokaryotic Names with Standing in Nomenclature]]}} (LPSN)<ref name="LPSN"/>
* N – {{lang|en|[[National Center for Biotechnology Information]]}} (NCBI, {{lang|en|Taxonomy Browser}})<ref name="NCBI"/>
----
In der [[DPANN]]-Gruppe (Superphylum) – (N):<br/>
[[Phylum]]: '''„Candidatus Nanohaloarchaeota“ <small>{{Person|Rinke}} ''et&nbsp;al.'' 2013</small>''' (L,N)
* [[Klasse (Biologie)|Klasse]]: „Candidatus Nanohalobia“ <small>{{Person|La Cono}} ''et&nbsp;al.'' 2020</small> (L,N)
** [[Ordnung (Biologie)|Ordnung]]: „Candidatus Nanohalobiales“ <small>{{Person|La Cono}} ''et&nbsp;al.'' 2020</small> (L,N)
*** [[Familie (Biologie)|Familie]]: „Candidatus Nanohalobiaceae“ <small>{{Person|La Cono}} ''et&nbsp;al.'' 2020</small> (L,N)
**** [[Gattung (Biologie)|Gattung]]: „''Candidatus'' Nanohalobium“ <small>{{Person|La Cono}} ''et&nbsp;al.'' 2020</small> (L,N)
***** [[Art (Biologie)|Spezies]]: „''Candidatus'' Nanohalobium constans“ <small>{{Person|La Cono}} ''et&nbsp;al.'' 2020</small> (L,N), inkl. {{lang|en|DPANN group archaeon LC1Nh}} (N) – Referenzstamm LC1Nh ist ein Symbiont des [[Halobacteria|Haloarchaeons]] ''[[Halomicrobium]]'' LC1Hm (L). Probenherkunft: [[Sizilien]], Westküste zw. [[Trapani]] und [[Marsala]], [[Salzwiese]]n, "37.85 N 12.48 E", Juni 2017 (N)
* keiner Klasse, Ordnung oder Familie zugewiesene Gattungen:
**** Gattung: „''Candidatus'' Nanohalarchaeum“ <small>corrig. {{Person|Hamm}} ''et&nbsp;al.'' 2019</small> mit Schreibvariante „''Candidatus'' Nanohaloarchaeum“ <small>{{Person|Hamm}} ''et&nbsp;al.'' 2019</small> (L)
***** Spezies: „''Candidatus'' Nanohalarchaeum antarcticum“ <small>corrig. {{Person|Hamm}} ''et&nbsp;al.'' 2019</small> (L) mit Schreibvariante „''Candidatus'' Nanohaloarchaeum antarcticus“<ref name="Hamm2019"/>
**** Gattung: „''Candidatus'' Nanopetraeus“ <small>corrig. {{Person|Crits-Christoph}} ''et&nbsp;al.'' 2016</small> mit Schreibvariante „''Candidatus'' Nanopetramus“ <small>{{Person|Crits-Christoph}} ''et&nbsp;al.'' 2016</small> (L)
***** Spezies: ''Candidatus'' Nanopetramus sp. SG9 alias Nanohaloarchaea archaeon SG9<ref name="LaCono2020"/><ref name="Crits-Christoph2016"/> (N<ref name="NCBI_Nanopetramus"/>)
**** weitere Stämme der Nanohaloarchaeota als mögliche Spezies mit vorläufiger Bezeichnung ohne Gattungszuweisung: Diverse Isolate nach NCBI mit vorläufiger Bezeichnung.<ref name="NCBI_uncl"/> (N)

== Literatur ==
* {{cite journal |author=Rohit Ghai, Lejla Pašić, Ana Beatriz Fernández, Ana-Belen Martin-Cuadrado, Carolina Megumi Mizuno, Katherine D. McMahon, R. Thane Papke, Ramunas Stepanauskas, Beltran Rodriguez-Brito, Forest Rohwer, Cristina Sánchez-Porro, [[Antonio Ventosa]], Francisco Rodríguez-Valera |date=2011-10-31 |title=New Abundant Microbial Groups in Aquatic Hypersaline Environments |url=https://www.nature.com/articles/srep00135 |journal=[[Nature]] Scientific Reports |volume=1 |issue=135 |pages=135| doi= 10.1038/srep00135 |pmid=22355652 |pmc=3216616|bibcode =2011NatSR...1E.135G }}
* {{cite journal |author=Priya Narasingarao, Sheila Podell, Juan A. Ugalde, Céline Brochier-Armanet, Joanne B. Emerson, Jochen J. Brocks, Karla B. Heidelberg, [[Jillian F. Banfield]], Eric E. Allen |date=2012 |title=De novo metagenomic assembly reveals abundant novel major lineage of Archaea in hypersaline microbial communities |url=https://www.nature.com/articles/ismej201178 |journal=[[Nature]] ISME J. |volume=6 |issue=1 |date=2011-06-30 |pages=81–93 |pmid=21716304 |pmc=3246234 |doi=10.1038/ismej.2011.78 }}

== Einzelnachweise ==
<references>

<ref name="OneZoom">[[OneZoom]]: [https://www.onezoom.org/life.html/@Nanohaloarchaeota Nanohaloarchaeota]</ref>

<ref name="LPSN">{{cite web |author=J.&nbsp;P. Euzéby |title=Phylum "''Candidatus'' Nanohaloarchaeota" Rinke ''et&nbsp;al.'' 2013| publisher=[[List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature]] (LPSN) |url=https://lpsn.dsmz.de/phylum/nanohaloarchaeota }}</ref>

<ref name="NCBI_Nanopetramus">{{cite web |author=Sayers ''et&nbsp;al.'' |url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Undef&name=Candidatus%20Nanopetramus%20*&srchmode=2 |title=Search: Candidatus Nanopetramus * (wild card)|publisher=[[National Center for Biotechnology Information]] (NCBI) taxonomy database}}</ref>

