Myoviridae

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Myoviridae
Bacteriophage P2.jpg

P2-Phagen im TEM

Systematik
Klassifikation: Viren
Bereich: Duplodnaviria[1][2]
Reich: Heunggongvirae[1][2]
Phylum: Uroviricota[1][2]
Klasse: Caudoviricetes[2]
Ordnung: Caudovirales
Familie: Myoviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: ikosaedrisch, tailed
Hülle: keine
Wissenschaftlicher Name
Myoviridae
Links
Typisches Aussehen eines Virusteilchens der Myoviridae

Die Familie Myoviridae umfasst sechs Gattungen von Bakteriophagen mit einem Molekül doppelsträngiger DNA als Genom. Die Mitglieder dieser Familie besitzen ein ikosaedrisches Kapsid und ein kontraktiles Schwanzteil; wegen dieser kontraktilen Eigenschaft leitet sich der Familienname von gr. myos (μυός) für Muskel ab. Innerhalb der Ordnung Caudovirales zeichnen sich die Myoviridae durch besonders große, teilweise langgestreckte Kapside (z. B. T4-Phage: 111 × 78 nm) und ein sehr großes Genom (34-169 kBp) aus. Der wichtigste Vertreter ist der schon früh entdeckte T4-Phage (Enterobacteria Phage T4), dessen besondere Morphologie und genetische Eigenschaften in der molekularbiologischen Forschung eine herausragende Rolle spielte. Die von diesem Phagen abgeleitete T4-DNA-Ligase findet heute noch Verwendung in der Molekularbiologie.

Myoviridae haben neben Bakterien auch Archaeen zum Wirt.

Systematik[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Die folgende Systematik nach ICTV (Stand 2018b.v2 vom März 2019, aktualisiert mit Stand 2019.v1 vom März 2020[1]) umfasst nur einen Teil der zugehörigen Spezies:

Familie Myoviridae

00 Unterfamilie Eucampyvirinae

  • Genus Firehammervirus (veraltet Cp220virus, Cp220likevirus, Cp220-ähnliche Viren)
  • Spezies Campylobacter-Virus CP220
  • Spezies Campylobacter virus CP81
00 Unterfamilie Ounavirinae

  • Spezies Salmonella virus FelixO1
  • Spezies Citrobacter virus Moogle
00 Unterfamilie Peduovirinae

  • Genus Hpunavirus (veraltet Hp1virus, Hpunalikevirus, Hp1likevirus)
  • Genus Peduovirus (veraltet P2virus, P2likevirus, P2-ähnliche Viren, 13 Spezies)
00 Unterfamilie Spounavirinae

  • Genus Pecentumvirus (veraltet P100virus)
  • Genus Okubovirus (veraltet Spo1virus, Spounalikevirus, SPO1-ähnliche Viren, zwei Spezies)
  • Genus Tsarbombavirus
00 Unterfamilie Tevenvirinae

00 Unterfamilie Vequintavirinae

00 Unterfamilie nicht bestimmt:

  • Spezies Burkholderia virus BcepMu
  • Mycobacterium phage Cali
  • Mycobacterium phage Catera
  • Mycobacterium phage Rizal
  • Mycobacterium phage ScottMcG
  • Mycobacterium phage Spud
  • Spezies Mycobacterium virus I3 (alias Mycobacterium-Phage I3)
  • Spezies „Mycobacterium phage Myrna“ (vorgeschlagen)
  • Spezies Pseudomonas-Virus EL (wiss. Pseudomonas virus EL, veraltet Pseudomonas phage EL) (*)
  • Spezies Halomonas virus HAP1
  • Spezies Iodobacter virus PLPE (veraltet Iodobacter phage phiPLPE) (*)
  • Spezies Clostridium virus phiCD119
  • Genus Myohalovirus (veraltet Phihlikevirus, phiH-like viruses, PhiH-ähnliche Viren)
  • Spezies Burkholderia virus Bcep1
  • Spezies Burkholderia virus Bcep43
  • Spezies Burkholderia virus Bcep781 (*, ehemals Genus Vidavervirus; veraltet Bcep78virus, Bcep78likevirus, Bcep78-ähnliche Viren)
  • Spezies Xanthomonas virus OP2
  • Spezies Synechococcus virus ACG2014bSyn9311C4
  • Genus Punavirus (veraltet P1virus, Punalikevirus, P1likevirus, P1-ähnliche Viren, 2 Spezies)
  • Spezies Salmonella virus SPN3US (veraltet Salmonella phage SPN3US)
00 Noch nicht vom ICTV bestätigte Vorschläge/Kandidaten:[13][14][15][16][17][18]

