Diese Liste enthält die Nummer-eins-Alben in Kroatien im Jahr 2006, basierend auf den offiziellen „Top 50 kombiniranih“ der Hrvatska diskografska udruga (HDU). Es wurden außerdem noch getrennte Chartlisten für kroatische und fremdsprachige Alben erhoben.
Das in diesem Jahr am längsten als englischsprachiges Album auf der Spitzenposition verweilende Studioalbum der US-amerikanischen Rockband erreichte weltweit die Spitze der Charts.
Mit dem im Olympia in Paris aufgenommenen Livealbum erreichte der kroatische Sänger zum zweiten Mal innerhalb eines Jahres die Spitzenposition der Charts.
Das Debütalbum des Sängers erreichte sofort die Spitzenposition, allerdings erst in der neunten Chartwoche, nachdem es zuvor auf Position 15 eingestiegen war.