<ref name="NCBI">{{cite web |author=Sayers ''et&nbsp;al.'' |url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=1462430&lvl=3 |title=Candidatus Nanohaloarchaeota |publisher=[[National Center for Biotechnology Information]] (NCBI) taxonomy database}} Details: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=1462430&srchmode=1 "Candidatus Nanohaloarchaeota" Rinke et&nbsp;al. 2013] (phylum; graphisch: [http://lifemap-ncbi.univ-lyon1.fr/?tid=1462430 =Candidatus Nanohaloarchaeota], auf: Lifemap NCBI Version.</ref>

<ref name="NCBI_uncl">{{cite web |author=Sayers ''et&nbsp;al.'' |url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=2099672&lvl=3&srchmode=2 |title=unclassified Candidatus Nanohaloarchaeota |publisher=[[National Center for Biotechnology Information]] (NCBI) taxonomy database}} Details: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/?term=txid2099673 Nucleotide: txid2099673], MAG: Candidatus Nanohaloarchaeota archaeon isolates.
</ref>

<!-Nanohaloarchaea---------------------->

<ref name="UnProt_Nanohaloarchaea">[[UniProt]]: [https://www.uniprot.org/taxonomy/1051663 Taxonomy - Nanohaloarchaea <small>(CLASS)</small>], [https://www.uniprot.org/taxonomy/?query=ancestor%3a1051663 Nanohaloarchaea: All lower taxonomy nodes]</ref><!-- Nanohaloarchaea in Candidatus Nanohaloarchaeota-->

<ref name="LPSN_Nanohaloarchaea">{{cite web |author=J.&nbsp;P. Euzéby |title=Class "''Candidatus'' Nanohaloarchaea" Narasingarao ''et&nbsp;al.'' 2012| publisher=[[List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature]] (LPSN) |url=https://lpsn.dsmz.de/class/nanohaloarchaea }}</ref>

<ref name="NCBI_Nanohaloarchaea">{{cite web |author=Sayers ''et&nbsp;al.'' |url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=1051663&lvl=3 |title=Nanohaloarchaea |publisher=[[National Center for Biotechnology Information]] (NCBI) taxonomy database}} Details: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=1051663&srchmode=1 "Nanohaloarchaea" Narasingarao et&nbsp;al. 2012] (class); graphisch: [http://lifemap-ncbi.univ-lyon1.fr/?tid=1051663 Nanohaloarchaea], auf: Lifemap NCBI Version.</ref>

<!----------------------->

<ref name="Andrade2015">
{{cite journal |author=Karen Andrade, Jörn Logemann, Karla B. Heidelberg, Joanne B. Emerson, Luis R. Comolli, Laura A. Hug, Alexander J. Probst, Angus Keillar, Brian C. Thomas, Christopher S. Miller, Eric E. Allen, John W. Moreau, Jochen J. Brocks, [[Jillian F. Banfield]] |title=Metagenomic and lipid analyses reveal a diel cycle in a hypersaline microbial ecosystem |url=https://www.nature.com/articles/ismej201566 |journal=[[Nature]] ISME J |date=2015-04-28 |volume=9 |issue=12 |pages=2697&#x200B;–2711 |doi=10.1038/ismej.2015.66 |pmid=25918833 |pmc=4817636 }}
</ref>

<ref name="Aouad2018">
{{cite journal |author=Monique Aouad, Najwa Taïb, Anne Oudart, Michel Lecocq, Manolo Gouy, [[Céline Brochier-Armanet]] |title=Extreme halophilic archaea derive from two distinct methanogen Class II lineages |url=https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1055790317306978 |journal=Molecular Phylogenetics and Evolution |date=2018-04-21 |volume=2018 |issue=27 |pages=46–54 |doi=10.1016/j.ympev.2018.04.011 |pmid=29684598 |publisher=Elsevier}} [https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01799910/file/aouad2018.pdf PDF].
</ref>

<ref name="Bickel1995">
Susanne M. Bickel, Martina Ufer, Kerstin Steinert, Michaela Dane: [https://www.researchgate.net/publication/225187724_Leben_im_Salz_-_Halophile_Archaea Leben im Salz]. In: [[Biologie in unserer Zeit]], Band 25, Nr.&nbsp;6, Dezember 1995, Projekt: Bioenergetics of Halophilic Archaea, S.&nbsp;380–393; [[doi:10.1002/biuz.19950250624]]. [https://www.researchgate.net/profile/Susanne-Bickel/publication/225187724_Leben_im_Salz_-_Halophile_Archaea/links/5c35c9ad92851c22a3665e7b/Leben-im-Salz-Halophile-Archaea.pdf PDF]
</ref>

<ref name="Cavalier-Smith2020">
{{Cite journal |author=[[Thomas Cavalier-Smith]], Ema E-Yung Chao |url=https://link.springer.com/article/10.1007/s00709-019-01442-7 |doi=10.1007/s00709-019-01442-7 |title=Multidomain ribosomal protein trees and the planctobacterial origin of neomura (Eukaryotes, archaebacteria) |date=2020-01-03 |journal=Protoplasma |volume=257 |issue=3 |pages=621–753 |pmid = 31900730 |pmc = 7203096 }}
</ref>

<ref name="Crits-Christoph2016">
{{cite journal |author=Alexander Crits-Christoph, Diego R. Gelsinger, Bing Ma, Jacek Wierzchos, Jacques Ravel, Alfonso Davila, M. Cristina Casero, Jocelyne DiRuggiero |title=Functional interactions of archaea, bacteria and viruses in a hypersaline endolithic community |url=https://sfamjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1462-2920.13259 |journal=Environmental Microbiology |date=2016-03-21 |volume=18 |issue=6 |pages=2064&#x200B;–2077 |doi=10.1111/1462-2920.13259 |pmid=26914534 }}
</ref>