  • Genus „Cbasmlikevirus
  • Spezies „Cellulophaga phage phiSM“ (*)
  • Spezies „Cellulophaga phage phi3:1
  • Spezies „Cellulophaga phage phi3ST:2
  • Spezies „Cellulophaga phage phi38:2
  • Spezies „Cellulophaga phage phi47:1
  • Genus „Cyanomyoviruses“ (informell)
  • Spezies „Synechococcus phage Syn9“ (alias „Bacteriophage Syn9“, „Cyanophage Syn9“)[19][20]
  • Spezies „Prochlorococcus phage P-SSM4“ (alias „Cyanophage P-SSM4“)[21]
  • Genus „Hfunalikevirus
  • Spezies „Halovirus HF1“ (*)
  • Spezies „Halovirus HF2
  • Genus „Rv5likevirus
  • Spezies „Enterobacteria phage phi92
  • Spezies „Escherichia phage rV5“ (*)
  • Spezies „Escherichia phage vB_EcoM_FV3
  • Genus „Sfv and relatives“ (informell, zu unterscheiden von Spezies Rabbit fibroma virus alias Shope fibroma virus,[22] Gattung Leporipoxvirus, Poxviridae)
  • Spezies „Enterobacteria phage SfV“ (alias „Shigella phage SfV“, „Shigella flexneri bacteriophage V“)[23] (*)
  • Spezies „Escherichia phage P27
  • ohne vorgeschlagene Gattung:
  • Spezies „Aggregatibacter phage Aaphi23“ (alias „Bacteriophage Aaphi23“, vorgeschlagen)
  • Spezies „Bdellovibrio phage phi1402
  • Spezies „Bdellovibrio phage phi1422
  • Spezies „Pectobacterium phage ZF40
  • Spezies „Pseudomonas phage OBP“ (alias Pseudomonas fluorescens bacteriophage OBP, vorgeschlagen)
  • Spezies „Sphingomonas Phage PAU[24][25]
  • Spezies „Vibrio phage 138
  • Spezies „Vibrio phage CP-T1
  • Spezies „Yersinia phage PY100
00 Folgende Riesenphagen (eng.huge phages“: Jumbo- und Megaphagen) gehören ggf. zu den Myoviridae (ohne Rang):[26][27]

  • Kabirphage
  • Mahaphage“ mit der Untergruppe
  • Lak-Phagen“ mit den Vertretern Lak-A1, Lak-A2, Lak-B1 bis Lak-B9 und Lak-C1[28]
  • Biggiephage
  • Dakhmphage
  • Kyodaiphage
  • Kaempephage
  • Jabbarphage
  • Enormephage
  • Judaphage
  • Whopperphage

Verschiebungen:

  • Genus Vi1virus (veraltet Viunalikevirus) mit Spezies Bacteriophage ϕMAM1 wurde zur neuen Caudovirales-Familie Ackermannviridae, Unterfamilie Cvivirinae verschoben.
  • Genus Siminovitchvirus (veraltet Cp51virus) wurde zur neuen Caudovirales-Familie Herelleviridae, Unterfamilie Spounavirinae verschoben.
  • Die Genera Agatevirus, Bequatrovirus (veraltet B4virus), Bastillevirus, Caeruleovirus (veraltet Bc431virus), Nitunavirus (veraltet Nit1virus) mit Spezies Bacillus virus NIT1 und Wphvirus wurden ebenfalls zur neuen Familie Herelleviridae, aber Unterfamilie Bastillevirinae verschoben.
  • Die neue Unterfamilie Twortvirinae der Herelleviridae enthält nun die Genera Baoshanvirus, Harbinvirus, Kayvirus, Sciuriunavirus, Sepunavirus (veraltet Sep1virus), Silviavirus, Twortvirus (alias Twortlikevirus, Twort-ähnliche Viren) mit Typusspezies Staphylococcus virus Twort

Literatur[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

  • A. M. Q. King, M. J. Adams, E. B. Carstens, E. J. Lefkowitz (Hrsg.): Virus Taxonomy. Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Amsterdam 2012, ISBN 978-0-12-384684-6, S. 46–62.
  • C. M. Fauquet, M. A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London / San Diego 2004.

Weblinks[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Einzelnachweise[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