<ref name="Ghai2011">
{{cite journal|author=Rohit Ghai, Lejla Pašić, Ana Beatriz Fernández, Ana-Belen Martin-Cuadrado, Carolina Megumi Mizuno, Katherine D. McMahon, R. Thane Papke, Ramunas Stepanauskas, Beltran Rodriguez-Brito, Forest Rohwer, Cristina Sánchez-Porro, [[Antonio Ventosa]], Francisco Rodríguez-Valera |title=New Abundant Microbial Groups in Aquatic Hypersaline Environments |url=https://www.nature.com/articles/srep00135 |journal=[[Nature]] Scientific Reports |date=2011-10-31 |volume=1 |pages=135 |doi=10.1038/srep00135 |pmid=22355652 |pmc=3216616 |bibcode=2011NatSR...1E.135G}}
</ref>


<ref name="Hamm2019">
Nanohaloarchaea were first identified from metagenomic data as a class of uncultivated halophilic archaea composed of 6 clades<ref>{{cite journal | last = Narasingarao | display-authors = etal | date = 2011 | title = De novo metagenomic assembly reveals abundant novel major lineage of Archaea in hypersaline microbial communities | journal = ISME J. | volume = 6 | issue = 1 |pages = 81–93 | pmid = 21716304 | doi = 10.1038/ismej.2011.78 | pmc=3246234}}</ref><ref name=salternRef>{{cite journal|last=Ghai|first=Rohit|display-authors=4|author2=Lejla Pašić|author3=Ana Beatriz Fernandez|author4=Ana-Belen Martin-Cuadrado|author5=Carolina Megumi Mizuno|author6=Katherine D. McMahon|author7=R. Thane Papke|author8=Ramunas Stepanauskas|author9=Beltran Rodriguez-Brito|author10=Forest Rohwer|author11=Cristina Sanchez-Porro|author12=Antonio Ventosa|author13=Francisco Rodriguez-Valera|title=New Abundant Microbial Groups in Aquatic Hypersaline Environments|journal=Scientific Reports|date=10 October 2011|volume=1|doi=10.1038/srep00135|pmid=22355652|pages=135|pmc=3216616|bibcode=2011NatSR...1E.135G}}</ref> and were subsequently placed in the phylum Nanohaloarchaeota within the Diapherotrites, Parvarchaeota, Aenigmarchaeota, [[Nanoarchaeota]], Nanohaloarchaeota ([[DPANN]]) [[superphylum]].<ref>{{cite journal |author1=Rinke C, Schwientek P, Sczyrba A, Ivanova NN, Anderson IJ, Cheng JF, Darling A, Malfatti S, Swan BK, Gies EA, Dodsworth JA, Hedlund BP, Tsiamis G, Sievert SM, Liu WT, Eisen JA, Hallam SJ, Kyrpides NC, Stepanauskas R, Rubin EM, Hugenholtz P, Woyke T |title=Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter |journal=Nature |date=July 25, 2013 |volume=499, 431–437 (2013) |issue=7459 |pages=431–437 |doi=10.1038/nature12352 |pmid=23851394 |bibcode=2013Natur.499..431R |doi-access=free }}</ref> However the phylogenetic position of nanohaloarchaea is still highly debated, being alternatively proposed as the sister-lineage of haloarchaea or a member of the DPANN super-phylum.<ref name="petitjean">{{cite journal |author=Petitjean, C. |author2=Deschamps, P. |author3=López-García, P. |author4=Moreira, D. |title=Rooting the domain Archaea by phylogenomic analysis supports the foundation of the new kingdom Proteoarchaeota |journal=Genome Biol. Evol. |volume=7 |issue=1 |pages=191–204 |year=2014 |pmid=25527841 |pmc=4316627 |doi=10.1093/gbe/evu274}}</ref><ref name="cavalier-smith">{{Cite journal|url= |doi = 10.1007/s00709-019-01442-7|title = Multidomain ribosomal protein trees and the planctobacterial origin of neomura (Eukaryotes, archaebacteria)|year = 2020|last1 = Cavalier-Smith|first1 = Thomas|last2 = Chao|first2 = Ema E-Yung|journal = Protoplasma|volume = 257|issue = 3|pages = 621–753|pmid = 31900730|pmc = 7203096}}</ref><ref>{{cite journal |author1=Monique Aouad, Najwa Taïb, Anne Oudart, Michel Lecocq, Manolo Gouy,Céline Brochier-Armanet |title=Extreme halophilic archaea derive from two distinct methanogen Class II lineages |journal=Molecular Phylogenetics and Evolution |date=21 Apr 2018 |volume=2018 |issue=27 |pages=46–54 |doi=10.1016/j.ympev.2018.04.011 |pmid=29684598 |url=https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01799910/file/aouad2018.pdf |publisher=Elsevier}}</ref>
Joshua N. Hamm, Susanne Erdmann, Emiley A. Eloe-Fadrosh, Allegra Angeloni, Ling Zhong, Christopher Brownlee, Timothy J. Williams, Kirston Barton, Shaun Carswell, Martin A. Smith, Sarah Brazendale, Alyce M. Hancock, Michelle A. Allen, Mark J. Raftery, Ricardo Cavicchioli: [https://www.pnas.org/content/116/29/14661 Unexpected host dependency of Antarctic Nanohaloarchaeota]. In: PNAS, Band 116, Nr.&nbsp;29, 16. Juli 2019, S.&nbsp;14661&#x200B;-14670; [[doi:10.1073/pnas.1905179116]], Epub 28. Juni 2019.
</ref>


<ref name="LaCono2020">
The lineage has since been identified in data from a range of hypersaline environments including: Australian thalassohaline lake,<ref>{{cite journal |author1=Karen Andrade, Jörn Logemann, Karla B Heidelberg, Joanne B Emerson, Luis R Comolli, Laura A Hug, Alexander J Probst, Angus Keillar, Brian C Thomas, Christopher S Miller, Eric E Allen, John W Moreau, Jochen J Brocks & Jillian F Banfield |title=Metagenomic and lipid analyses reveal a diel cycle in a hypersaline microbial ecosystem |journal=ISME J |date=28 April 2015 |volume=ISME J 9, 2697–2711 (2015) |issue=12 |pages=2697–2711 |doi=10.1038/ismej.2015.66 |pmid=25918833 |pmc=4817636 |doi-access=free }}</ref> Spanish saltern,<ref>{{cite journal |author1=Rohit Ghai, Lejla Pašić, Ana Beatriz Fernández, Ana-Belen Martin-Cuadrado, Carolina Megumi Mizuno, Katherine D. McMahon, R. Thane Papke, Ramunas Stepanauskas, Beltran Rodriguez-Brito, Forest Rohwer, Cristina Sánchez-Porro, Antonio Ventosa & Francisco Rodríguez-Valera |title=New Abundant Microbial Groups in Aquatic Hypersaline Environments |journal=Scientific Reports |date=31 October 2011 |volume=1 |issue=Sci Rep 1, 135 (2011) |page=135 |doi=10.1038/srep00135 |pmid=22355652 |pmc=3216616 |bibcode=2011NatSR...1E.135G |doi-access=free }}</ref> Russian soda brine,<ref>{{cite journal |author1=Vavourakis Charlotte D., Ghai Rohit, Rodriguez-Valera Francisco, Sorokin Dimitry Y., Tringe Susannah G., Hugenholtz Philip, Muyzer Gerard |title=Metagenomic Insights into the Uncultured Diversity and Physiology of Microbes in Four Hypersaline Soda Lake Brines |journal=Frontiers in Microbiology |date=25 February 2016 |volume=7 |pages=211 |doi=10.3389/fmicb.2016.00211 |pmid=26941731 |pmc=4766312 |doi-access=free }}</ref> Californian saltern,<ref>{{cite journal |author1=Olga Zhaxybayeva 1 , Ramunas Stepanauskas, Nikhil Ram Mohan, R Thane Papke |title=Cell sorting analysis of geographically separated hypersaline environments |journal=Extremophiles |date=29 January 2013 |volume=17,2 (2013) |issue=2 |pages=265–275 |doi=10.1007/s00792-013-0514-z |pmid=23358730 |s2cid=5933801 |url=https://www.researchgate.net/publication/235380187 |access-date=2 March 2021}}</ref> and Chilean halite<ref>{{cite journal |author1=Alexander Crits‐Christoph Diego R. Gelsinger Bing Ma Jacek Wierzchos Jacques Ravel Alfonso Davila M. Cristina Casero Jocelyne DiRuggiero |title=Functional interactions of archaea, bacteria and viruses in a hypersaline endolithic community |journal=Environmental Microbiology |date=21 March 2016 |volume=18 |issue=2016 v.18 no.6 |pages=2064–2077 |doi=10.1111/1462-2920.13259 |pmid=26914534 |url=https://doi.org/10.1111/1462-2920.13259 |access-date=2 March 2021}}</ref>
{{cite journal |author=Violetta La Cono, Enzo Messina, Manfred Rohde, Erika Arcadi, Sergio Ciordia, Francesca Crisafi, Renata Denaro, Manuel Ferrer, Laura Giuliano, Peter N. Golyshin, Olga V. Golyshina, John E. Hallsworth, Gina La Spada, Maria C. Mena, Alexander Y. Merkel, Margarita A. Shevchenko, Francesco Smedile, Dimitry Y. Sorokin, Stepan V. Toshchakov, Michail M. Yakimov
|date=2020-08-05 |title=Symbiosis between nanohaloarchaeon and haloarchaeon is based on utilization of different polysaccharides |url=https://www.pnas.org/content/117/33/20223 |journal=Proc Natl Acad Sci USA |volume=117 |issue=33 |pages=20223&#x200B;–20234 |pmid=32759215 |pmc=7443923 |doi=10.1073/pnas.2007232117 }} Siehe insbes. [https://www.pnas.org/highwire/powerpoint/944089 Fig.&nbsp;1] (PowerPoint).
</ref>


<ref name="Narasingarao2011">
==Taxonomy==
{{cite journal |author=Priya Narasingarao, Sheila Podell, Juan A. Ugalde, [[Céline Brochier-Armanet]], Joanne B. Emerson, Jochen J. Brocks, Karla B. Heidelberg, [[Jillian F. Banfield]], Eric E. Allen |date=2012-01 |title=De novo metagenomic assembly reveals abundant novel major lineage of Archaea in hypersaline microbial communities |url=https://www.nature.com/articles/ismej201178 |journal=[[Nature]] ISME J. |volume=6 |issue=1 |pages=81–93 |pmid=21716304 |doi=10.1038/ismej.2011.78 |pmc=3246234}} Epub 30. Juni 2011.
The currently accepted taxonomy is based on the [[List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature]] (LPSN)<ref>{{cite web | author=J.P. Euzéby | title=Phylum "Candidatus Nanohaloarchaeota" | access-date=2011-11-17 | publisher=[[List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature]] (LPSN) | url-status=live | url=https://lpsn.dsmz.de/phylum/nanohaloarchaeota }}</ref> and [[National Center for Biotechnology Information]] (NCBI).<ref>{{cite web |author = Sayers |display-authors = etal| url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=1051663&lvl=3&lin |title=Nanohaloarchaea |access-date=2011-06-05 |publisher=[[National Center for Biotechnology Information]] (NCBI) taxonomy database}}</ref>
</ref>