  1. a b c d ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. a b c d ICTV: ICTV Taxonomy history: Enterobacteria phage T4, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  3. NCBI: Synechococcus phage S-PM2 (species)
  4. Pseudomonas phage 201phi2-1, auf: Virus-Host DB, TAX:198110
  5. Proteomes - Pseudomonas phage 201phi2-1, auf: UniProt
  6. NCBI: Pseudomonas phage 201phi2-1 (species)
  7. NCBI: Prochlorococcus virus PSSM2 (species)
  8. a b Denise Brehm: Viruses Use Bacteria for Reproduction, auf: SciTechDaily vom 26. Januar 2012
  9. a b Qinglu Zeng, Sallie W. Chisholm: Marine Viruses Exploit Their Host's Two-Component Regulatory System in Response to Resource Limitation, in: Curr Biol Band 22, Nr. 2, CellPress vom 24. Januar 2012, S. 124-128, doi:10.1016/j.cub.2011.11.055, PDF, Supplement 1
  10. Ian J. Campbell, Jose Luis Olmos Jr., Weijun Xu, Dimithree Kahanda, Joshua T. Atkinson, Othneil Noble Sparks, Mitchell D. Miller, George N. Phillips Jr., George N. Bennett, Jonathan J. Silberg: Prochlorococcus phage ferredoxin: Structural characterization and electron transfer to cyanobacterial sulfite reductases – Phage Fd characterization and host SIR interactions, in: J. Biol. Chem., ASBMB Publications vom 19. Mai 2020, doi:10.1074/jbc.RA120.013501, PDF
  11. Beneath the Ocean’s Surface, a Virus Is Hijacking the Most Abundant Organism on Earth, auf: SciTechDaily vom 6. Juni 2020, Quelle: Rice University
  12. NCBI: Synechococcus virus S-SM1 (species)
  13. S. B. Santos, A. M. Kropinski, P.-J. Ceyssens, H.-W. Ackermann, A. Villegas, R. Lavigne, V. N. Krylov, C. M. Carvalho, E. C. Ferreira, J. Azeredo: Genomic and Proteomic Characterization of the Broad-Host-Range Salmonella Phage PVP-SE1: Creation of a New Phage Genus. In: Journal of Virology. 85, Nr. 21, 2011, S. 11265–11273. doi:10.1128/JVI.01769-10. PMID 21865376. PMC 3194984 (freier Volltext).
  14. L. Truncaite, E. Šimoliūnas, A. Zajančkauskaite, L. Kaliniene, R. Mankevičiūte, J. Staniulis, V. Klausa, R. Meškys: Bacteriophage vB_EcoM_FV3: A new member of "rV5-like viruses". In: Archives of Virology. 157, Nr. 12, 2012, S. 2431–2435. doi:10.1007/s00705-012-1449-x. PMID 22907825.
  15. A. Cornelissen, S. C. Hardies, O. V. Shaburova, V. N. Krylov, W. Mattheus, A. M. Kropinski, R. Lavigne: Complete Genome Sequence of the Giant Virus OBP and Comparative Genome Analysis of the Diverse KZ-Related Phages. In: Journal of Virology. 86, Nr. 3, 2011, S. 1844–1852. doi:10.1128/JVI.06330-11. PMID 22130535. PMC 3264338 (freier Volltext).
  16. C. M. Mizuno, F. Rodriguez-Valera, N. E. Kimes, R. Ghai: Expanding the Marine Virosphere Using Metagenomics. In: PLoS Genetics. 9, Nr. 12, 2013, S. e1003987. doi:10.1371/journal.pgen.1003987. PMID 24348267. PMC 3861242 (freier Volltext).
  17. K. Holmfeldt, N. Solonenko, M. Shah, K. Corrier, L. Riemann, N. C. Verberkmoes, M. B. Sullivan: Twelve previously unknown phage genera are ubiquitous in global oceans. In: Proceedings of the National Academy of Sciences. 110, Nr. 31, 2013, S. 12798–12803. doi:10.1073/pnas.1305956110. PMID 23858439. PMC 3732932 (freier Volltext).
  18. NCBI: unclassified Myoviridae
  19. NCBI: Synechococcus phage syn9 (species)
  20. NCBI: Cyanophage Syn9 (species)
  21. NCBI: Prochlorococcus phage P-SSM4 (species)
  22. NCBI: Rabbit fibroma virus (species)
  23. NCBI: Enterobacteria phage SfV (species)
  24. NVBI: Sphingomonas phage PAU (species)
  25. Richard Allen White III, Curtis A. Suttle: The Draft Genome Sequence of Sphingomonas paucimobilis Strain HER1398 (Proteobacteria), Host to the Giant PAU Phage, Indicates That It Is a Member of the Genus Sphingobacterium (Bacteroidetes), in: Genome Announc. 1(4), Juli-August 2013, e00598-13, doi:10.1128/genomeA.00598-13, PMID 23929486, PMC 3738902 (freier Volltext)
  26. Basem Al-Shayeb, Rohan Sachdeva, L. Chen, Jillian F. Banfield et al.: Clades of huge phages from across Earth’s ecosystems, in: Nature vom 12. Februar 2020, doi:10.1038/s41586-020-2007-4
  27. Ed Yong: A Huge Discovery in the World of Viruses, auf: The Atlantic vom 20. Februar 2020
  28. Audra E. Devoto, Joanne M. Santini et al.: Megaphages infect Prevotella and variants are widespread in gut microbiomes, in: Nature Microbiology, Band 4, S. 693–700, 28. Januar 2019, doi:10.1038/s41564-018-0338-9, insbes. Table 1 und Supplementary Figure 11