<ref name="Petitjean2014">
Phylum "Nanohalarchaeota" <small>corrig. Rinke et al. 2013</small>
{{cite journal |author=Céline Petitjean, Philippe Deschamps, Purificación López-García, David Moreira |title=Rooting the domain Archaea by phylogenomic analysis supports the foundation of the new kingdom Proteoarchaeota |url=https://academic.oup.com/gbe/article/7/1/191/601621 |journal=Genome Biol. Evol. |volume=7 |issue=1 |pages=191–204 |date=2014-12-19 |pmid=25527841 |pmc=4316627 |doi=10.1093/gbe/evu274 }}
* Class "Nanohalarchaeia" <small>corrig. Narasingarao et al. 2012</small>
</ref>
** Order "Nanohalarchaeales"
*** Family "Nanohalarchaeaceae"
**** Genus "''Candidatus'' [[Nanohalarchaeum]]" <small>corrig. Hamm et al. 2019</small>
***** "''Ca.'' N. antarcticum" <small>corrig. Hamm et al. 2019</small>
** Order "Nanohalobiales" <small>La Cono et al. 2020</small><ref>{{cite journal | last=La Cono | display-authors=et al. | date=2020 | title=Symbiosis between nanohaloarchaeon and haloarchaeon is based on utilization of different polysaccharides | journal=Proc Natl Acad Sci USA | volume=117 | issue=33 |pages=20223–20234 | pmid= 32759215| pmc= 7443923| doi=10.1073/pnas.2007232117 | doi-access=free }}</ref>
*** Family "Nanohalobiaceae" <small>La Cono et al. 2020</small>
**** Genus "''Candidatus'' [[Nanohalobium]]" <small>La Cono et al. 2020</small>
***** "''Ca.'' N. constans" <small>La Cono et al. 2020</small>
** Order "Nanosalinales" <small>Rinke et al. 2020</small>
*** Family "Nanosalinaceae" <small>Rinke et al. 2020</small>
**** Genus "''Candidatus'' [[Nanopetraeus]]" <small>corrig. Crits‐Christoph et al. 2016</small> ["Nanopetramus" (sic)]
**** Genus "''Candidatus'' [[Haloredivivus]]" <small>Ghai et al. 2011</small>
**** Genus "''Candidatus'' [[Nanosalina]]" <small>Narasingarao et al. 2012</small>
**** Genus "''Candidatus'' [[Nanosalinicola]]" <small>corrig. Narasingarao et al. 2012</small> ["Nanosalinarum" (sic)]


<ref name="Rinke2013">
==References==
{{cite journal |author=Christian Rinke, Patrick Schwientek, Alexander Sczyrba, Natalia N. Ivanova, Iain J.
{{Reflist|30em}}
Anderson, Jan-Fang Cheng, Aaron Darling, Stephanie Malfatti, Brandon K. Swan, Esther A. Gies, Jeremy A. Dodsworth, Brian P. Hedlund, George Tsiamis, Stefan M. Sievert, Wen-Tso Liu, Jonathan A. Eisen, Steven J. Hallam, Nikos C. Kyrpjdes, Ramunas Stepanauskas, Edward M. Rubin, Philip Hugenholtz, Tanja Woyke |title=Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter |url=https://www.nature.com/articles/nature12352 |journal=[[Nature]] |date=2013-07-25 |volume=499| issue=7459 |pages=431–437 |doi=10.1038/nature12352 |pmid=23851394 |bibcode=2013Natur.499..431R }}
</ref>


<ref name="Rinke2021">
==Further reading==
Christian Rinke, Maria Chuvochina, Aaron Mussig, Pierre-Alain Chaumeil, Adrián Davín, David W. Waite, William B. Whitman, Donovan H. Parks, Philip Hugenholtz: [https://www.researchgate.net/publication/352608636_A_standardized_archaeal_taxonomy_for_the_Genome_Taxonomy_Database A standardized archaeal taxonomy for the Genome Taxonomy Database]. In: [[Nature]] Microbiology, Band 6, Nr.&nbsp;7, 21. Juni 2021, S.&nbsp; pages 946–959; [[doi:10.1038/s41564-021-00918-8]], Epub Juli 2021. Projects: A rank-normalized prokaryotic taxonomy – A rank normalized prokaryotic taxonomy. Hier insbes. Tbl.&nbsp;S13 in [https://static-content.springer.com/esm/art%3A10.1038%2Fs41564-021-00918-8/MediaObjects/41564_2021_918_MOESM1_ESM.pdf Supplementary Information].
* {{cite journal | last = Ghai | display-authors = etal | date = 2011 | title = New Abundant Microbial Groups in Aquatic Hypersaline Environments | journal = Scientific Reports | volume = 1 | issue = 135 |pages = 135| doi = 10.1038/srep00135 | pmid=22355652 | pmc=3216616| bibcode =2011NatSR...1E.135G}}
</ref>
* {{cite journal | last = Narasingarao | display-authors = etal | date = 2012 | title = De novo metagenomic assembly reveals abundant novel major lineage of Archaea in hypersaline microbial communities | journal = ISME J. | volume = 6 | issue = 1 |pages = 81–93 | pmid = 21716304 | pmc = 3246234 | doi = 10.1038/ismej.2011.78}}


<ref name="Vavourakis2016">
{{Archaea classification}}
{{cite journal |author=Charlotte D. Vavourakis, Rohit Ghai, Francisco Rodriguez-Valera, Dimitry Y. Sorokin, Susannah G. Tringe, Philip Hugenholtz, Gerard Muyzer |title=Metagenomic Insights into the Uncultured Diversity and Physiology of Microbes in Four Hypersaline Soda Lake Brines |url=https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2016.00211/full |journal=Frontiers in Microbiology |date=2016-02-25 |volume=7 |pages=211 |doi=10.3389/fmicb.2016.00211 |pmid=26941731 |pmc=4766312 }}
{{Taxonbar|from=Q6964054}}
</ref>


<ref name="Zhaxybayeva2013">
[[Category:Archaea classes]]
{{cite journal |author=Olga Zhaxybayeva, Ramunas Stepanauskas, Nikhil Ram Mohan, R. Thane Papke |title=Cell sorting analysis of geographically separated hypersaline environments |url=https://link.springer.com/article/10.1007/s00792-013-0514-z |journal=Extremophiles |date=2013-01-29 |volume=17 |issue=2 |pages=265–275 |doi=10.1007/s00792-013-0514-z |pmid=23358730 }} [https://www.researchgate.net/publication/235380187 ResearchGate].
[[Category:Euryarchaeota]]
</ref>


</references>


[[Kategorie:DPANN]]
{{Euryarchaeota-stub}}

Version vom 15. Februar 2022, 21:13 Uhr

Nanohaloarchaeota
Systematik
Klassifikation: Lebewesen
Domäne: Archaea
Überstamm: DPANN
Stamm: Nanohaloarchaeota
Wissenschaftlicher Name
Nanohaloarchaeota
Rinke et al. 2013

Die Nanohaloarchaeota[1] sind ein Phylum (Stamm) winziger extrem halophiler (sog. „nanohalophiler“) Archaeen mit einem ebenfalls vergleichsweise kleinen Genom und begrenzten Stoffwechselfähigkeiten.

Forschungsgeschichte

Nanohalophile Archaeen, d. h. extrem kleine, salzliebende (halophile) Archaeen sind in hypersalinen (stark salzhaltigen) Lebensräumen allgegenwärtig, die sie mit den größeren, ebenfalls extrem halophilen Haloarchaeen teilen.

Bei der Sequenzierung von Genomen dieser halophilen Archaeen aus dem Lake Tyrrell – einem Salzsee in der Region „The Mallee“ im Nordwesten des australischen Bundesstaates Victoria – fanden sich Metagenomdaten, die sich stark von denen der Halobakterien unterschieden.[2] Später wurden solche nanohalophilen Archaeen auch in weiteren hyper- und thalassosalinen[3][4] Gewässern und Umgebungen auch außerhalb Australien identifiziert, darunter:

Für diese Gruppe nicht kultivierbarer nanohalophiler Archaeen wurde daher zunächst die Klasse Nanohaloarchaea, und anschließend auch das Phylum Nanohaloarchaeota vorgeschlagen. Innerhalb der Gruppe konnten zu dieser Zeit insgesamt sechs Kladen (Verwandtschaftsgruppen) ausgemacht werden.[9][5]

Es bildeten sich in Konkurrenz zueinander zwei Theorien zur Taxonomie dieser nanohalophilen Archaeen heraus:[10][11][12]

  1. Es könnte sich um einen eigenständiges Phylum (Stamm) „Nanohaloarchaeota“ innerhalb des Superphylums DPANN (Diapherotrites, Parvarchaeota, Aenigmarchaeota, Nanoarchaeota, Nanohaloarchaeota) handeln.[13][14] Zusammen mit halophilen Bakterien und anderen Haloarchaeen ist DPANN in Salzseen und Salzpfannen auf der ganzen Welt zu finden.
  2. Es könnte sich aber auch nur um eine Klasse „Nanohaloarchaea“ und Schwestergruppe der Haloarchaea innerhalb des (Super-)Phylums Euryarchaeota handeln; diese beiden Euryarchaeota-Gruppen werden zusammen mit anderen gelegentlich zur größeren „Stenosarchaea-Gruppe“ zusammengefasst.[15]

Die phylogenetische Position der nanohalophilen Archaeen ist bis heute umstritten. Die Diskussion könnte möglicherweise einen vorläufigen Abschluss gefunden haben,[16] indem die Gruppe der nanohalophilen Archaeen als polyphyletisch aufgefasst und die Klasse „Nanohaloarchaea“ vom Rest des Phylums „Nanohaloarchaeota“ abgetrennt wird. Während die Klasse „Nanohaloarchaea“ bei den Euryarchaeota (und dort evtl. in der „Stenosarchaea-Gruppe“) verortet wird,[17][15] könnte der Rest des Phylums „Nanohaloarchaeota“ – das ist die Klasse „Nanohalobia“ und einige bisher nicht näher zugeordnete Vertreter – möglicherweise als namensgebender Teil bei den DPANN-Archaeen verbleiben,[14] letzteres ist aber nicht sicher.[18]

Beschreibung und Vorkommen

Vertreter der Nanohaloarchaeota sind obligate Symbionten von Haloarchaeen, beispielsweise „Ca. Nanohaloarchaeum antarcticus“ von Halorubrum lacusprofundi.[19]

Unter den aus der Metagenomik vermuteten möglichen Vertreten des nach der Ausgliederung verbliebenen Phylums befinden sich nach Informationen aus der Gendatenbank des NCBI[20] Isolate

Etymologie

Der Name des Phyalums „Nanohaloarchaeota“ leitet sich ab von altgriechisch νᾶνος nanos, deutsch ‚klein‘, lateinisch nanus, „zwergig“; sowieἅλς háls, deutsch ‚Salz, Meer‘, der Suffix ‚-archaeota‘ ist reserviert für Phyla (Stämme/Abteilungen) der Archaeen. „Nanohaloarchaeota“ bezeichnet also ein Phylum salzliebender, keliner (d. h. nanohalophiler) Archaeen.

Systematik

Die Klasse (Biologie) „Nanohaloarchaea“ wurde jüngst aus dem hier bschriebenen Phylum Nanohaloarchaeota ausgegliedert (s. o.) und stattdessen den Euryarchaeota angegliedert (LPSN, NCBI); nach der NCBI-Taxonomie gehören sie dort der „Stenosarchaea-Gruppe“ an (Stand 14. Februar 2022).

In der graphischen Darstellung von LifeMap (NCBI Version, älterer Stand)[15] wird die Klasse „Nanohaloarchaea“ (anders als in der NCBI-Taxonomie) selbst noch im Phylum „Candidatus Nanohaloarchaeota“ dargestellt, dieses aber insgesamt zur „Stenosarchaea-Gruppe“ innerhalb der Euryarchaeota; ebenso ist es bei UniProt.[21] In der graphischen Darstellung bei OneZoom sind alle Vertreter derzeit umgekehrt der DPANN-Gruppe zugeordnet.[1]

Die folgende Systematik der nach der Ausgliederung verbleibenden Nanohaloarchaeota (Stand 14. Februar 2022) basiert im Wesentlichen auf folgenden Quellen:

In der DPANN-Gruppe (Superphylum) – (N):
Phylum: „Candidatus Nanohaloarchaeota“ Rinke et al. 2013 (L,N)

  • Klasse: „Candidatus Nanohalobia“ La Cono et al. 2020 (L,N)
    • Ordnung: „Candidatus Nanohalobiales“ La Cono et al. 2020 (L,N)
      • Familie: „Candidatus Nanohalobiaceae“ La Cono et al. 2020 (L,N)
        • Gattung: „Candidatus Nanohalobium“ La Cono et al. 2020 (L,N)
  • keiner Klasse, Ordnung oder Familie zugewiesene Gattungen:
        • Gattung: „Candidatus Nanohalarchaeum“ corrig. Hamm et al. 2019 mit Schreibvariante „Candidatus Nanohaloarchaeum“ Hamm et al. 2019 (L)
          • Spezies: „Candidatus Nanohalarchaeum antarcticum“ corrig. Hamm et al. 2019 (L) mit Schreibvariante „Candidatus Nanohaloarchaeum antarcticus“[19]
        • Gattung: „Candidatus Nanopetraeus“ corrig. Crits-Christoph et al. 2016 mit Schreibvariante „Candidatus Nanopetramus“ Crits-Christoph et al. 2016 (L)
          • Spezies: Candidatus Nanopetramus sp. SG9 alias Nanohaloarchaea archaeon SG9[22][8] (N[23])
        • weitere Stämme der Nanohaloarchaeota als mögliche Spezies mit vorläufiger Bezeichnung ohne Gattungszuweisung: Diverse Isolate nach NCBI mit vorläufiger Bezeichnung.[20] (N)

Literatur

  • Rohit Ghai, Lejla Pašić, Ana Beatriz Fernández, Ana-Belen Martin-Cuadrado, Carolina Megumi Mizuno, Katherine D. McMahon, R. Thane Papke, Ramunas Stepanauskas, Beltran Rodriguez-Brito, Forest Rohwer, Cristina Sánchez-Porro, Antonio Ventosa, Francisco Rodríguez-Valera: New Abundant Microbial Groups in Aquatic Hypersaline Environments. In: Nature Scientific Reports. 1. Jahrgang, Nr. 135, 31. Oktober 2011, S. 135, doi:10.1038/srep00135, PMID 22355652, PMC 3216616 (freier Volltext), bibcode:2011NatSR...1E.135G (nature.com).
  • Priya Narasingarao, Sheila Podell, Juan A. Ugalde, Céline Brochier-Armanet, Joanne B. Emerson, Jochen J. Brocks, Karla B. Heidelberg, Jillian F. Banfield, Eric E. Allen: De novo metagenomic assembly reveals abundant novel major lineage of Archaea in hypersaline microbial communities. In: Nature ISME J. 6. Jahrgang, Nr. 1, 30. Juni 2011, S. 81–93, doi:10.1038/ismej.2011.78, PMID 21716304, PMC 3246234 (freier Volltext) – (nature.com).

Einzelnachweise

  1. ↑ a b OneZoom: Nanohaloarchaeota
  2. ↑ Karen Andrade, Jörn Logemann, Karla B. Heidelberg, Joanne B. Emerson, Luis R. Comolli, Laura A. Hug, Alexander J. Probst, Angus Keillar, Brian C. Thomas, Christopher S. Miller, Eric E. Allen, John W. Moreau, Jochen J. Brocks, Jillian F. Banfield: Metagenomic and lipid analyses reveal a diel cycle in a hypersaline microbial ecosystem. In: Nature ISME J. 9. Jahrgang, Nr. 12, 28. April 2015, S. 2697​–2711, doi:10.1038/ismej.2015.66, PMID 25918833, PMC 4817636 (freier Volltext) – (nature.com).
  3. ↑ thalassohaline, Wiktionary (en.)
  4. ↑ Susanne M. Bickel, Martina Ufer, Kerstin Steinert, Michaela Dane: Leben im Salz. In: Biologie in unserer Zeit, Band 25, Nr. 6, Dezember 1995, Projekt: Bioenergetics of Halophilic Archaea, S. 380–393; doi:10.1002/biuz.19950250624. PDF
  5. ↑ a b Rohit Ghai, Lejla Pašić, Ana Beatriz Fernández, Ana-Belen Martin-Cuadrado, Carolina Megumi Mizuno, Katherine D. McMahon, R. Thane Papke, Ramunas Stepanauskas, Beltran Rodriguez-Brito, Forest Rohwer, Cristina Sánchez-Porro, Antonio Ventosa, Francisco Rodríguez-Valera: New Abundant Microbial Groups in Aquatic Hypersaline Environments. In: Nature Scientific Reports. 1. Jahrgang, 31. Oktober 2011, S. 135, doi:10.1038/srep00135, PMID 22355652, PMC 3216616 (freier Volltext), bibcode:2011NatSR...1E.135G (nature.com).
  6. ↑ Charlotte D. Vavourakis, Rohit Ghai, Francisco Rodriguez-Valera, Dimitry Y. Sorokin, Susannah G. Tringe, Philip Hugenholtz, Gerard Muyzer: Metagenomic Insights into the Uncultured Diversity and Physiology of Microbes in Four Hypersaline Soda Lake Brines. In: Frontiers in Microbiology. 7. Jahrgang, 25. Februar 2016, S. 211, doi:10.3389/fmicb.2016.00211, PMID 26941731, PMC 4766312 (freier Volltext) – (frontiersin.org).
  7. ↑ Olga Zhaxybayeva, Ramunas Stepanauskas, Nikhil Ram Mohan, R. Thane Papke: Cell sorting analysis of geographically separated hypersaline environments. In: Extremophiles. 17. Jahrgang, Nr. 2, 29. Januar 2013, S. 265–275, doi:10.1007/s00792-013-0514-z, PMID 23358730 (springer.com). ResearchGate.
  8. ↑ a b Alexander Crits-Christoph, Diego R. Gelsinger, Bing Ma, Jacek Wierzchos, Jacques Ravel, Alfonso Davila, M. Cristina Casero, Jocelyne DiRuggiero: Functional interactions of archaea, bacteria and viruses in a hypersaline endolithic community. In: Environmental Microbiology. 18. Jahrgang, Nr. 6, 21. März 2016, S. 2064​–2077, doi:10.1111/1462-2920.13259, PMID 26914534 (wiley.com).
  9. ↑ Priya Narasingarao, Sheila Podell, Juan A. Ugalde, Céline Brochier-Armanet, Joanne B. Emerson, Jochen J. Brocks, Karla B. Heidelberg, Jillian F. Banfield, Eric E. Allen: De novo metagenomic assembly reveals abundant novel major lineage of Archaea in hypersaline microbial communities. In: Nature ISME J. 6. Jahrgang, Nr. 1, Januar 2012, S. 81–93, doi:10.1038/ismej.2011.78, PMID 21716304, PMC 3246234 (freier Volltext) – (nature.com). Epub 30. Juni 2011.
  10. ↑ Céline Petitjean, Philippe Deschamps, Purificación López-García, David Moreira: Rooting the domain Archaea by phylogenomic analysis supports the foundation of the new kingdom Proteoarchaeota. In: Genome Biol. Evol. 7. Jahrgang, Nr. 1, 19. Dezember 2014, S. 191–204, doi:10.1093/gbe/evu274, PMID 25527841, PMC 4316627 (freier Volltext) – (oup.com).
  11. ↑ Thomas Cavalier-Smith, Ema E-Yung Chao: Multidomain ribosomal protein trees and the planctobacterial origin of neomura (Eukaryotes, archaebacteria). In: Protoplasma. 257. Jahrgang, Nr. 3, 3. Januar 2020, S. 621–753, doi:10.1007/s00709-019-01442-7, PMID 31900730, PMC 7203096 (freier Volltext) – (springer.com).
  12. ↑ Monique Aouad, Najwa Taïb, Anne Oudart, Michel Lecocq, Manolo Gouy, Céline Brochier-Armanet: Extreme halophilic archaea derive from two distinct methanogen Class II lineages. In: Molecular Phylogenetics and Evolution. 2018. Jahrgang, Nr. 27. Elsevier, 21. April 2018, S. 46–54, doi:10.1016/j.ympev.2018.04.011, PMID 29684598 (sciencedirect.com). PDF.
  13. ↑ Christian Rinke, Patrick Schwientek, Alexander Sczyrba, Natalia N. Ivanova, Iain J. Anderson, Jan-Fang Cheng, Aaron Darling, Stephanie Malfatti, Brandon K. Swan, Esther A. Gies, Jeremy A. Dodsworth, Brian P. Hedlund, George Tsiamis, Stefan M. Sievert, Wen-Tso Liu, Jonathan A. Eisen, Steven J. Hallam, Nikos C. Kyrpjdes, Ramunas Stepanauskas, Edward M. Rubin, Philip Hugenholtz, Tanja Woyke: Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter. In: Nature. 499. Jahrgang, Nr. 7459, 25. Juli 2013, S. 431–437, doi:10.1038/nature12352, PMID 23851394, bibcode:2013Natur.499..431R (nature.com).
  14. ↑ a b c Sayers et al.: Candidatus Nanohaloarchaeota. National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database; Details: "Candidatus Nanohaloarchaeota" Rinke et al. 2013 (phylum; graphisch: =Candidatus Nanohaloarchaeota, auf: Lifemap NCBI Version.
  15. ↑ a b c Sayers et al.: Nanohaloarchaea. National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database; Details: "Nanohaloarchaea" Narasingarao et al. 2012 (class); graphisch: Nanohaloarchaea, auf: Lifemap NCBI Version.
  16. ↑ Christian Rinke, Maria Chuvochina, Aaron Mussig, Pierre-Alain Chaumeil, Adrián Davín, David W. Waite, William B. Whitman, Donovan H. Parks, Philip Hugenholtz: A standardized archaeal taxonomy for the Genome Taxonomy Database. In: Nature Microbiology, Band 6, Nr. 7, 21. Juni 2021, S.  pages 946–959; doi:10.1038/s41564-021-00918-8, Epub Juli 2021. Projects: A rank-normalized prokaryotic taxonomy – A rank normalized prokaryotic taxonomy. Hier insbes. Tbl. S13 in Supplementary Information.
  17. ↑ J. P. Euzéby: Class "Candidatus Nanohaloarchaea" Narasingarao et al. 2012. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN);
  18. ↑ a b J. P. Euzéby: Phylum "Candidatus Nanohaloarchaeota" Rinke et al. 2013. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN);
  19. ↑ a b Joshua N. Hamm, Susanne Erdmann, Emiley A. Eloe-Fadrosh, Allegra Angeloni, Ling Zhong, Christopher Brownlee, Timothy J. Williams, Kirston Barton, Shaun Carswell, Martin A. Smith, Sarah Brazendale, Alyce M. Hancock, Michelle A. Allen, Mark J. Raftery, Ricardo Cavicchioli: Unexpected host dependency of Antarctic Nanohaloarchaeota. In: PNAS, Band 116, Nr. 29, 16. Juli 2019, S. 14661​-14670; doi:10.1073/pnas.1905179116, Epub 28. Juni 2019.
  20. ↑ a b Sayers et al.: unclassified Candidatus Nanohaloarchaeota. National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database; Details: Nucleotide: txid2099673, MAG: Candidatus Nanohaloarchaeota archaeon isolates.
  21. ↑ UniProt: Taxonomy - Nanohaloarchaea (CLASS), Nanohaloarchaea: All lower taxonomy nodes
  22. ↑ Violetta La Cono, Enzo Messina, Manfred Rohde, Erika Arcadi, Sergio Ciordia, Francesca Crisafi, Renata Denaro, Manuel Ferrer, Laura Giuliano, Peter N. Golyshin, Olga V. Golyshina, John E. Hallsworth, Gina La Spada, Maria C. Mena, Alexander Y. Merkel, Margarita A. Shevchenko, Francesco Smedile, Dimitry Y. Sorokin, Stepan V. Toshchakov, Michail M. Yakimov: Symbiosis between nanohaloarchaeon and haloarchaeon is based on utilization of different polysaccharides. In: Proc Natl Acad Sci USA. 117. Jahrgang, Nr. 33, 5. August 2020, S. 20223​–20234, doi:10.1073/pnas.2007232117, PMID 32759215, PMC 7443923 (freier Volltext) – (pnas.org). Siehe insbes. Fig. 1 (PowerPoint).
  23. ↑ Sayers et al.: Search: Candidatus Nanopetramus * (wild card). National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database;
Abgerufen von „https://de.wikipedia.org/w/index.php?title=Nanohaloarchaeota&oldid=220235995“